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与免疫检查点抑制剂的疗效和益处相关的皮肤不良反应:一项系统评价和荟萃分析
近年来,免疫检查点抑制剂(ICIs)的临床应用已成为癌症治疗领域的重要突破,尤其是在晚期或转移性肿瘤的治疗中,ICIs显著提升了患者的肿瘤反应率和生存预后。然而,在这一治疗过程中,免疫相关不良事件(irAEs)的出现往往伴随着治疗效果的提升,同时也带来了潜在的临床挑战。特别是在皮肤相关免疫不良事件(cirAEs)方面,尽管已有部分研究探讨其与患者预后之间的关系,但不同肿瘤亚型之间的证据仍存在不一致。因此,本研究旨在通过系统综述和荟萃分析,全面评估cirAEs及其亚型与癌症患者预后之间的关联。在癌症治疗中,免疫检查点抑制剂的作用机制是通过阻断免疫系统中的抑制性信号通路,增强T细胞对肿瘤的识别和攻
来源:Frontiers in Oncology
时间:2025-11-08
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KSRV:一种基于核主成分分析(Kernel PCA)的框架,用于以单细胞分辨率推断RNA的运动速度
理解基因表达的时间动态变化及其在空间背景下的模式,对于解析细胞分化过程至关重要。RNA速度分析作为一种新兴的技术手段,通过区分未剪接和已剪接的mRNA来估计基因表达的未来状态,为研究这些动态变化提供了强大的工具。然而,现有的空间转录组学技术在同时捕捉这两种mRNA时存在一定的局限性,尤其是在高分辨率下的应用。为了解决这一挑战,研究人员提出了一种新的计算框架——KSRV(基于核主成分分析的空间RNA速度推断),该框架整合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学数据,使得在空间解析的组织中能够更准确地推断RNA速度。KSRV经过了10x Visium数据集和MERFISH数据集的验证
来源:Frontiers in Genetics
时间:2025-11-08
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重组景观与转座元件在欧洲摇蚊种群中的相互作用机制研究
在基因组进化研究领域,转座元件(Transposable Elements, TE)一直被喻为基因组中的"暗物质"。这些能够改变自身位置的DNA序列不仅能够驱动基因组重排,更可能通过与其他基因组特征的相互作用塑造物种的演化轨迹。然而,长期以来,科学家们对TE与重组景观之间的复杂关系知之甚少——究竟是TE的分布影响了重组模式,还是重组机制本身通过自然选择对TE的活性产生了制约?这一"鸡与蛋"的难题在非模式生物中尤为突出,因为大多数研究都集中在果蝇、小鼠等传统模型生物上。摇蚊科昆虫Chironomus riparius为这一科学问题提供了独特的研究窗口。这种非叮咬性摇蚊不仅具有清晰的种群结构,其基
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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欧洲海鲈胚胎三倍体诱导的阶段性转录组与DNA甲基化响应:揭示多倍体适应机制
在生命演化历程中,多倍体现象(polyploidy)——即生物体拥有超过两套染色体的状态——犹如一把双刃剑。在植物界,多倍体是推动物种形成和适应进化的重要引擎;然而在动物界,由于生殖隔离等挑战,多倍体却相对罕见。有趣的是,鱼类成为这一规律的例外,不仅存在天然多倍体物种,人类还通过人工诱导三倍体技术(triploidy)为水产养殖业带来了革命性变革:三倍体鱼通常不育(尤其是雌性),有效避免了性成熟导致的生长减缓、肉质下降等问题,同时保持了与二倍体相似的生长性状。这背后隐藏着一个令人着迷的科学谜题:三倍体鱼如何平衡额外那套染色体的基因表达?是否存在类似剂量补偿(dosage compensatio
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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特征选择解耦细胞类型与状态转录程序:提升单细胞多条件差异分析一致性
随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的成熟,科学家们能够以前所未有的分辨率探索细胞间的异质性。在多条件实验设计中(如疾病状态比较或处理前后对照),研究人员不仅关注细胞亚群组成的变化(差异丰度分析,DAA),更希望深入了解特定细胞亚群在不同条件下基因表达的差异(差异状态分析,DSA)。然而,当前分析流程面临一个核心挑战:用于构建细胞低维嵌入空间的特征(基因)选择通常同时包含了细胞类型(相对稳定的特征)和细胞状态(短暂变化的特征)的转录信号,这导致下游的差异分析结果高度依赖于所选的嵌入空间,使得不同分析方法(如基于聚类的方法与基于邻域的非聚类方法)得出的结论难以比较。为了解决这一难题,W
