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树根的进化可能导致了物种的大规模灭绝
科学家们在格陵兰岛东部的Ymer岛收集岩石样本,这是对泥盆纪湖底化学组成进行深入分析的几个地点之一。 IUPUI的科学家和英国的同事领导的一项研究表明,在3亿多年前的泥盆纪时期,树根的进化可能引发了一系列的大规模灭绝,震动了地球的海洋。关于地球史前时期异常动荡的新观点的证据发表在《美国地质学会公报》上,这是地质学领域最古老、最受尊敬的出版物之一。这项研究是由Gabriel Filippelli领导的,他是IUPUI理学院地球科学的首席教授,马修·斯玛特是他实验室的博士生,当时他正在进行这项研究。Filip
来源:Geological Society of America Bulletin
时间:2022-11-11
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Cell发布基本基因的功能格局!人类细胞存活所需的5000多个基因的功能
怀特黑德研究所、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的一组科学家使用一种新颖的、集合的、基于图像的筛选方法,系统地评估了5000多个人类基本基因的功能。他们的分析利用CRISPR/Cas9敲除基因活性,形成了一种前所未有的资源,可以通过空间和时间分辨率了解和可视化细胞过程中广泛的基因功能。该团队的研究结果发表在《细胞》杂志上,涵盖了超过3100万个单个细胞,包括数百个不同参数的定量数据,使预测基因如何工作和共同运作成为可能。“在我的整个职业生涯中,我一直想知道当一个重要基因的功能被消除时,细胞会发生什么,”该研究的资深作者、怀特黑德研究所Iain Cheeseman说。“现在,我们可以做到这一点
来源:broad institute
时间:2022-11-10
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“吃骨头”的肺结核病
结核病通常是一种肺部疾病,但在美国2%的病例中,它也可以在骨骼中发现。一些有9000年历史的埃及木乃伊的骨骼显示出感染结核病的迹象,这种痛苦的情况使骨头看起来像被啃过一样。因此,当杜克大学的内科医生Jason Stout在2000年代中期遇到威克县的肺结核疫情时,这是一个奇怪的谜题,当时有6人的感染扩散到了肺部以外。“六分之四在骨头里,”Stout说。“这远远超过2%。”索引病例是罗利市(Raleigh)第一个感染这种菌株的人,他显然是在越南感染了这种细菌,但他并不觉得很不舒服,而且一直在他的工作场所与400多人打交道。杜克大学医学教授Stout说:“所以这是在工作场所长时间接触的结果。”他通
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PacBio SMRT HiFi和Omni-C染色体捕获 揭开美丽珍珠背后的分子指纹
图片:珍珠牡蛎壳中的珍珠。珍珠贝在日本是一种重要的产品,因为它们能生产出漂亮的珍珠,被用来制作项链、耳环和戒指。 图片来源 MIKIMOTO株式会社,珍珠研究所双十一到了,年底也快到了,你奖励自己或者送给爱人的礼品清单中有没有这种具有迷人光泽的有机珠宝——珍珠?akoya珍珠具有更晶莹锐利更镜面效果的独特光泽、相对大溪地和南洋珠更可亲的价格,是许多爱美人士的心头好。为了能养殖出更美丽、更高产量的珍珠,科研人员正在做出重要贡献。珍珠贝是一种重要的养殖动物,在过去的20年里因为疾病和赤潮
来源:DNA Research
时间:2022-11-10
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创新分子显微镜追踪乳腺癌扩散
