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  • 南极湖泊细菌群落跨时空变异格局及构建机制解析:空间异质性主导而组装过程分异

    南极湖泊细菌群落研究的背景与意义南极湖泊作为环境变化的敏感指示器,其微生物群落动态对于理解全球变化下的生态系统响应至关重要。然而,驱动这些群落时空变异的相对强度及其背后的生态机制尚不明确。本研究旨在通过系统分析南极菲尔德斯半岛11个湖泊在2017至2023年间四个夏季采集的水体和沉积物样本,揭示细菌群落的时空变异格局并阐明其生态构建过程。样品采集与研究方法研究团队在南极菲尔德斯半岛的11个湖泊(包括两个浅水池塘)进行了系统采样,涵盖了表层水(50厘米深度)和表层沉积物(0-10厘米深度)。所有样品在四个不同年份(2017、2019、2021和2023年)的夏季采集,共获得165份样品。通过测量

    来源:Applied and Environmental Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 综述:无融合生殖作为交叉研究主题和植物科学模型性状的曙光

    Abstract无融合生殖(Apomixis)作为一种通过种子进行无性繁殖的形式,在此被界定为一个跨越从基因到生态系统多个组织层级的综合性生物学现象。它并非静态性状,而是涉及动态的分子与细胞变化,这些变化引导发育途径和生殖策略,进而影响生态感知、适应性乃至植物谱系的进化成功。此种复杂性使无融合生殖置于系统学(Systematics)、遗传学(Genetics)、发育生物学(Developmental Biology)、进化生物学(Evolutionary Biology)和农业(Agriculture)等多学科的交汇点。作为模型性状和对照性状,无融合生殖为理解有性生殖及检验植物科学假说提供了独

    来源:Critical Reviews in Plant Sciences

    时间:2025-10-23

  • 基于物理模拟温度增强LSTM模型在鱼塘水温预测中的性能研究

    随着气候变化对水产养殖影响的加剧,水温波动已成为威胁鱼类健康的关键因素。传统水温预测方法主要依赖物理模型或纯数据驱动模型,但物理模型对参数敏感且需要复杂校准,而数据驱动模型在历史数据不足时表现受限。台湾阳明交通大学土木工程系杨尊华与林嘉慈团队在《Smart Agricultural Technology》发表研究,创新性地将物理模型与LSTM结合,通过物理模拟水温增强模型泛化能力。研究团队在新竹渔业研究所的1000平方米鱼塘布设传感器,收集2023年11月至2024年4月的太阳辐射、气温、湿度、风速等气象数据及水温数据。他们构建了包含两层LSTM单元(各100个神经元)的堆叠网络,输入序列为连

    来源:Smart Agricultural Technology

    时间:2025-10-23

  • 茶叶发酵过程中真菌群落演替规律及其对品质形成的影响机制研究

    茶作为世界上最受欢迎的饮品之一,其独特的风味品质主要取决于加工过程中的发酵程度。传统上茶叶按发酵程度分为不发酵(绿茶)、部分发酵(乌龙茶)和完全发酵(红茶)三大类,每种茶类都呈现出截然不同的色泽和风味特征。这些风味差异主要来源于茶叶中儿茶素、酚酸等植物化合物的生物化学转化,而转化过程并非单纯由植物自身完成,微生物群落特别是真菌在其中扮演着关键角色。尽管微生物在茶叶发酵中的重要性已得到认可,但现有研究多集中于细菌群落,特别是普洱茶等后发酵茶中的细菌作用。相比之下,真菌群落的研究相对匮乏,且多数研究聚焦于后发酵茶的晚期发酵阶段。然而,新兴证据表明真菌可能在乌龙茶和红茶等初始发酵阶段发挥着比以往认知

