• 大麻品种鉴定的突破：基于最小SNP分型面板的开发与验证

  随着加拿大2018年大麻合法化政策的实施，市场对高精度品种鉴定技术的需求急剧增长。传统的大麻品种命名体系存在严重混乱——所谓"籼稻型"(indica)和"粳稻型"(sativa)的分类缺乏遗传学依据，而商品名更是无法反映真实的遗传背景或代谢物特征。更棘手的是，大麻作为曾经的违禁作物，长期缺乏规范的育种记录，导致同名品种可能具有完全不同的遗传特征。这种混乱不仅影响消费者体验，更阻碍了药用大麻的标准化进程。Université de Moncton的研究团队在《BMC Genomics》发表的研究中，开发了一套革命性的分子鉴定系统。他们采用全基因组测序结合靶向SNP分型技术，首次建立可区分32个大

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 日本鳗鲡雌雄性腺全长转录组解析：解锁生殖奥秘，助力产业发展

  日本鳗鲡是一种广泛分布于西太平洋的重要经济鱼类，深受人们喜爱。然而，它的人工繁殖却面临着重重困难。由于对其生殖生物学的了解有限，目前人工繁殖技术难以取得突破，幼鱼主要依赖野生捕捞。但过度捕捞和栖息地破坏导致野生鳗鲡资源急剧减少，严重威胁着鳗鱼产业的可持续发展。因此，深入探究日本鳗鲡的生殖生物学机制迫在眉睫。集美大学的研究人员为了揭开日本鳗鲡生殖的神秘面纱，开展了一项极具意义的研究。他们结合 PacBio Iso-Seq 和 Illumina RNA-Seq 技术，对日本鳗鲡雌雄性腺进行了全长转录组分析。该研究成果发表在《BMC Genomics》上，为我们理解日本鳗鲡的生殖过程提供了重要线索。

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 解析假拉拉藤属叶绿体基因组：为植物系统发育与分类学研究带来新曙光

  在植物的奇妙世界里，分类与进化一直是科学家们探索的重要课题。假拉拉藤属（Pseudogalium）作为一个独特的存在，在植物界中有着特殊的地位。它是一个新的单型属，在中国有两个亚种，日本有一个亚种 ，在茜草族中占据着独特的系统发育位置，具有重要的生态意义。然而，以往对假拉拉藤属的研究存在诸多不足。早期主要基于形态特征进行分类，把它归为拉拉藤属（Galium）。后来虽有分子系统学研究提出它应独立成属，但样本有限，且未深入探讨属内关系，其叶绿体基因组也未得到充分研究。为了填补这些知识空白，来自云南师范大学生命科学学院、广西植物研究所和云南师范大学地理学部的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 杏仁与野生矮扁桃AP2/ERF基因家族的全基因组鉴定及冷冻胁迫响应机制研究

  在植物应对环境胁迫的复杂调控网络中，AP2/ERF（APETALA2/乙烯响应因子）转录因子家族扮演着关键角色。作为植物最大的转录因子家族之一，它们如同交响乐团的指挥，协调着生长、发育和逆境响应的基因表达。然而，在蔷薇科重要经济作物杏仁中，这个"分子指挥家"家族的特性却鲜为人知。更令人担忧的是，中国新疆杏仁产区常遭遇-25℃极端低温，导致大面积冻害，而近缘种野生矮扁桃却能耐受-20℃环境，这种抗寒性差异背后的分子机制一直是个未解之谜。新疆农业大学园艺学院的张冬冬、曾斌等研究人员在《BMC Genomics》发表的研究，首次对'万丰'杏仁和'裕民'野生矮扁桃的AP2/ERF家族进行了全基因组尺度

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 转录组与激素代谢组联合解析：核桃芽萌发调控机制的深度挖掘

  全球气候变化的大背景下，晚春寒霜（LSFs）的发生愈发频繁，这给农业和林业带来了不小的挑战。对于核桃这种广泛种植的重要油料树种而言，在叶片长出、开花以及果实发育的早期阶段，它特别容易受到晚春寒霜的侵害，进而导致产量和品质下降。所以，深入探究核桃芽休眠、萌发以及发育的调控机制，对于制定应对晚春寒霜的策略和培育抗寒品种至关重要。山西农业大学的研究人员针对这一问题展开研究，他们以早萌的雌性先熟核桃品种 W13 为研究对象，通过转录组和激素代谢组分析，对核桃芽的休眠、萌发、抽芽和展叶这四个关键发育阶段进行深入探究。该研究成果发表在《BMC Genomics》上，为全面理解核桃芽萌发和发育机制奠定了重要