新技术可以追踪到哪些乳腺癌细胞群对疾病的传播负责,并首次强调癌细胞的位置可能与肿瘤生长的突变一样重要。该方法是由来自威康桑格研究所、EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)、德国癌症研究中心(Deutsches Krebsforschungszentrum, DKFZ)、瑞典生命科学实验室及其合作者的团队发明的。它可以用来帮助解答癌症领域的一些重大问题,比如为什么有些癌细胞会扩散,抗药性是如何形成的,以及为什么有些疗法会失败。这项新研究今天(2022年11月9日)发表在《NATURE》杂志上,它结合癌细胞的遗传信息、周围的细胞类型以及它们如何随时间与环境相互作用,展示了现在如何可能绘
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Nature:结肠癌复发相关细胞的鉴定
大肠癌类器官,经过编辑,在上皮膜蛋白1 (Emp1)高表达的细胞中表达tdTomato报告基因,被植入小鼠盲肠产生原发肿瘤。几周后,我们切片整个肝脏,并染色tdTomato(红色)和E-Cadherin(灰色),以寻找转移启动细胞。在图中可以观察到CRC播散性肿瘤细胞如何表达高水平的Emp1,这是我们所描述的高复发细胞(HRC)群体的标记基因。结肠癌是世界上第三大常见癌症,每年约有200万新发病例。大多数患者在肿瘤还位于结肠或直肠时就被诊断出来了。这些肿瘤通过手术切除,在许多情况下,通过化疗来防止复发。然而,20%到35%的患者,癌症会以其他重要器官转移的形式再次出现。这是由手术时残留的肿瘤细
来源:IRB Barcelona
时间:2022-11-10
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科学家在线虫体内发现一个意外基因,挑战了细胞核结构理论
左图是一种活的野生型秀丽隐杆线虫的核仁的超分辨率图像,显示了内部凝析物的良好组织结构。右图中,当一种新发现的编码基因NUCL-1在突变线虫中被破坏时,结构就会崩溃。与人们对核仁亚结构功能的一些认识相反,野生型和突变型线虫都是健康的,发育正常,并保持生育能力。 图片来源:MDI生物实验室的Emily Spaulding博士核仁素Nucleolin与人类神经退行性疾病和癌症有关。但这项新发现挑战了最近关于细胞核内部结构在这种疾病中可能扮演的角色的理论,并为研究Nucleolin的功能以及它如何导致疾病提供了一
来源:Nature Communications
时间:2022-11-10
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DNA条形码揭示癌细胞逃避免疫系统防御的能力
每条彩色丝带代表一个DNA条形码。随着肿瘤的发展,一些癌细胞开始主导肿瘤,如橙色和红色丝带所示。这表明,这些癌细胞已经有了逃离免疫系统的能力,甚至在治疗后也能继续生长。使用DNA通过条形码来追踪癌细胞的时间,科学家们表明,癌症细胞有不同的能力逃脱免疫系统的防御。根据加文医学研究所的一项新的科学研究,一些癌细胞可以利用平行机制来规避免疫系统的防御,并抵抗免疫疗法的治疗。研究人员发现,乳腺癌细胞能够通过抑制杀伤T细胞的作用和阻碍免疫系统标记肿瘤细胞进行破坏的能力来复制和转移。第一作者Louise Baldwin说,她是Alex Swarbrick教授的博士生:“我们知道,乳腺癌通常对免疫疗法反应不
来源:Nature Communications
时间:2022-11-10
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生物体细胞的数量靠什么控制呢?
如果T细胞的密度达到上限,细胞死亡就开始了。 巴塞尔大学(University of Basel)的研究人员发现了一种细胞内在机制,它控制机体中适当数量的T细胞,从而确保免疫系统正常运转。在黏菌中也发现了这种机制,表明这种细胞密度的调节在进化上是保守的。我们的免疫系统由多种细胞组成,它负责控制病毒、细菌、寄生虫的攻击,同时也防止癌细胞的发生。我们体内有数十亿个这样的免疫细胞,包括T淋巴细胞,简称T细胞。T细胞在骨髓中产生,在胸腺中被选择,对我们免疫系统的正常运作至关重要。虽然在任何时候都需要有足够的T细胞
来源:Science Signaling
时间:2022-11-10
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单克隆抗体保护脑干细胞
