• Monod：通过将随机转录动态模型拟合到单细胞测序数据中，实现基于模型的发现与整合

  摘要单细胞RNA测序分析旨在揭示细胞多样性并理解细胞功能背后的转录机制。这些数据集规模庞大、噪声较多且结构复杂。目前的分析方法侧重于去除噪声和降维处理，以应对这些挑战并提取生物学信息。我们提出了一种不同的、基于物理原理的方法，利用这些数据的随机性、多样性和多模态特性，明确区分其生物学和技术层面的特征，同时揭示潜在的调控过程。通过Python软件包Monod，我们展示了如何将大多数已发表数据集中存在的新生RNA和成熟RNA计数结果有效地整合到生物物理学转录模型中。通过分析这些数据的多模态变化，我们可以识别出仅通过平均基因表达变化无法发现的转录调控现象，定量比较基因调控的机制假说，在统一框架内分析

  来源：Nature Methods

  时间：2025-11-09

• 针对寄生虫的B细胞能够捕获空间上相互关联的抗原，从而获得T细胞的辅助作用

  本研究探讨了B细胞如何从大型病原体中获取抗原并将其呈递给T细胞，从而支持体液免疫反应。长期以来，科学家们对B细胞如何处理大型病原体的抗原，尤其是寄生虫类病原体，了解有限。与小蛋白或病毒不同，大型病原体如疟疾原虫（*Plasmodium*）含有大量基因，生成了广泛的抗原多样性，这使得免疫系统面临更大的挑战。本文通过使用疟疾孢子虫（*Plasmodium berghei*）孢子虫（SPZs）作为模型，研究了B细胞在获取和处理这些大型病原体抗原方面的作用机制。在实验中，研究人员利用了Ighg2A10 B细胞受体敲入小鼠，这些小鼠的B细胞对疟疾原虫表面的*Plasmodium falciparum*环

  来源：Science Immunology

  时间：2025-11-09

• 哺乳动物前定型血管-造血细胞谱系的特征分析

  编辑总结在哺乳动物胚胎发育过程中，有三波不同的造血活动产生了支持胚胎发育的血细胞。此外，内皮细胞也与造血细胞同步发育，但这些发育途径及其相互关系尚未完全明了。Lazarov等人通过在小鼠中进行的时间序列谱系追踪研究，发现了一类中胚层的Cxcr4+前体细胞，这类细胞能够生成头部的血管、前定型造血细胞以及出生后的组织巨噬细胞，但无法参与原始造血或定型造血过程。人类诱导多能干细胞培养中也存在类似的一类血管-造血前体细胞，这些细胞中CXCR4的表达表明它们倾向于向RUNX1依赖性的前定型造血-内皮细胞方向分化。这些发现进一步明确了早期哺乳动物发育过程中造血-内皮细胞的谱系特征。——Claire Oli

  来源：Science Immunology

  时间：2025-11-09

• TH17细胞转化为exTH17细胞后，仍能引发类似类风湿性关节炎的、不依赖于IL-17的炎症性关节炎

  编辑总结T辅助细胞17（TH17）和IL-17家族细胞因子与类风湿性关节炎（RA）患者的炎症部位有关，但针对IL-17的疗法并未取得显著效果。Zoccheddu等人使用SKG小鼠模型研究了TH17细胞在RA病理中的作用。通过谱系追踪方法，他们发现滑膜中的TH17细胞会转化为CD44+、IFN-γ−、IL-10−的exTH17细胞，这类细胞具有致关节炎性，且其引发关节炎症的过程不依赖于IL-17。这些CD44+ exTH17细胞表达鞘氨醇-1-磷酸受体4（S1PR4）以及其他在人类RA滑膜CD4+ T细胞中发现的基因。在纤维母细胞样滑膜细胞存在的情况下，S1PR4的信号传导促进了TH17向exT

