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  • 多物种序列马尔可夫溯祖模型下家系变化等待距离的估计研究

    基因组如同镶嵌着不同祖先来源片段的马赛克,这些片段被历史上的重组事件分隔。这种空间异质性使得多个基因组间的家系关系在不同基因组区域呈现变异。虽然单群体(溯祖模型)或多群体结构(多物种溯祖模型MSC)下非连锁基因组区域的家系变异已有较好描述,但连锁基因组区域家系关系的预期相似性仍缺乏系统表征。Patrick F. McKenzie和Deren A. R. Eaton在《Systematic Biology》发表的研究,通过建立多物种序列马尔可夫溯祖模型(MS-SMC),填补了这一理论空白。研究团队首先将Deng等(2021)单群体恒定有效群体大小的解析解推广至多物种框架,允许分支特异性有效群体大

    来源:Systematic Biology

    时间:2025-09-10

  • 基于AI的被子植物GATA转录因子功能预测与分类系统:GATA TF Class Classifier的开发与应用

    Highlight功能分类系统A-D类的生物学作用被子植物GATA转录因子根据系统发育关系分为四大功能类别(A-D类),每类均具有独特基序(如HAN/LLM)、附加结构域(如CCT或ASXH)及GATA型锌指变异(CX2CX18-20CX2C),这些特征在不同物种间高度保守。A类成员通过IVb型锌指(CX2CX18CX2C)调控光信号与油菜素内酯通路;B类虽同为IVb型锌指,但携带HAN/LLM基序,主导植物生长与花器官发育;C类独特的IVc型锌指(CX2CX20CX2C)与TIFY/CCT结构域协同调控开花时间;D类则通过LXXLL基序参与广泛调控网络。GATA TF分类器的功能与谱系解析基

    来源:BioSystems

    时间:2025-09-10

  • IL-1β通过NF-κB (RelA) Ser276/p62介导的线粒体清除通路抑制软骨细胞凋亡的自限性机制研究

    在骨关节炎(OA)的炎症风暴中,白细胞介素-1β(IL-1β)如同双面特工——既推动软骨细胞走向凋亡,又暗中启动自救程序。最新研究揭开了这个分子悖论:当IL-1β激活NF-κB信号通路时,其关键亚基RelA在Ser276和Ser536位点同步磷酸化,犹如开启了两道生物开关。特别有趣的是,MSK1激酶特异地调控Ser276位点,进而指挥细胞"清道夫"p62蛋白标记受损线粒体,通过线粒体自噬(mitophagy)途径将这些"故障发电厂"打包清除。实验显示,缺乏p62的软骨细胞会堆积超氧化物"垃圾",最终崩溃死亡。这项发现揭示了炎症因子自我刹车的精巧机制,为开发靶向MSK1-p62通路的OA治疗策略

    来源:Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

    时间:2025-09-10

  • 大西洋庸鲽(Hippoglossus hippoglossus)中肠残留饲料通过cck1/pyy通路抑制食欲的机制及投喂策略优化研究

    亮点大西洋庸鲽(Hippoglossus hippoglossus)中肠残留饲料通过cck1/pyy信号通路显著抑制食欲,每2-3天投喂策略可优化养殖效益。特定生长率适应期两性生长率均为负值:雌鱼平均SGR -0.16%(SD 0.16),雄鱼-0.11%(SD 0.10)。性别对生长影响显著,第二次采样时(SGR-2)性别差异达峰值,而水箱效应可忽略。生长、性成熟与摄食量试验期间所有组别生长缓慢,适应期(标记至首次采样)多数个体呈现负增长。冬季环境、运输应激和标记操作可能共同导致摄食减少,首次采样时胃内容物普遍偏低。结论在8.5℃养殖条件下,投喂频率(每日/隔日/每三日)对2kg大西洋庸鲽的

    来源:Aquaculture

    时间:2025-09-10

  • 循环水养殖系统(RAS)与海水网箱联合养殖模式下虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)的适应性研究:生长性能与应激调控机制解析

    Highlight【研究亮点】盐度转换在鲑科鱼类养殖中具有关键意义,幼鱼通常在淡水陆基系统中培育,经鲑化(smoltification)后转入海水环境。与必须经历淡水-海水转换的大西洋鲑(Salmo salar)不同,虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)并非必需双环境养殖。然而在芬兰,约90%的成鱼养殖仍采用海水网箱模式(芬兰环境部,2020)。本研究首次系统评估了稳定RAS环境培育的大型虹鳟对波罗的海微咸水(6-7‰)的适应瓶颈。Discussion【讨论】实验数据表明,初始养殖水质参数(RAS与PRAS系统)对转移成功率无显著影响,这与传统认知形成有趣对比。值得注意的是,9月转

    来源:Aquaculture

    时间:2025-09-10

  • 利用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)作为细胞工厂生产抗鱼类传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)亚单位疫苗

