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  • Be(CO)3作为一种非传统的路易斯碱参与卤素键的形成

    Be(CO)3中的HOMO结构类似于一个能够在中卤素键环境中提供电荷的铍孤对电子。这种特性通过量子化学计算进行了验证,其中Be(CO)3分别与XF、XCl、XCN和XCF3(X = I、Br、Cl)配对。在后两种分子中,当X与碳原子相连时,会形成完全非共价的卤素键,其键强在2.2到9.7 kcal/mol之间变化。这种键合会导致X–C键发生伸缩,并使其伸缩频率向红端移动。与XF和XCl的相互作用要强得多,能量超过40 kcal/mol,且具有明显的共价性特征。在这些配合物中,作为桥接原子的X原子会显著向铍原子中心移动,这可以被视为部分电荷转移或卤素共享现象。与XCN和XCF3中的非共价卤素键不

    来源:The Journal of Physical Chemistry A

    时间:2025-11-19

  • 四氢呋喃分子对电子的散射:弹性相互作用与电子非弹性相互作用

    电子与分子相互作用是理解辐射损伤机制的重要组成部分,尤其在DNA研究中,这种相互作用对于解释由二次电子引起的永久性损伤具有重要意义。本研究聚焦于低能电子与四氢呋喃(THF)分子在气相条件下的弹性散射和电子激发非弹性散射过程,通过系统性地分析五种不同的散射模型,探讨多通道耦合效应在散射过程中的作用。THF作为DNA骨架中脱氧核糖(2-脱氧核糖)的简单替代物,其结构与DNA骨架中的糖-磷酸键具有高度相似性,因此,研究THF的电子散射特性对于揭示DNA损伤机制至关重要。在本研究中,采用Schwinger多通道方法(SMC)结合规范保持赝势(SMCPP)进行计算,以获得电子与THF分子碰撞的散射截面。

    来源:The Journal of Physical Chemistry A

    时间:2025-11-19

  • 通过原子级里程碑模拟揭示大型HIV非核苷类逆转录酶抑制剂解离的动力学机制

    非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)是抗HIV治疗的关键组成部分。像JLJ636这样的大分子且结构灵活的NNRTIs,在对抗HIV逆转录酶中的耐药突变方面具有潜在优势。然而,这些抑制剂从酶的疏水结合口袋中解离的机制仍不清楚。在这项研究中,我们利用原子级模拟来研究JLJ636的解离动力学。我们采用了随机加速分子动力学和Milestoning模拟相结合的方法来识别解离路径、估算平均停留时间并计算自由能曲线。在三种可能的解离途径(分别称为“入口”、“隧道”和“沟槽”通道)中,“隧道”通道最为有利,其次是“沟槽”通道,而“入口”通道几乎不被利用。这种解离行为与较小的NNRTIs(如JLJ135及其类

    来源:The Journal of Physical Chemistry B

    时间:2025-11-19

  • 非单调离子传输及其与NaTFSI和NaFSI基水电解液中结构与动态异质性的关联:盐在水中的行为与水在盐中的行为

    基于双(三氟甲磺酰)亚胺钠(NaTFSI)和双(氟磺酰)亚胺钠(NaFSI)盐的水-盐电解质(WiSEs)相比基于锂离子的电解质具有显著优势。实验研究表明,这些盐的水溶液的离子导电性随盐浓度的变化呈现非单调行为。本文旨在通过原子分子动力学模拟来解释这两种电解质离子导电性非单调行为的可能原因。我们的深入分析发现,NaTFSI基电解质在6摩尔浓度时、NaFSI基电解质在5摩尔浓度时观察到的导电性峰值可能是由于离子所处的溶剂化环境更为动态,即离子周围的离子数量频繁发生变化。进一步分析Na+离子的溶剂化壳层(包含水分子和阴离子)的平均大小以及Na+离子在水中和阴离子区域中的平均扩散长度后,我们发现:在

    来源:The Journal of Physical Chemistry B

    时间:2025-11-19

  • 基于咪唑鎓的离子液体在铝电池中的电化学稳定性窗口:关于阳离子官能化及含氟阴离子的计算研究

    理解和调整离子液体(ILs)的电化学稳定性窗口(ECW)对于推动储能技术的发展至关重要。在这项研究中,采用了密度泛函理论结合热力学循环方法,系统地研究了以咪唑鎓为基础的阳离子与多种氟化物和氯化物阴离子配对时的ECW,这些阴离子的电位是相对于铝电极来参考的。研究探讨了一系列阳离子结构,包括烷基、甲氧基-乙氧基、乙烯基以及烷基桥接衍生物,同时还研究了常见的含氢氟酸根阴离子[F(HF)n−](n = 0 – 3)。结果表明,简单的烷基取代对氧化还原性质的影响很小,而供电子和π共轭基团通过HOMO(最高未占分子轨道)的离域作用降低了氧化电位。氟化物阴离子赋予了较高的氧化还原稳定性,而含氢氟酸根阴离子则

