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匹配的冷冻组织和经福尔马林固定、石蜡包埋的结直肠癌组织的比较空间全转录组分析
本研究以泰国玛希隆大学斯里拉贾医院为背景,聚焦结直肠癌(CRC)组织样本不同保存方法(石蜡包埋固定- Embedding,FFPE;新鲜冷冻,FF;速冻,SF)在空间转录组分析中的技术比较。通过单例四期CRC患者的多组学联合分析,揭示样本保存方式对转录组特征解析的影响机制,为临床病理样本保存策略提供科学依据。一、技术背景与研究价值空间转录组学通过结合形态学定位与基因表达谱分析,成为解析肿瘤微环境(TME)异质性的关键技术。传统单细胞测序存在空间定位缺失,而FFPE样本虽能保持组织结构完整性,但RNA降解问题长期制约其应用。本研究创新性地采用Nanostring GeoMx DSP平台,通过三色
来源:Biochemistry and Biophysics Reports
时间:2025-12-20
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细胞外腺苷通过激活A2B腺苷受体,促进了人类合胞滋养层细胞的形成
研究聚焦于细胞外腺苷在合胞滋养层(STB)形成中的关键作用,通过体外模型揭示其分子机制及临床意义。首先,合胞滋养层作为胎盘屏障的核心结构,其正常形成依赖于单核细胞间的程序性融合。研究指出,细胞外腺苷通过激活特定受体调控这一过程,而该信号通路与妊娠并发症存在潜在关联。在实验设计方面,研究者采用人绒毛膜癌BeWo细胞作为模型,通过 Forskolin(FSK)诱导细胞进入滋养层发生程序。通过对比实验发现,添加外源性腺苷可显著增强多核STB的融合效率,形态学分析显示细胞膜融合及核膜消解现象更明显。关键机制在于腺苷通过激活A2B受体,促进cAMP信号通路,进而调控细胞骨架重组和膜融合相关蛋白的表达。关
来源:Biochemical and Biophysical Research Communications
时间:2025-12-20
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在经过基因工程改造的大肠杆菌中,微生物利用甘油和葡萄糖合成了L-岩藻糖
【L-岩藻糖合成路径优化与动态调控技术研究进展】一、L-岩藻糖的生物学价值与产业化需求L-岩藻糖作为人类母乳中最主要的活性寡糖成分之一,其结构中的岩藻糖基团具有独特的生物功能。研究表明该糖分子在肠道屏障维护、抗炎调节、肿瘤抑制及皮肤抗衰老等方面发挥关键作用,市场需求呈现指数级增长。当前工业化生产主要依赖藻类提取(成本高、步骤复杂)、化学合成(环境友好度低)及酶催化法(效率受限)三种途径,而微生物发酵法因其绿色环保、可规模化生产的特性成为研究热点。二、大肠杆菌代谢工程改造策略研究团队以E. coli MG1655为底盘细胞,通过多级递进式代谢重构实现L-岩藻糖的高效合成。首先建立基础代谢框架:整
来源:Biochemical Engineering Journal
时间:2025-12-20
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新型癌相关谷氨酸残基通过泛素结合和PARylation调控BAP1活性
BAP1酶的分子机制与癌症调控功能研究进展(全文约2100词)一、BAP1蛋白的生物学功能基础BAP1作为肿瘤抑制因子,在细胞核和胞质中分别承担着基因组稳定性和细胞死亡调控的双重职责。在核内,其通过修复紫外线诱导的DNA损伤、调控基因转录和维持基因组稳定性发挥关键作用。特别是在DNA双链断裂修复过程中,BAP1与PARP1形成的复合体能够有效清除H2A-Ub修饰,这种动态平衡机制对于防止DNA修复错误至关重要。胞质中BAP1通过调控凋亡和铁死亡等细胞死亡途径参与细胞稳态维持。二、结构生物学揭示的关键催化位点1. 核心催化区域研究团队通过X射线晶体学解析发现,BAP1的C末端水解酶结构域存在三个
来源:Biochemical and Biophysical Research Communications
时间:2025-12-20
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丹参酮IIA通过抑制巨噬细胞NLRP3炎性小体活性加速糖尿病伤口愈合
糖尿病足溃疡(DFU)是糖尿病最严重并发症之一,其核心病理特征表现为持续炎症反应和修复能力受损。DFU不仅导致患者生活质量显著下降,更造成沉重的医疗负担。全球每年约有1.86亿糖尿病患者出现DFU,五年生存率不足70%,且该病症治疗费用占糖尿病相关总医疗支出的15%-20%。传统治疗方法存在明显局限性,约30%的DFU患者经过常规治疗仍无法实现完全愈合并存在复发风险。研究团队通过构建糖尿病大鼠全层皮肤缺损模型,发现Tanshinone IIA(丹参酮IIA)能显著缩短伤口愈合周期。具体表现为,在糖尿病模型组中,伤口面积在28天时仍存在明显缺损(约72.4%未愈合),而丹参酮IIA治疗组的伤口闭
来源:Biochemical and Biophysical Research Communications
时间:2025-12-20
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热碱处理和热水解对污泥厌氧消化过程中甲烷产率及抗生素抗性基因去除的影响