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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骡鸭胚胎热编程的短期转录动力学研究:肝脏代谢调控新机制
在畜禽生产领域,如何通过早期环境干预提升动物生产性能一直是研究热点。胚胎热编程(embryonic thermal programming)作为一种有效的干预手段,已被证实能够调控禽类出生后的生理代谢特性。特别是在骡鸭(mule duck)生产中,前期研究发现胚胎期适度的温度干预可显著提高出雏后填饲阶段的肥肝产量,但这一现象背后的分子机制尚不明确。传统研究多聚焦于热刺激的长期效应,而对编程过程中的动态转录变化缺乏系统解析。为此,Andrieux等人在《BMC Genomics》发表研究,首次采用时间动力学方法揭示骡鸭胚胎肝脏对热刺激的短期转录响应。团队设计了两阶段实验:第一阶段在热刺激启动日(
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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对中间马蹄蝠(Rhinolophus affinis)器官的单细胞分析揭示了病毒感染及抗病毒免疫特征
这项研究聚焦于蝙蝠肺部和肾脏中的病毒表达情况,特别是以“大耳蝠”(Rhinolophus affinis)为对象,探索其在病毒感染下的免疫反应机制。蝙蝠作为多种病毒的天然宿主,包括冠状病毒、狂犬病毒和埃博拉病毒等,但它们通常不会表现出明显的疾病症状。这种独特的免疫耐受能力使其成为研究病毒与宿主相互作用的重要模型。通过单细胞转录组学技术,研究者能够深入解析蝙蝠体内不同细胞类型在病毒感染下的基因表达模式,从而揭示其免疫系统如何在不引起严重病理反应的情况下控制病毒复制。在研究过程中,科学家们使用了Viral-Track这一计算工具,用于检测病毒RNA并根据转录组特征对感染细胞进行分类。与传统的单细胞
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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西班牙罗姆人父系遗传多样性解析:奠基者效应与地域亚结构揭示六百年迁徙史
在伊比利亚半岛生活了六个世纪的卡莱罗姆人,是欧洲罗姆人群体中规模最大却遗传研究最薄弱的支系之一。尽管语言学与历史记录均指向其南亚起源,但罗姆人如何穿越欧亚大陆、在迁徙过程中与哪些人群发生基因交流,以及定居伊比利亚后是否形成内部遗传结构,始终是人口遗传学领域的悬案。更引人深思的是,民间长期流传着“罗姆人经北非迁入伊比利亚”或“与犹太人群存在亲缘关系”的假说,而先前线粒体DNA(mtDNA)研究揭示的母系遗传图谱显示,罗姆人存在显著的性别偏向性混合模式——母系基因库中欧洲成分高达86%,南亚成分仅占14%。这是否意味着父系遗传会呈现截然不同的图景?为填补这一空白,由西班牙庞培法布拉大学Giacom
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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揭示大肠杆菌泛基因组中扩展核心基因变异谱系:从假基因化到结构重塑的进化轨迹
在微生物基因组学研究领域,大肠杆菌(Escherichia coli)作为模式生物一直备受关注。这种细菌展现出惊人的基因组可塑性,能够适应从哺乳动物肠道到淡水生态系统乃至医院环境等多样化生存空间。在泛基因组分析框架下,基因通常被划分为核心基因组(几乎所有菌株中都存在,≥99%)、附属基因组(菌株特异性)以及扩展核心基因组(大多数但非全部基因组中存在)三类。然而,当前主流的泛基因组分析工具如Roary,采用严格的蛋白序列同一性阈值(通常≥95%)进行聚类分析,这种"一刀切"的策略存在明显局限性。即使是单一突变事件——如大片段插入缺失(indel)、无义突变或高速率序列分歧——都可能导致蛋白同一性
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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大肠杆菌对不同生长阶段全氟烷基物质暴露的转录组应答机制研究
在现代化工产业快速发展的背景下,全氟烷基物质(PFAS)作为一类具有卓越稳定性的氟化化合物,被广泛应用于消防泡沫、不粘涂层等工业产品中。然而,这种稳定性却成为了环境持久性污染的根源——PFAS在自然环境中难以降解,已在水体、土壤乃至生物体内广泛检出。更令人担忧的是,研究表明PFAS暴露与免疫毒性、肝损伤等健康风险密切相关。面对这一新兴环境污染物,传统检测和修复技术因PFAS复杂的化学特性而面临巨大挑战,这促使科学家转向生物系统寻找解决方案。微生物作为生态系统的重要组成,其与PFAS的相互作用机制却鲜为人知。为此,Wintenberg等人在《BMC Genomics》上发表了创新性研究,以大肠杆