    来源:The Journal of Physical Chemistry B

    时间:2025-11-19

  • 芳基甲苯磺酸酯的光催化还原脱硫

    本文描述了一种利用可见光光催化将芳基甲磺酸盐还原脱保护为相应酚类的方法,产率可高达93%。在这种新方法中,10-溴蒽-9-酮脱质子化生成的烯醇盐在光照下能够选择性地断裂芳基甲磺酸盐底物上的S–O键,释放出酚阴离子。此外,这种脱保护方法不会影响底物中的常见官能团。因此,这种转化提供了一种新的脱保护策略,在有机合成和药物化学中可用于芳基甲磺酸盐的后期脱保护反应。文中还讨论了该方法的设计、适用范围及其局限性。

    来源:The Journal of Organic Chemistry

    时间:2025-11-19

  • 通过PPh3促进的[4 + 2]环化反应,实现苯并[c][1,2]二硫醇-3-酮与氨基甲酸酯之间的反应,合成苯并[e][1,3]-噻嗪-2,4-二酮

    本文描述了一种通过PPh3催化的[4 + 2]环化反应,将苯并[c][1,2]二硫醇-3-酮与氨基甲酸酯反应,高效制备苯并[e][1,3]-噻嗪-2,4-二酮的方法。该新策略具有反应条件温和、操作简便、产率高等优点,并且适用于多种官能团,易于扩大生产规模和实现实际转化应用。

    来源:The Journal of Organic Chemistry

    时间:2025-11-19

  • 双膦盐催化的邻二醇在可见光照射下的C–C键断裂反应

    通过使用双膦盐光催化剂在可见光下,开发了一种温和的、无金属的光催化方法,用于邻二醇的氧化断裂。该反应在室温下、空气气氛中高效进行,能够选择性地断裂1,2-二醇中的C–C键,生成醛和酮,产率良好至较高。机理研究表明,该反应机制涉及自由基途径。

    来源:The Journal of Organic Chemistry

    时间:2025-11-19

  • 关于由•OH自由基引发4-甲基环己醇的大气和燃烧化学的理论研究:机理、动力学及环境风险

    4-甲基环己醇(4MCHexOH)被广泛用作生物燃料添加剂和化工原料,但其环境归趋和潜在风险仍知之甚少。在本研究中,结合密度泛函理论和多结构变分过渡态理论,探讨了4MCHexOH与·OH自由基的反应机理和动力学性质。共发现了12条氢提取途径(R1–R12),其中R2途径(−CH< adjacent to −CH3)的能量障碍最低。在298 K时,计算得到的反应速率系数为1.84 × 10–11 cm3 molecule–1 s–1,与实验测量结果吻合良好。在200–900 K范围内,隧穿效应显著影响反应速率系数;而在900–2500 K区间,多结构效应变得较为明显。4MCHexOH在大气中的半

    来源:The Journal of Physical Chemistry A

    时间:2025-11-19

  • AHMD中两种竞争性的激发态分子内质子转移途径

    激发态分子内质子转移(ESIPT)是调控氢键发色团光物理行为的基本过程。在本研究中,我们对4-氨基-7-羟基-2-甲基异吲哚-1,3-二酮(AHMD)这种新型荧光染料中的两种竞争性ESIPT机制进行了全面的理论分析。AHMD具有较高的量子产率和环境稳定性。通过结合多组态电子结构计算(CASSCF/MS-CASPT2)与非绝热表面跃迁动力学模拟,我们揭示了这两种质子转移途径及其与非辐射衰减通道的耦合关系。研究发现了两种不同的ESIPT路径:一种是高势垒的N2–H1 → O6转移(ESIPT-1,能量障碍为7.26 kcal·mol–1);另一种是近乎无势垒的O8–H7 → O12转移(ESIPT

    来源:The Journal of Physical Chemistry A

    时间:2025-11-19

  • 2014-2025年FDA对人工泪液制剂召回事件的回顾性分析

    摘要通俗语言总结 目的: 研究2014年至2025年间所有人工泪液的召回事件,以确定最常见的产品类型、召回原因,并提供安全指导。 研究背景: 美国 研究方法: 通过FDA执法报告,梳理了2014年1月至2025年8月期间的人工泪液召回情况。分析了产品的制造国家、分类、成分、防腐剂使用情况以及召回原因。研究的主要终点是召回的最常见原因以及与每次召回相关的产品类型;次要终点包括召回原因的分类、与召回相关的常见成分以及产品的制造国家。 研究结果: 共发现110种不同配方的人工泪液产品被召

