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  • 印度淡水巨型动物保护研究:时间维度下的出版格局与趋势分析

    在印度这个生物多样性热点国家,淡水生态系统正面临着前所未有的威胁。淡水巨型动物——包括体重超过30公斤的鱼类、爬行动物和哺乳动物——作为水生生态系统的关键组成部分,却长期处于研究不足的困境。尽管印度实施了《野生动物保护法》(WLPA)等多项保护法规,但淡水巨型动物的保护效果仍不尽如人意。这种保护与研究之间的脱节现象,促使研究人员对印度淡水巨型动物(IFM)的研究格局进行了首次全面评估。为了揭示印度淡水巨型动物研究的发展轨迹,研究团队采用了创新的文献计量分析方法。他们首先确定了35种符合标准的印度淡水巨型动物,包括19种鱼类、9种爬行动物和7种哺乳动物。通过系统检索Web of Science数

    来源:Biological Psychiatry

    时间:2025-10-23

  • 植物根系种内性状变异沿纬度梯度变化格局及其生态意义

    在郁郁葱葱的森林地下,隐藏着一个复杂而精细的世界——植物根系。它们不仅是植物的锚定点,更是感知环境、获取资源的关键器官。长期以来,生态学家通过研究植物功能性状来理解物种如何适应环境、群落如何构建以及生态系统如何运作。然而,传统性状生态学多基于物种水平的平均值比较,很大程度上忽略了一个关键事实:同一物种的不同个体,其性状并非一成不变。这种种内性状变异(Intraspecific Trait Variation, ITV)由遗传变异和表型可塑性共同驱动,对物种共存和生态系统功能可能产生深远影响。尽管人们对植物地上部分(尤其是叶片)的ITV已有较多认识(平均约占全球总性状变异的25%),但对地下根系

    来源:Nature Communications

    时间:2025-10-23

  • 全球地下生态系统多功能性对气候变化的非线性响应及其未来预测

    随着全球气候变化加剧,生态系统功能的可持续性面临严峻挑战。地下生态系统作为支撑陆地生态系统运行的关键组成部分,其多功能性(Belowground Ecosystem Multifunctionality, BEMF)维系着碳储存、养分循环和生物多样性等核心生态过程。然而,当前研究多局限于区域尺度或特定生物群系,对全球尺度下BEMF的分布格局及其对气候变化的响应机制认知严重不足。尤其缺乏对气候因子突变阈值及其与生物、非生物因子交互作用的系统解析,这极大限制了预测未来气候变化对生态系统功能影响的准确性。针对这一科学空白,由中国科学院青藏高原研究所孙健研究员领衔的国际团队,在《Nature Comm

    来源:Nature Communications

    时间:2025-10-23

  • 格林氏图克托草基因组图谱揭示加州季节性池塘两栖禾草的进化适应与保护意义

    在加州中央山谷短暂存在的季节性池塘中,孕育着一类独特的生命奇迹——它们能在冬春积水的淹没状态下萌芽,又在夏季干涸的龟裂土地上繁茂生长。这类被称为Orcuttiinae亚族的禾草,包括格林氏图克托草(Tuctoria greenei)等9个物种,是验证植物水生到陆生适应性演化的"活化石"。然而随着加州95%以上的季节性池塘因城市扩张和农业开发而消失,这些特化物种的生存空间被严重压缩,格林氏图克托草自1997年起被列入美国濒危物种名录,现存种群仅存31个且多数呈现衰退趋势。面对栖息地碎片化与气候变化双重压力,物种保护亟需基因组学层面的支撑。传统研究仅能通过微卫星标记等有限手段评估遗传多样性,无法揭

    来源:Journal of Heredity

    时间:2025-10-23

  • 综述:海藻与废塑料热解可持续生产生物油的最新进展:综述

    样本采集与区位特征研究团队从孟加拉国孙德尔本斯红树林保护区系统采集了尼帕棕榈(Nypa fruticans)根系样本。样品经过蒸馏水与去离子水分级清洗至中性后,通过自然晾晒与110°C烘箱干燥24小时完成预处理,确保去除水分及可溶性杂质。这种标准化处理流程为后续活化实验提供了均质原料基础。理化特性深度解析通过工业分析与元素分析对四种活性炭变体(N1-N4)进行系统评估。数据显示N3样品展现出最优异的燃料特性:固定碳含量达51.2%,碳元素占比88%,热值高达7850.50 kcal/kg。值得注意的是,N4样品因灰分(13.3%)与水分(5.2%)含量最高导致能量特性受损。这些理化参数为理解材