本研究聚焦于污水处理厂污泥资源化利用中的抗生素耐药基因(ARGs)控制问题,通过对比热碱水解与热水解两种预处理工艺,系统揭示了其对污泥厌氧消化效能及ARGs消减的协同作用机制。研究团队基于天津地区污水处理厂污泥样本,构建了包含8类典型ARGs(如tetA、tetG、tetX等)及HGT关键基因intI1的多维度分析体系,通过代谢组学技术与宏基因组测序技术相结合,首次实现了对两种预处理工艺在细胞破碎效率、有机质溶出特性及ARGs动态演变过程的定量解析。在预处理工艺对比方面,热碱水解(TAH)通过pH值调控至12的强碱性环境,结合90℃中温条件,实现了污泥絮体结构的梯度式解构。这种预处理方式使有机
来源:Biocatalysis and Agricultural Biotechnology
时间:2025-12-20
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维生素C对于肌肉细胞的正常分化至关重要
### 维生素C对肌细胞分化的调控机制研究#### 研究背景与意义骨骼肌作为人体重要组织,其质量与功能直接关联健康水平。肌细胞分化涉及复杂的基因调控网络,包括肌调节因子(MRFs)的表达调控。已有研究指出,维生素D和生长因子在肌肉再生中起关键作用,但关于维生素C(VC)的生理作用尚未明确。尽管人类需要通过饮食摄取VC,其在肌肉代谢中的具体机制仍不清晰。本研究通过建立体外细胞模型,系统评估VC对肌细胞分化的影响,为理解肌肉萎缩和衰老的分子机制提供新视角。#### 实验设计与核心发现1. **细胞模型与培养体系** 研究采用小鼠C2C12成肌细胞系,构建两种分化培养基:VC补充组(50 μ
来源:Archives of Biochemistry and Biophysics
时间:2025-12-20
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PDZ6从PDZD2的折叠路径中三个过渡态的结构解析
Cosmin Marian Obreja | Dimitrios Marinidis | Valeria Pennacchietti | Sara Di Matteo | Rodolfo Ippoliti | Francesca Malagrinò阿奎拉大学临床医学、公共卫生、生命与环境科学系,意大利拉奎拉市Vetoio路67100号Coppito摘要蛋白质折叠的协同性质限制了对反应机制的实验分析。PDZ结构域具有保守的折叠结构、大量的同源蛋白以及可访问的折叠中间体,是研究折叠路径的理想模型。本文详细分析了PDZD2中的PDZ6的折叠路径,通过在不同盐浓度条件下的动力学实验结合φ值分析,揭示了
来源:Archives of Biochemistry and Biophysics
时间:2025-12-20
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膳食维生素E补充对金湖石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus ♀ × Epinephelus tukula ♂)生长性能和肝脏健康的影响(这些鱼被喂食了氧化鱼油饲料)
本研究以皱纹桥鲈(Jinhu grouper)为对象,系统评估了氧化鱼油对生长性能和肝脏功能的影响,并探讨了维生素E的缓解作用。实验构建了包含新鲜鱼油(FFO)和氧化鱼油(OFO)的基础饲料,并在OFO基础上增设200、400和600 mg/kg维生素E(VE1、VE2、VE3)的补充组,通过为期8周的正交实验设计,从生长指标、血清生化参数、肝脏抗氧化酶活性及病理学变化等多维度展开分析。### 1. 研究背景与意义随着水产饲料中鱼油替代品需求增加,氧化鱼油作为成本更低廉的替代品被广泛应用。然而,氧化过程中产生的MDA等自由基产物会破坏肝细胞膜结构,引发脂质过氧化反应。已有研究表明,氧化鱼油摄入
来源:Aquaculture Reports
时间:2025-12-20
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全面的转录组分析揭示了珍珠贝(Pinctada fucata martensii)在缺氧应激下特定的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)以及miRNA-mRNA相互作用网络
本研究以市场价值极高的珠母贝(*Pinctada fucata martensii*)为对象,系统解析了其暴露于短期缺氧胁迫时的分子响应网络,通过整合转录组测序与ceRNA网络分析技术,揭示了非编码RNA在缺氧适应性机制中的关键作用。研究团队从广东海洋大学水产学院实验基地采集健康珠母贝样本,采用梯度氧浓度控制实验(正常氧6.0 mg/L vs. 缺氧2.0 mg/L),通过多组学联合分析发现:珠母贝在48小时缺氧胁迫下,其鳃组织中共检测到721个差异表达mRNA、259个差异表达lncRNA、55个差异表达circRNA和17个差异表达miRNA,并首次构建了包含9个lncRNA、10个cir
来源:Aquaculture Reports
时间:2025-12-20
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对肌肉进行的多组学综合分析揭示了H3K4me3表观遗传调控在太平洋白虾(Litopenaeus vannamei)生长性状中的作用
太平洋白虾作为全球最重要的水产养殖物种之一,其生长性能的遗传和表观调控机制始终是研究热点。本研究通过整合基因组关联分析(GWAS)与组蛋白甲基化(H3K4me3)定位技术,首次系统揭示了组蛋白修饰在调控虾类生长中的分子机制。研究团队构建了300尾全同胞家系样本,利用SLAF-seq技术完成高密度SNP分型,通过EMMAX模型筛选出24个显著关联SNP位点(-log10P≥4),这些位点主要富集在能量代谢相关基因区域。值得注意的是,其中位于NW_020869654.1 scaffold的134130位点(G/T等位基因频率0.31)与体质量呈显著负相关,而NW_020869886.1 scaff