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 羊闭锁卵泡卵母细胞转录组与卵泡液蛋白质组：解锁卵母细胞退化机制的密码

  在哺乳动物的生殖世界里，卵巢如同一个神秘的 “魔法盒子”，卵泡则是其中的 “魔法精灵”，它们的发育状况直接影响着雌性的生育能力。在卵泡的发育旅程中，大多数卵泡会经历一种被称为闭锁（follicular atresia）的退化过程，只有少数幸运儿能走向成熟和排卵。然而，长期以来，卵母细胞在这个退化过程中的分子变化机制，以及卵泡闭锁的关键蛋白标记，就像隐藏在重重迷雾中的谜题，让科研人员困惑不已。对于羊等家畜而言，了解卵泡闭锁机制和卵母细胞质量调控更是关乎畜牧业的发展。因为优质的卵母细胞是提高家畜繁殖效率、培育优良品种的关键，所以揭开这些谜题迫在眉睫。为了攻克这些难题，内蒙古农业大学的研究人员勇挑重

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 揭秘褐飞虱卵巢发育奥秘：海藻糖酶抑制的转录组与代谢组学解析

  褐飞虱，这个水稻田里的 “大反派”，一直让农民们头疼不已。它不仅吸食水稻汁液，破坏水稻组织，还是传播水稻病毒的 “帮凶”，每年都给全球水稻生产带来巨大损失。以往，人们主要依靠化学杀虫剂来对付它，可时间一长，褐飞虱产生了抗药性，让防治工作愈发艰难。所以，寻找新的环保有效的防治方法迫在眉睫。杭州师范大学等研究机构的研究人员挺身而出，开展了一项极具意义的研究。他们聚焦于海藻糖酶（TRE）对褐飞虱繁殖的影响机制，通过对比转录组学和代谢组学分析，深入探究 TRE 抑制后褐飞虱卵巢的变化。最终发现，抑制 TRE 表达会改变卵巢的营养和能量代谢，进而影响褐飞虱的繁殖能力。这一发现为农业害虫防治提供了全新的思

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 云南松 WOX 基因家族全转录组鉴定及特征分析：解锁植物生长发育的遗传密码

  在神奇的植物世界里，植物的生长发育就像一部精密运转的机器，每个环节都至关重要。而 WUSCHEL 相关同源盒（WOX）基因家族，作为植物生长发育的 “幕后操控者”，对干细胞调控、植物再生和生长起着关键作用。在拟南芥、玉米等被子植物中，WOX 基因的功能已被广泛研究，可在针叶树这类裸子植物中，人们对它的了解却十分有限。云南松（Pinus yunnanensis）是我国西南地区极具经济和生态价值的主要造林针叶树，它适应性强、生长旺盛，为当地生态系统稳定贡献巨大。为了填补对针叶树中 WOX 基因功能认知的空白，西南林业大学的研究人员开展了一项重要研究。他们对云南松 WOX 基因家族进行深入探究，旨在

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 蓝莓BBX基因家族在不同染色体倍性水平及果实发育和胁迫响应中的鉴定与功能研究

  蓝莓作为富含花青素的高价值经济作物，其果实色泽和抗逆性直接影响商品价值。然而，调控这些性状的关键转录因子B-box（BBX）家族在蓝莓中的系统研究尚属空白。浙江农林大学的研究团队在《BMC Genomics》发表的研究，首次揭示了BBX基因家族在蓝莓中的进化规律与功能特性。研究采用生物信息学与实验验证相结合的策略。通过全基因组扫描从四倍体蓝莓（Vaccinium corymbosum）和二倍体蓝莓（V. darrowii）中分别鉴定出83个VcBBX和24个VdBBX基因，运用MCScanX分析基因复制事件，基于STRING数据库构建蛋白互作网络，结合PlantCare预测启动子顺式元件。实验

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 果园草 ARF 转录因子全基因组分析：DgARF7 在抗旱中的正向调控作用及研究意义

  在植物的生长历程中，从胚胎的孕育到衰老的落幕，生长素（auxin）始终扮演着极为重要的角色，它不仅参与植物生长发育的各个阶段，还在植物应对环境压力时发挥关键作用。其中，生长素响应因子（Auxin Response Factor，ARF）作为一类重要的转录因子，在生长素信号传导、细胞形态建成以及植物对环境的抵抗能力等方面都有着不可或缺的作用 。在众多植物中，果园草（Dactylis glomerata）是一种具有重要经济价值的牧草，广泛种植于世界各地，对畜牧业发展和生态环境修复意义重大。然而，令人遗憾的是，目前对于果园草中 ARF 基因家族的全基因组信息以及功能特性的了解却十分有限。随着全球气候

