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健康人群与克罗恩病患者粪便中17种链球菌基因组测序及比较基因组分析
研究人员从健康人群和克罗恩病患者的粪便及活检样本中培养细菌,在37°C厌氧条件下使用含5%绵羊血的胰蛋白酶大豆琼脂(TSS)培养基进行培养。通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)鉴定为瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)的菌落,在脑心浸液培养基(BHI)中扩大培养后,使用Qiagen Genomic-tip 100/G提取DNA,并通过Megaruptor 3系统进行35个循环的片段化处理。采用PacBio Sequel IIe平台进行30小时长读长测序,分别使用Flye(2.9.2版)和metaFlye进行基因组组装。通过Contig注释工具(CAT)分类,
来源:Microbiology Resource Announcements
时间:2025-08-12
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强脉冲光(IPL)疗法改善接触镜不适症状及体征的临床疗效研究
在当代社会,约1.5亿人佩戴接触镜,其中半数饱受接触镜不适(Contact Lens Discomfort, CLD)困扰,25%患者最终因此放弃使用。这种由接触镜与眼表微环境失衡引发的症状,不仅降低佩戴时间,更严重影响生活质量。传统治疗方法如热敷、人工泪液等效果有限且依从性差,亟需创新解决方案。新南威尔士大学医学院视光与视觉科学学院的研究团队在《Contact Lens and Anterior Eye》发表突破性研究,首次系统评估强脉冲光(Intense Pulsed Light, IPL)治疗CLD的长期疗效。这项前瞻性随机双盲试验采用M22 IPL系统,对36眼进行干预,发现两次治疗即
来源:Contact Lens and Anterior Eye
时间:2025-08-12
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不规则角膜患者巩膜镜验配优化:算法验光与传统验光及追加验光的对比研究
Highlight这项研究揭示了算法验光在角膜不规则患者中的临床应用价值,为巩膜镜验配提供了创新性解决方案。研究设计采用交叉对照研究设计,比较19例不规则角膜患者在裸眼状态和配戴巩膜镜(SL)时,传统验光与Vision-R 800算法验光的差异。所有测量均遵循赫尔辛基宣言伦理标准。折射数据表2显示了两组验光方法的球镜等效值(M)和散光分量(J0、J45)数据。未配戴SL时,球镜差异达-0.80±1.20 D(p=0.001);配戴SL后差异为-1.04±0.93 D(p=0.001)。高低对比视力(HCVA/LCVA)在两种方法间无统计学差异。讨论波前像差技术为临床验光带来革新,但传统主观验光
来源:Contact Lens and Anterior Eye
时间:2025-08-12
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面向智能数据分析的机器可读元数据模型GeMeDaFi:自动化预处理与知识发现新范式
Highlight元数据(Metadata)作为"数据的数据",在知识发现(KDD)与人工智能(AI)流程中具有基石作用。传统研究多聚焦于元数据存储工具开发,却忽视其对自动化高级KDD流程的支撑能力。本文突破性提出GeMeDaFi方法论,使非技术利益相关者能自动生成机器可读元数据文件,彻底改变依赖人工创建的现状。Variable types变量类型体系突破传统二分法:• 数值型变量(Numerical Variable):测量个体特征的离散/连续量• 分类型变量(Categorical Variable):含S种模态D = {m1,...,mS}的定性变量,细分为名义型、序数型与李克特量表(L
来源:Cognitive Systems Research
时间:2025-08-12
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肝脏疾病中IL-6/IL-22信号通路的计算模型构建与功能解析
肝脏作为人体重要的代谢和免疫器官,其疾病机制研究一直是医学领域的重点。在众多肝病相关因子中,白细胞介素6(IL-6)和白细胞介素22(IL-22)这对"双面因子"尤为特殊——它们既能促进肝脏再生,又会加剧炎症反应。这种矛盾行为使得相关药物开发陷入两难:临床数据显示,酒精性肝炎患者使用IL-22药物F-652后肝功能明显改善,但肝癌患者中IL-22却可能加速肿瘤进展。更复杂的是,这两种细胞因子共享部分信号通路元件,却通过不同的受体组合发挥作用,这种错综复杂的调控网络至今未能完全破解。德国法兰克福大学分子生物信息学组(Goethe University Frankfurt, Molecular B
