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  • 口腔-肠道微生物富集评分:基于22,710例宏基因组的大规模荟萃分析揭示其与宿主健康及疾病的关联

    在我们身体的每一个角落,都存在着一个肉眼看不见的微观宇宙——人类微生物组。这个由数万亿细菌、病毒和真菌组成的复杂生态系统,尤其是肠道微生物组,被誉为人类的"第二大脑",与我们的健康息息相关。然而,当我们试图解读这个微观宇宙的奥秘时,却面临着巨大的挑战:不同研究的数据如同散落的拼图碎片,缺乏统一的标准和处理方法,使得我们难以窥见全貌。正是为了解决这一难题,由Paolo Manghi和Giacomo Antonello共同领导的研究团队在《Nature Communications》上发表了他们的最新成果。他们开发了curatedMetagenomicData (cMD) 3,这是一个经过精心整理

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-24

  • 基于实验数据,对木材与替代生物质颗粒原料在分散式供热系统中的从摇篮到坟墓的生命周期评估进行比较

    ### 拉脱维亚生物质燃料环境影响的系统性评估与启示#### 一、研究背景与核心问题当前全球能源结构转型背景下,生物质燃料作为替代化石能源的重要选项,其环境效益受到广泛关注。木屑颗粒虽占据市场主导地位,但其对森林资源的依赖性引发生态保护与能源供给的矛盾。本研究聚焦拉脱维亚这一区域,通过生命周期评估(LCA)方法,系统比较木屑颗粒与其他非木生物质(如啤酒糟、向日葵壳、大麻等)的环境影响,旨在为区域能源政策制定提供科学依据。研究选择1兆瓦热能产出的生命周期作为功能单元,覆盖从生物质采集到燃烧排放的全流程。通过实验获取的关键数据包括原料含水率、颗粒压缩性能、锅炉热效率等,突破传统数据库依赖的局限,使

    来源:Biomass and Bioenergy

    时间:2025-12-24

  • 综述:迈向微生物光电化学生物传感器的旅程:利用光合生物实现下一代环境监测技术

    近年来,随着全球环境问题日益严峻,研发高效、低成本的实时监测系统成为研究热点。微生物光电化学生物传感器(mPEB)通过整合光合微生物的电化学响应机制,展现出在环境污染物检测中的独特优势。这类系统利用光合细菌将光能转化为电能,同时通过代谢活动对污染物产生特异性响应,形成自供电的监测装置,特别适用于电力供应困难的偏远地区。### 一、技术原理与发展背景光合微生物通过光能驱动电子传递链,在细胞膜内外形成电位差。当环境中的污染物(如除草剂)与光合系统中的电子传递载体(如细胞色素、质子载体)结合时,会改变电子传递效率,从而影响电极间的电流信号。这种信号变化可作为污染物的间接指标,实现无标记检测。相较于传

    来源:Bioelectrochemistry

    时间:2025-12-24

  • 极端环境驱动微生物基因组特征趋同:跨域最大分化微生物的k-mer特征研究

    在地球上最严酷的环境中,存在着一类被称为“极端微生物”的生命形式,它们能够在高温、高酸、高辐射等极限条件下繁衍生息。这些微生物不仅是生命适应能力的奇迹,更是研究环境压力驱动基因组演化的天然实验室。然而,一个长期困扰科学家的问题是:当来自完全不同进化谱系的微生物面临相似的环境压力时,它们的基因组是否会展现出趋同的适应特征?这种环境驱动的基因组特征是否能够超越传统的分类学界限?近日发表在《NAR Genomics and Bioinformatics》上的研究给出了令人振奋的答案。由Monireh Safari领衔的研究团队开发了一套创新的计算生物学方法,发现极端环境压力确实能够在最大分类差异的微