当给予一种新的单克隆抗体治疗时,人神经干细胞移植(绿色)存活并在小鼠大脑(蓝色)中迁移。 &nbs
来源:University of Michigan
时间:2022-11-10
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个性化的基因组测序使罕见病的诊断率翻一番
英国伦敦大学学院(UCL)的研究人员近日在《Nature Communications》杂志上发文称,针对个体患者来定制全基因组测序分析可以使罕见病的诊断率翻一番。2018年,英国卫生部宣布了一项NHS基因组医学服务,允许罕见病患者读取他们的整个遗传密码,以便提供急需的诊断。然而,对这些数据的解释可能颇具挑战性。许多患有复杂而罕见的遗传病的人至今仍没有得到分子答案。伦敦大学学院的研究人员希望为此类患者提供更好的诊断。为此,他们测试了如何通过由专科医生、生物信息学家和科学家组成的基因组医学团队来提高NHS诊断实验室的能力,而不仅仅是依靠标准的半自动数据分析。研究团队重新评估了未确诊的病例,以便找
来源:Nature Communications
时间:2022-11-10
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严重的压力事件会加重长COVID的症状(新冠后遗症)
一项新的研究发现,爱人的死亡、经济或粮食不安全,或新出现的残疾是COVID-19住院患者一年后是否会出现长时间COVID-19症状的最有力预测因素。该研究的作者说,由纽约大学格罗斯曼医学院的研究人员领导的这项研究发现,有这种“主要生活压力源”的成年患者——超过50%的随访患者存在这种压力源——与抑郁、脑雾、疲劳、睡眠问题和其他长期COVID-19症状作抗争的可能性至少是其他患者的两倍。本周发表在《神经科学杂志》(JNS)在线版上的这项分析还证实了传统因素对更大的长时间COVID风险的影响,正如过去的研究所显示的那样——年龄较大、残疾程度以及COVID-19首发病例的严重程度。“我们的研究是独特
来源:Journal of the Neurological Sciences
时间:2022-11-10
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eLife:基因相互作用可以将肠道肿瘤分类
这种新的肠癌分类方法将有助于人们对这种疾病的了解,并可能最终被医生用于精准医疗——帮助他们为个别患者量身定制最佳治疗方案。“目前,疾病分期被用于指导肠癌患者的临床管理,但这是不够的,因为在相似阶段的肿瘤之间可能存在显著差异,”第一作者、郑州大学第一附属医院的吕枣曲(音译)解释说。“更详细的肠癌分子分类更有效,但它仍然是基于肿瘤内某个时间点的基因活性水平的快照(例如,在活组织检查时),并没有反映基因活性的变化动态以及基因之间如何相互作用。”相比之下,生物相互作用网络——即基因之间通常相互作用的图谱——无论何时都保持相对稳定,并且可以更可靠地描述组织。此外,基因相互作用在正常组织中高度保守,但在疾
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Nature Methods:识别全基因组测序研究中的罕见遗传变异
印第安纳大学医学院的一组研究人员开发了专门的生物信息学软件,旨在识别全基因组测序研究中的罕见遗传变异。生物统计学和健康数据科学助理教授Zilin Li博士是最近发表在《自然方法》杂志上的第一作者和共同通讯作者,该杂志详细介绍了使用STAARpipeline的变体-关联测试框架。“尽管有上亿的罕见基因变异,但它们的研究一直具有挑战性,因为没有方便的、可扩展的和健壮的管道来进行全面的罕见变异分析,这需要对变异集而不是单个变异进行评估,”Li说。STAARpipeline允许研究人员评估一系列罕见的非编码遗传变异,这将有助于基因研究。非编码遗传变异是基因组中不编码氨基酸的部分,氨基酸是结合形成蛋白质
来源:Nature Methods
时间:2022-11-10
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癌细胞凭什么在人体内扩散?