来源:BioSystems
时间:2025-08-12
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离子电扩散与电突触耦合在心脏电动力学中的协同作用机制研究
心脏如同精密的生物电泵,数万亿心肌细胞需要通过精确的电信号同步收缩。传统理论认为,细胞间的缝隙连接(Gap Junctions, GJs)是电信号传递的唯一"高速公路",但在基因敲除GJs的小鼠心脏中,科学家们意外发现电信号仍能以"乡间小路"的方式缓慢传导。这个现象引出了心脏电生理学的重大谜题:是否存在不依赖GJs的"备用电报系统"?美国普渡大学数学系(Purdue University, Department of Mathematics)的Ning Wei和Yoichiro Mori团队在《Biophysical Journal》发表的研究,揭开了这个谜题的关键部分。他们发现,当心肌细胞紧
来源:Biophysical Journal
时间:2025-08-12
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长期低氧胁迫下大西洋鲑(Salmo salar)的行为与生理适应机制及其对摄食生长的影响
在全球水产养殖业快速发展的背景下,大西洋鲑(Salmo salar)作为重要经济鱼种,其养殖过程常面临溶解氧(DO)波动的挑战。随着气候变化加剧和水体富营养化,养殖网箱中的低氧事件频发,而鲑鱼作为高耗氧物种对缺氧尤为敏感。现有研究多聚焦于小规格鱼种,对1公斤以上成鱼的长期低氧适应机制认知不足,这直接关系到养殖效益和动物福利。挪威海洋研究所(Institute of Marine Research, IMR)的研究团队在《Aquaculture》发表的最新研究中,通过为期107天的对照实验,系统评估了不同DO水平(50%、60% vs 90%)对海水阶段大西洋鲑的影响。研究采用三重复循环水系统,
来源:Aquaculture
时间:2025-08-12
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"求偶舞蹈与鸣唱的协同演化:伞鸟科鸟类杂交预测的多模态信号研究"
在热带雨林的树冠层中,伞鸟科(Pipridae)鸟类以其绚丽的羽毛和复杂的求偶仪式闻名。这些鸟类通过精心编排的舞蹈配合独特的鸣唱吸引配偶,形成了动物行为学中著名的多模态信号系统。然而,这种华丽的求偶展示背后隐藏着一个进化谜题:为何部分亲缘关系较近的物种会发生杂交,而其他物种却能保持生殖隔离?这个问题的答案对理解物种形成和行为隔离机制至关重要。荷兰瓦赫宁根大学(Wageningen University & Research)野生动物生态与保护系的研究人员Arjen A.W. van der Kamp和Jente Ottenburghs在《Biological Journal of th
来源:Biological Journal of the Linnean Society
时间:2025-08-12
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欧洲山杨氮素吸收与代谢的分子机制解析:基因家族动态表达与木材形成的关联研究
氮素作为植物生长发育的关键营养元素,其利用效率直接影响森林生态系统的生产力。然而,木本植物中氮素吸收、转运与木材形成的分子关联仍存在显著认知空白。瑞典农业科学大学森林遗传与植物生理系(Umeå Plant Science Centre, Swedish University of Agricultural Sciences)的研究团队在《Tree Physiology》发表的最新研究,通过多组学整合分析揭示了欧洲山杨氮代谢的遗传调控框架。研究首先鉴定了14个氮素相关基因家族的214个成员,包括硝酸盐转运蛋白(NRT1/NPF、NRT2、NRT3)、铵转运蛋白(AMT)、氨基酸转运蛋白(AAP/
来源:Tree Physiology
时间:2025-08-12
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杨树杂交种'52-225'与美洲黑杨'D-124'的耐涝性差异机制:生理代谢与分子调控网络的整合分析
在气候变化加剧的背景下,洪涝灾害已成为威胁陆地植物生存的重要非生物胁迫。作为河岸带关键树种,杨树(Populus)的耐涝性差异直接影响其生态分布与经济价值。然而,不同基因型杨树应对缺氧胁迫的协同调控机制尚不明确,这限制了耐涝品种的定向选育。美国橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)生物科学部的Tao Yao等研究人员在《Tree Physiology》发表研究,通过整合生理表型、代谢组学和基因表达分析,系统比较了美洲黑杨(P. deltoides)‘D-124’与北美黑杨杂交种(P. trichocarpa × P. deltoides)‘52-225’
