• 《Cell Metabolism》哈佛大学研究揭示糖尿病和肥胖症的新潜在疗法

  一项研究表明，肝脏充当双向枢纽，与心脏交换肠道微生物群衍生的代谢产物。由 FAPESP 资助、在美国哈佛大学开展研究的一个研究团队发现了一系列代谢物，这些代谢物从肠道转移到肝脏，然后到达心脏，再由心脏将它们输送到全身。这些化合物会影响肝脏中的关键代谢过程，并影响身体对胰岛素的反应。作者表示，这些发现最终可能指导治疗肥胖症和2型糖尿病的新策略。该研究近期发表在《细胞代谢》（Cell Metabolism）杂志上。“肝门静脉将大部分来自肠道的血液引流至肝脏。因此，它是接收肠道微生物群产物的第一站。在肝脏中，这些产物可以被结合、转化或消除，然后进入体循环，”该研究的第一作者、巴西圣保罗大学里贝朗普雷

  来源：Cell Metabolism

  时间：2025-12-09

• Nature子刊：人类基因图谱偏向于欧洲血统

  一项新研究显示，人类基因图谱存在重大盲点，因为这些图谱主要是基于欧洲血统人群的DNA序列构建而成。巴塞罗那超级计算中心和巴塞罗那科学技术研究所的科学家在非洲、亚洲和美洲人群中发现了数千个遗漏的转录本，其中可能包括人们尚未发现的全新基因的产物。这项研究成果于12月3日发表在《Nature Communications》杂志上。研究结果表明，某些疾病在特定人群中发病率更高的部分原因在于，他们的基因可能通过剪接等过程产生不同的转录本以及不同的蛋白质。这些分子变化在目前的基因图谱中几乎无法观察到，导致一些对疾病风险至关重要的信息被掩盖。共同第一作者、巴塞罗那超级计算中心的Pau Clavell-Rev

  来源：AAAS

  时间：2025-12-09

• AlphaGenome：解码非编码DNA的“瑞士军刀”及其在复杂疾病变异 prioritization 中的挑战与前景

  人类基因组中约98%的序列为非编码区域，这些"暗物质"如何调控基因表达一直是遗传学领域的核心难题。随着GWAS（全基因组关联分析）技术的普及，科学家们在非编码区发现了成千上万与复杂疾病（如糖尿病、精神分裂症）和数量性状（如血压、血脂水平）相关的遗传变异，但绝大多数变异的功能机制仍属未知。非编码DNA可通过改变转录因子结合、染色质可及性、三维基因组互作或RNA剪接等方式影响细胞功能，而理解这些分子过程如何介导遗传变异与表型关联，已成为转化GWAS发现为生物学洞察的关键瓶颈。为突破这一瓶颈，计算生物学领域开始涌现基于深度学习的序列功能预测模型。这类模型通过训练现有实验数据（如GTEx、ENCODE

  来源：TRENDS IN Genetics

  时间：2025-12-09

• Pap1是一种粘附素，参与申克孢子丝菌（Sporothrix schenckii）和巴西孢子丝菌（Sporothrix brasiliensis）与宿主之间的相互作用

  ### 中文解读：Sporothrix schenckii和Sporothrix brasiliensis中PAP1基因功能研究#### 1. 研究背景与目的孢子丝菌病是一种由Sporothrix属真菌引起的皮下组织感染，其分布广泛且在不同地区呈现流行差异。主要病原体为S. schenckii和S. brasiliensis，两者在基因组结构、毒力水平及宿主免疫应答上存在显著差异。尽管已发现Gp70、Hsp60等细胞壁蛋白作为粘附因子，但PAP1的功能尚未明确。本研究通过构建PAP1基因沉默突变株，系统评估其对两种真菌表型及致病性的影响。#### 2. 实验设计与方法研究采用基因沉默技术（农杆

  来源：The Cell Surface

  时间：2025-12-09

• 由IGF2BP1-LPAL2-YBX1相互作用介导的分支链氨基酸（BCAA）代谢紊乱会促进胆囊癌的恶性发展

  李学川|刘克|李琳|严思远|杨月|杨阳|杨佳华|邹璐|李伟健|李国强|毛阳|刘立国|王子怡|耿亚俊|龚颖斌|刘应斌|吴向松上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科，中国上海200127摘要细胞代谢的重编程在多种癌症的发展和进展中起着关键作用。然而，这些代谢变化如何驱动胆囊癌（GBC）的恶性转化机制仍不清楚。在这项研究中，我们通过全面的转录组学和代谢分析发现了GBC中支链氨基酸（BCAA）代谢的显著改变。BCAA分解酶ACADS、ACADSB和BCKDHA的活性降低与GBC患者的不良预后相关。在GBC的小鼠模型中，减少饮食中的BCAA摄入显著减缓了肿瘤生长。lncRNA LPAL2的表达与BCAA

