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综述:多学科方法为临床有效的癌症肽疫苗开辟道路
### 癌症肽疫苗的研究背景与意义癌症严重威胁人类健康,是全球第二大死因,预计未来患者数量还会大幅增加。目前的癌症治疗手段,如手术、化疗和放疗,虽对部分癌症有效,但常伴有严重副作用,且对侵袭性癌症的治疗效果有限。因此,开发新的癌症治疗方法迫在眉睫。疫苗在预防传染病方面成效显著,但用于癌症治疗却面临诸多挑战。诱导强大的细胞毒性 CD8+ T 淋巴细胞(CTL)效应和记忆反应,对癌症免疫治疗至关重要。基于肽的 T 细胞疫苗,因能同时诱导 CTL 和 CD4+ T 辅助细胞反应,成为癌症免疫治疗的研究热点。CTL 免疫反应机制CTL 在适应性免疫系统抵御病毒感染和癌症中起核心作用。未激活的 T 细胞
来源:npj Vaccines
时间:2025-04-11
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多模态深度学习算法在肺动脉高压筛查中的开发与验证:突破传统超声心动图局限的创新诊断模型
肺动脉高压(PH)是一种威胁生命的疾病,全球约1%人口受累,65岁以上人群患病率高达10%。这种以肺血管进行性重塑为特征的疾病,最终会导致右心衰竭甚至死亡。然而,PH的诊断却面临巨大挑战——从症状出现到确诊平均延误2.5-4年。这种延误部分源于现有诊断方法的局限性:虽然右心导管检查(RHC)是诊断金标准,但其侵入性、复杂性和高成本使其难以用于大规模筛查;而作为主要筛查工具的经胸超声心动图(TTE),其特异性仅0.56,敏感性0.88,存在大量假阳性和假阴性结果。针对这一临床困境,由阜外医院领衔的多中心研究团队开发了基于多模态深度学习的肺动脉高压筛查模型(MMF-PH)。这项发表在《npj Di
来源:npj Digital Medicine
时间:2025-04-11
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近红外二区聚集诱导发光纳米颗粒伪装预激活巨噬细胞膜用于肺结核光热诊疗:创新策略与显著成效
光热诊疗能够同时实现诊断和治疗,在无创性、可控性和低耐药性方面具有显著优势,为疾病治疗提供了一种有前景的方法。通过整合具有聚集诱导发光(AIE)特性的第二近红外(NIR-II,1,000–1,700nm)光热诊疗剂和具有特定靶向能力的细胞膜,研究人员开发出一种多功能仿生纳米颗粒(NP),用于肺结核(TB)的精准光热诊疗。用预激活的巨噬细胞膜包覆光热诊疗剂可形成仿生纳米颗粒,其通过病变 - 病原体双靶向策略与肺结核特异性结合,能够通过 NIR-II 荧光成像准确检测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis),并利用 1,064nm 激光照射进行精确的光热治疗。与传统治疗
来源:Nature Protocols
时间:2025-04-11
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多组学研究中伴随元数据共享与格式化的感知和技术障碍及解决策略
一、引言元数据在多组学数据分析中的作用:过去十年,下一代测序技术发展使大量公共组学数据可获取,这些数据存储在如 ArrayExpress、序列读取档案(Sequence Read Archive)和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus)等公共存储库中。元数据是关于原始数据生成、来源和背景的描述性信息,遵循 FAIR(可发现、可访问、可互操作、可重用)原则对数据管理至关重要。它能帮助研究人员理解、管理、分析组学数据,提高数据的可发现性、解释性,助力数据库管理和研究的可重复性。元数据在二次分析中的作用:二次分析是对现有数据和元数据的重新分析,有助于生物医学领域的新发现
来源:Cell Genomics
时间:2025-04-11
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综述:肿瘤微环境至关重要:FOSTER 联盟对基于微环境的骨肉瘤治疗方法的见解
### 1. 骨肉瘤现状与肿瘤微环境的重要性骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是一种罕见的恶性原发性骨肿瘤,主要影响儿童和年轻人。尽管癌症治疗取得了进展,但 OS 的治疗效果和患者预后改善有限。传统治疗手段如手术和化疗长期占据主导,生存率提升幅度较小,靶向治疗也因疾病的复杂性和异质性成效不佳。近年来,肿瘤微环境(Tumor Microenvironment,TME)在肿瘤进展和治疗耐药中的重要性日益凸显,尤其是在 OS 中。OS 的 TME 具有独特特征,细胞外基质(Extracellular Matrix,ECM)改变、免疫细胞相互作用异常以及缺氧环境等,都对肿瘤行为和治疗反应产生重要
来源:Cancer and Metastasis Reviews