来源:Tree Physiology
时间:2025-08-12
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infomeasure:面向复杂系统信息理论分析的全能Python工具包
在当今数据驱动的科学研究中,信息理论已成为分析复杂系统的核心工具。从分子生物学到宇宙学,从金融系统到神经网络,科学家们越来越依赖熵(Entropy)、互信息(MI)和传递熵(TE)等指标来量化信息流动和系统组织模式。然而,这些理论工具的实际应用长期面临四大障碍:计算复杂度高、软件工具碎片化、实现不一致导致的可重复性问题,以及缺乏统一的评估标准。这些问题严重制约了信息理论方法在真实世界研究中的广泛应用。针对这些挑战,研究人员开发了infomeasure这一综合性Python软件包。该工具包创新性地整合了多种信息理论度量和估计算法,为复杂系统分析提供了统一的计算框架。infomeasure支持从基
来源:Scientific Reports
时间:2025-08-12
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甘油醛-3-磷酸脱氢酶促进鸡滑液支原体在下呼吸道的定殖机制研究
鸡滑液支原体(M. synoviae)是家禽业的重要病原体,可引发呼吸道疾病和关节炎,造成巨大经济损失。目前使用的减毒活疫苗MS-H是通过化学诱变野生型7NS株获得,但其减毒机制尚未完全阐明。前期基因组比较发现MS-H在gapdh、obgE和oppF基因存在突变,其中obgE和oppF的作用已有研究,但gapdh突变的功能影响仍是未解之谜。墨尔本大学亚太动物健康中心的研究团队在《Veterinary Microbiology》发表最新研究,通过构建携带野生型gapdh的MS-H互补株(MS-H + gapdh),系统评估了该基因对疫苗生物学特性的影响。研究采用基因重组技术构建互补质粒,通过SP
来源:Veterinary Microbiology
时间:2025-08-12
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机器学习揭示肾移植后新发HLA特异性抗体形成的术前关键因素
Highlight本研究通过机器学习揭示了肾移植后新发HLA特异性抗体的关键术前预测因子,为改善移植预后提供了量化决策工具。Results在460例肾移植患者队列中,115例(25%)出现新发HLA特异性抗体,其中36例(31%)为供体特异性抗体(dnDSA)。XGBoost模型表现最优(未使用SMOTE时F1值0.54-0.59,使用后提升至0.72-0.79)。单变量分析显示显著预测因子包括:术前HLA抗体(p<0.001)、移植次数(p<0.001)、冷缺血时间(CIT)(p=0.02)、女性(p=0.01)、年轻患者(p=0.03)、HLA错配(p=0.01)、氨基酸错配(
来源:Transplant Immunology
时间:2025-08-12
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黑叶茜草提取物缓解黄曲霉毒素B1对肉鸡生长、免疫及氧化应激的毒性作用
Highlight黑叶茜草提取物(PNLE)显著改善AFB1暴露肉鸡的相对生长率(RGR)和胴体品质,其机制涉及:抗氧化防御:提升过氧化氢酶活性,降低脂质/蛋白质氧化损伤;免疫增强:逆转AFB1对IgG/IgM/IgA的抑制,促进免疫稳态;炎症调控:抑制促炎因子(IL-6、TNF-α)风暴,恢复干扰素-γ(IFN-γ)平衡;代谢保护:修复三碘甲状腺原氨酸(T3)和瘦素水平,降低Hsp70应激标志。DiscussionAFB1通过诱发氧化应激和免疫抑制导致肉鸡生长性能下降,而PNLE中黄酮类和多酚成分通过直接清除自由基、调控NF-κB通路发挥保护作用。剂量效应显示,2 g/L PNLE组效果最优
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莽山原矛头蝮蛇毒酶活性与血液毒性机制研究:凝血级联反应的关键靶点解析
在亚洲毒蛇研究领域,莽山原矛头蝮(Protobothrops mangshanensis)因其独特的生态地位和日益频发的宠物贸易相关咬伤事件备受关注。这种体长超过2米的中国特有剧毒蛇种,其咬伤病例常表现为局部组织坏死和严重凝血功能障碍,但 venom(蛇毒)的作用机制长期缺乏系统研究。随着该物种在爬宠市场的走红,临床治疗面临严峻挑战——现有抗蛇毒血清针对性不足,亟需从分子层面破解其致病机理。德国吉森大学(Justus Liebig University Giessen)的研究团队在《Toxicon》发表的最新研究,首次通过多维度体外实验揭示了莽山原矛头蝮蛇毒的"分子武器库"。研究人员采用荧光底
