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Cell子刊：dynein-2的运动和调控新机制
2017年5月4日，清华大学生命科学院欧光朔研究组在《Current Biology》杂志在线发表了题为“线虫感觉纤毛中Dynein驱动的反向鞭毛内运输呈现三相模式”（Dynein-Driven Retrograde Intraflagellar Transport Is Triphasic in C. elegans Sensory Cilia）的文章，报道胞质动力蛋白2（dynein-2）在纤毛中的运动和调控机制。纤毛是参与运动和外界信号感知的重要细胞器，其组装和维持依赖于高度有序而保守的双向鞭毛内运输（intraflagellar transport，IFT）机制。胞质动力蛋白2（cyt
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《Nature Genetics》两个基因，疑难杂症
匹兹堡大学、发育生物学系Cecilia Lo课题组生物通报道：左心发育不全综合征（hypoplastic left heart syndrome HLHS）是一种严重的先天性心脏病，占新生儿心脏病死亡率的25%。这种畸形的原因不清，到目前为止，仍无根治方法，一般在出生后数日死亡。近日《Nature Genetics》报道了与HLHS有关的两个关键基因。目前，HLHS的治疗手段是手术。患病儿童需要经历无数的多重复杂手术，对有些人来说手术疗法有效，另一些人的心脏功能并没有改善，对部分出现心力衰竭的患者来说，必须立即进行心脏移植。尽管如此，HLHS患儿的五年生存率仅为50-70%。造成HLHS的遗传
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中科院微生物所向华研究组连发NUCLEIC ACIDS RES，阐明CRISPR适应机制
CRISPRs-Cas是细菌的免疫系统，也是人类的基因组编辑工具（如CRISPR-Cas9系统），它是生命科学研究的前沿窗口。Cell最新报道:CRISPR新发现中国科学院微生物研究所、微生物资源前期开发国家重点实验室、向华研究组致力于遗传、代谢、功能基因组学及生物工程研究，是我国较早从事CRISPR-Cas系统基础研究的团队。2014年：嗜盐菌（Haloarcula hispanica）CRISPR 的PAM(protospacer adjacent motif)验证面对国际上长期缺乏CRISPR从纯病毒高效获取spacer的适应系统的困境，向华研究组在古菌中建立了首个（所有系统中第二个）C
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两所实验室Nature同期报道：人工造血！
生物通报道：《Nature》杂志高度评价了这两项研究对自体干细胞临床治疗和血液疾病根源基础研究的重要意义，它们为白血病和其他需要骨髓移植却无法找到合适捐赠者的血液疾病患者们点亮了一盏明灯。一篇文章来自著名干细胞生物学家哈佛医学院院长、波士顿儿童医院的George Daley的实验室，他们体外诱导出了“极为接近”的人类造血干细胞；另一篇文章来自康奈尔医学院Ansary干细胞研究所的Shahin Rafii Weill团队，他们将成年老鼠体细胞培养成了完全成熟的造血干细胞。1998年，科学家们分离出了人类胚胎干（ES）细胞，当试图用它们制造造血干细胞时，收获甚微。2007年，包括Daley实验室在
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华人先锋《Nature Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱
生物通报道：斯坦福大学亓磊（Lei Stanley Qi）教授早年毕业于清华大学，现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授，近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展，比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术，改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式（由此入选了生物通的2016年生命科学风云人物）。作为基因组靶向改造（敲除和敲入）的遗传学手段，基因组编辑技术历经ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9，已发展成为自20世纪70年代生物技术时代开启以来最重要的基因工程技术。因没有物种限制、简单、高效，以CRISPR/Cas9为代表的基因组编辑技术已广
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盘点全基因组检测CRISPR脱靶位点的几种重要技术
生物通报道：在2013年，来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限：会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性，即该技术可以发生非特异性切割，引起基因组非靶向位点的突变，这样会造成研究结果的不确定性以及研究工作的大量增加，这一问题严重地限制了Cas9的应用。因此科学家们希望能通过全基因组检测脱靶剪切，近年来研发了不少检测脱靶剪切酶活性的实验方法，比如近期Nature Methods报道的两项技术，这些技术是什么，具有何种优势，具体让我们来看看：1.GUIDE-seq以往人们在检测CR
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Nature Methods：全面检测CRISPR脱靶效应的新策略
