• OTUD7a下调及小鼠哮喘模型中全局泛素化重塑的鉴定

  摘要气道上皮功能障碍是哮喘的一个标志性特征，参与慢性炎症和结构重塑。近期研究提示翻译后修饰在调节上皮免疫反应中发挥作用。然而，特异性去泛素化酶（deubiquitinating enzymes, DUBs）的作用仍不清楚。在本研究中，研究人员在一个过敏性哮喘小鼠模型中鉴定出OTU去泛素化酶7a（OTUD7a）是一个显著下调的基因。两个独立数据集（GSE71822和GSE9383）的转录组学分析一致揭示哮喘肺组织中OTUD7a的表达受到抑制。此外，免疫荧光分析表明，OTUD7a在CC10阳性的细支气管上皮细胞中被检测到，这类非纤毛上皮细胞以其抗炎功能而著称。为探索OTUD7a的分子关联，研究人员

  来源：Experimental and Molecular Pathology

  时间：2026-09-04

• 1990–2023年间中国、美国和英国1型及2型糖尿病肾病的趋势

  摘要背景我们利用2023年全球疾病负担（GBD）数据，比较了1990年至2023年间中国、美国和英国因1型糖尿病（T1DM-DKD）和2型糖尿病（T2DM-DKD）导致的慢性肾病的负担及其时间趋势。方法我们提取了发病率、死亡率以及伤残调整生命年（DALY）的估计值，并提供了95%的置信区间（UIs），并按照国家、年龄和性别进行了年龄标准化分析。时间趋势通过连接点回归分析，使用年度百分比变化（APC）和平均年度百分比变化（AAPC）来评估。选定的T2DM-DKD风险因素也使用了GBD的比较风险评估框架进行评价。结果中国总体而言慢性肾病（DKD）的年龄标准化发病率和死亡率有所下降，而美国的T2DM

  来源：Diabetes Research and Clinical Practice

  时间：2026-09-04

• 系统发育约束与环境调控糖苷水解酶结构域架构

  糖苷水解酶（glycoside hydrolases, GHs）是催化聚糖和寡糖中糖苷键水解的碳水化合物活性酶（carbohydrate active enzymes, CAZymes）。GHs支持微生物在从土壤、海洋生态系统到人体肠道的各类生态系统中降解纤维素、半纤维素、几丁质及其他复杂碳水化合物。水解所释放的可代谢短糖为异养生长提供能量，从而促进整体生物地球化学循环。GHs在宏基因组数据集中的普遍存在凸显了其核心功能。目前已鉴定出众多GH家族，且它们常以多结构域蛋白形式存在，即GH结构域与若干辅助结构域相关联。然而，预测GH序列的功能仍是一项重大挑战，而在辅助结构域可能影响酶功能的多结构域

  来源：Current Research in Microbial Sciences

  时间：2026-09-04

• NucGen3D：一个用于大规模3D细胞核分割的合成框架，具有开源训练数据和模型

  摘要：在3D显微镜图像中进行稳健的细胞核分割是定量细胞生物学中一个关键但尚未解决的挑战。主要挑战在于带注释的体积数据集的稀缺性和变异性。由于这些数据难以获得，大多数现有先进方法（包括Cellpose）对单个2D切片进行分割，然后通过启发式方法重建3D体积，从而丢失了关键的空间上下文。研究人员对专家注释者表现的分析证实，忽略3D上下文会在细胞核检测和注释中引入显著的变异性。尽管少数3D模型是在小型或玩具数据集上训练的，但目前尚无大规模、公开可用的资源来支持高容量3D分割网络的稳健训练。为了解决这一问题，研究人员提出了NucGen3D，这是一个可定制的模拟框架，可从有限的2D输入（特别是2018年

  来源：Computers in Biology and Medicine

  时间：2026-09-04

• 基于计算机模拟的方法鉴定针对霍乱弧菌（Vibrio cholerae）产 cholera 毒素的黄酮类抑制剂：分子对接、ADMET 剖析及分子动力学模拟

  ? 采用了一种综合计算策略来识别与霍乱毒素相关的NAD(+)-精氨酸ADP-核糖转移酶的潜在抑制剂。 ? 对50种黄酮类化合物进行筛选后，发现山柰酚（Kaempferol，亲和力为-9.1 kcal/mol）和-taxifolin（Taxifolin，亲和力为-8.9 kcal/mol）是具有潜力的抑制剂。分子相互作用研究表明，山柰酚的相互作用网络比-taxifolin更复杂。 ?

