• 连接传统与前沿：高通量测序技术在棕熊保护遗传学中微卫星数据整合的新策略

  在保护遗传学领域，微卫星（microsatellite）标记长期以来是追踪野生动物种群遗传变异的黄金标准。这些短串联重复序列（STR）因其高多态性和基因组广泛分布的特性，被广泛应用于种群结构、亲缘关系及遗传多样性评估。然而过去几十年积累的海量微卫星数据均基于PCR（聚合酶链式反应）片段长度分析技术获得，随着高通量测序技术的普及，如何将历史数据与现代测序数据有效衔接，成为保护遗传学家面临的重大挑战。这一问题在濒危物种保护中尤为紧迫。以北美棕熊（Ursus arctos）为例，其在美国本土48州的数量从过去的约50,000头锐减至不足2,000头，而基于微卫星的遗传监测数据已成为制定保护策略的重要

  来源：Journal of Heredity

  时间：2025-11-04

• 生物物理化学和药物研究中色氨酸的时间分辨荧光技术：与自然界天然荧光团打交道所带来的乐趣与挑战

  摘要 由于此内容没有提供摘要，因此提供了预览版本。请使用上方的“获取访问权限”链接来了解如何访问该内容。

  来源：Quarterly Reviews of Biophysics

  时间：2025-11-04

• DiffHiChIP：基于距离衰减建模的HiChIP差异染色质互作识别新方法

  400 kb）差异环的检测能力不足。即使采用隐式或显式的距离效应校正，此局限性依然存在。因此，亟需一个专门针对HiChIP数据特性、能够稳健识别差异染色质互作，特别是长程互作的分析框架。为此，研究人员在《Cell Reports Methods》上发表了题为“DiffHiChIP: Identifying differential chromatin contacts from HiChIP data”的研究论文，提出了首个用于HiChIP及类似3C数据差异环检测的综合框架——DiffHiChIP。为了系统解决上述问题，研究人员开发了DiffHiChIP。其核心技术方法包括：1）支持两种主流计

  来源：Cell Reports Methods

  时间：2025-11-04

• 使用CyberKnife进行立体定向加速部分乳腺照射，并结合非侵入性皮肤基准标记追踪技术治疗早期乳腺癌：一项关于可行性、剂量学及早期疗效的回顾性研究

  这项研究探讨了使用CyberKnife（CK）系统进行加速部分乳腺照射（APBI）在亚洲人群中的可行性、剂量学特征以及早期临床结果。APBI是一种针对早期乳腺癌患者的放射治疗方式，相较于传统的全乳腺照射（WBI），其疗程时间更短，能够减少患者的治疗负担。然而，由于亚洲女性通常具有较小的乳腺体积，传统的侵入性标记物植入可能面临技术和接受度上的挑战。因此，研究团队采用了一种非侵入性的皮肤标记物方法，用于在CK治疗过程中追踪呼吸运动，以提高治疗的精确性和安全性。研究回顾性分析了2019年5月至2024年12月期间在台湾某医院接受CK APBI治疗的74名女性患者。患者均接受乳腺保留手术（BCS）后进

  来源：Breast Cancer: Targets and Therapy

  时间：2025-11-04

• Kp03重组酶介导的千碱基级DNA片段在植物细胞中的高效定点整合技术研究

  在植物遗传改良和合成生物学领域，如何将大片段外源DNA精准、高效地插入特定位点一直是技术瓶颈。传统的CRISPR-Cas9技术依赖双链断裂（DSBs）诱导的DNA修复途径，但常伴随插入缺失突变、染色体碎裂等副作用。虽然PrimeRoot编辑系统可实现11.1 kb片段的靶向插入，但其容量仍有限制。大型丝氨酸重组酶（LSRs）因其高特异性和不依赖宿主修复机制的特性，为这一难题提供了新思路。福建农林大学和天津大学的研究团队在《Cell Reports》上发表了关于Kp03重组酶在植物基因组工程中应用的重要研究成果。该研究系统评估了Kp03在植物细胞中介导大片段DNA定点整合的能力，发现其可高效整合