    来源:Biomass and Bioenergy

    时间:2025-10-23

  • 前瞻性保护指数:揭示全球脊椎动物保护中被忽视的未来优先事项

    引言人类活动导致的环境压力预计在21世纪将持续加剧。因此,开发面向未来的工具和方法来预测生物多样性面临的压力,对于有效确定保护行动的优先级、补充现有方法至关重要。本研究开发了一个连续的保护优先级指数——前瞻性保护指数(PCI),该指数整合了预测的未来外部威胁以及可能 predispose 物种脆弱性的特征。研究人员使用PCI评估了全球33,560种陆生脊椎动物的保护优先级,将其结果与国际自然保护联盟(IUCN)濒危物种红色名录中这些物种的灭绝风险类别进行了比较,并研究了这些物种未来保护需求的空间和系统发育格局。结果PCI与IUCN红色名录的互补性PCI得分在被分配相同IUCN红色名录类别的物种

    来源:PLOS Biology

    时间:2025-10-23

  • 肠道菌群代谢功能群:不同结构菊粉特异性代谢特征与健康关联的新见解

    ABSTRACT膳食纤维对健康的促进作用通常归因于大肠细菌发酵及其相关的生物活性代谢物。历史上,后者的研究主要集中在短链脂肪酸(SCFAs),如丁酸盐。胃肠道微生物群产生数千种异源代谢物(微生物衍生的“非宿主”代谢物)。其中大多数在组成和潜在生物活性方面仍未得到表征,并且关于纤维结构对异源代谢组(xenometabolome)的影响知之甚少。本研究利用液相色谱-质谱联用(LC/MS)技术,对源自三名健康成年捐赠者粪便的传代培养物上清液代谢物谱进行了表征,这些培养物使用了六种覆盖不同聚合度(DP)范围的菊粉。在最终数据分析包含的1,219个LC/MS检测到的代谢物中,704个代谢物的浓度具有统计

    来源:mSystems

    时间:2025-10-23

  • CNPS.cycle:宏基因组数据驱动的生物地球化学循环分析新工具

    摘要鸟枪法宏基因组数据分析在环境生物地球化学循环研究中仍面临学习曲线陡峭、时间投入大和计算需求高等挑战。CNPS.cycle这一新型R语言工具包应运而生,它专门用于简化与生物地球化学过程相关的宏基因组数据解读,并提供信息丰富的可视化结果。该工具包包含四个独立分析模块,分别聚焦碳、氮、磷、硫循环。用户只需上传基于KEGG和NCBI非冗余蛋白序列数据库的注释结果文件,即可自动化完成数据预处理、基因筛选、差异分析、功能微生物鉴定、β-多样性分析及可视化等一系列步骤,最终获得与CNPS循环相关的差异丰度基因和功能微生物的全面分析结果。重要性CNPS.cycle R包通过简化与生物地球化学循环相关的鸟枪

    来源:mSystems

    时间:2025-10-23

  • 艺术打破肥胖健康信息孤岛:跨学科融合构建公平健康生态系统

    传统肥胖干预措施往往形成"健康信息孤岛(health information silos)",将科学知识与生活经验及系统驱动因素相互隔离。艺术干预通过将复杂数据转化为具身化的共创体验,独特地瓦解这些信息壁垒。这种创新方法有效连接城市设计(urban design)、行为科学(behavioral science)和社区行动(community action),共同将致肥胖系统(obesogenic systems)转化为公平的健康生态系统(equitable health ecosystems)。

    来源:TRENDS IN Endocrinology & Metabolism

    时间:2025-10-23

  • 整合多源数据揭示中国归化植物气候生态位扩张与偏移的新模式

    通过整合标本记录与公民科学数据,研究人员揭示了中国归化植物气候生态位的扩张与偏移规律。研究表明,仅依赖全球生物多样性信息机构(GBIF)数据会显著低估归化植物占据的气候空间,尤其在中国南方地区。而结合本地数字化数据集后,不仅提升了气候生态位大小的估算可靠性,还发现了更明显的生态位偏移现象——这些偏移主要受温度梯度与季节变化驱动。该成果强调了全球数据平台整合本地记录的必要性,对准确预测归化物种的气候适应性及生态影响具有重要价值。