  来源：Computational Biology and Chemistry

  时间：2026-09-04

• 聚多巴胺纳米颗粒集成微针贴片用于近红外-II光触发溶栓

  聚多巴胺（polydopamine, PDA）纳米颗粒（nanoparticles, NPs）是一种受贻贝黏附机制启发的材料，因其优异的光热转换性能而受到广泛关注。研究人员开发了一种集成了PDA NPs的微针（microneedle, MN）贴片，用于近红外-II（near-infrared-II, NIR-II）光触发的溶栓治疗。所制备的PDA NPs平均尺寸为163 nm，在可见光至NIR-II区域表现出宽谱吸收，并具有良好的NIR-II光热转换性能。将PDA NPs整合到微针贴片（PDA MN）中后，该贴片不仅表现出优异的NIR-II光热转换效率，还具备足够的机械强度以无破损地刺入皮肤。

  来源：Engineered Regeneration

  时间：2026-09-04

• 中国软壳龟（Pelodiscus sinensis）脾脏中ceRNA框架的特征分析：其对嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）感染的响应

  ?首次发现的非编码RNA（ceRNA）网络是在一种爬行动物（Pelodiscus sinensis）中，经过Aeromonas hydrophila感染后构建的，共发现了253个lncRNA-miRNA-mRNA和436个circRNA-miRNA-mRNA三元组合。?mRNA LOC102455872、lncRNAs MSTRG.3526.7/ MSTRG.8091.1、circRNA novel-circ-026391和miRNA novel-m0923-3p被确定为连接性最高的枢纽节点。?MAPK信号通路和色氨酸代谢途径被证实是ceRNA网络中连接性最强的通路。引言中华软壳龟（Pelod

  来源：Developmental & Comparative Immunology

  时间：2026-09-04

• 原发性和转移性ALK基因重排的非小细胞肺癌（NSCLC）的空间转录组学研究揭示了具有位点特异性的适应性变化

  摘要引言基因改变和肿瘤微环境（TME）影响间变性淋巴瘤激酶重排的非小细胞肺癌（ALK+ NSCLC）的治疗反应。本研究绘制了淋巴结转移（LNT）中的位点特异性TME适应性和探索性风险相关特征，以研究转移进化过程。方法我们对16例患者的肿瘤（PanCK+）和基质（PanCK-）组成部分进行了空间转录组学分析，包括原发性肺肿瘤（LT，n = 3例）、淋巴结转移（LNT，n = 10例）和脑转移（BT，n = 3例），并使用了三个位点匹配的非肿瘤对照组。利用癌症基因组图谱-肺腺癌（TCGA LUAD）队列评估了LNT衍生的预后特征。结果观察到了不同的、位点特异性的TME特征。LNT基质中纤维母细胞和

  来源：Current Problems in Cancer

  时间：2026-09-04

• 利用 idopNetwork 和路径同源性从横截面数据中对定向生理网络进行准动态重建

  **摘要****背景** 过量的脂肪通过宏观的系统机制而非孤立的代谢缺陷驱动心血管代谢疾病的发生。虽然传统的统计模型能够有效地估计生物标志物之间的关联，但它们无法解析这种病理机制背后的定向和循环调节依赖性。网络生理学提供了一个强大的数学框架，用于描绘这些复杂的、由反馈驱动的相互作用。**方法** 我们将 idopNetwork 框架应用于一个主要临床队列（??=7,343）和一个外部验证队列（??=6,881）的横断面数据，重建了四个体质量指数（BMI）分层的定向、加权血液代谢网络。该分析流程将静态的临床快照映射到连续的坐标空间，以提取准动态的自回归轨迹。随后，通过高阶拓扑特征整合了 GL

  来源：Computers in Biology and Medicine

  时间：2026-09-04

• 利用表位顺序优化方法设计下一代多目标多表位结核病疫苗：一项500纳秒的分子动力学研究

  ? 表位顺序显著改变了多表位结核病疫苗的特性。 ? 为优化疫苗设计，筛选了一个包含3,628,800个变体的库。 ? TLR4特异性对接和分子动力学（MD）分析确定了稳定的疫苗候选物。 ? MM/GBSA分析、免疫模拟和克隆技术支持了排名靠前的变体。