  来源：Science Immunology

  时间：2025-11-09

• 串联重复的SCPL酰基转移酶基因的功能差异揭示了菊苣酸生物合成的趋同进化

  在植物生物化学领域，特定的代谢产物对于植物的生存和适应环境具有重要作用。其中，一种名为奇酰酸（chicoric acid）的化合物因其广泛存在于超过60种植物中，并且具有抗氧化、抗炎、抗菌、抗癌、抗病毒和免疫调节等多种生物活性，受到了广泛关注。奇酰酸作为植物次生代谢产物，不仅对人类健康有益，还在植物自身中扮演重要角色，例如增强对紫外线的抵御能力，并作为一种植物间的化学信号物质，参与植物间的相互作用。然而，尽管奇酰酸的合成路径在一些植物中已被阐明，如紫锥花（*Echinacea purpurea*）中通过BAHD型酰基转移酶和SCPL型酰基转移酶共同完成其合成，但关于其在其他植物，特别是生菜（*

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• PLAMseq 通过单一工作流程实现了与染色质相关的蛋白质及其相互作用的蛋白质组学分析

  PLAMseq是一种新型的实验方法，它结合了TurboID的邻近标记技术和亲和纯化技术，能够同时进行蛋白质组学和基因组学分析。这种方法克服了传统方法中对特定抗体的需求，同时提升了实验的灵敏度和特异性。在研究中，PLAMseq被用来分析CTCF和RNA聚合酶II这两种在基因组中具有明确定位的蛋白质，验证了其在蛋白质组和基因组分析中的有效性和可重复性。此外，PLAMseq还被用于研究组蛋白H1的SUMO化修饰，这在之前由于缺乏特定的试剂而难以进行。PLAMseq的核心在于利用TurboID的邻近标记能力，通过添加生物素，使得与目标蛋白邻近的蛋白质被标记，随后使用链霉亲和素珠进行亲和纯化。在纯化过程

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 源自人类干细胞的β细胞，经过优化后表达CD155蛋白，能够抑制细胞毒性免疫细胞的活性，适用于1型糖尿病的治疗

  干细胞来源的胰岛β细胞（sBC）在治疗1型糖尿病（T1D）方面展现出巨大的潜力。然而，这一疗法在临床推广过程中面临诸多挑战，例如供体组织短缺和免疫排斥反应。因此，科学家们致力于探索新的方法，以增强sBC的免疫逃避能力，从而减少免疫系统对移植细胞的攻击，提高其在体内的存活率和功能稳定性。本研究通过基因工程技术，将天然杀伤细胞（NK）和T细胞的检查点抑制分子CD155在sBC中进行修饰，重点探讨了野生型（WT）和高亲和力突变型（Mut）CD155在免疫调节中的作用，为未来的T1D治疗策略提供了新的思路。### CD155的免疫调节作用CD155，也被称为多瘤病毒受体（PVR），是一种在免疫系统中发

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 在吸入纳米颗粒后，肺泡巨噬细胞会启动对中性粒细胞的定向招募过程

  在现代医学和环境科学的交叉领域，肺部驻留免疫细胞对于应对吸入的空气污染物，包括纳米颗粒（NPs）起着至关重要的作用。这些纳米颗粒是大气污染的主要组成部分，其微小的尺寸和高表面积使其能够深入肺部并沉积在脆弱的肺泡区域，从而对健康造成更大的风险。本文研究了纳米颗粒在急性吸入暴露后如何引发肺泡中的先天免疫反应，特别是通过肺泡巨噬细胞（AMs）的活动和其对中性粒细胞（neutrophils）的招募过程。研究采用了一种先进的肺部在体显微镜技术（lung intravital microscopy, L-IVM），结合通风辅助的气溶胶输送系统，对小鼠肺部的免疫反应进行了实时观察和定量分析。### 肺泡巨噬

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 土卫二北极的内生热

  本文讨论了土星卫星恩克勒达斯（Enceladus）北极高纬度区域的热损失与内部热源之间的关系，特别是通过使用卡西尼号（Cassini）的复合红外光谱仪（CIRS）数据进行的观测和分析。研究指出，恩克勒达斯的海洋长期生存依赖于热产生与热损失之间的平衡。目前，仅在南极为直接测量了其热损失，但通过比较北半球冬季和夏季的观测数据，研究发现北极高纬度区域的热损失比被动模型预测的更大。这表明恩克勒达斯北极高纬度区域可能存在额外的内源性热通量，从而对热辐射产生显著影响。### 内部热源与热损失的对比研究中提到，通过比较冬季和夏季的观测数据，发现北极高纬度区域的温度比被动模型预测的高出约7开尔文（K）。这一温