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磺酰亚胺中苯乙烯消除机制研究:哈米特分析、动力学同位素效应与计算化学证据
在有机合成化学领域,含硫化合物的精准构建一直是研究热点,其中N-酰基磺酰胺(N-acylsulfenamides)作为重要中间体,其合成效率与机理理解直接影响药物开发和材料科学进展。然而,这类化合物通过磺酰亚胺(sulfilimines)中间体消除苯乙烯(styrene)的详细机制尚不明确,制约了反应体系的优化设计。针对这一科学问题,美国耶鲁大学化学系(Yale University, Department of Chemistry)的Shivani Patel、Jonathan A. Ellman等研究人员开展了一项多角度机理研究。团队通过系统设计S-芳基和S-苯乙基双位点取代基的哈米特分析
来源:Ticks and Tick-borne Diseases
时间:2025-08-12
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南非小麦锈病分子监测:病原变异与防控策略研究
小麦作为全球主要粮食作物,其生产长期受到三种锈病的严重威胁——由Puccinia triticina(Pt)引起的叶锈病、P. graminis f. sp. tritic(Pgt)导致的秆锈病,以及P. striiformis f. sp. tritici(Pst)引发的条锈病。这些真菌病害不仅造成产量损失,还显著影响籽粒品质。在南非,小麦是仅次于玉米的第二大主食作物,但2023/2024年度仍需进口近200万吨才能满足国内需求。更严峻的是,最新研究表明五种小麦真菌病害在撒哈拉以南非洲可导致高达8.5%的产量损失。面对这一挑战,传统依赖抗性基因(R基因)的防治策略正遭遇瓶颈——病原菌通过突变
来源:South African Journal of Botany
时间:2025-08-12
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H3K27me3介导的TET1表观遗传调控在子宫内膜异位症不孕患者在位内膜中的作用机制研究
子宫内膜异位症是困扰育龄女性的常见疾病,约10%女性受其影响,其中30-50%伴随不孕问题。这种疾病最令人困惑的是:为什么看似正常的"在位内膜"(eutopic endometrium)却会导致不孕?近年研究发现,表观遗传调控异常可能是关键因素。TET1作为DNA主动去甲基化的"分子擦除器",其表达异常与子宫内膜异位症不孕密切相关。但一个悬而未决的问题是:是什么"关闭"了TET1的表达开关?波兰波兹南医科大学(Poznan University of Medical Sciences)生殖医学系的Magdalena Adamczyk团队将目光投向了组蛋白修饰标志物H3K27me3——这个被称为
来源:Scientific Reports
时间:2025-08-12
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DMDmdx大鼠模型的骨骼肌转录组学分析揭示杜氏肌营养不良症的关键病理机制与治疗靶点
杜氏肌营养不良症(Duchenne muscular dystrophy, DMD)是一种致命的X连锁遗传病,由Dmd基因突变导致肌纤维结构蛋白dystrophin缺失,引发进行性肌肉退化和早逝。尽管mdx小鼠模型广泛用于研究,但其病理表现与人类差异显著,亟需更接近人类疾病特征的动物模型。为此,波兰华沙生命科学大学(Warsaw University of Life Sciences, Poland)与法国南特大学(Nantes Université, France)的研究团队利用DMDmdx大鼠模型,通过多组学分析揭示了骨骼肌退化的分子机制,相关成果发表于《Scientific Report
来源:Scientific Reports
时间:2025-08-12
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C57BL/6小鼠海马CA2b区锥体细胞类型的渐进式转变及其突触连接特征研究
海马CA2区作为社会记忆的关键枢纽,其细胞组成与连接特性长期存在争议。传统观点认为CA2神经元以"无苔藓纤维输入"和"无棘状突起(thorny excrescences, TE)"为特征,但分子标记技术重新定义了CA2边界,将部分原CA3a区域纳入新划分的CA2b亚区。这一变化引发核心问题:CA2b区神经元究竟如何与苔藓纤维互动?其细胞组成是否存在过渡特征?来自德国歌德大学医院(Goethe-University Hospital Frankfurt)的Meike Fellenz团队通过系统研究,在《Scientific Reports》发表重要发现。研究采用固定脑片离子电泳染色结合PCP4免
来源:Scientific Reports
时间:2025-08-12