    来源:LWT

    时间:2025-10-23

  • 包膜肥料源微塑料对土壤-番茄系统的风险:发芽抑制与生长补偿效应

    亮点包膜肥料产生的微塑料对番茄生长表现出阶段性双重效应:虽然显著抑制种子萌发,但在营养生长期却可能通过激活植物的抗氧化防御系统来促进生长。结论本研究揭示了包膜肥料源微塑料对作物生长的阶段性影响规律。研究结果表明,两类微塑料均会抑制番茄种子的发芽率,导致发芽势和种子活力下降。虽然两种微塑料在种子生长参数上未表现出显著差异,但它们可能通过物理阻碍作用或有毒添加剂释放,对幼苗发育产生负面影响。有趣的是,在营养生长阶段,微塑料未表现出明显植物毒性,甚至通过诱导抗氧化酶活性增强了植物的适应性生长能力。土壤酶活性分析进一步证实微塑料会干扰土壤生化过程。这些发现强调了在评估包膜肥料农业应用风险时,必须考虑其

    来源:Journal of Hazardous Materials

    时间:2025-10-23

  • 互花米草入侵对滨海湿地沉积物多环芳烃分布特征及控制机制的影响研究

    亮点研究区域与样品采集本研究在中国东部江苏盐城湿地国家级自然保护区缓冲带(33°21′−33°23′ N, 120°42′−120°44′ E)进行。研究区域面积21,115公顷,位于保护区内的斗龙港与四卯酉河之间。该区域显著的向海扩张主要归因于近岸沙脊和古河三角洲丰富的沉积物输入。该地区属季风气候,年平均气温14°C。沉积物理化性质在盐城湿地国家级自然保护区采集的沉积物样品中,平均粒径(Mz)、比表面积(SSA)和总有机碳(TOC)分别为6.02 φ、13.69 m² g-1 和 0.8%。就沉积物组成而言,粒径分布表明粉砂占比最大,平均为67.16%,其次是粘土,平均为18.49%。砂占比

    来源:Journal of Hazardous Materials

    时间:2025-10-23

  • 亚抑制浓度抗生素暴露对水生微生物群落元素循环基因的调控作用及生态风险

    重点发现抗生素暴露对元素循环基因及相关代谢通路的影响50 mg/L(详见我们近期发表的研究[13])。因此,实验设置的七个浓度梯度——10 ng/L、100 ng/L、1 μg/L、10 μg/L、100 μg/L、1 mg/L和10 mg/L——均属于亚抑制暴露水平。为探究这些抗生素处理如何影响碳、氮、硫循环关键功能基因的相对丰度和多样性及其关联代谢通路,我们进行了深入分析。结论与局限性我们评估了亚抑制浓度抗生素污染对水生生态系统功能的潜在影响,重点关注碳、氮、硫循环及抗生素抗性。随着抗生素浓度升高,元素循环基因的多样性及其对应代谢通路的丰度呈现显著下降趋势。通过对比甲氧苄啶、林可霉素及其复

    来源:Journal of Hazardous Materials

    时间:2025-10-23

  • 基于多重核苷酸多态性标记系统的鱼类环境DNA精准识别与生物多样性监测研究

    增强环境DNA分析中MNP标记的灵敏度能力在自然环境中,硬骨鱼类通过上皮细胞、黏液和代谢废物持续释放DNA,研究表明单条鱼每天可向水中释放多达104–105份线粒体DNA拷贝。然而,环境压力因素(包括酶降解、紫外线辐射和微生物活动)会迅速将环境DNA(eDNA)片段化为短片段(< 200 bp),并在流动生态系统中将其持久性缩短至仅数小时。在长江这样的大型河流流域,水动力扩散进一步将eDNA稀释至痕量浓度,使得依赖长扩增子或高DNA完整性的传统方法对物种检测无效。本研究开发的MNP系统通过协同设计原则克服了这些限制。首先,短扩增子(180 bp)与降解eDNA片段的主要尺寸范围一致,使得MNP