  来源：Computational Biology and Chemistry

  时间：2026-09-04

• 血浆蛋白质组与新发冠状动脉疾病的性别特异性关联

  摘要 目的冠状动脉疾病（CAD）的病因在男性和女性之间似乎存在差异，但对潜在性别特异性生物机制的了解有限。我们整合了基因组学和蛋白质组学分析，以调查血浆蛋白质组与 CAD 之间的性别特异性关联。方法和结果在 40,829 名英国生物样本库参与者（无 CAD，基线后 365 天内；55% 为女性；平均年龄 56.9?±?8.1 岁）中，我们使用多变量调整后的 Cox 比例风险模型，考察了 2,922 种血浆蛋白质与新发 CAD 之间的关联，中位随访时间为 13.7 年（IQR 13.1-14.4）。性别特异性分析确定了 440 种女性

  来源：Cardiovascular Research

  时间：2026-09-04

• 主要衣壳蛋白亚单位疫苗可阻断大口黑鲈亲鱼中 LMBV 的垂直传播

  ?LMBV在大口黑鲈的亲代中发生了垂直传播。?亚单位疫苗对亲鱼提供了良好的保护，相对保护率（RPS）为87.4%。?经LMBV攻毒后，免疫亲鱼正常完成了产卵。?经LMBV攻毒后，接种疫苗的亲鱼未产生阳性卵子。?母源免疫可作为预防LMBV感染的一种新方法。引言大口黑鲈（Micropterus salmoides），原产于北美密西西比河流域，在中国水产养殖业中通常被称为加州鲈。它是一种肉食性淡水商业鱼类[1]。该物种具有强大的环境适应性、优良的生长性能、较短的养殖周期，且肉质紧实、无肌间刺，养殖利润高，市场价值显著[2]。据报道，2023年大口黑鲈产量达到88万吨，是中国最受欢迎的水产养殖品种之一

  来源：Developmental & Comparative Immunology

  时间：2026-09-04

• 综述：从细胞到群体：抗菌药物耐药性的多尺度定量研究方法

  抗菌药物耐药性（AMR）是当前关键的全球健康挑战，正日益通过定量和系统层面的方法来加以应对。除进化遗传学和突变适应之外，细菌在抗生素作用下的存活还反映了生理状态转变和代谢约束。研究人员综述了跨尺度的数学模型，从群体层面的方法（涵盖剂量优化、多药治疗、群落效应和全局上位效应），到基于蛋白质组分配和资源分配的细胞框架。这些粗粒度模型揭示了代谢约束如何塑造抗生素作用、基因编码耐药性以及非遗传耐受性或持留性，尤其是对核糖体抑制剂，以及日益增多的其他抑菌和杀菌药物。它们还识别了非线性行为，包括双稳定性、阈值效应和依赖于状态的耐药策略。尽管实验室模型与临床应用之间存在巨大差距，这一多尺度框架阐明了细菌代谢

  来源：Current Opinion in Systems Biology

  时间：2026-09-04

• 一种融合光生理学、细胞内养分配额与多重裂殖的小球藻（Chlorella vulgaris）混合连续-离散单细胞模型

  摘要翻译：研究人员为小球藻（Chlorella vulgaris）构建了一个单细胞框架，将光生理学、细胞内养分配额与多重裂殖过程相耦合。离散的细胞周期规则表征了2、4或8个自孢子（autospore）的产出结果。经校准后，该模型成功复现了所选定的已发表实验终点数据。留一来源（LOSO）分析显示，与参考模型相比，该模型的平均均方根误差（RMSE）更低。论文主体解读：**研究背景与问题**小球藻（Chlorella vulgaris）作为一种绿色微藻，因其光自养生长特性以及能够生产富含蛋白质、脂质和色素生物质的潜力，在生物技术领域受到广泛关注，其应用前景涵盖食品、饲料、生物燃料、废水处理及碳捕集等

  来源：Computational Biology and Chemistry

  时间：2026-09-04

• 基于结构的潜在小分子抑制剂发现方法：以MM/GBSA结合自由能为导向，针对由Hedgehog信号通路驱动的癌症

  ?刺猬（Hh）信号通路对发育、组织稳态以及通过血管生成、转移和抑制凋亡来促进癌症进展至关重要。?通过ZINC数据库的glide评分、MM/GBSA能量分析和相互作用分析，鉴定出ZINC000299767263是一种潜在的新型刺猬通路抑制剂，该抑制剂针对Smoothened（SMO）受体蛋白。?在150ns的MDS条件下，ZINC000299767263的稳定性及其关键结合位点（Asp384、Arg400、Gln477）与已获FDA批准的刺猬通路抑制剂Vismodegib相当。?ZINC000299767263符合Jorgensen的三条规则和Lipinski的五条规则，显示出与Vismodeg