    Highlight重组亚单位疫苗因其安全性和有效性备受认可,但其高昂的成本和对先进生产基础设施的依赖带来了巨大挑战。虽然植物合成的疫苗可以在农业规模上廉价生产,但其应用受到转基因作物生产问题和食品供应污染不确定性的阻碍。可食用微藻如莱茵衣藻(C. reinhardtii)为低成本生产重组疫苗提供了一种可行的替代方案。Discussion我们的研究表明,当在黑暗条件下培养时,工程藻株不会积累叶绿素,从而改善了其感官特性。该菌株还具有作物保护特性,当使用亚磷酸盐作为唯一磷源时能够选择性生长。冻干生物质保持了MCP蛋白的完整性,支持其作为口服疫苗的应用潜力。Conclusion本研究成功证明了可食用

    来源:Algal Research

    时间:2025-09-10

  • 靶向组蛋白乙酰化增强栓皮栎体细胞胚胎发生:表观遗传调控在林木再生中的关键作用

    在地中海生态系统中具有重要经济价值的栓皮栎,正面临气候变化和病害导致自然再生困难的严峻挑战。传统繁殖方式受限于长生殖周期和种子活力低下,而体细胞胚胎发生(SE)技术虽能实现大规模繁殖,却在林木这类"顽固性物种"中效率低下。究其根源,体细胞向胚胎态重编程的分子机制尚未明晰,特别是表观遗传调控的关键作用亟待揭示。为破解这一难题,Natalia E. de la Paz团队创新性地将目光投向组蛋白修饰领域。既往研究表明,DNA甲基化和组蛋白甲基化参与SE过程,但组蛋白乙酰化这一可逆修饰在林木中的调控机制仍是空白。研究人员假设:通过调控组蛋白乙酰转移酶(HAT)和去乙酰化酶(HDAC)的平衡,可能打开

    来源:Tree Physiology

    时间:2025-09-10

  • 高山灌木应对干旱与极端温度的策略转变:从获取型到保守型的植物功能性状研究

    这项开创性研究揭示了高山柳(Salix flabellaris)在喜马拉雅山脉气候梯度下的多维适应策略。通过系统分析茎干解剖特征(如导管直径与密度)、小枝形态(包括比茎密度SSD)和叶片经济谱性状(如比叶面积SLA),发现三个独立的生态策略维度:1)茎干解剖呈现水力安全效率(vulnerability segmentation)与导水率(Ks)的经典权衡;2)小枝构建表现出"碳投资-机械支撑"的平衡关系;3)叶片性状沿资源获取-保守连续体分布。研究采用空间替代时间法(space-for-time substitution),沿三个海拔梯度采样发现:中海拔核心种群具有最优性状组合——较宽的导管、

    来源:Annals of Botany

    时间:2025-09-10

  • 摩洛哥野生橄榄树遗传多样性热点与栽培种分化中心:地中海西南缘自然资源的进化历史与管理策略

    在地中海盆地(MB)最西南端的摩洛哥,野生橄榄树(oleaster)与栽培橄榄树(varieties)共同构成了独特的遗传景观。这项研究通过分析25个野生种群共221份样本的核基因组与叶绿体DNA,结合306个地中海栽培品种的已知数据,揭示了令人惊奇的发现:西北部摩洛哥的野生种群不仅保持着与栽培品种相当的遗传多样性,更展现出独特的基因库特征。研究团队鉴定出两种通过种子繁殖的橄榄类型:真正的野生种和栽培区附近的"逃逸种"(feral olives),后者显示出野生与无性繁殖栽培种之间的基因流动证据。特别值得注意的是,西北部种群中占据主导地位的E3母系谱系携带多个特有单倍型,强烈支持该区域作为冰期

    来源:Annals of Botany

    时间:2025-09-10

  • 口腔链球菌群(SAG)肺炎:被低估的社区获得性肺炎病因及其与脓胸的关联研究

    在社区获得性肺炎(CAP)的诊断迷宫中,病原学检测始终是临床难题。尽管现代分子技术不断发展,仍有大量CAP病例的病因无法明确。传统观念认为,口腔链球菌群(Streptococcus anginosus group, SAG)作为正常口腔菌群,其从痰液中检出多被归为"污染"。然而矛盾的是,SAG却是内脏脓肿和脓胸的常见病原体——这种"组织侵袭能力"与"呼吸道无害定植"的生物学特性形成了鲜明对比。正是这种认知鸿沟,促使Rebecca E. Sell和Joshua Fierer团队开展这项开创性研究。研究人员聚焦一个关键临床现象:为何SAG常在脓胸中单独检出,却极少被视为肺炎病原体?通过分析37例S