来源:Aquaculture Reports
时间:2025-12-20
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谷氨酰胺二肽、植物精油和黄芪多糖对大黄鲈(Larimichthys crocea)生长性能、抗氧化能力、免疫功能及肠道健康的综合影响
中国大型黄颡鱼(*Larimichthys crocea*)集约化养殖面临多重挑战,包括疾病频发和环境压力加剧。传统抗生素滥用虽短期控制病害,却引发耐药性、环境污染和肠道菌群失衡等问题。近年来,学者们聚焦于开发基于功能添加剂的生态养殖策略,其中谷氨酰胺二肽(GLN)、植物精油(PEO)和黄芪多糖(APS)的组合应用逐渐成为研究热点。2025年发表于《Environmental Ecology and Fish Nutrition》的论文系统评估了这三种添加剂单独及协同作用对大型黄颡鱼生长性能、抗氧化能力、免疫功能和肠道菌群的影响,为水产养殖可持续发展提供了新思路。### 研究背景与意义大型黄颡
来源:Aquaculture Reports
时间:2025-12-20
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人类在映射三维空间时,会根据运动需求利用几何线索和身体感知信息
本研究通过虚拟现实技术,系统探讨了人类在三维空间中的导航策略如何因运动模式(行走或飞行)和环境几何形变而改变。研究揭示,重力约束下的地面行走促使人类优先利用身体轴线作为垂直参考系,而飞行模式则强化了环境边界在三维空间中的锚定作用,这一发现为理解多维空间认知机制提供了关键依据。### 核心发现解析1. **运动模式对三维空间表征的分化作用** - **飞行组**:通过虚拟头枕转向实现三维移动,其空间记忆表现出显著的水平-垂直不对称性。垂直方向记忆精度(中位数绝对偏差MAD为0.45米)显著低于水平方向(0.28米),符合边界邻近模型预测。该模型认为物体位置通过距离各边界的倒数加权编码,与
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2025-12-20
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白色和透明念珠菌细胞对巨噬细胞吞噬作用的反应表明,透明细胞具有“预先适应”的能力
Candida albicans作为人类肠道和黏膜的正常菌群成员,同时也是机会性病原体,其形态转换机制与宿主免疫逃逸密切相关。研究聚焦于白型(white)与透明型(opaque)两种细胞表型的动态差异,特别是透明型在巨噬细胞吞噬环境中的独特适应性。### 研究背景与核心问题白型和透明型细胞的形态转换由复杂的转录反馈环路调控,二者在代谢偏好、免疫应答和器官定植能力上存在显著差异。传统研究多关注白型细胞在巨噬细胞内的动态,如快速形成假丝体并导致细胞破裂。然而,临床分离株中约三分之二存在白-透明型转换能力,而透明型细胞在宿主体内的免疫逃逸机制尚未明确。### 关键发现1. **形态学差异**:
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HeptaTB Dx:一种基于铜死亡(cuproptosis)与铁死亡(ferroptosis)相互作用的诊断模型,用于区分潜伏性结核与活动性结核
结核病(TB)作为全球公共卫生挑战,其诊断和分型始终面临瓶颈。传统方法如结核菌素皮肤试验(TST)和干扰素-γ释放试验(IGRA)在区分潜伏感染(LTBI)与活动性结核病(ATB)时存在显著局限性,前者易受免疫状态干扰导致假阴性/阳性结果,后者则缺乏对疾病进展预测的敏感性。近年来,金属依赖性细胞死亡通路的研究为揭示结核病免疫代谢异质性提供了新视角。本研究首次系统整合铁依赖性细胞死亡(ferroptosis)与铜依赖性细胞死亡(cuproptosis)的交互作用,构建了具有临床转化潜力的HeptaTB Dx诊断模型,为结核病精准诊疗开辟了新路径。### 研究背景与科学问题结核分枝杆菌(MTB)在
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20
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噬菌体T4的离散长程细胞内运动
噬菌体T4与大肠杆菌B宿主表面动态互作的微观机制研究本研究通过单粒子荧光显微技术首次揭示了噬菌体T4在宿主表面进行长程动态扫描的分子机制。实验采用定制化流细胞系统,将活体大肠杆菌B固定于聚赖氨酸涂层表面,通过荧光标记技术实时追踪了673个噬菌体T4与宿主的相互作用全过程。研究发现,噬菌体在感染前会执行一种独特的"步态式"运动模式,通过尾纤维的动态重组实现宿主表面空间的高效搜索。1. 实验技术体系创新研究团队构建了双模态成像系统(荧光显微+相差显微),在50Hz和200Hz双帧率下同步获取噬菌体运动轨迹与宿主细胞形态变化。通过开发改进的TrackMate轨迹追踪算法,实现了对纳米级移动的精确捕捉
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20
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为什么迫切需要准确鉴定稀有酵母呢?