  来源：Cell Reports

  时间：2025-11-04

• 综述：表观基因组学方法学的最新进展

  摘要过去十年间，方法学的快速突破已将表观基因组学从群体平均水平检测，转变为单细胞、多组学和细胞内空间层面的研究。本综述考察了当前以空前广度和分辨率绘制表观基因组图的相互关联的技术支柱。1. 引言表观基因组学研究不改变DNA序列本身、但调控基因表达的基因组化学修饰，例如DNA甲基化、组蛋白（翻译后）修饰以及相关的三维高阶染色质结构。早期的表观基因组研究依赖于群体细胞测量，例如用于DNA甲基化的亚硫酸氢盐测序和用于组蛋白修饰的染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）。这些群体方法揭示了全局表观遗传机制，但掩盖了细胞异质性和局部表观遗传调控。为了应对这些局限性，过去十年发展出的众多新方法使研究人员能够

  来源：Epigenomics

  时间：2025-11-04

• 利用光物理和计算方法对基于光电活性香豆素的替代物（PM6C和PM7C）衍生物进行研究

  摘要在室温下，通过一系列极性逐渐增加的溶剂中的吸收和发射光谱，研究了4-(2-碘代-苯氧基甲基)-6-甲氧基-铬烯-2-酮（PM6C）和4-(2-碘代-苯氧基甲基)-7-甲氧基-铬烯-2-酮（PM7C）的溶剂致色效应和偶极矩特性。从光谱数据获得的斯托克斯位移（Stokes shift）对于这两种分子来说都是向长波方向移动的，表明发生了π-π*跃迁。利用Lippert-Mataga、Bakhshiev、Kawaski-Chamma-Viallet和Reichardt的溶剂极性函数，确定了PM6C和PM7C的基态和激发态偶极矩。由于在极性更强的激发态中π电子密度发生了显著重分布，因此激发态的偶极矩

  来源：Journal of Fluorescence

  时间：2025-11-04

• 定量单分子FLIM与PIE-FRET成像技术在生物分子系统研究中的应用与标准化

  在生命科学领域，实时观测生物大分子的结构动态变化一直是研究人员面临的重大挑战。蛋白质和核酸的构象变化往往发生在纳秒到秒级的时间尺度，而传统技术难以捕捉这些瞬时过程。荧光显微镜虽已成为生物学研究的利器，但常规方法主要依赖荧光强度这一单一参数，无法全面反映分子的动态特性。正是在这样的背景下，时间分辨荧光技术应运而生，为研究者提供了全新的观测维度。荧光寿命成像显微镜(FLIM)和弗斯特共振能量转移(FRET)技术的结合，特别是单分子水平的应用，为研究生物分子构象变化和相互作用提供了强大工具。然而，技术在复杂生物系统中的广泛应用仍受到技术和分析挑战的限制。为了解决这一问题，Irene Silverna

  来源：BMC Methods

  时间：2025-11-04

• 功能改进的尿素酶抑制剂（NBPT）：开发环保衍生物的方法

  传统的农业尿素酶抑制剂存在抑制效率低和作用时间短的问题。因此，本研究通过分子对接和分子动力学方法对典型的传统尿素酶抑制剂——N-丁基硫代磷酸三酰胺（NBPT）进行了改良，并结合了机器学习技术。在设计的79种尿素酶抑制剂替代物中，有7种显示出比NBPT更强的尿素酶抑制潜力，抑制效果提高了21.30%至48.91%。通过改进的G1评估方法，最终筛选出4种替代品，这些替代品在尿素酶抑制效果上提高了22.30%至47.40%，同时在土壤毒性方面降低了25.30%至47.71%。此外，功能性质模拟显示，这些替代品在施用后能够将氨挥发率降低65.16%至76.81%，N₂O排放量减少30.53%至57.6