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 由超快自旋电流引发的太赫兹反铁磁动力学

  在信息和通信技术领域，磁性材料的创新研究正逐步推动新一代超快器件的发展。其中，反铁磁体（Antiferromagnets, AFs）因其独特的磁性结构和优异的动态特性，成为超快自旋电子学（spintronics）研究的重要对象。反铁磁体中相邻原子磁矩呈反平行排列，这种结构使得它们在保持低能耗的同时，具备高速的自旋信息传输潜力。近年来，研究者们发现，反铁磁绝缘体（insulating AFs）在亚太赫兹（sub-terahertz）和太赫兹（terahertz）频段内表现出显著的磁共振特性，这为构建高效、低功耗的自旋电子器件提供了新的思路。在自旋电子学的框架下，自旋电流的生成和传输是关键环节。自

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• Pfs230 Domain 12是一种具有强效疟疾传播阻断作用的疫苗候选物

  ### 马拉疟疾传播阻断疫苗的研究进展近年来，随着全球气候变化、人口流动以及抗疟疾药物耐药性的增加，疟疾的流行病学形势愈发严峻。据世界卫生组织的数据，2016年全球疟疾死亡病例为45万，而到2022年已上升至60.8万，这表明疟疾仍然是全球公共卫生的重大挑战之一。在这一背景下，开发有效的疫苗成为控制和最终消除疟疾的关键策略之一。其中，一种新型的疫苗策略——传播阻断疫苗（Transmission-Blocking Vaccines, TBVs）引起了广泛关注。TBVs的目标是阻止疟原虫在蚊子体内的传播过程。具体而言，这些疫苗通过诱导宿主体内针对疟原虫性阶段表面蛋白的抗体，使得这些抗体能够在蚊子摄

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 量化东太平洋海隆北纬9°43′至57′之间广泛分布的热液喷口

  在海洋中脊的活动区域，热液循环扮演着至关重要的角色，它不仅影响着地球内部热量和物质向全球海洋的输送，还为深海生态系统提供了能量来源。热液喷口周围的环境通常充满高温和化学物质，支持着独特的化学合成生命形式。然而，尽管在中脊轴线附近发现了许多活跃的热液喷口，远离轴线的热液排放范围仍存在许多未解之谜。本研究利用自主水下航行器（AUV）Sentry在东太平洋海岭（EPR）9°43′N至9°57′N之间的25公里长区域收集的近海底数据，揭示了热液流在轴线附近广泛分布的现象。通过高分辨率的海底地形测绘和水体观测，研究团队识别出了448个可能的热液烟囱结构，其中超过一半的烟囱位于轴线顶部沟槽（AST）之外，

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 是拥抱粉丝还是追随名人？中国社交媒体上是如何强化民族主义的？

  在中国社会的数字化进程中，社交媒体平台已成为政治观念传播的重要渠道。尤其在非民主体制下，国家主义的扩散和强化机制一直备受关注。近期一项研究通过分析中国微博（Weibo）平台上的800多万条微博客及其评论，揭示了粉丝与明星之间互动关系在国家主义传播中的关键作用。这项研究发现，粉丝对明星的影响远大于明星对粉丝的反向作用，尤其是在那些与特定政治立场一致的群体中，这种影响尤为显著。研究背景显示，国家主义在全球范围内呈现出上升趋势，特别是在中国，随着国家经济和地缘政治地位的提升，国家主义情绪在网络空间中的传播变得更加频繁和强烈。尽管有大量文献探讨了国家主义在社交媒体上的传播机制，但大多数研究倾向于认为国

  来源：SCIENCE ADVANCES

  时间：2025-11-09

• 病毒介导的基因融合：点燃并持续驱动肿瘤发生的新机制

  在肿瘤研究领域，病毒感染与癌症发生的关联早已被广泛证实，其中人类乳头瘤病毒（HPV）尤其是高危型HPV16，是导致头颈部鳞状细胞癌（OPSCC）等恶性肿瘤的重要病原体。尽管HPV疫苗已有效降低相关癌症发病率，但全球范围内HPV阳性OPSCC的疾病负担仍在持续增长，尤其在男性人群中尤为显著。病毒通过整合进入宿主基因组，长期表达E6和E7等癌蛋白，进而抑制p53和Rb等关键抑癌蛋白功能，促进细胞无限增殖。然而，科学家逐渐意识到，单靠E6/E7的表达往往不足以完全驱动细胞恶性转化，暗示病毒整合可能通过更复杂的机制参与肿瘤发生。近年来，随着基因组学技术的进步，研究者发现HPV整合事件远非以往所认为的“