时间:2025-04-11
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基于DNA邻近扫描编码测序技术(PADSE-seq)的膜蛋白纳米级组织全景图谱构建
细胞膜蛋白的惊人多样性和精确定位构成了动态纳米微环境的核心特征。传统方法受限于有限的蛋白覆盖范围,难以全面解析膜蛋白的复杂空间组织。为此,科学家们开发出革命性的邻近激活DNA扫描编码测序技术(Proximity-activated DNA scanning encoded sequencing, PADSE-seq)。这项技术采用长度可调的DNA扫描探针(SPs)和条形码探针(BPs),通过探针间杂交激活切口内切酶,触发SPs的循环释放以实现纳米级邻近蛋白搜索。被切割的BPs随后作为引物启动链置换扩增(strand displacement amplification)和双向延伸反应,生成包含
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2025-04-11
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Eukfinder:从宏基因组数据中挖掘真核微生物基因组序列的创新管道及其在肠道共生体研究中的应用
ABSTRACTEukfinder是一款针对宏基因组数据中真核微生物基因组回收的创新型生物信息学流程。其通过结合双数据库分类(Centrifuge和PLAST)与定制化分箱流程,解决了传统方法(如Refmapping和机器学习工具EukRep/Tiara)在真核序列识别中的局限性。研究团队利用模拟肠道微生物组数据集(含不同比例的Blastocystis reads)和真实人类肠道样本验证其性能,结果显示Eukfinder在基因组完整性、连续性和准确性上均优于同类工具,尤其在高测序深度下可回收近完整基因组。INTRODUCTION微生物真核生物(如Blastocystis)的基因组研究长期滞后于
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MetaFlowTrain:揭秘微生物间代谢互作的创新利器,开启生态与健康研究新征程
在神秘的自然界中,陆地和海洋生态系统里都活跃着各种各样的微生物群落,它们的组成和多样性已被人们有所了解。然而,宿主、微生物和环境之间相互作用的机制却依旧藏在重重迷雾之中。这些相互作用不仅依赖于生物之间的直接接触,还和它们之间的代谢交换密切相关,而这种代谢交换在推动更高级别的生物组织形成,以及生物之间的共存或排斥方面,起着至关重要的作用。当前,研究人员在研究宿主 - 微生物以及微生物 - 微生物之间的相互作用时,常用的方法是在单隔室无菌系统中混合培养生物。虽然这些方法在解析相互作用的结果和相关机制上有一定作用,但在深入了解生物或群落之间的代谢通量和交换方面,还远远不够。其他研究外代谢物介导的生物
来源:Nature Communications
时间:2025-04-11
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干涉散射显微镜(iSCAT):无标记成像技术的前沿探索与生命科学洞察
在过去二十年里,干涉散射(iSCAT)显微镜已成为一种强大的无标记成像方法,在基础科学和技术领域有着广泛应用。iSCAT 通过与参考光束干涉来检测亚波长物体的散射。在多种照明和检测方案下,iSCAT 利用振幅和相位信息达到单分子检测灵敏度,可确定纳米颗粒的大小、质量和折射率,在纳米颗粒的三维追踪中实现高时空精度,对亚细胞纳米结构进行成像,还能量化固体中的超快扩散和能量传输。在本入门指南中,从理论和实践角度阐述了 iSCAT 检测和成像的基本原理。探讨了影响可达到的信噪比的各种因素,而信噪比又决定了灵敏度和速度等关键性能特征。还概述了 iSCAT 发挥重要作用、提供新见解的部分应用。最后,讨论了
来源:Nature Reviews Methods Primers
时间:2025-04-11
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探索多语言英语教师焦虑的时变特征:基于个体动态学方法的研究
在语言教育领域,教师焦虑如同水面下的冰山,长期被学生焦虑研究的光芒所掩盖。尽管Horwitz等学者早在1986年就构建了外语课堂焦虑量表(FLCAS),但二十余年来,研究者们始终将镜头对准学习者,忽视了讲台上那些同样会紧张到手指发抖的教师群体。随着复杂动态系统理论(CDST)在二语习得(SLA)领域的兴起,情绪研究迎来了"动态转向",但令人惊讶的是,即便是这场范式革命,也几乎将教师焦虑排除在讨论范围之外——这种学术盲点直接导致教师培训项目中情绪管理模块的缺失,使得无数教师在无人指导的情况下独自面对课堂中的情绪风暴。正是为了填补这一双重空白,来自Niğde Ömer Halisdemir Uni
来源:BMC Psychology
时间:2025-04-11