    来源:Molecular Ecology Resources

    时间:2025-10-23

  • 利用NEON宏基因组数据挖掘美国土壤真核生物多样性:方法验证与生态模式解析

    研究方法创新:从原核靶向数据中挖掘真核生物信号传统上,美国国家生态观测网络(NEON)的土壤宏基因组数据主要服务于原核生物(细菌和古菌)群落研究。本研究独辟蹊径,针对其测序深度相对较浅、真核生物序列占比低的特点,自主开发了一套定制化生物信息学分析流程。该流程的核心在于利用Barrnap软件的真核生物特异性隐马尔可夫模型(HMM)profile,从海量的shotgun宏基因组原始数据中高效提取18S核糖体RNA(rRNA)基因序列片段。流程的关键步骤包括:对NEON特有的双端测序文件进行排序合并、使用Trimmomatic进行严格的质量控制和修剪、利用nhmmer(HMMER3套件组件)以1e-

    来源:Molecular Ecology Resources

    时间:2025-10-23

  • 全球冷水珊瑚生物地理分布及其对未来气候变化的响应与保护意义

    全球冷水珊瑚生物地理格局与气候响应引言冷水珊瑚(CWC)是深海生态系统的关键工程师物种,通过构建复杂的三维结构为大量海洋生物提供栖息地,显著促进深海生物多样性。然而,气候变化导致的海洋变暖、脱氧和酸化等压力正严重威胁其生存。尽管冷水珊瑚已被联合国指定为脆弱海洋生态系统(VME),但全球尺度的分布模式、生物多样性热点及其对未来气候变化的响应机制仍不明确,严重制约了有效保护策略的制定。方法研究团队整合了全球741种冷水珊瑚(涵盖Octocorallia、Scleractinia、Antipatharia等类群)的专家验证分布数据,结合Bio-ORACLE v3.0提供的环境变量(如温度、溶解氧、p

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-10-23

  • 夜之色谱:光污染特定光谱对生物群的差异化影响及其生态警示

    夜间人工光照(ALAN)正通过改变自然光周期影响物种生理和行为,成为日益严峻的全球生态威胁。本研究通过荟萃分析解析了ALAN不同波长与照度对生物体的作用机制:富含蓝光与紫外线辐射的广谱"冷光"会显著扰乱昼夜节律、抑制褪黑素生成并干扰夜行性活动。但出乎意料的是,缺乏紫外线的广谱"暖光"同样能产生近乎相当的破坏力——尽管短波长光线对生理过程的调控占主导地位。更值得注意的是,ALAN的影响并非简单的剂量依赖关系,即使低于5勒克斯(< 5 lx)的微弱光照仍可引发实质性生物紊乱。因此,有效的减缓策略需结合具体生态场景定制解决方案,原则上应避免非必要的夜间照明,因为根本不存在普适的"安全剂量"与"

    来源:Global Change Biology

    时间:2025-10-23

  • 曼谷休闲区环境酵母丰度与多样性评估及其对人类健康风险的启示

    引言热带与亚热带地区环境酵母群落多样性研究长期被低估。土壤和水体作为高度异质性生境,蕴含大量微生物资源。近年全球自然环境中已发现约340种酵母及类酵母真菌,主要分布于淡水、海洋、土壤及动植物体表。曼谷作为热带城市代表,其公共休闲区的人类活动可能显著改变酵母群落结构,增加致病性酵母比例,对频繁接触人群构成潜在感染风险。实验方法样本采集与处理研究于2019-2021年旱季采集曼谷12个主要公园的158份样本(120份土壤、38份水体)。采样点覆盖圣堤帕公园(ST)、伦披尼公园(LP)等不同人流密度区域,采用GPS定位记录地理坐标。土壤样本取自10-15厘米深度,水体样本采集30厘米表层水,所有样本