    来源:New Phytologist

    时间:2025-10-23

  • 综述:叶间低语:阐明植物对植食性昆虫的机械感知及下游防御反应

    ABSTRACT昆虫取食不仅造成植物组织损伤,还产生一系列生物物理和化学信号,植物必须检测并解读这些信号。为应对这些挑战,植物进化出特殊结构和机制来感知机械输入并将其转化为协调的防御响应。本综述总结了昆虫取食过程中机械刺激(mechanostimulation)的概念,重点阐述植物如何识别机械信号并将其整合到更广泛的防御信号网络中。机械刺激的类型与感知机制昆虫取食时产生的机械刺激包括组织撕裂、振动和压力变化等。植物通过形态特征(如表皮毛、细胞壁)和分子传感器(如离子通道、细胞壁关联激酶(wall-associated kinases, WAKs))感知这些信号。例如,机械敏感离子通道(mech

    来源:Plant, Cell & Environment

    时间:2025-10-23

  • FcrNAC22转录因子通过调控叶绿素降解基因加速金橘果实脱绿的分子机制

    柑橘果实脱绿是影响品质与商品价值的关键过程,其叶绿素降解的分子调控机制尚不清晰。本研究在金橘(Fortunella crassifolia)中发现NAC转录因子FcrNAC22是响应脱绿信号的核心调控因子。该因子在红光、ABA和乙烯利诱导下被激活,其mRNA和蛋白水平在果实转色期达到峰值。在本氏烟草叶片、番茄及金橘果实中过表达FcrNAC22可加速叶绿素分解并上调叶绿素降解基因(CCGs)表达,而干扰其表达则抑制脱绿过程。蛋白-DNA互作实验证实FcrNAC22直接结合并激活叶绿体定位基因FcrSGR、FcrCLH、FcrPPH、FcrPAO和FcrNYC1的启动子,阐明了转基因体系中脱绿表型

    来源:Plant, Cell & Environment

    时间:2025-10-23

  • 滤纸在实验室条件下回收猪流行性腹泻病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒的效果评估:为低成本环境监测提供新策略

    引言:环境监测在传染病防控中的重要性日益凸显,尤其是在应对新发和再发人类与动物病原体方面。滤纸因其成本低廉、易于获取以及在诊断医学中作为生物样本收集、储存和运输基质的悠久历史,成为环境监测中备受关注的工具。本研究的长远目标是开发一种实用、低技术、低成本的留置式环境采样系统,用于畜禽养殖设施。本文旨在比较9种商用滤纸产品在液体回收(实验一)和释放RT-qPCR可检测靶标(实验二)方面的“实验室兼容性”。材料与方法:实验一评估了9种滤纸产品在浸入特定体积水后的液体回收率。每种滤纸样品(5.1厘米×3.8厘米)置于50毫升锥形管中,加入1000至3000微升PCR级水,手动倒置3至5次使滤纸饱和,然

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 综述:精神分裂症中的人类内源性逆转录病毒:临床证据、分子机制及意义

    人类内源性逆转录病毒(HERVs)占人类基因组的8%,是古老逆转录病毒感染的遗迹。近年来,它们在精神分裂症这一复杂精神障碍发病机制中的作用日益受到关注。精神分裂症的病因涉及遗传、表观遗传和环境因素的多重交互作用,而HERVs恰恰位于这些风险因素的交汇点。1 Introduction精神分裂症以阳性症状(如幻觉、妄想)和阴性症状(如情感淡漠、社交退缩)为特征。全基因组关联研究已识别出287个精神分裂症风险基因座,主要影响神经元基因表达、突触功能、神经递质信号、神经发育、免疫反应和表观遗传调控。环境风险因素,如孕期母体感染、早期生活压力等,也显著增加患病风险。HERVs作为基因组调控元件,可作为增

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 微塑料通过调节根际硅的移动性来影响稻田中的碳封存

    尽管越来越多的研究记录了微塑料(MPs)对微生物碳(C)和氮(N)循环的影响,但它们对水稻生态系统中硅(Si)介导的碳封存的综合效应仍知之甚少。本研究通过一个水稻(Oryza sativa L.)生长周期微宇宙实验,探讨了可降解的(聚乳酸,PLA)和不可降解的(聚乙烯,PE)微塑料如何改变根际硅的动态、微生物的碳氮代谢以及土壤中的碳储存。与对照组相比,PLA处理显著增加了谷粒(+33%)和地上部分的碳积累(+10%),而PE处理则使这两者分别减少了26–40%,同时伴随着不同的硅吸收模式。PLA处理下硅转运的短暂增强(最多增加两倍)有助于短期内缓解由微生物引起的碳损失。然而,这两种微塑料都逐渐