宾厄姆顿大学和纽约州立大学的教师共同撰写的一项新研究为癌细胞如何扩散提供了进一步的见解。几十年来,弄清楚为什么癌症肿瘤会在人体内形成一直是科学家们的目标,但了解癌细胞是如何扩散的也是对抗这种通常致命的疾病的关键。癌症运动的渗透发动机模型表明,受限制的细胞通过在前缘吸收水分并从后部排出,从而产生推进力。然而,调控这些细胞后缩的确切分子仍然难以捉摸。发表在《Nature Communications》杂志上的一项新研究(“极化NHE1和SWELL1调节迁移方向、效率和转移”)回答了关于细胞运动的问题,为未来癌症治疗提供了更多的步骤。今年秋天加入宾汉姆顿大学工程与应用科学学院生物医学工程系的助理教授
来源:Nature Communications
时间:2022-11-10
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Cell Reports文章解析HIV-1如何躲过免疫系统
根据世界卫生组织的统计,截至2021年底,全球有超过3,800万人感染了人类免疫缺陷病毒(HIV-1)。这是一种逆转录病毒,可引起人类细胞的免疫功能缺陷,导致各种机会性感染和肿瘤发生。为了开发针对HIV-1的疫苗,许多实验室都在研究如何产生抗体。考虑到在体内难以引发广谱中和抗体,非中和抗体(nnAb)便成为一种替代选择。非中和抗体代表HIV-1感染者血浆内的大多数抗体,很容易通过疫苗接种引发。今天,数以百万计的HIV-1感染者携带非中和抗体。尽管如此,这种疾病仍然难以根除。如果抗体如此有效,那么它们为什么似乎不起作用?加拿大蒙特利尔大学领导的一项新研究首次表明,在人源化小鼠中,病毒蛋白Vpu的
来源:Cell Reports
时间:2022-11-10
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“蛋白质饥饿”导致暴饮暴食和肥胖
研究证实加工食品是肥胖增加的关键一项大规模人口研究显示,“蛋白质饥饿”会导致暴饮暴食。一项为期一年的对9341名澳大利亚人饮食习惯的研究表明,越来越多的证据表明,精加工和精炼食品是西方国家肥胖率上升的主要原因。这项新研究基于澳大利亚统计局(ABS)进行的一项全国营养和体育活动调查,进一步支持了“蛋白质杠杆假说”。这项研究由悉尼大学的查尔斯·帕金斯中心(CPC)进行,并发表在最新一期的《Obesity》杂志上。蛋白质杠杆假说于2005年由劳本海默教授和斯蒂芬·辛普森教授首次提出,该假说认为,人们过量摄入脂肪和碳水化合物是因为身体对
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新发现一种能预测男性长期健康的重要激素
科学家们发现了一种激素的重要作用,这种激素在男性的青春期产生,可以早期预测他们在以后的生活中是否会患上某些疾病。诺丁汉大学的研究人员发现,这种名为INSL3的新型胰岛素样肽激素在很长一段时间内保持一致,是预测年龄相关疾病的重要早期生物标志物。他们的最新发现将于今天(11月8日)发表在《Frontiers in Endocrinology》杂志上。 INSL3是由睾丸中产生睾酮的同一细胞产生的,但与睾酮在人的一生中波动不同,INSL3是始终如一的,在青春期的水平在人的一生中基本保持不变,到老年时只略有下降。与其他可测量参数相比,这使其成为第一个
来源:Frontiers in Endocrinology
时间:2022-11-10
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对专家的信任、媒体素养与COVID-19疫苗意愿有关
一项调查发现,受访者接受COVID-19疫苗的意愿更多地与他们的媒体素养和对卫生专家的看法有关,而不是与病毒知识或以前的接种行为有关。在发表在《美国健康促进杂志》上的这项研究中,华盛顿州立大学的研究人员还发现,对于最近拒绝接种流感疫苗的受访者来说,COVID-19知识的提高实际上与未来接种疫苗的意愿较低相关。在这项研究中,研究人员对1264名美国成年人进行了在线调查。研究结果表明,人们进行的是所谓的动机推理:人们有意识地、有选择地使用事实来得出结论,从而强化他们想要的信念,而不是理性地分析证据的心理过程。这种过程受到了不断变化的新闻环境的严重影响。这是一个信息的迷宫,包含了错误信息——无意的不
来源:Washington State University
时间:2022-11-10
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美国公园管理人警告说:请不要舔迷幻蟾蜍
索诺兰沙漠蟾蜍,也叫科罗拉多河蟾蜍,生活在美国西南部和墨西哥西北部。美国公园的管理人员要求游客停止舔有迷幻作用的蟾蜍,并警告说,任何试图从这种长满疣的两栖动物身上获得致幻快感的人更有可能最终患上重病。上周,美国国家公园管理局在社交媒体上发布了警告信息,禁止人们舔索诺兰沙漠的蟾蜍,这是《辛普森一家》(The Simpsons)和《恶搞之家》(Family Guy)等热门动画电视节目长期以来描绘的行为。公园管理人员说:“正如我们对你在国家公园里遇到的大多数东西所说的那样,无论是香蕉蛞蝓、
来源:medical Xpress
时间:2022-11-10