    来源:Environmental Microbiology Reports

    时间:2025-10-23

  • 硫氧化与耗氧影响:阿萨巴斯卡油砂区首个油砂尾矿库试点湖泊Base Mine Lake的研究

    1 引言Base Mine Lake (BML)作为阿萨巴斯卡油砂区(AOSR)首个油砂尾矿库(OSPL)试点湖泊,其水体溶解氧动态对生态系统重建至关重要。2016年9月全湖硫酸铝(alum)添加后,夏季分层期湖下层(hypolimnion)出现季节性缺氧区。硫循环如何影响该现象尚不明确。本研究通过7年追踪(2015-2021),旨在解析硫氧化细菌(SOB)的群落功能及其耗氧风险。2 方法2.1 研究地点BML位于Mildred Lake矿场(57.011553, -111.622203),2021年时尾矿层厚40米,水帽层深12米。湖体呈双循环分层模式,夏季冬季均存在热分层。冰封期通常为11

    来源:Frontiers in Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 基于多环境试验的洋葱基因型稳定性与多性状综合评价:BLUP、GGE和AMMI模型的应用

    研究背景与目的洋葱是一种重要的蔬菜作物,其产量和品质受到基因型(G)、环境(E)以及两者交互作用(G×E)的显著影响。这种交互作用使得在不同环境中筛选出稳定高产的基因型变得复杂。本研究旨在通过多环境试验,评估24个红皮洋葱基因型在印度8个不同rabi季节种植环境下的表现,重点关注市场产量(MY)、收获天数(DTH)、平均鳞茎重量(ABW)、总可溶性固形物(TSS)、双球形成(DB)和蓟马发生率(TI)等关键性状。研究综合运用了最佳线性无偏预测(BLUP)、基因型主效加基因型与环境互作(GGE)双标图、加性主效应和乘性交互作用(AMMI)模型以及多性状选择指数(如MGIDI),以期鉴定出具有广泛

    来源:Frontiers in Plant Science

    时间:2025-10-23

  • 综述:土壤下的私语:大豆根际中的微生物通讯途径

    植物到微生物的通讯植物与土壤微生物通过分泌不同的代谢物和分子进行交流。植物根系分泌多种代谢物,包括类黄酮、激素和有机酸,这些物质有助于在根际招募或排斥微生物。根分泌物的分泌受到营养需求、环境条件和植物发育阶段等因素的调节。例如,干旱或盐胁迫等环境压力会触发氨基酸和有机酸等分泌物的释放,从而吸引适应此类条件并能缓解胁迫的微生物物种。类黄酮类黄酮是一类在植物界广泛分布的天然多酚化合物。大豆和其他豆科植物特别富含一种独特的类黄酮亚类,称为异黄酮。异黄酮在结构上以3-苯基色原酮为骨架。由于类黄酮分子核上酚羟基的存在,它们构成了一个次级活性氧(ROS)清除系统,以平衡植物体内的氧化水平。除了作为ROS清

    来源:Frontiers in Plant Science

    时间:2025-10-23

  • 全基因组宏基因组学揭示印度泰米尔纳德邦城乡人为污染土壤微生物群落与耐药组的变异及其生态意义

    1 引言环境污染特别是重金属和烃类化合物对微生物多样性及土壤功能产生深远影响。本研究利用全基因组宏基因组测序技术,系统分析了花园(AGS)、家禽养殖场(NPS)、牛棚(CSS)、市场(TMS)、医院(THS)、热电厂(TPS)、造纸厂(PIS)和垃圾处理场(DYS)等八类地点的土壤样本,聚焦微生物组成、抗生素抗性基因(ARGs)、重金属抗性基因(HMRs)和毒力基因(VGs)的分布规律。研究假设不同重金属和有机污染物浓度的土壤具有独特的耐药组和微生物群落特征,旨在明确污染物与微生物多样性间的相互作用机制。2 材料与方法2.1 样本采集与处理土壤样本采集自泰米尔纳德邦八个典型地点,每处取五个重复