  来源：Computational Biology and Chemistry

  时间：2026-09-04

• 六种罕见骨病患者在整个生命周期中出现的不良健康后果：一项为期10年的人群队列研究

  摘要 背景 罕见的骨骼疾病是一组复杂且致残的疾病。关于多种罕见骨骼疾病的年龄特异性住院模式和院内治疗结果的相关证据较为有限。 方法 本研究采用基于人口的队列研究方法，使用国家医院住院数据（2012年1月至2021年12月）。在11,092,151例住院病例中，通过ICD-10编码（X连锁性低磷血症、成骨不全症、纤维发育不良、软骨发育不全症、假性甲状旁腺功能减退症、进

  来源：European Journal of Endocrinology

  时间：2026-09-04

• 餐后超快效胰岛素对比餐时快效胰岛素在囊性纤维化相关糖尿病成人中的应用：一项随机多中心交叉试验

  目的：餐后给予超快效胰岛素（postprandial ultra-fast-acting insulin, PP-UFI）可能为囊性纤维化相关糖尿病（cystic fibrosis–related diabetes, CFRD）患者提供更大灵活性。本研究评估PP-UFI是否能提供与标准餐时快效胰岛素（mealtime fast-acting insulin, MT-FI）相当的血糖控制。方法：研究人员在成人CFRD患者中开展了一项开放标签、多中心、随机IV期交叉试验，采用两序列四周期设计。参与者使用连接式胰岛素笔分别接受MT-FI或PP-UFI治疗，每期3个月。主要终点为血糖目标范围内时间（t

  来源：Diabetes Research and Clinical Practice

  时间：2026-09-04

• 鼠伤寒沙门氏菌在循环暴露于3-(二乙氨基)丙胺后产生消毒抗性

  研究人员对鼠伤寒沙门氏菌（Salmonella Typhimurium）LT2在循环暴露于阳离子消毒剂3-(二乙氨基)丙胺（DEAPA）后产生的消毒抗性进行了研究。采用三种适应性实验室进化（ALE）方案，即递增浓度（ALE-Inc）、恒定亚抑制浓度（ALE-Con）和重复短时致死处理（ALE-Let），在受控条件下选择稳定突变。研究发现，重复致死DEAPA暴露筛选出了耐受变异体，三种ALE方案的抗性结果存在差异。获得的变异体在热处理后存活能力提升超过1000倍，两个变异体对庆大霉素的最小抑菌浓度（MIC）增加两倍。抗性表型随鉴定出的突变不同而变化。全基因组测序显示，ALE-Con变异体携带co

  来源：Current Research in Microbial Sciences

  时间：2026-09-04

• 表达性失韵律症的多模态病灶定位映射

  情感韵律（affective prosody）通过调节言语的副语言特征（如音高与节奏）促进情绪交流。脑损伤患者可出现情感韵律表达受损，称为表达性失韵律症（expressive aprosodia），对其社交互动与生活质量产生不利影响。尽管既往病灶研究较多，但极少有研究在大规模患者样本中联合病灶位置、相关结构性与功能性网络映射来探讨表达性失韵律症的神经关联。鉴于长期社交功能与生活质量结局的实际重要性，尤其需要推进对慢性期（即病灶发生后>3个月）表达性失韵律症神经生物学的理解。本研究旨在大型慢性局灶性脑损伤参与者样本（N=673）中，刻画表达性失韵律症如何与病灶位置及受损相关结构、功能脑网络

  来源：Cortex

  时间：2026-09-04

• 天然产物虚拟筛选及潜在杀虫剂体外活性评价

  对COCONUT数据库（含407615个天然产物）进行虚拟筛选，鉴定出新型乙酰胆碱酯酶（AChE）抑制剂。两种挥发性且低成本的化合物表现出显著的体外活性。其中一种新型化合物为混合型抑制剂，其抑制常数（Ki）为88.1±3.1 μM。所选先导化合物价格低廉（8 USD/g）。蛋白质-配体相互作用指纹（PLIF）分析揭示了其与黑腹果蝇AChE变构口袋的关键相互作用。研究背景方面，传统合成农药存在对非靶标生物选择性低、环境毒性大、沿食物链生物累积及在生态系统中持久残留等问题，在发展中国家小农因成本限制仍依赖高毒淘汰化学品。有机磷与氨基甲酸酯类杀虫剂作用于AChE催化位点，该位点跨物种高度保守，导致人

  来源：Computational Biology and Chemistry

  时间：2026-09-04

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