生物通报道 CRISPR/Cas9基因组编辑目前正应用得如火如荼，但若要转化到临床应用，准确检测脱靶效应则是必不可少的。近日，麻省总医院的研究人员开发出一种新策略，能够鉴定全基因组范围的CRISPR/Cas9脱靶突变。之前，在全基因组范围鉴定脱靶效应的细胞方法也时有报道，但这些方法可能错过低频率的脱靶突变，而且高效转染的要求也限制了其应用。相比之下，体外筛查策略则具有一定的优势。它不需要高效转染，避免了细胞适应性的影响。此外，活性核酸酶的浓度可以尽可能高，将低频率突变一网打尽。在这篇周一发表于《Nature Methods》的文章中，麻省总医院和哈佛大学的研究人员介绍了一种新的体外
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罗建华Nature子刊：CRISPR新编辑技术开创全新抗癌方法
生物通报道：来自匹兹堡大学健康科学学院的研究人员发现，利用基于CRISPR基因组编辑技术的一种新型基因治疗技术能有效地靶向致癌“融合基因”，而且能改善患有侵袭性肝癌和前列腺癌小鼠模型的存活率。这一研究成果公布在5月1日的Nature Biotechnology杂志上，文章的通讯作者是匹兹堡大学病理学教授，高通量基因组中心主任罗建华（Jianhua Lou，音译），他表示，“这是第一次利用基因编辑来专门针对癌症融合基因，这项成果令人激动，因为这为提出癌症治疗的全新途径奠定了基础。”基因融合在基因组中非常普遍，也是一些类型癌症的标志。它是由两个不相关的基因融合形成的一种基因产物，具有全新的功能或与
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Nature Genetics报道重量级发现：开启人类生命的基因
生物通报道：人类胚胎的形成始于精子细胞和卵母细胞的结合。这只初生的受精卵携带了分别来自母亲和父亲的一个拷贝的基因组。但是，这些遗传信息只有在受精卵分裂几次后才会被表达，这一事件被称为 “合子基因组激活（zygotic genome activation，ZGA）”，是什么触发了ZGA？有研究报道过斑马鱼和果蝇的母系ZGA触发因子，但在哺乳动物中，ZGA的启动仍不为人知。直到最近，综合理工学校洛桑联邦（EPFL）的科学家们发现，是DUX蛋白质家族点燃了新生胚胎的基因表达程序。这一里程碑式的新发现被发表在《Nature Genetics》杂志。这项发现始于Didier Trono实验室的一名博后A
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4月王牌聚焦：验证or质疑，都是科学道路上的铺路石
生物通报道：事物发展波浪式前进，螺旋式上升，科学研究总是能反复证明这个道理：本月一些研究受到了质疑，一些研究得到了验证，无论如何，这些都是科学道路上的铺路石。早在2005年，一组研究人员就发现来自年轻小鼠的血液能让老年小鼠的肝脏和骨骼肌干细胞回复到了更年轻的状态。而本月的一项最新研究则证明年轻人体血浆中的一种蛋白，能改善老年小鼠的大脑功能。这是首次发现一种人体蛋白具有这样的作用，也是关于年轻血液是否能逆转衰老症状（包括记忆丧失，肌肉功能和新陈代谢减少，骨骼结构流失）的最新证据。多年来，科学家们通过一种称为异种共生（parabiosis，生物通译）的技术分析年轻血液对小鼠衰老的影响，这种技术就是
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哈工大最新发表Nature文章 再次解析CRISPR作用机制
生物通报道：来自哈尔滨工业大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为“Structural basis of CRISPR–SpyCas9 inhibition by an anti-CRISPR protein”的文章，揭示了Anti-CRISPR 蛋白AcrIIA4抑制SpyCas9活性的分子机制。这一研究成果公布在4月27日的Nature杂志上，文章的通讯作者是哈工大黄志伟教授，这一成果也是继黄志伟团队CRISPR-Cpf1（Nature，2016；RNA Biology，2017）、CRISPR-C2c1(Cell Research，2017)等研究成果之后，在病原与宿主相互作用和基因
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《Cell》子刊：干细胞技术“熄火”关节炎症
生物通报道：“当看到组织内的细胞们迅速释放TNF-α，消灭炎症时，我们相信这种基因改造策略也可以工作于其他反馈依赖型系统。例如糖尿病，我们很有可能制造出能感知葡萄糖并激活胰岛素的干细胞，利用多能干细胞（pluripotent stem cell）的强大分化能力，和CRISPR的删除和插入技术，类似的策略能治疗许多疾病。”利用新的基因编辑技术，研究人员重新组装了老鼠干细胞，让它们与关节炎和其他慢性疾病炎症对抗，这种经改造后的干细胞被称为“自发型再生治疗改良干细胞（Stem cells Modified for Autonomous Regenerative Therapy ，SMART cell
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李劲松，于翔Cell Res最新文章：CRISPR技术构建基因功能分析方法
生物通报道：来自中科院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和中国科学院神经科学研究所于翔研究组合作发表了最新成果：利用CRISPR/Cas9技术和细胞谱系示踪技术对小鼠两细胞胚胎中的单个卵裂球进行了基因敲除，一步法获得了Tet3基因敲除的健康嵌合小鼠，并对Tet3基因敲除后大脑皮层和海马神经元的突触传递进行了探究。该方法是一种快速地分析致死基因在各个组织器官中功能的新方法。这一研究成果公布在Cell Research杂志上，文章的通讯作者是李劲松研究员和于翔研究员，第一作者是汪凌波博士和李敏寅博士。DNA双加氧酶Tet3是Tet蛋白家族的一个重要成员，之前的研究发现， Tet3全身性敲除小鼠
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CRISPR重要成果与前Nature子刊成果相呼应：CRISPR帮助恢复视觉