    来源:JRCS

    时间:2025-11-19

  • Cu5振动态波包动力学的温度依赖性

    本研究通过飞秒(fs)泵浦-探测光谱技术,利用“负离子-中性-正离子”(NeNePo)激发方案,对中性铜五聚体(Cu₅)的振动波包动力学进行了深入探讨。该方法的核心在于通过飞秒激光脉冲对Cu₅⁻离子进行光电子探测,从而在中性电子基态上激发振动波包。随后,使用第二个超快探测脉冲对波包的时间演化进行分析,通过共振多光子电离过程将Cu₅转化为Cu₅⁺。研究中发现,随着泵浦-探测延迟时间从0.2到20.0皮秒变化,振荡信号中出现了两个主要的拍频,分别为148 cm⁻¹和108 cm⁻¹,同时还有较弱且短暂的频率特征出现在222、216、76和40 cm⁻¹处。通过对这些频率与量子化学计算得到的正常模式

    来源:The Journal of Physical Chemistry A

    时间:2025-11-19

  • 磷酸果糖激酶-1组装的多尺度模拟:揭示特异性相互作用与瞬态相互作用之间的相互作用

    磷果糖激酶-1(PFK1)是一种在糖酵解途径中起关键作用的酶,它通过催化果糖-6-磷酸转化为果糖-1,6-二磷酸来调控糖酵解的速率。在哺乳动物细胞中,PFK1存在三种不同的同工酶:PFKL(肝脏)、PFKM(肌肉)和PFKP(血小板),它们在调控机制上具有显著的差异。PFKL具有形成丝状结构的能力,这种结构被认为是糖酵解过程中空间组织的重要基础。然而,尽管PFKL的丝状组装已被广泛研究,但其分子相互作用的细节以及不同同工酶在形成此类结构上的倾向性仍不完全清楚。PFK1的丝状结构在细胞内可能承担多种功能,包括促进糖酵解的局部调控、增强底物传递效率以及在细胞应答中组织代谢通路。此外,研究还表明,P

    来源:The Journal of Physical Chemistry B

    时间:2025-11-19

  • 《使用TS-DAR进行生物分子模拟中过渡态分析的实用指南》

    蛋白质构象变化是其生物学功能的关键,这些变化通常涉及在复杂的自由能景观中经历多个短暂且高能的中间状态。现有的方法,如马尔可夫状态模型(MSMs)和基于分子动力学(MD)模拟的非马尔可夫方法,虽然在识别亚稳态方面表现良好,但在定位过渡态方面仍面临挑战。过渡态是决定分子过程速率限制的关键构象,其在自由能景观中占据稀疏区域,难以直接观察和分析。为了解决这一问题,研究者提出了一种基于分布外检测(OOD)的深度学习框架——TS-DAR(过渡态识别通过散度和变分原理正则化神经网络)。TS-DAR利用神经网络将MD模拟中获得的蛋白质构象映射到一个高维球面的潜在空间中,从而系统性地识别所有与特定生物分子构象变

    来源:The Journal of Physical Chemistry B

    时间:2025-11-19

  • LASIK术后角膜扩张导致的角膜水肿:病例报告及最新文献综述

    急性角膜水疱是一种罕见但严重的并发症,常见于接受过激光原位角膜磨镶术(LASIK)治疗的患者。这种病症通常发生在角膜扩张(ectasia)的基础上,其特点为角膜完整性受损,导致Descemet膜破裂,使得房水进入角膜基质,引起肿胀、浑浊以及视力下降。虽然在角膜圆锥症(keratoconus)患者中,水疱的发生率约为2%至3%,并且有自发性角膜穿孔的风险较低,但LASIK术后水疱的情况则更为少见,且其自发性穿孔的风险较高,因此需要更为积极的管理和治疗策略。在本案例中,一位53岁的非洲裔男性患者,因左眼视力下降而就诊。他的病史显示,曾在25年前接受过单侧LASIK手术。此后,他的视力逐渐恶化,最终