    来源:Open Forum Infectious Diseases

    时间:2025-09-10

  • 马拉蒂-德拉肯斯堡山脉在南非温带植物区系演化中的关键作用:基于菊科蜡菊属的生物地理历史研究

    在南非这片被誉为"世界植物王国"的土地上,生长着占非洲大陆近一半的植物物种,其中约70%是当地特有。这片神奇的土地被地理学家划分为三个主要区域:沿海平原、雄伟的大陡坡(Great Escarpment)和中央高原。特别是绵延5000公里的大陡坡,形成于冈瓦纳大陆解体之后,像一条巨龙蜿蜒在南非大陆边缘,创造了从干旱西部到湿润东部的显著环境梯度。在这条生态廊道中,海拔3482米的马拉蒂-德拉肯斯堡(Maloti-Drakensberg)地区尤为特殊,它不仅是南非唯一的"高山"区域,更是植物多样性的热点地区。然而,长期以来科学家们对这个地区在植物演化中的确切角色存在诸多疑问:它是如何成为如此多特有物

    来源:South African Journal of Botany

    时间:2025-09-10

  • 基于ISSR标记的极危物种Aloe peglerae遗传多样性评估及其保护意义

    在南非雄伟的Magaliesberg山脉陡峭的石英岩山脊上,生长着一种被称为"红热扑克"的奇特多肉植物——Aloe peglerae。这种植株无茎、叶片呈螺旋状排列的芦荟属植物,目前已被列为南非红皮书中的极危物种(CR A4abd)。令人担忧的是,1999至2010年间其种群数量锐减43%,若不加干预,预计三代内(约90年)将减少80%。这种危机主要源于非法采集交易,加之采矿、过度放牧等人类活动,使得这个仅分布在3445 km2的特有物种面临灭绝风险。更棘手的是,作为主要传粉者的南非岩鸫(Cape Rock Thrush)在种群碎片化环境下访问频率降低,可能导致近交衰退。虽然保护性移植被视为拯

    来源:South African Journal of Botany

    时间:2025-09-10

  • 海藻提取物促进水生植物离体繁殖的突破性研究:以袖珍榕(Anubias barteri var. nana)与红蝴蝶(Alternanthera reineckii)为例

    研究亮点本研究首次揭示红藻(Jania rubens)与褐藻(Cystoseira barbata)提取物作为天然生物刺激素(biostimulants)对水生植物离体繁殖的增效作用,突破传统依赖合成生长调节剂的技术瓶颈。讨论海藻富含宏量元素(Na、K、P)、微量元素(Zn、Fe)、多糖及内源激素(如细胞分裂素cytokinins、生长素auxins),其提取物通过协同调控营养供给与信号通路,显著提升袖珍榕与红蝴蝶的丛生芽增殖率(shoot clusters)、根系发育及叶绿素合成。高浓度提取物(20%)在低MS培养基(1-2 g/L)中仍表现促生效应,暗示其可部分替代化学营养基质。结论海藻提

    来源:South African Journal of Botany

    时间:2025-09-10

  • 低温储存引发的人富血小板血浆光谱变化:基于表面增强拉曼光谱(SERS)的时效性分子标记研究

    Highlight本研究首次系统揭示了人类富血小板血浆在+4℃长期储存过程中的分子光谱演变规律,为血小板相关研究建立了关键时间窗口标准。Results and discussion通过拉曼光谱分析,我们在血小板样本中检测到与蛋白质(1002 cm−1)、脂质(1155 cm−1)、酰胺(1445 cm−1)及氨基酸(1654 cm−1)对应的特征峰。数据显示:• 分子变化始于采样后3小时,呈现持续6周的动态演变• 不同振动模式具有特异性变化轨迹:•蛋白质构象变化最早显现(2小时)•脂质氧化标记在24小时后显著增强• 主成分分析(PCA)证实样本在4小时后出现显著光谱漂移Conclusion研究

    来源:Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy

    时间:2025-09-10

  • 综述:农业管理策略主动促进底土碳储存

    引言0.2 m深度)因其低微生物活性和物理化学保护机制,成为全球碳储存的关键未被充分利用的储库。尽管底土有机碳(SOC)含量较低,但其体积庞大,据估算3 m深度内储存约2344 Gt碳,远超表土(615 Gt)。然而,底土环境存在压实、缺氧、酸度和养分限制等挑战,制约根系发育和碳输入。近年来,通过机械、化学和生物干预促进底土碳封存的研究取得显著进展。机械干预策略秸秆深埋:中国田间试验表明,将秸秆埋于30-40 cm深度可增加底土SOC达60%,同时改善土壤结构和抗旱性。但可能引发厌氧环境导致CH4和N2O排放,且需权衡表土碳损失风险。有机物料深施:粪肥和堆肥深埋可提供缓释养分,但存在硝酸盐淋溶