生物通报道：视网膜退行性疾病（Retinitis pigmentosa：RP）是一类遗传性的视觉损伤疾病，其中存在60多个基因的突变。全世界范围内，每4000人中就有一个人患有RP。这种杆细胞特异性的基因突变会导致杆状光受体的功能失活，进而锥状细胞的功能也会紊乱。目前还没有有效的针对RP的治疗方案。 近期来自加州大学圣地亚哥分校医学院，广州医科大学等处的研究人员发表了题为“Gene and mutation independent therapy via CRISPR-Cas9 mediated cellular reprogramming in rod photoreceptors”的文章，
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Cell Stem Cell八大热点文章（4月）
生物通报道：《Cell Stem Cell》杂志是2007年Cell出版社新增两名新成员之一（另外一个杂志是Cell Host & Microbe），这一杂志内容涵盖了从最基本的细胞和发育机制到医疗软件临床应用等整个干细胞生物学研究内容。这一杂志特别关注胚胎干细胞、组织特异性和癌症干细胞的最新成果。《Cell Stem Cell》自创刊以来就倍受关注，影响因子迅速提升，从0一冲至16.826，又达到了25.315。其中最受关注的文章包括：Zika Virus Disrupts Neural Progenitor Development and Leads to Microcephaly
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一只全球独家的模式生物
金小蜂（Jewel Wasp）一种典型的寄生蜂，不仅是重要的昆虫天敌资源，还是理想的模式生物。金小蜂不只是消灭棉田中的红铃虫，还消灭森林里和蔬菜地里的各种螟虫的幼虫、甚至还能控制惹人厌的蟑螂。据科学家验证，1公顷土地上，只要放十万只金小蜂，就可以把害虫基本消灭。 《Science Report》报道，来自加州大学河滨分校的Akbari研究团队创造了一个全新的金小蜂品种——全球唯一的红眼金小蜂突变品系。 这种品系的金小蜂将有助于科学家们开展其他有关金小蜂的生物学研究。例如，金小蜂如何运用“自私遗传因子”控制后代的性别等。 “杀死雌性胚胎，只创造雄性后代，没人知道雄性
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赵庆顺教授教您三天学会如何使用CRISPR/Cas9技术
第十一期CRISPR/Cas9基因靶向修饰技术学习班的通知玮瑜主办 江苏.南京 2017年5月12-14日周五-周日 (理论与实验相结合，请认准 南京大学模式动物研究所赵庆顺教授主讲)同期举办系统评价与meta分析和TCGA数据库数据挖掘与探索学习班 详细请联系谢老师 13611825136作为基因组靶向改造（敲除和敲入）的遗传学手段，基因组编辑技术历经ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9，已发展成为自20世纪70年代生物技术时代开启以来最重要的基因工程技术。因没有物种限制、简单、高效，以CRISPR/Cas9为代表的基因组编辑技术已广泛应用于人、大鼠
来源：上海玮瑜生物科技有限公司
时间：2017-04-20
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张锋Science发表CRISPR技术重要成果，Jennifer Doudna如何看？
——基于CRISPR的诊断工具可以用于检测病原体，鉴定癌变突变和人类DNA基因型。生物通报道：来自哈佛大学医学院，Broad研究院的研究人员指出利用一种新CRISPR技术：CRISPR-Cas13a/C2c2，可以高灵敏度检测包括寨卡病毒感染，登革热病毒感染等在内的疾病，其原理在于将CRISPR-Cas13a与等温RNA扩增结合，检测具有单碱基特异性的RNA和DNA。这一研究成果公布在4月13日的Science杂志上，文章的通讯作者分别是张锋研究员，以及James J. Collins教授，Collins教授是合成生物学的前沿科学家之一，同时也是创造出由合成生物学发展的先进商业化技术的第一人。
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华人先锋：源自CRISPR的低成本，高灵敏性诊断技术
生物通报道：一组科学家们改进一种CRISPR蛋白，研发出了靶向RNA，而不是DNA的快速，便宜，高灵敏度的诊断工具，可以用于检测诸如寨卡病毒感染和登革热感染等的疾病，这一进展也有助于便捷检测和诊断许多其它的病原体。这一研究成果公布在Science杂志上，由张锋研究组联合MIT的Jim Collins研究组完成。目前已经不少方法可以检测基因序列，但这些方法在灵敏度、特异性、简易性、成本和检测速度等方面都存在缺陷，为了寻找更好的方法，研究人员转向了以RNA为靶标的CRISPR-Cas系统，同时他们也加入了一个报告RNA，该报告RNA在被切割时会释放出荧光信号。另外为了增加灵敏度，研究人员还采用了一
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基因编辑大牛Nature子刊发文：CRISPR单碱基编辑非常准确！
生物通报道：来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章，证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature Biotechnology杂志上，文章的通讯作者是基因编辑领域的大牛KIM Jin-Soo，其研究组曾在Nature等顶级杂志发表多篇文章，提出了CRISPR技术领域的不少创新想法，比如他们曾设计出了目前最小的CRISPR-Cas9，并通过腺伴随病毒(AAV)将其递送到了肌细胞和小鼠的眼睛里
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