来源:BMC Genomics
时间:2025-11-08
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阿加西斯树脂与孪叶豆树脂的节肢动物捕获差异及其对琥珀化石记录解释的启示
在古生物学研究中,琥珀如同一个神奇的时空胶囊,能够将数千万年前的生物细节完美封存。然而科学家们长期面临一个令人困惑的谜题:为什么白垩纪的琥珀沉积中节肢动物包裹体如此稀少,而新生代的琥珀却往往富含这些古生物证据?这种差异究竟反映了古代森林生态系统的真实面貌,还是源于不同树脂本身的捕获特性?这一问题的解答对于准确重建远古森林的生物群落结构至关重要。由Monica M. Solorzano-Kraemer带领的国际研究团队在《BMC Biology》上发表了他们的最新研究成果。研究聚焦于两种关键的树脂生产树种:属于针叶树的阿加西斯和属于被子植物的孪叶豆。前者被认为是白垩纪许多琥珀的来源,而后者则是许
来源:BMC Biology
时间:2025-11-08
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单角羚诱导的心力衰竭大鼠模型中前肢肌肉的功能、组织学和分子适应性变化
摘要心力衰竭后骨骼肌的组织学变化在下肢已得到广泛研究,包括慢肌纤维向快肌纤维的转变、快肌纤维为主的萎缩、毛细血管数量减少以及胶原蛋白含量增加。然而,上肢肌肉的组织学变化仍然很大程度上未被探索。鉴于握力和上肢肌肉质量在心力衰竭中的预后意义,阐明这些变化至关重要。我们的研究旨在探讨单克罗塔尔林(MCT)诱导的心力衰竭大鼠模型中前肢肌肉的组织学变化。将大鼠分为对照组(注射生理盐水)和心力衰竭组(注射MCT)。在第27天测量握力,并在第28天对肱二头肌(BiB)和指深屈肌(FDP)进行组织学分析。心力衰竭组的握力显著下降。BiB和FDP均表现出快肌纤维的显著萎缩,而慢肌纤维的大小没有变化。BiB的毛细
来源:Histochemistry and Cell Biology
时间:2025-11-08
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大麻(Cannabis sativa L.)根和茎提取物对日本脑炎病毒的杀病毒活性:甾醇(stigmasterol)的作用
摘要由于缺乏有效的抗病毒疗法,日本脑炎病毒(JEV)对公共卫生构成了重大威胁。为了发现新的抗病毒剂,我们评估了从大麻(Cannabis sativa L.)的根和茎中提取的乙醇提取物及有机溶剂组分具有一定的抗病毒活性。通过体外细胞毒性实验确定了这些提取物和组分的非细胞毒性浓度。在这些浓度下,多个组分表现出强烈的杀病毒活性,其中己烷和氯仿组分的效果最为显著。用这些组分处理病毒感染的细胞后,病毒复制显著受到抑制,这体现在JEV mRNA和E蛋白表达的减少上。相比之下,预先处理或同时处理并未产生明显的抗病毒效果。气相色谱-质谱(GC-MS)分析显示,活性组分中含有多种已知的大麻衍生化合物。其中,豆甾
来源:Archives of Virology
时间:2025-11-08
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银纳米颗粒抑制了黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中某些幼虫胰岛素信号基因的表达,导致幼虫发育迟缓以及体内循环葡萄糖水平升高
摘要银纳米颗粒在日常生活中具有多种用途,但它们对黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的发育产生了不良影响。我们旨在探讨银纳米颗粒是否通过抑制某些调控胰岛素信号传导的幼虫基因来导致果蝇的发育受阻,而这些基因的改变可能进一步影响幼虫的葡萄糖代谢。实验中,5只雄性和5只雌性成年黑腹果蝇被暴露在浓度为25–300 mg/L的银纳米颗粒环境中。研究人员测量了对照组和实验组中第三龄幼虫的发育延迟程度及体长变化。从幼虫总RNA中提取了cDNA,并通过定量实时PCR技术检测了、dilp5、dInR和dAkt等基因的mRNA表达水平。与对照组相比,银纳米颗粒会显著延迟第三龄幼虫、蛹及成年果
来源:The Nucleus
时间:2025-11-08
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印度大戟(Acalypha indica Linn.)叶片的甲醇提取物通过Bax/Bcl2介导的内源性凋亡途径抑制A549腺癌细胞增殖
摘要非小细胞肺癌(NSCLC)的侵袭性比小细胞肺癌高85%,这导致了更多肺部疾病的发生,因此需要寻找替代药物疗法。本研究旨在探讨A. indica叶片的甲醇提取物(AILME)对A549腺癌细胞具有抗癌作用,并通过细胞毒性分析以及膜破坏和细胞凋亡检测来验证其可能的作用机制。AO/EtBr染色证实了凋亡小体的形成,而蛋白质表达的变化则通过Western blot技术进行了研究。AILME处理后,处理过的细胞出现核膜破坏和DNA片段化。使用Annexin V-FITC和碘化丙啶(PI)进行的凋亡检测显示,在低于IC50(120.05 µg/mL)和IC50(240.1 µg/mL)的浓度下,细胞生