    来源:NAR Genomics and Bioinformatics

    时间:2025-12-24

  • 线粒体重塑和代谢重编程驱动了嗜热四膜虫(Tetrahymena thermophila)对长期盐度的适应

    本文通过系统性的多组学分析和长期实验进化,揭示了淡水原生动物Tetrahymena thermophila对慢性盐胁迫的适应性机制。研究采用为期三年的定向选择实验,在逐步升高的NaCl浓度(4-12 g/L)下培育出三个适应株系(ST-4、ST-8、ST-12),并运用转录组、蛋白质组和代谢组学技术,解析了其独特的生存策略。**盐胁迫适应性核心机制**1. **脂质动态平衡与膜结构重塑** 适应株系通过START2蛋白介导的脂滴动态调控实现膜稳定性。实验发现,ST-4和ST-8的脂滴密度较野生型(WT)增加1.7倍,而ST-12因更高盐耐受性,脂滴体积缩小但数目保持稳定。RNA干扰实验

    来源:mSystems

    时间:2025-12-24

  • 关于一种多功能深海甲烷氧化菌的基因组学研究:该菌类构成了巴西碳酸盐丘群落中独特的微生物生态系统

    本研究聚焦于深海碳酸盐环境中甲烷氧化菌的生态功能与基因组适应性。通过整合高通量测序技术与靶向培养策略,科研团队在巴西圣保罗湾Alpha Crucis碳酸盐斜坡区域发现了甲烷氧化菌新物种*Methylotuvimicrobium crucis*,并揭示了其独特的生态适应机制。该物种基因组显示出对高压低温环境的强适应能力,同时具备多代谢通路的冗余设计,为理解深海微生物生态位分化提供了新视角。在研究方法上,科研人员构建了48个富集培养体系(24个好氧/24个厌氧),通过分阶段梯度培养维持微生物活性。宏基因组测序数据显示,目标培养体系中的甲烷氧化菌丰度较原位测序提升3-5倍,证实传统16S rRNA测

    来源:mSystems

    时间:2025-12-24

  • 基于全表观基因组的介导分析发现了胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(Cytosine-phosphate-Guanine,CPG)位点,这些位点将环境因素与糖尿病相关指标联系了起来

    本文聚焦于表观遗传机制在非遗传因素与糖尿病之间的中介作用,通过整合台湾生物库(TWB)的2366名中年人群数据,系统性地解析了DNA甲基化(DNAm)在BMI、年龄、性别、吸烟、饮酒、教育程度和运动习惯等环境因素与糖尿病指标(空腹血糖FG、糖化血红蛋白HbA1c)之间的传导路径。研究采用高维度中介假设检验(HDMT)结合多中介模型筛选,最终识别出8个具有生物学意义的甲基化位点,这些发现为理解环境因素通过表观遗传调控影响糖尿病风险提供了新的视角。### 研究背景与核心问题糖尿病已成为全球最常见的代谢性疾病,其发病机制涉及遗传与环境因素的交互作用。传统研究多关注遗传变异的影响,而表观遗传学机制(如

    来源:Epigenomics

    时间:2025-12-24

  • 阴道链球菌(Streptococcus vaginalis)通过氧化应激诱导内质网未折叠蛋白应答(endoplasmic reticulum unfolded protein response,ERUPR)的激活,影响宫颈癌细胞的细胞动力学

    研究团队通过系统分析韩国女性阴道菌群中新型链球菌属成员S. vaginalis的功能特性,揭示了该菌种在宫颈癌发生发展中的潜在调控机制。研究采用多组学整合策略,结合宏基因组测序、全基因组分析以及体外细胞实验,首次完整解析了S. vaginalis对宫颈癌细胞的作用路径。研究发现,该菌种在韩国女性中检出率达27%,作为优势链球菌属仅次于乳杆菌科,其独特的代谢模式和免疫调控机制可能为宫颈癌防治提供新靶点。在菌群结构分析方面,研究团队对301例韩国女性阴道样本进行系统分类,确认乳杆菌科仍保持主导地位(50%样本),但值得注意的是,链球菌科作为第二大菌群占比达18.3%。特别值得关注的是新发现的S.