    来源:Soil and Tillage Research

    时间:2025-09-10

  • 成年黑猩猩多模态交流策略的灵活运用:揭示个体差异与行为可塑性在语言进化中的意义

    在探索人类语言起源的奥秘时,科学家们始终被一个核心问题困扰:我们复杂的交流能力究竟是如何进化而来的?作为人类最近的近亲,黑猩猩的交流系统展现出令人惊讶的灵活性——它们能像人类一样组合使用声音、手势和面部表情,还能根据社交情境调整信号使用策略。然而,过去的研究大多将个体差异视为"噪音",忽视了这种变异可能蕴含的进化意义。发表在《Scientific Reports》的这项研究打破了传统范式,首次将行为生态学中的"行为反应规范"框架引入灵长类交流研究。团队对82只成年黑猩猩(包括动物园和庇护所群体)的6865次交流行为进行编码,创新性地区分了多组分信号(Multicomponent, MC,即同时

    来源:Scientific Reports

    时间:2025-09-10

  • 马铃薯抗病机制研究:链霉菌提取物诱导四种栽培品种对链格孢菌的体外抗性基因表达分析

    研究亮点韦氏链霉菌(S. werraensis) ASC25菌株展现出显著的体外生防潜力,其抗真菌活性能有效抑制链格孢菌(A. alternata)。通过体外添加微生物提取物诱导植物抗性,为植物生物技术和作物改良领域提供了创新思路。这些发现深化了植物-病原体互作机制认知,为开发可持续作物保护策略开辟了新途径。讨论当前,马铃薯微型块茎和体外植株已成为全球种薯生产的基础材料(Wróbel, 2015;Boubaker等, 2023)。为提升种薯质量,本研究创新性地在传统体外生产体系中添加病原体和生防剂提取物,通过分析6个标志基因的表达水平评估抗性诱导效果。结论韦氏链霉菌(S. werraensis

    来源:Plant Gene

    时间:2025-09-10

  • 基于阈值分析的韩国马山湾富营养化动态研究:溶解无机氮(DIN)的主导作用及生态风险评价

    半封闭海湾的富营养化问题日益严峻,由于水体交换受限和持续的营养盐输入,这类区域对生态系统稳定构成重大威胁。韩国马山湾作为典型代表,自1970年代快速城市化以来,长期面临污水排放、工业废水和填海造地带来的环境压力。尽管1993年建成污水处理厂(WWTP)并实施总污染负荷管理系统(TPLMS),但传统指标化学需氧量(COD)在盐水环境中氧化效率低,且无法反映营养盐负荷的生物学效应,导致生态恢复成效难以评估。这凸显了建立整合化学与生物指标的评估框架的迫切性。为破解这一难题,Yejin Kim团队在《Marine Pollution Bulletin》发表研究,创新性地采用阈值分析方法,通过2010-

    来源:Marine Pollution Bulletin

    时间:2025-09-10

  • GAPDH、Hsp90与一氧化氮协同调控亚铁血红素(heme)胞内运输的分子机制及其生理意义

    在真核细胞中,亚铁血红素(heme)作为铁-原卟啉IX复合物,是血红蛋白、细胞色素P450(CYP)等关键蛋白的必需辅基。然而长期以来,heme如何从线粒体合成部位定向运输至胞质靶蛋白的机制存在重大知识空白。更令人困惑的是,非红细胞中大多数hemeprotein(血红素蛋白)如肌红蛋白(Mb)、色氨酸双加氧酶(TDO)等普遍存在heme未饱和现象,提示细胞存在精细的heme分配调控系统。Dennis J. Stuehr团队通过二十年研究,首次解析了这一生命过程的核心机制。研究人员发现细胞通过"三重调控"实现heme精准分配:线粒体膜转运蛋白FLVCR1b与TANGO2协作输出heme;糖酵解酶

    来源:Journal of Inorganic Biochemistry

    时间:2025-09-10

  • 定义培养基揭示脂质清除在支持癌细胞增殖中的关键作用

    在生物医学研究中,胎牛血清(FBS)如同细胞培养的"神秘配方",虽然被广泛使用,但其促进细胞增殖的具体机制却长期笼罩在迷雾中。这种成分复杂的添加剂不仅存在批次差异影响实验可重复性,还可能引入动物病原体,更关键的是——作为胎儿来源的血清,它是否真正模拟了人类疾病微环境?这些悬而未决的问题促使Fred Hutchinson癌症研究中心的Oliver J. Newsom团队开展这项揭开血清功能奥秘的研究。研究人员创新性地结合活细胞成像和液相色谱-质谱(LC-MS)技术,构建了动态监测系统。使用核定位红色荧光蛋白标记的H1299非小细胞肺癌细胞(H1299 NucRFP)实时追踪增殖,同时通过定量脂质

    来源:Journal of Biomechanics

    时间:2025-09-10


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