来源:The Nucleus
时间:2025-11-08
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低剂量光子计数探测器CT筛查类风湿关节炎相关间质性肺病:一项新兴的前瞻性病例对照研究
类风湿关节炎(RA)是一种常见的系统性自身免疫性疾病,全球患病率约为0.5-1.5%。除了关节病变外,RA还可累及多个器官系统,其中肺部受累尤其是间质性肺病(ILD)是最严重的关节外表现之一。RA相关间质性肺病(RA-ILD)是导致RA患者死亡的重要原因,与无ILD的RA患者相比,死亡风险增加三倍。然而,RA-ILD的早期诊断面临巨大挑战,因为疾病往往在亚临床阶段悄然发生,传统的筛查方法如胸部X线摄影(DR)和肺功能检查(PFTs)敏感性有限,难以捕捉早期的肺部细微改变。目前临床上缺乏统一的RA-ILD筛查指南,而高分辨率CT(HRCT)虽然诊断准确性高,但其较高的辐射剂量(5-15 mSv)
来源:Arthritis Research & Therapy
时间:2025-11-08
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基于深度学习的放射组学模型,用于黑色素瘤的非侵入性诊断
摘要通俗语言总结 本研究旨在开发一种结合深度学习和放射组学的非侵入性诊断模型,以提高早期黑色素瘤诊断的准确性和临床实用性。2022年1月至2024年12月期间,共有350名患有皮肤色素性病变的患者被纳入研究,并按7:3的比例随机分为训练集(n=245)和验证集(n=105)。所有患者的完整信息均被收集。通过单变量分析筛选出与恶性黑色素瘤相关的因素,然后利用最小绝对收缩和选择算子回归方法对变量进行优化,最终通过多变量逻辑回归确定独立预测因子。使用Python 3.8.5和sklearn库构建了随机森林(RF)、支持向量机(SVM)和K近邻(KNN)模型。模型性能通过接收者操作特征曲线下面积(AU
来源:Melanoma Research
时间:2025-11-08
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儿童语音频率加权的发展变化
摘要 研究目的: 语音可懂度的估计取决于语音中各频谱带的可听度以及每个频谱带对语音识别的重要性权重。在儿童中,将语音可懂度估计与识别准确性联系起来的传递函数会随年龄变化,这表明在临床应用语音可懂度指标时需要考虑儿童的发展变化。先前的研究表明,儿童利用频谱线索进行语音识别的方式存在发展性差异,但构成语音识别模型基础的个体频谱带重要性差异尚未在儿童中进行直接验证。本研究的目的是确定儿童在不同年龄阶段的频谱带重要性权重是否存在差异,如果存在差异,还需探究这些差异与词汇量和认知能力发展变化之间的关系。
来源:EAR AND HEARING
时间:2025-11-08
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关于Bacillus paramycoides RZ3MS14的基因组研究:这种来自亚马逊雨林的多性状植物生长促进根瘤菌能够改善甘蔗的生长
摘要 Bacillus属的某些物种具有显著的促进植物生长的特性(PGPTs),并且在可持续农业中的生物技术潜力方面得到了广泛认可。其中,Bacillus paramycoides因其在绿色生物聚合物合成、金属基纳米颗粒制备以及抑制植物病原真菌方面的多功能性而备受关注;然而,其促进植物生长的特性仍缺乏深入研究。在这项研究中,我们对从亚马逊雨林瓜拉纳植物根际分离出的B. paramycoides RZ3MS14采用了基因组学和生理学相结合的方法,通过体外和体内实验来探索和验证其潜在的促进植物生长的特性。B. paramycoides R
来源:FEMS Microbiology Letters
时间:2025-11-08
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生长条件对Pheronema carpenteri可培养细菌丰度、多样性及其抗菌潜力的影响研究
随着抗生素耐药性危机日益严峻,人类迫切需要从非传统环境中发现新型抗菌化合物。深海因其极端环境(低温、高压、低营养)孕育着独特的微生物群落,成为新型天然产物挖掘的宝库。其中,深海海绵作为"微生物酒店",其共生的细菌群体展现出丰富的生物活性潜力。然而,传统培养方法仅能捕获不到1%的微生物多样性,导致大量具有生物活性的菌株被遗漏。在这项发表于《FEMS Microbes》的研究中,研究人员将目光投向了东北大西洋深海的玻璃海绵Pheronema carpenteri。这种海绵以往研究较少,但其脆弱的骨骼结构暗示其共生微生物可能具有独特的防御机制。为了克服"平板计数异常"难题,研究团队设计了一套多维培养
来源:FEMS Microbes
时间:2025-11-08