    来源:Microbiological Research

    时间:2025-12-24

  • 热响应性、按需释放的粘合剂以及贴合组织形态的水凝胶电极:用于器官修复与脑机接口技术

    本文报道了一种新型多功能的导电水凝胶材料(PAAL),通过动态共价键与物理相互作用结合,解决了植入式生物电子设备在潮湿组织表面的粘附难题。该材料在生物医学工程领域展现出突破性应用潜力,以下从技术突破、性能优势、应用场景三个维度进行详细解读。### 一、技术突破与材料创新1. **动态共价键网络构建** PAAL水凝胶通过聚丙烯酸(PAA)与聚α-脂酸(PLA)-NHS的动态共价键形成双重网络结构。其中,PAA的羧基与组织表面的极性基团(如羟基、氨基)形成氢键,而PLA-NHS的活性酯基团在湿环境下通过亲核取代反应与组织蛋白的巯基结合,构建了物理-化学复合锚定机制。这种设计不仅实现了秒级

    来源:Materials Today Bio

    时间:2025-12-24

  • 宏基因组分析与以基因组为中心的研究揭示了与奶酪相关的细菌和真菌中的铁吸收系统

    本文聚焦奶酪微生物群落中铁获取系统的多样性及其生态学意义。研究团队通过整合元基因组测序与基因组学分析,系统解析了法国原产地保护奶酪中细菌和真菌的铁载体合成、转运及吸收机制,揭示了不同奶酪类型(如硬质熟成奶酪、蓝纹霉菌奶酪等)和微生物类群(放线菌门、变形菌门、子囊菌门等)在铁代谢策略上的显著差异。研究涉及136份奶酪元基因组数据、1105个细菌MAGs和158个真菌MAGs,构建了包含185个隐马尔可夫模型(HMM)的功能数据库,涵盖铁载体合成、转运及铁直接吸收等关键通路。### 核心发现解读**1. 表面铁获取系统的生态位分化** 研究发现奶酪表面(rind)与内部核心(core)微生物的铁

    来源:Environmental Microbiology

    时间:2025-12-24

  • 粉煤灰施用对泥炭土中玉米(Zea mays)重金属和养分浸出及吸收的影响

    印尼混合飞灰在红树林酸性土壤中改良应用及环境安全研究摘要解读本研究针对印尼电力行业年产生约1300万吨飞灰的处置难题,通过 greenhouse实验系统评估了混合飞灰(MFA)对红树林土壤重金属迁移和作物生长的综合影响。研究发现,当MFA施用量达到105克/盆时,玉米产量较对照组提升96.3克/盆,增幅达88%,同时所有重金属浓度均控制在安全阈值内。该研究为符合新规的飞灰资源化利用提供了科学依据,证实MFA在改善酸性红树林土壤肥力方面具有显著效果。1. 研究背景与意义印尼作为东南亚最大能源消费国,2020年电力行业产生飞灰量达1300万吨级。新实施的政府法规(No.22/2021)将飞灰重新归

    来源:Heliyon

    时间:2025-12-24

  • 将机器学习模型与地面传感器相结合,以提高德克萨斯州农业生态系统中土壤湿度的预测精度

    土壤湿度预测的集成模型研究:方法创新与跨生态系统性能比较1. 研究背景与科学价值土壤湿度作为连接大气-植被-土壤的纽带参数,在农业管理和水资源配置中具有关键作用。传统方法依赖经验公式或单一传感器数据,存在时空分辨率不足、模型泛化能力弱等问题。随着遥感技术和机器学习的发展,构建多源数据融合的预测模型成为研究热点。本研究聚焦美国得克萨斯州草原农业生态系统,通过对比机器学习与深度学习模型,系统评估不同管理条件下的预测效能,为精准农业提供技术支撑。2. 多维度数据融合方法研究团队创新性地整合了三类核心数据源:(1)部署在42个作物小区和21个牧草区的126个TEROS传感器(2023-2024赛季),