  来源：Cancer Letters

  时间：2025-12-09

• 强化一种根深蒂固的共生关系的特异性

  亮点•这种喜欢与蚂蚁共生的巡虫甲通过感知蚂蚁的信息素来寻找并潜入蚁巢•这种甲虫在自然界中与一种特定的蚂蚁物种共同生活，但也能接受其他多种蚂蚁作为宿主•其选择性并非源于神经系统的偏好，而是受到更换宿主的限制•这种严格的选择性可能是后生动物中根深蒂固的共生生活方式的典型特征总结后生动物包含众多依赖特定宿主的共生生物和生态特化物种。这些共生关系的维持和稳定性通常被认为依赖于对宿主释放的信号的感觉适应，这一观点得到了针对宿主特异性模型中神经功能研究的支持。我们通过实验重建了这种严格共生的巡虫甲与其天然宿主蚂蚁之间的复杂社会关系，从而探究了其感觉机制。研究发现，蚂蚁的表皮烃类物质（用于识别同伴的信息素）

  来源：Current Biology

  时间：2025-12-09

• 真菌可动基因组中广泛的转座子水平转移塑造基因组多样性

  在真菌的演化历程中，基因组大小和结构呈现出惊人的多样性，有些物种的基因组仅有2.2 kb，而另一些则超过1.3 Gb。这种差异很大程度上由转座子（Transposable Elements, TEs）的增殖所驱动。转座子作为基因组的“寄生”序列，能够通过复制或切割粘贴机制在基因组中移动，长期以来被视为基因组膨胀和变异的主要推手。然而，转座子如何在寄主基因组防御机制的压制下实现长期存续，一直是演化生物学中的核心问题。水平转移（Horizontal Transfer of Transposable Elements, HTT）为这一谜题提供了关键线索：转座子可能通过跨物种的“基因偷渡”逃避灭绝命运

  来源：Current Biology

  时间：2025-12-09

• B类生长素响应因子MpARF2对自由生活的植物配子体中分生组织的形成至关重要

  亮点 • 生长素响应因子MpARF2在Marchantia中决定了细胞的全能性 • MpARF2通过创造低生长素响应的环境来促进干细胞的身份形成 • A-ARFs和B-ARFs竞争性地控制生长素的生物合成，从

  来源：Current Biology

  时间：2025-12-09

• 细胞大小的趋同进化使得生物能够适应红树林栖息地

  亮点•耐盐性要求细胞能够承受较高的膨压•红树林经过多次进化，形成了细胞体积更小、细胞壁更厚的特征•红树林中较小的细胞与基因组大小的变化无关总结红树林在大约20个植物科中至少独立演化了27次，以适应高盐度、洪水侵袭、强光和强风等沿海环境。11.何泽 · 冯晓 · 陈强 ...基于完整红树林基因组的沿海森林演化研究Nat. Ecol. Evol. 2022; 6:738-749Google Scholar,22.汤姆林森, P.B.《红树林的植物学》剑桥大学出版社, 2016Google Scholar 为了在这些极端环境中生存，红树林展现出多种生理策略来耐受盐水淹没带来的低渗透压。33.江国富

  来源：Current Biology

  时间：2025-12-09

• NAT10通过染色质相关tRNA调控p300/CBP活性促进癌症转移的新机制

  癌症转移是导致乳腺癌患者死亡的主要原因，其分子机制复杂且尚未完全阐明。尽管遗传、表观遗传和微环境因素均被证实参与转移过程，但RNA修饰在癌症转移中的作用仍知之甚少。NAT10作为目前已知唯一负责RNA N4-乙酰胞苷(ac4C)修饰的乙酰转移酶，在癌症发展中作用日益受到关注，但其促进转移的具体机制仍有待揭示。发表在《Molecular Cell》上的这项研究，首次揭示了NAT10通过调控染色质相关tRNA的乙酰化状态，影响p300/CBP组蛋白乙酰转移酶活性，从而改变增强子介导的基因转录程序，最终促进乳腺癌转移的完整机制。研究人员运用了多种关键技术方法：利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构