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生物基壳聚糖纳米水凝胶薄膜:拳参和钙掺杂碳点协同促进凝血的创新材料
在生活中,创伤出血是一个常见且危险的问题,每年因创伤出血导致的死亡人数众多。皮肤作为人体最大的器官,一旦受伤,不仅会引发出血,还可能遭受细菌感染,影响伤口愈合,严重时甚至危及生命。目前,合成的伤口愈合方法虽然有所发展,但存在诸多弊端,如保留时间短、成本高、疗效低,更严重的是毒性大,容易引发感染和炎症,产生皮肤不良反应。因此,开发高性能、无毒的止血材料迫在眉睫。来自伊朗的研究人员针对这些问题展开研究,他们将目光聚焦于生物材料。壳聚糖(CS)因其具有生物相容性、酶降解能力和抗菌作用等独特性质,成为生物医学应用的理想材料。而纳米颗粒,尤其是碳点(CDs),凭借其高表面活性、大量功能基团、生物相容性、
来源:Journal of Biological Engineering
时间:2025-04-11
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综述:间充质干细胞(MSCs)及其外泌体:通过激活信号通路促进皮肤再生的新方法
### 间充质干细胞(MSCs)及其外泌体在皮肤再生中的重要意义在外科和再生医学领域,加速伤口愈合是一个至关重要的目标。伤口愈合过程主要包含炎症、细胞增殖以及组织修复这三个关键阶段。间充质干细胞(MSCs)在促进组织再生方面展现出显著的治疗潜力,尤其是在增强表皮细胞迁移和增殖上作用突出。然而,MSCs 介导伤口愈合的精确分子机制尚未完全明晰。MSCs 及其外泌体在伤口修复中的作用MSCs 能够加速伤口闭合、增加胶原蛋白沉积并调节免疫反应,进而促进组织再生。体外和体内研究都证实了这些效果。而外泌体作为 MSCs 分泌的重要组成部分,同样在伤口修复中发挥着关键作用。关键信号通路在伤口修复中的调控机
来源:Journal of Molecular Histology
时间:2025-04-11
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探索噻唑并嘧啶并喹啉衍生物的非线性光学性质:Z 扫描技术与密度泛函理论(DFT)联合研究的意义与价值
研究了含有不同苯环取代基的噻唑并嘧啶并喹啉衍生物的非线性光学(NLO)性质。借助 Z 扫描技术和高斯 09 程序的密度泛函理论(DFT),对化合物分子结构和偶极矩之间的关系展开研究。所有结构都在 M06 - 2X/6 - 311G 水平下进行了优化。结果发现,噻唑并嘧啶并喹啉衍生物之一,6 -(3,4 - 二羟基苯基) - 9,9 - 二甲基 - 1,2,6,9,10,11 - 六氢 - 5H - 噻唑并 [2',3':2,3] 嘧啶并 [4,5 - b] 喹啉 - 5,7 (8H)- 二酮(4a)相较于其他衍生物,具有更大的非线性吸收系数(β)、非线性折射率(n2)和偶极矩,展现出在 NLO
来源:Journal of Fluorescence
时间:2025-04-11
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“Thermal Jacket”:早产儿和低出生体重儿体温管理的创新突破
在全球范围内,早产和低出生体重(LBW,birthweight less than 2500 g)问题一直是困扰医学界的难题。每年,超过 1500 万新生儿早产(<37 completed weeks of gestation),约 2000 万新生儿出生时体重过低,这些脆弱的新生儿占全球新生儿死亡人数的近 16%。在孟加拉国,早产率高达 16.2%,低出生体重率为 23%。世界卫生组织(WHO)推荐的袋鼠式护理(KMC),虽能通过母婴皮肤接触维持新生儿体温(36.5 - 37.5°C/97.7 - 99.5°F),但在实际应用中却困难重重。比如,母亲在住院期间缺乏家人支持,个人休息时间
来源:Scientific Reports
时间:2025-04-11
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透明质酸修饰川芎油脂质体:预防皮肤光老化的创新疗法
在阳光灿烂的日子里,人们尽情享受日光的同时,皮肤却在悄悄遭受着紫外线的伤害。其中,紫外线 B(UVB)辐射是导致皮肤光老化的重要 “元凶”。长期暴露在 UVB 下,皮肤不仅会加速衰老,出现皱纹、松弛等问题,还可能增加患皮肤癌的风险。而现有的防晒霜产品,部分含有可能引起皮肤毒性的成分,这让人们在防晒时陷入了两难的境地。为了寻找更安全有效的防晒方法,成都中医药大学的研究人员展开了一项极具意义的研究。他们聚焦于透明质酸(HA)和川芎油(CXO),这两种物质都具有出色的抗氧化和抗凋亡特性,或许能为解决皮肤光老化问题带来新的希望。研究人员将 HA 和 CXO 结合,制备出了一种复合纳米系统 —— 透明质
来源:Scientific Reports
时间:2025-04-11
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Feature fusion with attributed deepwalk:蛋白质 - 蛋白质相互作用预测的创新策略