    来源:Computers and Electronics in Agriculture

    时间:2025-12-24

  • 用于生菜水分状况监测的集成传感与通信技术

    本文针对设施农业中作物水分监测的痛点问题,提出了一种基于集成感知与通信(ISAC)技术的非接触式解决方案。研究团队通过重新定义现有3GHz通信链路的物理层功能,在不改变硬件架构和频段配置的前提下,实现了对生菜相对含水量(RWC)的连续监测,同时确保通信质量符合工业标准。在技术实现层面,创新性地构建了"通信-感知"双模协同机制。系统通过实时采集经过植物组织后的电磁波幅度和相位扰动特征,建立水分状态与信号参数的物理映射模型。这种设计突破了传统传感器依赖接触式部署的局限,采用分布式通信节点即可完成整行作物的监测覆盖。实验表明,该方法在保证误码率(BER)低于10^-4、信噪比(SNR)约20dB的通

    来源:Computers and Electronics in Agriculture

    时间:2025-12-24

  • 一种用于从复杂森林场景中提取单棵树木的3D点云实例分割网络

    森林点云三维实例分割技术研究进展与创新实践森林资源数字化管理对林业生态保护和可持续经营具有重要意义。当前主流的LiDAR三维激光扫描技术能够获取森林三维点云数据,但其中的复杂植被结构给目标识别带来严峻挑战。针对传统分割方法存在的漏检、误检和边界模糊等问题,本研究通过构建多模态特征融合框架和自适应聚类机制,实现了森林树木个体的高精度分割。该技术体系在三个关键维度实现突破创新:首先建立了覆盖五大森林生态系统的标准数据集,其次研发了动态特征增强网络架构,最后开发了基于树干基准点的自适应聚类算法。复杂森林场景的感知难题主要体现在三个层面:1)高密度植被造成的点云冗余与噪声干扰,2)异质树木形态导致的特

    来源:Computers and Electronics in Agriculture

    时间:2025-12-24

  • 醛类的结构多样性决定了其对类固醇5α-还原酶1的抑制机制是共价抑制还是非共价抑制:物种特异性差异及初步的结构-活性关系

    陈俊英|齐书芳|林子健|方浩楠|张普田|李婉瑜|葛仁山|王毅艳温州市医科大学第二附属医院及育英儿童医院麻醉与围手术医学科,中国浙江省温州市325027摘要类固醇5α-还原酶1型(SRD5A1)在神经类固醇生物合成中起着关键作用,环境化学物质对其的抑制可能会扰乱大脑功能。本研究通过微粒体酶测定、表面等离子体共振(SPR)结合实验、细胞实验和计算分析,系统评估了13种结构不同的醛类物质对人类和大鼠SRD5A1活性的抑制作用。三种醛类物质显著抑制了人类SRD5A1的活性:邻苯二甲醛(OPA,IC50 = 2.74 μM)、苯甲醛(BEA,IC50 = 45.97 μM)和肉桂醛(CNA,IC50 =

    来源:Chemico-Biological Interactions

    时间:2025-12-24

  • 日本鳗鲡北部边界分布的热限制:土地利用与地质学的关联及其对气候变化响应的启示

    在广阔的海洋中,许多鱼类拥有复杂而神奇的生命周期,它们的一生如同一场跨越不同生态系统的漫长旅程。对于像日本鳗鲡(Anguilla japonica)这样的物种而言,其生命早期阶段(如柳叶状幼体)会随洋流漂浮扩散,完成长达数月的海洋之旅,随后才进入河流等沿岸环境生长成熟。长期以来,科学家们认为洋流运输等“浮游期因素”是决定这类鱼类分布范围的关键。然而,在幼体成功抵达海岸并进入河流之后,哪些“后浮游期因素”决定了它们能否在特定河流中生存和繁衍,从而塑造了其最终的地理分布格局?这个问题至今仍笼罩在迷雾之中,尤其在其分布区的北部边缘地带,这种认知的缺乏限制了我们准确预测物种如何响应全球变化的能力。日本