  来源：Molecular Cell

  时间：2025-12-09

• 综述：强直性脊柱炎与静脉血栓栓塞风险之间的关联：一项荟萃分析

  强直性脊柱炎（Ankylosing Spondylitis, AS）与静脉血栓栓塞症（Venous Thromboembolism, VTE）的关联性研究进展近年来，慢性炎症性疾病与血栓风险增高的关联引发广泛关注。强直性脊柱炎作为一种以脊柱强直为特征的慢性炎症性自身免疫疾病，其患者群体中VTE的发生率长期存在争议。2025年6月完成的最新系统综述通过整合六项高质量观察性研究，首次系统性地揭示了AS与VTE之间的潜在风险关联，为临床预防策略提供了重要依据。一、研究背景与临床意义强直性脊柱炎全球患病率约为0.1%-1%，好发于15-30岁男性群体，其典型症状包括晨僵、脊柱活动受限及炎症相关全身症状

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-12-09

• 综述：利用HLA-G的免疫调节特性开发先进的免疫疗法

  HLA-G分子在免疫调节与疾病治疗中的核心作用研究进展一、HLA-G的生理免疫调节功能HLA-G作为非经典MHC I类分子，在维持免疫稳态中发挥关键作用。其生理功能最初在妊娠免疫耐受机制中被揭示，胚胎绒毛滋养层通过表达HLA-G与母体NK细胞表面的抑制受体KIR2DL4结合，有效阻断母体免疫系统对胎儿的攻击。这种双向调控机制确保了妊娠过程中母胎免疫耐受的建立，同时促进胎盘血管重塑的生物学过程。在正常成人免疫系统中，HLA-G的表达呈现严格调控。研究发现外周血中存在特定亚群HLA-G阳性免疫细胞，包括CD14+HLA-G+单核细胞和CD3+HLA-G+调节性T细胞。这些细胞亚群通过抑制T细胞增殖

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-12-09

• TSC1基因缺陷通过mTORC1介导的PD-L1糖基化异常，促使结直肠癌细胞逃避免疫系统的攻击

  结直肠癌中TSC1调控的糖基化代谢轴与免疫逃逸机制研究解读1. 研究背景与科学问题结直肠癌作为全球第三大常见恶性肿瘤，其免疫治疗响应率存在显著个体差异。尽管PD-1/PD-L1抑制剂取得突破性进展，仍有大部分微卫星稳定型患者呈现治疗抵抗。近年研究揭示肿瘤细胞表面糖基化修饰，特别是PD-L1的α2,6-唾液酸共价键，在免疫逃逸中起关键作用。但糖基化代谢与mTOR信号通路的具体关联机制尚未阐明。2. 研究方法与技术路线该研究采用多组学整合分析策略，构建了"临床数据-分子机制-动物模型"三级验证体系：- **临床数据分析**：基于TCGA-COAD数据库的471例肿瘤样本和41例正常组织，建立sia

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-12-09

• 靶向基因组安全港的位点特异性转座酶实现人细胞中基因大小DNA的高效无缺口插入

  实现基因的精准替换是基因治疗领域的圣杯。许多单基因遗传病由患者特异性的突变引起，使得个体化矫正变得不切实际，这凸显了通用型全基因替换策略的必要性。然而，现有的基因整合技术面临两大核心挑战：病毒载体整合位点不可控，存在插入突变和致癌风险；而基于CRISPR-Cas系统的同源定向修复效率低下，尤其在非分裂细胞中几乎不可行，且其依赖的双链断裂会引发染色体缺失、重排甚至染色体重碎等严重后果。有没有一种方法能够像“精准快递”一样，将完整的治疗基因安全、高效地投递到基因组的“安全港”，且不破坏基因组的稳定性？发表在《Nucleic Acids Research》上的这项研究给出了肯定的答案。研究人员开发了

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-12-09

• 端粒DNA损伤图谱：区分氧化应激与炎症应激的分子标志物

  每当细胞面临压力时，端粒——染色体末端的保护帽——往往首当其冲出现损伤。无论是氧化应激还是炎症应激，都会导致端粒缩短和功能障碍，这与衰老和多种疾病密切相关。然而，一个长期困扰科学界的问题是：这两种应激在分子层面究竟如何损伤端粒？它们的破坏模式是否存在本质区别？回答这个问题对于理解疾病机制和开发精准诊疗策略至关重要。传统观点认为活性氧(ROS)是导致DNA损伤的主要元凶。但在生理条件下，细胞内的碳酸氢盐(HCO3-)缓冲系统会改变这一化学反应路径。犹他大学的Aaron M. Fleming和Cynthia J. Burrows教授团队在《Nucleic Acids Research》发表的研究揭