  来源：TRENDS IN Cancer

  时间：2025-11-09

• 骨转移的计算机模拟数字孪生模型有助于研究肿瘤进展和治疗效果 可购买

  摘要 骨转移（Bone Metastasis, BM）是前列腺癌和肾癌患者发病和死亡的主要原因之一。驱动其进展的复杂而动态的生物学过程给理解和治疗这种疾病带来了重大挑战。尽管当前的体内（in vivo）研究提供了宝贵的见解，但这些研究往往受到无法完全捕捉骨转移复杂多因素本质的限制。因此，通过多尺度计算方法补充现有的体内模型对于解析肿瘤细胞与骨微环境之间的复杂相

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

• METTL14 通过 m6A 依赖性机制诱导 PD-1 的丢失来增强抗肿瘤免疫力 现已可供购买

  摘要 N6-甲基腺苷（m6A）修饰可以通过调控不同的靶基因来影响免疫反应。在本研究中，我们发现PD-1基因PDCD1会发生m6A修饰，这会进一步影响T细胞的功能。METTL14通过促进m6A依赖性的PDCD1mRNA不稳定来下调T细胞中的PDCD1表达，这一过程由YTHDF1/2/3介导。METTL14的杂合缺陷会损害CD8+ T细胞的活化，并通过升高PD-1水平促进肿瘤生长。临床研究表明，METTL14与多种癌症类型的PDCD1水平以及PD-1靶向免疫

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

• 肠道微生物群介导的胆汁酸代谢通过改变中性粒细胞的募集来调控结直肠癌的肝转移 可购买

  摘要 在结直肠癌中，肠道微生物群常常出现失调。肠道微生物群可以改变胆汁酸（BA）的成分，而胆汁酸是一类与肿瘤发生和发展相关的代谢物。在本研究中，我们观察到肝转移性结直肠癌（CRLM）患者体内具有胆盐水解酶（BSH）活性的肠道细菌显著减少。这些患者的循环系统中结合型初级胆汁酸（CPBA）水平升高，而非结合型胆汁酸（UBA）水平降低。在男性CRLM患者中，细菌BS

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

• 靶向Siglec-10与α3β1整合素之间的相互作用可增强巨噬细胞对胰腺癌的吞噬作用 可购买

  摘要 在胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境（TME）中，肿瘤相关巨噬细胞（TAM）表现出免疫抑制表型，并且吞噬活性受损，这促进了肿瘤的进展和免疫逃逸。在这项研究中，我们发现整合素α3β1（由ITGA3和ITGB1亚基组成）是一种唾液酸化糖蛋白配体，它可以与Siglec-10结合。Siglec-10是一种抑制性糖免疫检查点受体，在PDAC中的TAM上高表达。T

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

• 更正：具有片段重复的肿瘤抑制基因容易发生体细胞缺失和结构变异 免费

  在这篇文章的原始版本（1）中，图1B存在一些错误。具体来说，由于图表最终版本的格式问题，热图和比值比图的顶部行显示不正确。此外，“Sheep”这个标签被错误地用黑色文字标注了，而实际上应该用红色文字来表示正确的统计显著性水平。这些错误已在文章的最新在线HTML和PDF版本中得到修正。作者对这一错误表示歉意。

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

• 编者按：MDM2/MDMX-p53拮抗剂PM2能够增强野生型p53肿瘤对放疗的敏感性 （免费提供）

  编辑们发布此声明，是为了提醒读者注意这篇文章（1）中存在的问题。作者向期刊反馈称：在图1A中，p53 Western blot的结果在第二条泳道之后被拼接了；用于表示3小时加载对照带的图像是错误的。在图2C中，代表10× PM2 + 3 × 2 Gy处理组第14天的图像实际上是复制自3× 2 Gy处理组第7天的图像。这些受影响的图像是从更大的数据集中选取的代表性图片，作者已经找到了这些实验的正确原始图像，并将其包含在本声明的补充数据中。

  来源：Cancer Research

  时间：2025-11-09

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