    来源:Frontiers in Microbiology

    时间:2025-10-23

  • 水生植物病毒组揭示:从基础藻类到观赏植物的病毒多样性及全球贸易带来的生物安全风险

    在宁静的池塘、流动的溪流乃至家中的水族箱里,水生植物构成了水下世界不可或缺的绿色基底。它们不仅是水生生态系统的重要组成,也在全球观赏植物贸易中占据一席之地。然而,在这些看似平静的水面之下,一个隐秘的微观世界——水生植物的病毒组(virome)——长期以来却如同深海般未被充分探索。相较于水稻等主要水生作物,人们对非栽培及观赏性水生植物所携带的病毒知之甚少,这留下了一个关键的知识空白:这些水生植物是否会成为潜在植物病毒的“储藏库”,甚至通过日益活跃的全球贸易网络,成为病毒传播及其相关生物入侵风险的“特洛伊木马”?为了回答这些问题,一个由斯洛文尼亚国家生物研究所等机构组成的研究团队在《Environ

    来源:Environmental Microbiome

    时间:2025-10-23

  • 时间序列花粉分析揭示滇西北气候变化与人类活动的植被响应

    在云南西北部横断山脉的深处,玉龙雪山南麓的文海和哈哩谷,不仅拥有壮丽的高山湖泊和垂直分布的森林带,更是研究气候与人类活动如何塑造植被的天然实验室。地表花粉研究长期以来是重建古植被、古气候和古人类活动的重要工具,但一个关键问题始终悬而未决:同一地点不同年份采集的花粉组合差异,究竟能否真实反映植被、气候和人类活动的短期变化?以往研究多聚焦于空间差异,而对时间序列变化的关注不足,尤其在生态敏感的中国西南山地地区,数据更为匮乏。发表于《BMC Plant Biology》的一项新研究,通过对比2005年和2022年在文海和哈哩谷同一地点采集的28个现代样品(包括土壤和苔藓垫),首次系统分析了17年间花

    来源:BMC Plant Biology

    时间:2025-10-23

  • 温泉居住与干眼病的关联:一项来自台湾的交叉基因-环境交互作用研究

    在传统认知中,温泉常被视为养生疗愈的象征,从古罗马浴场到日本温泉文化,其健康益处被广泛传颂。然而,温泉区域释放的硫化氢(H2S)等生物活性气体在近年研究中却显示出对心血管系统的潜在威胁,甚至与白内障发病率上升相关。这种矛盾凸显了温泉环境健康效应的复杂性,尤其对眼部疾病的影响几乎未被科学探索。干眼病(Dry Eye Disease, DED)作为常见的眼表疾病,其发生与泪膜稳定性密切相关,而环境因素如湿度、空气成分可能通过影响泪液动力学参与疾病进程。尽管已有研究关注空气污染物对DED的影响,但温泉特有的高温、高湿及气体排放环境如何与遗传背景交互作用,仍是未知领域。为解决这一问题,研究团队利用台湾

    来源:Human Genomics

    时间:2025-10-23

  • 异质结工程技术显著提升了光电探测器的抗海水腐蚀和光腐蚀能力,从而延长了其使用寿命

    光通信技术被视为海洋勘探和开发中最重要的技术之一,而光电探测器是其实现的关键。然而,复杂的海洋环境(如光衰减和海水腐蚀性)限制了传统光电探测器的应用。在这里,我们报道了一种p-GaAs/n-CdS光电化学光电探测器,该探测器在海水中具有高灵敏度、稳定性和宽带响应特性。由于强内建电场驱动的电子传输加速、阶梯状能带结构以及n-CdS的高电子迁移率,这种异质结结构实现了快速的界面反应,并避免了电子在GaAs上积累导致的光腐蚀。得益于这些优势,与p-GaAs相比,p-GaAs/n-CdS在0 V电压下的宽带范围内的光电检测性能显著提升:响应时间为2.16/2.22毫秒,检测灵敏度达到1.06 × 10

    来源:Nano Letters

    时间:2025-10-23


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