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 深度学习赋能5′ UTR高效发现与设计：UTR-Insight模型突破mRNA治疗瓶颈

  在mRNA疗法开发中，5′非翻译区(5′ UTR)如同基因表达的"调控开关"，直接影响mRNA稳定性和翻译效率。传统疗法常采用人α-珠蛋白基因(hHBA)的5′ UTR，但越来越多的证据表明，这种"一刀切"的策略可能导致某些细胞类型中蛋白表达不理想。更棘手的是，实验筛选方法通量低、成本高，而现有计算模型又面临序列长度限制、长程依赖捕捉不足等瓶颈，严重制约了mRNA药物的个性化开发。针对这一系列挑战，研究人员开发了革命性的UTR-Insight模型。该模型巧妙融合预训练语言模型的深度表征能力与CNN-Transformer架构的多尺度特征捕捉优势，创新性地引入帧池化技术突破序列长度限制。在技术实

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 探秘牛空肠 RNA 世界：揭开副结核病感染分子机制的神秘面纱

  在畜牧业的广阔天地里，副结核病（JD）就像一个隐匿的 “杀手”，悄然威胁着众多反刍动物的健康。它由牛分枝杆菌副结核亚种（MAP）感染引发，是一种慢性肠道疾病。患病动物会出现腹泻、体重减轻等症状，严重时甚至死亡。目前，针对 JD 既没有有效的治疗方法，疫苗的效果也存在争议。不过，遗传选育抗病动物为攻克这一难题带来了希望。在此背景下，中国农业大学的研究人员开展了一项极具意义的研究，相关成果发表在《BMC Genomics》上。研究人员采用了 RNA 测序（RNA-seq）和小 RNA 测序（sRNA-seq）技术。他们从北京三元奶牛场中心挑选了 9 头荷斯坦奶牛，分为健康、亚临床和临床感染三组，每

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 中国人群中与 4 型裂手裂足畸形相关的罕见 TP63 变异的分子特征：揭示 p63-Dlx 信号通路的关键作用

  在生命的奇妙画卷中，肢体畸形是一块令人揪心的 “瑕疵”，裂手裂足畸形（Split-hand/foot malformation，SHFM）便是其中之一。SHFM 表现为手部和 / 或足部中央射线的缺失或发育不全，给患者的生活带来诸多不便。目前，虽然染色体微阵列分析在产前诊断中广泛应用，但仍有近半数相关病例无法明确病因，这使得遗传诊断面临巨大挑战。为了深入探究 SHFM 的遗传奥秘，泉州妇幼保健院、福建医科大学附属第二医院等机构的研究人员开展了一项意义重大的研究，相关成果发表于《BMC Genomics》杂志。研究人员主要采用了核型分析、染色体微阵列分析（Chromosomal microarr

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 探寻策勒羊黑毛遗传密码：多组学解析关键基因与育种价值

  在动物的世界里，毛色不仅仅是一种外在的装饰，它对动物的生存和繁衍有着至关重要的意义。就拿羊来说，不同颜色的羊毛在功能上存在差异，其中黑毛不仅能有效防止羊受到紫外线的伤害，避免 DNA 受损，还能抵御真菌的感染，甚至对羊的生殖性能也有积极影响。然而，在现代养羊业中，虽然羊的毛色丰富多样，但对于羊毛颜色遗传机制的了解还十分有限，尤其是像策勒羊这种中国优良羔皮羊，其羊毛颜色的遗传密码亟待破解。为了填补这一知识空白，塔里木大学动物科学技术学院等机构的研究人员开展了一项深入研究，相关成果发表在《BMC Genomics》杂志上134。研究人员主要运用了以下几种关键技术方法：首先，采集 123 只 1 -

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• MHC基因对猪睾丸中连锁嗅觉受体基因遗传多样性及表达的影响机制研究

  在动物繁殖领域，一个长期存在的谜题是：为何个体会偏好与主要组织相容性复合体(MHC)基因型不同的配偶？这种"MHC介导的交配选择"现象在多个物种中被观察到，但其分子机制仍不清楚。有趣的是，在基因组中，大量嗅觉受体(OR)基因与MHC基因紧密连锁，这些OR在睾丸和精子中异常活跃，暗示着它们可能在繁殖过程中扮演着特殊角色。韩国建国大学(Department of Stem Cell and Regenerative Biotechnology, Konkuk University)的Mingue Kang等研究人员在《BMC Genomics》发表的研究，通过创新的分子遗传学方法，揭示了MHC基因

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 温度胁迫下牙鲆(Paralichthys olivaceus)基因表达分析中内参基因的转录组学鉴定与评估