    来源:Journal of Agricultural and Food Chemistry

    时间:2025-10-23

  • 生态修复对中国黑龙江流域受损边坡土壤微生物群落的影响:喷播与造林策略的比较研究

    本研究旨在阐明在退化山地边坡进行生态修复过程中土壤微生物群落的动态变化,重点比较了两种常见策略——客土喷播(aggregate spray-seeding)与人工造林(planted forest establishment)——相对于未受干扰的自然边坡的影响,并评估了微生物恢复的关键驱动因素。在修复工程启动七年後,研究人员分析了土壤微生物群落组成(包括细菌和真菌)、多样性以及共现网络(co-occurrence network)结构。结果表明,两种修复方法均促进了微生物群落的恢复,修复後的边坡其微生物群落组成逐渐向自然边坡的基线水平靠拢。真菌群落表现出比细菌更高的OTU(Operationa

    来源:Journal of Applied Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 热性能曲线普适性规律的数学揭示及其在气候变化预测中的意义

    温度对生物和生态过程具有强烈影响,热性能曲线(TPC)被广泛用于评估这种影响。研究发现,从细胞到个体、种群乃至生态系统的生物层级中,TPC始终呈现特定的不对称形态:性能随温度呈指数增长至最佳点后急剧下降。这种普遍存在的不对称形态引发了长期争论,多种机制和模型试图解释TPC现象。通过数学推导,研究揭示了生物过程随温度的指数缩放特性,促使TPC数据和模型收敛于单一曲线(称为通用TPC,UTPC)。这表明即使在不同生物体和环境下,看似各异的TPC实际上都是同一曲线的缩放版本。研究验证了从微生物到脊椎动物、从个体生理到种群生长的数据均呈现显著的UTPC收敛现象。UTPC现象为预测暖适应生物对温度波动的

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-23

  • T9SS组分蛋白SprA的C端结构域协助嗜冷黄杆菌噬菌体内溶素Ely174裂解革兰氏阴性菌的机制研究

    ABSTRACT嗜冷黄杆菌(Flavobacterium psychrophilum)是引起细菌性冷水病(BCWD)的病原体,给水产养殖业造成巨大经济损失。使用抗生素控制嗜冷黄杆菌存在产生耐药菌株的风险。利用噬菌体来源的内溶素作为抗生素的有效替代品是当前的研究热点。本研究异源表达了嗜冷黄杆菌噬菌体的内溶素Ely174。使用2.5 µg/mL的Ely174可在约6分钟内将经Triton预处理的嗜冷黄杆菌在600 nm处的光密度(OD600)从0.8降至0.2。除了广泛的pH耐受范围外,Ely174还显示出广谱的宿主范围。反应体系中存在Mg2+、Ca2+和Na+可增强其杀菌活性。通过随机突变,El

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 微生物多样性支持硝化作用:来自全尺度缺氧/好氧废水处理工艺的启示

    硝化性能与微生物群落划分研究在一个全尺度的石油化工废水处理厂(WWTP)进行,该厂采用缺氧/好氧(anoxic/oxic, AO)活性污泥工艺处理丙烯腈-丁二烯-苯乙烯(ABS)树脂生产废水。尽管进水特性在两个采样期间(Period 1 和 Period 2)存在显著差异,但AO工艺表现出强劲的性能,化学需氧量(COD)去除效率超过95%,氮去除率约为90%,硝化效率始终维持在95%以上,硝化速率在8至36 mg-N/L/天之间波动。这凸显了微生物群落在氮负荷和组成波动下维持有效硝化的显著韧性和适应性。为了探究微生物多样性与硝化性能的关系,研究将微生物群落划分为三种类型:总群落(total c

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 通过自适应和可编程防御策略构建广谱抗噬菌体大肠杆菌工程菌

    摘要噬菌体污染是影响工业发酵产品质量和生产效率的主要挑战。尽管细菌进化出了多种防御系统来对抗噬菌体感染,但这些系统通常存在宿主特异性窄和效力有限的问题。本研究从受污染的发酵底物中分离并鉴定了一种新型烈性大肠杆菌噬菌体TR2。其强大的环境稳定性、短的潜伏期和高裂解活性使其对发酵过程构成重大威胁。基于该噬菌体的生理特性和基因组特征,研究人员开发了两种策略来生成抗噬菌体大肠杆菌菌株:(i)选择细菌表面受体的自发突变以防止噬菌体吸附和感染;(ii)整合外源CRISPR/Cas9系统以赋予序列特异性免疫。自发突变提供广谱抗性,但以适应性和进化稳定性为代价,而CRISPR/Cas9确保长期、可编程的免疫,

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-10-23


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