    来源:PNAS Nexus

    时间:2025-12-24

  • 海洋洞穴生态系统中的化能合成作用:揭示光照区黑暗生境中微生物群落的功能分化与初级生产新机制

    在广袤的海洋中,光合作用长期以来被认为是驱动初级生产的主要过程。然而,近年来科学家们逐渐认识到,一种更为古老的代谢方式——化能合成(chemosynthesis),即微生物利用无机化合物的化学能而非光能来固定二氧化碳并合成有机质,在海洋生态系统中扮演着比以往认知更为重要的角色。尽管在光照充足的海洋表层,化能合成通常处于从属地位,但在光照区内的无光栖息地(如海洋洞穴、裂隙)中,其生态功能却鲜为人知。这些独特的界面环境,连接着海岸带海洋与地下环境,因其取样困难而成为微生物生态学研究中的空白地带。为了深入探究这一科学问题,由Francesco Ricci和Chris Greening领导的研究团队选

    来源:The ISME Journal

    时间:2025-12-24

  • 道路扩建风险预示着未来热带森林砍伐的热点地区

    本研究针对全球热带雨林地区道路扩张的驱动机制及其环境影响展开系统性分析,提出了一套具有普适性的道路扩张风险预测模型。研究覆盖亚马逊流域、刚果盆地及亚太岛国三大热带森林核心区,整合了1370万公顷的1公顷分辨率道路数据,通过多变量统计建模揭示了道路建设与生物物理环境、社会经济因素之间的深层关联。研究团队创新性地构建了三维分析框架:首先基于地理加权回归(GWR)和空间自回归(SAR)技术处理区域异质性,其次采用随机森林算法筛选出20个关键预测因子,最后通过转移学习(transfer learning)方法建立跨区域的泛化模型。模型验证显示,在刚果盆地、亚马逊流域和亚太地区,道路扩张风险指数的预测准

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-12-24

  • 全球废水处理厂中Candidatus Accumulibacter的基因组多样性、代谢适应与生态分布研究

    在全球水资源短缺与富营养化问题日益严峻的背景下,生物除磷技术成为废水处理的关键环节。其中,Candidatus Accumulibacter(暂定名 Accumulibacter)作为强化生物除磷(EBPR)过程的核心功能菌群,通过聚磷酸盐(poly-P)的厌氧-好氧转化实现磷的高效去除。然而,传统研究依赖ppk1基因和16S rRNA基因的扩增子测序,存在引物偏好性导致的多样性低估问题,且其代谢异质性、生态适应机制与病毒防御策略尚未系统揭示。为此,研究团队通过全球尺度宏基因组分析,首次构建了覆盖六大洲废水处理厂(WWTPs)的Accumulibacter基因组资源库,旨在解析其进化轨迹与生态

    来源:The ISME Journal

    时间:2025-12-24

  • 综述:在欧洲,100%纯果汁的消费及其在可持续饮食中的融入对环境的影响

    ### 100%纯果汁的环境影响与健康效益分析#### 摘要解读当前研究普遍支持适量饮用100%纯果汁(FJ)对健康和环保的积极意义。虽然果汁生产存在环境压力,但其对促进水果消费、补充营养的独特作用使其成为可持续饮食的重要选项。研究指出,FJ在碳足迹和水足迹中的占比显著低于肉类及谷物产品,同时其维生素、矿物质和植物化学物的营养价值有助于降低慢性病风险。然而,果汁消费需控制在合理范围,避免过量摄入游离糖带来的健康隐患。#### 核心发现与结论1. **健康价值与营养贡献** FJ是补充膳食纤维、维生素C、钾等营养素的有效途径。研究显示,每日摄入约70-100克FJ可帮助达到"每日五份蔬果

    来源:International Journal of Food Sciences and Nutrition

    时间:2025-12-24


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