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-12-09

• 溶酶体核酸降解机制：先天免疫调控的关键枢纽与疾病关联

  在细胞这座精密的生命工厂中，溶酶体如同高效的回收处理中心，负责将各种生物大分子分解并回收利用。其中，核酸（DNA和RNA）的降解与循环尤为重要，它不仅关乎细胞的营养供给和能量平衡，更与机体的先天免疫防御系统紧密相连。然而，长久以来，科学家们对核酸在溶酶体中被“拆解”的具体步骤、关键的执行者（酶和蛋白）以及这个过程一旦出错会引发何种后果，仍知之甚少。尤其值得注意的是，内体/溶酶体是细胞内感知病原体相关分子模式（PAMPs）的重要场所，特别是其中的Toll样受体（TLR），它们能特异性地识别DNA和RNA作为配体。这意味着，核酸的快速且受控的降解，对于平衡机体对抗病原体的免疫反应和防止自身免疫至关

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-12-09

• 多能性退出过程中增强子-启动子相互作用的纳米尺度动态研究

  在基因组调控的复杂世界中，增强子如何跨越千碱基对的距离精确控制基因表达一直是领域内的核心谜题。传统观点认为增强子需要与启动子发生物理接触才能发挥作用，但近年来的活细胞成像研究却给出了相互矛盾的证据——有些基因在转录激活时确实显示出E-P距离的缩短，而另一些基因则完全不受空间距离变化的影响，甚至出现了距离增加反而促进转录的"反常"现象。这种分歧使得科学界对基因调控的空间机制产生了激烈争论，特别是在发育过程中基因表达程序发生剧烈重编程的关键时期。为了解开这一谜团，德国慕尼黑大学和马克斯·普朗克多学科科学研究所的研究团队将目光投向了小鼠胚胎干细胞的多能性状态转变过程。这一发育时间窗口伴随着大规模的转

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-12-09

• 脊椎动物、无脊椎动物和病毒中胰岛素/胰岛素样生长因子及其受体的进化全景与功能保守性分析

  在生命演化过程中，胰岛素及其相关的胰岛素样生长因子（IGF）系统犹如一把精准的分子钥匙，调控着生长、代谢和发育等核心生命活动。尽管科学家已深入探索其生理功能，但这些关键分子及其受体在漫长进化史中的起源与分化路径仍笼罩着迷雾。更令人惊奇的是，病毒竟能编码类似胰岛素的肽段（VILPs），这些“分子间谍”如何融入宿主代谢网络？为解开这些谜题，由Martina Chrudinová和Jeffrey M DaCosta领衔的国际团队在《Molecular Biology and Evolution》发表了突破性研究，通过绘制涵盖千余序列的进化图谱，揭示了胰岛素家族跨越数十亿年演化的守恒法则与创新轨迹。研

  来源：Molecular Biology and Evolution

  时间：2025-12-09

• 植物中一氧化氮的氧化生物合成：CYP79s、N-OX FMOs和过氧化物酶协同作用的新途径

  在植物王国的信号分子万神殿中，一氧化氮(NO)堪称最小却功能强大的明星分子。这个简单的双原子气体分子，调控着从种子萌发到开花结果，再到应对环境挑战的几乎所有生命过程。然而，一个长期困扰科学界的谜团是：动物拥有专门合成NO的一氧化氮合酶(NOS)，但在高等植物中却始终找不到它的同源物。植物究竟通过何种精妙机制在特定时间、特定地点产生这种寿命极短、作用剧烈的信号分子？这成为了植物信号传导领域亟待攻克的“圣杯”级难题。以往的研究多聚焦于硝酸盐还原途径，但越来越多的证据表明，植物体内存在一条不依赖NOS的氧化合成路径。特别是过氧化物酶被证明能够利用肟类化合物产生NO，但过氧化物酶在植物体内分布广泛、底

  来源：Molecular Plant

  时间：2025-12-09

• I期TNBC患者新辅助化疗后的病理完全缓解与生存情况：一项基于登记系统的研究

  荷兰国家癌症登记处开展了一项针对早期三阴性乳腺癌（TNBC）患者新辅助化疗（NACT）疗效和预后的全国性研究。该研究纳入2012-2022年间接受蒽环类联合紫杉醇方案NACT的1144例cT1N0M0 TNBC患者，重点探讨了病理完全缓解率（pCR）及其与生存预后的关联。研究首先明确了病理完全缓解的定义：乳腺及同侧腋窝淋巴结均无残留浸润性肿瘤（ypT0N0或ypTisN0）。结果显示总pCR率达57.3%，其中年轻患者（<50岁）的pCR率高达66%，显著高于50岁以上患者的49%。肿瘤分级方面，III级肿瘤的pCR率（62%）显著高于I/II级（40%）。值得注意的是，尽管41.3%的患者接

  来源：ESMO Open

  时间：2025-12-09

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