在生命的微观世界里,蛋白质就像一个个忙碌的 “小工匠”,它们之间的相互作用(Protein - Protein Interactions,PPIs)至关重要,参与着细胞内各种活动,如信号传导、细胞通讯和代谢调节等。一旦这些 “小工匠” 之间的合作出现异常,就可能引发各种疾病,像癌症、心血管疾病等。因此,搞清楚蛋白质之间的相互作用关系,对于理解疾病发生机制和开发治疗策略意义重大。目前,虽然有一些传统实验方法可以检测 PPIs,比如免疫共沉淀(Co - Immunoprecipitation,Co - IP)、酵母双杂交(Yeast Two - Hybrid,Y2H)系统和蛋白质交联技术等,但这些
来源:Scientific Reports
时间:2025-04-11
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基于高通量测序技术的PPV抗性诱导研究:四种发夹结构在烟草中的RNAi机制解析
在全球核果类作物产业中,李痘病毒(Plum pox virus, PPV)引发的"沙卡病"堪称植物界的"癌症",每年造成高达100%的果实脱落率。这种由蚜虫传播的病毒自20世纪初在保加利亚首次报道后,已肆虐除澳大利亚外的所有大陆。传统防治措施收效甚微,而检疫制度在多国的失效更凸显了基因工程解决方案的紧迫性。面对这一挑战,土耳其Erciyes大学基因组与干细胞研究中心的Maryam Ghaderi Sohi团队独辟蹊径,利用土耳其本土流行的PPV-T毒株KyEsAp301,开展了一项突破性的RNA干扰(RNAi)抗病毒研究。研究团队采用Gateway克隆技术构建了四种ihpRNA载体,分别靶向P
来源:Scientific Reports
时间:2025-04-11
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创新蛋白降解技术:开启农业应用新征程 —— 靶向害虫蛋白的 PROTACs 研究
在农业生产的广阔战场上,害虫一直是威胁作物生长、影响粮食产量的 “顽固敌人”。传统的农药虽然在一定程度上能够抵御害虫侵袭,但随着时间的推移,问题逐渐凸显。一方面,害虫对农药的抗性不断增强,使得农药的效果大打折扣;另一方面,日益严格的环境法规对农药的使用提出了更高要求,而新的有效成分研发又进展缓慢。在这样的困境下,开发创新的作物保护解决方案迫在眉睫。与此同时,靶向蛋白降解(TPD)技术在药物研发领域正掀起一场革命。其中,蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)凭借独特的作用机制脱颖而出。PROTACs 是一种异双功能小分子,它能招募天然存在的 E3 泛素连接酶(E3 ubiquitin ligase
来源:Communications Biology
时间:2025-04-11
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综述:潜伏结核感染诊断方法的进展:区分近期与远期感染
潜伏结核诊断的时空挑战全球约四分之一人口携带潜伏结核感染(LTBI),这些无症状感染者构成活动性结核病(ATB)的庞大储备库。研究表明,感染后前2年进展为活动性结核的风险比远期感染高15倍,这凸显了区分感染时间窗对精准干预的重要性。然而,传统诊断工具TST和IGRA依赖宿主对结核分枝杆菌(MTB)抗原的免疫记忆反应,其阳性结果可持续终身,无法辨别新近感染与远期感染。现有诊断工具的局限性结核菌素皮肤试验(TST)采用纯化蛋白衍生物(PPD)诱发迟发型超敏反应,但存在BCG疫苗接种和环境分枝杆菌交叉反应的干扰。γ-干扰素释放试验(IGRA)通过检测ESAT-6/CFP-10特异性T细胞产生的IFN
来源:One Health Outlook
时间:2025-04-11
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综述:利用邻近依赖性生物素识别技术(BioID)表征宿主与细菌效应蛋白的相互作用
细菌效应蛋白在宿主 - 微生物相互作用中的角色细菌感染对全球公共卫生构成重大挑战,随着抗生素耐药性的增加,深入了解感染过程对于制定治疗和预防策略至关重要。细菌病原体进化出多种策略来与宿主相互作用并建立感染,其中细菌毒力蛋白起着关键作用,而效应蛋白(effector proteins)是一类在感染过程中发挥重要功能的分泌蛋白。在感染过程中,效应蛋白通过介导宿主 - 病原体蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPIs),操纵宿主细胞功能,以利于病原体的生存、复制和传播 。例如,细胞内病原体鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica)编码两种 III 型分泌系统(T3SS),分别位于致病岛 SP
来源:Communications Biology
时间:2025-04-11