近年来,全球范围内罕见酵母菌感染的临床病例显著增加,尤其是在免疫抑制或重症患者群体中。这类感染不仅具有高致死率,还常伴随抗生素耐药性问题,这对临床诊断和及时治疗提出了严峻挑战。传统鉴定方法依赖形态学观察、生化试验及PCR结合测序技术,存在耗时长、操作复杂、数据库覆盖不足等缺陷。基于此,研究团队通过构建本地化 Bruker MALDI-TOF MS 质谱库,成功实现了对141种罕见酵母菌的精准物种水平鉴定,为临床微生物学提供了创新解决方案。**技术背景与核心问题** 矩阵辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术自2010年引入临床微生物学领域后,凭借其快速(数分钟内完成)、
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20
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对QuantiFERON-TB Gold-Plus检测中临界结果的详细分析,并结合了纵向随访数据:适用于中等感染负担的情况
近年来,结核分枝杆菌(*Mycobacterium tuberculosis*)潜伏感染(LTBI)的筛查和治疗备受关注。作为第二代干扰素-γ释放试验(IGRA),QuantiFERON-TB Gold Plus(QFT-Plus)因其高灵敏度和特异性被广泛应用。然而,检测中出现的介于阴性和阳性之间的“临界值”结果(0.2–0.7 IU/mL)易引发临床决策的困惑。韩国 Konkuk 大学医学院的研究团队通过5年的回顾性分析,对770例临界值 QFT-Plus 结果的纵向变化进行了系统性研究,为临床实践提供了重要参考。### 研究背景与核心问题全球结核病负担依然严峻,2023年估计有1.08亿
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20
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青藏高原牦牛血清参数、代谢组及肠道微生物群受海拔高度影响的研究
该研究通过整合生理生化、代谢组学和肠道菌群多组学分析,系统揭示了牦牛在青藏高原不同海拔梯度下的适应性机制。研究选取海拔3600米(低海拔)、4000米(中海拔)和4500米(高海拔)的30头2.5岁牦牛作为样本,重点探究环境压力对宿主代谢、免疫和微生物群落的三重调控网络。在宿主代谢层面,高海拔环境显著抑制了蛋白质合成代谢。血清总蛋白、球蛋白和尿素氮水平随海拔升高而下降,表明牦牛通过氮节省策略减少能量消耗。酶学分析显示,高海拔下血清超氧化物歧化酶(T-SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)显著提升,而谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性降低,这可能与硒元素缺乏导致抗氧化酶系统重构有关。值得注意的
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20
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环境监测揭示了中国济南地区肠道病毒的多样性:检测到了D68、A71、A76、B88、A90和C99型肠道病毒
肠道病毒(Enterovirus, EV)作为全球范围内重要的病原体,其血清型多样性及遗传演化规律始终是公共卫生领域的研究热点。本研究聚焦中国山东省济南市,通过结合传统细胞培养技术与前沿的下一代测序(NGS)技术,对2024年度城市污水样本进行系统性监测,揭示了EV在区域环境中的流行特征与分子演化趋势,为全球EV流行病学研究提供了新的区域性数据支持。一、研究背景与意义75%)被广泛采用作为血清分型标准(如E11、E3、CVB4等)。值得关注的是,这类病毒通过粪便-口传播的途径,其病毒颗粒可随生活污水进入下水道系统,这使得环境样本监测成为追踪病毒流行病学特征的重要手段。二、研究方法与技术路线研究
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-12-20