  在气候变化加剧的背景下，水温波动已成为威胁水产养殖业的关键环境因素。作为东亚地区重要的经济鱼种，牙鲆(Paralichthys olivaceus)在养殖过程中常遭遇夏季高温和冬季低温胁迫，导致生理机能紊乱甚至大规模死亡。虽然定量实时PCR(qRT-PCR)是研究鱼类应激反应基因表达的金标准，但长期以来研究者们习惯性地沿用哺乳动物研究的传统内参基因如β-肌动蛋白(actb)和18S核糖体RNA(18S RNA)，这些基因在鱼类温度应激条件下已被证实存在表达波动，可能导致数据偏差。更棘手的是，目前牙鲆温度应激研究缺乏系统性的内参基因筛选，严重制约了相关分子机制研究的可靠性。针对这一科学瓶颈，宁波

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 自噬参与生物防治剂 GC16 对葛氏叶螨毒性的分子机制解析 —— 基于转录组和蛋白质组学研究

  在农业生产的大舞台上，葛氏叶螨（Tetranychus pueraricola）可谓是个 “大反派”。它广泛分布于中国和日本，严重威胁着当地农业，尤其是给中国西南地区的农作物带来了巨大的经济损失。为了对付这个 “害虫”，化学农药曾是常用手段，然而长期使用化学农药导致叶螨产生抗药性，还对农业生态系统和人类健康造成危害。因此，开发新型生态杀螨剂迫在眉睫。GC16 作为一种新型环保农药，由 55% 卵磷脂（大豆提取物）和 45% 氯化钙（CaCl2）组成，在控制叶螨、蓟马和粉虱方面展现出一定潜力，目前正在中国 15 个省份进行田间试验。尽管此前研究探索了 GC16 对葛氏叶螨的杀螨活性和生理机制，但

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 新型玫瑰噬菌体 vB_DshS - R26L：海洋生态中噬菌体与宿主相互作用的新探索

  在广袤的海洋世界里，微生物如同隐藏的神秘力量，默默地影响着整个生态系统的平衡。玫瑰杆菌属（Roseobacter clade）细菌便是其中重要的一环，它们广泛分布于海洋环境，积极参与碳、硫和氮的生物地球化学循环，是海洋生态系统的关键参与者。然而，与玫瑰杆菌紧密相关的玫瑰噬菌体（roseophage），却如同迷雾中的神秘身影，一直未被人类完全了解。尽管已知玫瑰噬菌体在调节微生物群落和生物地球化学过程中发挥着重要作用，但已被分离和深入研究的玫瑰噬菌体数量极为有限，这极大地限制了人们对它们生物学和生态意义的认知，以及对噬菌体与玫瑰杆菌之间相互作用的理解。为了揭开玫瑰噬菌体的神秘面纱，深入探索噬菌体与

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-02-10

• 解析枝顶孢属菌株基因组：解锁生物防治真菌的遗传密码

  在微生物的奇妙世界里，有一种名为枝顶孢属（Clonostachys）的真菌，它们虽然个头微小，却有着巨大的能量。许多研究发现，枝顶孢属真菌是对抗多种植物真菌病原体的有效生物制剂，就像植物健康的 “保护神”。比如，玫瑰粘帚霉（Clonostachys rosea）和绿粘帚霉（C. chloroleuca）能有效抑制镰刀菌属（Fusarium species）、核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum）和灰葡萄孢（Botrytis cinerea）引发的植物病害。而且，这些真菌还能产生具有多种生物活性的次生代谢产物，在医药和农业领域有着潜在应用。然而，目前人们对枝顶孢属真菌生物防治

  来源：BMC Genomic Data

  时间：2025-02-10

• CDK1 调控中期 II 卵母细胞 DNA 双链断裂修复的代谢机制研究及其意义

  在生命的繁衍过程中，卵母细胞的质量至关重要，它就像一颗孕育生命的 “种子” 。然而，在卵母细胞成熟的过程中，DNA 双链断裂（DSBs）这一 “捣乱分子” 却时常出现。DSBs 就像是 DNA 链条上的断裂口，如果不能及时、准确地修复，就可能降低卵母细胞的质量，甚至引发基因突变，影响后代的健康。目前，虽然已知真核细胞核 DNA 双链断裂主要通过同源定向修复（HDR）和非同源末端连接（NHEJ）等途径进行修复，但在卵母细胞这个特殊的 “小世界” 里，DSBs 如何修复，哪些因素会影响其修复过程，仍是未解之谜。而且，在体外培养卵母细胞时，不同的培养基是否会对 DSB 修复产生影响，也有待研究。为了

  来源：BMC Biology

  时间：2025-02-10

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