    来源:JCRS Online Case Reports

    时间:2025-11-19

  • 利用双转运蛋白靶向的2-脱氧葡萄糖类似物来利用癌症中的代谢脆弱性,实现低剂量、强效的抗肿瘤作用

    2-脱氧葡萄糖(2DG)作为癌症治疗药物的临床应用一直受到限制,因为需要将其全身浓度提高到足以超过循环中葡萄糖的水平,但这会导致剂量相关的毒性。在这里,我们通过将2DG与1,18-十八烷二酸(ODDA)共价连接起来,同时激活葡萄糖和长链脂肪酸的转运途径,从而克服了这一障碍。所得到的结合物(2DG-ODDA)能够与血清白蛋白结合,并通过4T1三阴性乳腺癌(TNBC)细胞中的双重转运蛋白被吸收。在体外实验中,2DG-ODDA的活性远高于其母体化合物2DG,其IC50值降低了16倍。对2DG-ODDA细胞毒性作用机制的分析表明,该化合物通过抑制糖酵解引发细胞凋亡,这一过程得到了代谢流分析的支持,结果

    来源:Journal of the American Chemical Society

    时间:2025-11-19

  • 基于ESIPT的双向单分子光电导体

    能够光学调节分子导电性的单分子光导体在分子光电子学领域具有巨大潜力,但在单分子层面实现双向光导调节仍面临挑战。本文提出了一种合理的设计策略,通过激发态分子内质子转移(ESIPT)与量子干涉(QI)效应的协同作用,实现了导电性的增强或减弱。利用扫描隧道显微镜断裂结(STM-BJ)技术,我们研究了两种结构相似的2-(2-羟基苯基)吡啶衍生物——带有p-SMe基团和m-SMe基团的PPOH与PMOH,获得了创纪录的高光导调节效果。在持续365纳米光照下,基于PPOH的结表现出首个负光导现象,导电性降低了约120倍,这是迄今为止报道中最显著的例子之一;而基于PMOH的结则显示出约1.78倍的导电性增强

    来源:Journal of the American Chemical Society

    时间:2025-11-19

  • 基于绿色盒结构的超分子人工辅因子,用于可见光驱动的非对称光酶催化

    光酶催化系统结合了光催化、电子转移和酶促转化功能;然而,其整体效率往往受到活性组分空间分离的限制,这阻碍了形成类似光合作用中“Z-结构”的紧凑架构。在这里,我们报道了一种超分子人工辅因子(SeV–Rh–Box⊃NAD+),该辅因子通过基于硒代维生素的环芳烃(绿色Box衍生物SeV–Rh–Box)与NAD+之间的主客体相互作用形成。当这种人工辅因子与醇脱氢酶结合时,可以构建出一个光酶催化系统,该系统能够在可见光驱动下实现手性生物活性分子的不对称合成。该系统表现出优异的催化性能:对映体过量率超过87%,转化次数超过47,700次,并且在24小时和8次反应循环后仍保持超过50%的催化效率。超分子结构

    来源:Journal of the American Chemical Society

    时间:2025-11-19

  • 计算脂质组学揭示前列腺癌中与环境相关的膜重塑现象

    在癌症进展过程中,代谢变化导致正常细胞(RWPE-1)、良性增生细胞(BPH-1)以及转移性前列腺癌细胞(淋巴结:LNCaP,骨骼:PC-3,大脑:DU145)之间的磷脂分布出现显著差异,这些差异是疾病进展和癌细胞适应的标志(Young等人,2021年)。然而,癌症相关脂质组变化对膜结构动态的影响尚未在特定细胞背景下进行过研究。在这里,我们通过空间映射每个细胞系数据集中的特定膜脂质组,来评估正常细胞、良性增生细胞和转移性前列腺癌细胞中的膜组织和动态变化。长时间尺度的分子动力学模拟显示,转移性细胞膜的膜结构发生了特定变化,其细胞内层的流动性增加。所有膜都表现出富含多不饱和脂质且胆固醇含量较低的相

    来源:Journal of Chemical Information and Modeling

    时间:2025-11-19

  • 克服材料信息学中的小数据限制:利用CORRELATO算法对光学限制效率进行可解释的预测建模

    本研究致力于解决预测光学限幅器(OLs)效率这一根本性难题:光学限幅器是一类关键材料,用于保护敏感的光学组件免受强激光辐射的伤害。虽然传统方法(包括量子化学计算和机器学习(ML))存在计算成本高、数据稀缺以及可解释性差等局限性,但我们提出并验证了一种基于CORRELATO算法的新方法。这种混合方法整合了非线性回归、符号回归和因子分析的原理,并针对小数据集进行了优化。它能够揭示分子结构与宏观功能特性之间的复杂且可解释的分析关系。研究系统地对24种专门合成的低对称性酞菁染料进行了测试,这些染料包括单体和二聚体。它们的非线性光学(NLO)响应通过532纳米处的Z扫描测量进行了实验表征,而关键的电子结

    来源:Journal of Chemical Information and Modeling

    时间:2025-11-19


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