  来源：Journal of Agricultural and Food Chemistry

  时间：2025-11-04

• RNAtive：基于共识的RNA三维结构模型评估新方法及其在无参考结构下的应用

  在RNA结构生物学领域，准确评估计算预测的三维模型质量一直是核心挑战。传统方法如均方根偏差(RMSD)和相互作用网络保真度(INF)严重依赖实验确定的参考结构，这极大限制了它们在新发现RNA分子中的应用。随着深度学习等人工智能方法在RNA结构预测中的广泛应用，产生的模型数量激增且变异性大，但现有工具无法系统提取多个预测结构中重复出现的结构特征——这些特征往往代表着功能重要的结构核心。尽管共识方法在RNA序列分析和进化研究中已被证明有效，但尚无工具将这些原理应用于三维模型评估。为填补这一空白，波兰波兹南理工大学的研究团队在《Bioinformatics》上发表了RNAtive工具，建立了评估RN

  来源：Bioinformatics

  时间：2025-11-04

• 基于单幅SAR卫星影像的托斯卡纳城市洪涝制图研究：提升气候韧性的新方法

  当极端天气事件日益频繁，城市地区正面临着前所未有的洪涝风险。特别是在地中海区域，小型流域的快速响应特性使得山洪暴发往往在数小时内形成并消退，给传统监测手段带来巨大挑战。光学卫星在云雨天气下观测能力受限，而合成孔径雷达（SAR）虽能穿透云层，但在复杂城市环境中的雷达后向散射效应使得洪水识别变得异常困难。更棘手的是，对于突发性洪水事件，往往只能获取到单一时相的SAR影像，如何从这有限的数据中准确还原洪水范围，成为提升城市气候韧性的关键技术瓶颈。正是在这一背景下，由Beatrice Carlini等人组成的研究团队在《Heliyon》上发表了他们的最新研究成果。该研究以意大利托斯卡纳大区2023年1

  来源：Heliyon

  时间：2025-11-04

• FM-SAM：基于YOLOv10与分割一切模型（SAM）的无人机影像单木树冠提取与分类新方法及其在森林监测中的应用

  森林作为地球陆地生态系统的主体，在维持自然平衡、提供生态服务和支撑生物多样性方面扮演着至关重要的角色。准确监测森林健康状况，及时获取树木的结构信息，对于森林资源的科学管理和保护至关重要。其中，单木树冠的分割与识别是一项关键技术，能够有效估算冠幅大小、树种、生物量以及树木生长状况，进而帮助确定最佳采伐间隔、评估资源可用性，以支持工业用材和能源作物的可持续收获。然而，传统的林业资源调查方法，如野外实地测量或人工航片判读，不仅耗时费力，而且难以获得准确全面的数据。近年来，基于无人机（UAV, Unmanned Aerial Vehicle）的遥感技术为森林生态系统的精确测量带来了显著进展。与卫星和航

  来源：Computers and Electronics in Agriculture

  时间：2025-11-04

• AdaFishCount：基于领域特定扰动与不变特征学习的跨域鱼类计数方法

  在水产养殖领域，准确统计鱼类数量对资源评估和精细化管理至关重要。传统的人工计数方法不仅效率低下，还容易对鱼类造成应激伤害。随着计算机视觉技术的发展，基于密度图回归的深度学习计数方法逐渐成为主流。然而，实际养殖环境中存在诸多变量——不同养殖模式（如网箱养殖与循环水系统）、水域透明度变化、鱼类行为差异以及摄像机视角切换等，都会导致训练数据与真实场景之间存在显著的域间差异(domain gap)。这种差异使得在特定场景下训练成熟的模型，应用到新环境时性能急剧下降，成为制约智能渔业发展的技术瓶颈。针对这一挑战，发表于《Computers and Electronics in Agriculture》的

  来源：Computers and Electronics in Agriculture

  时间：2025-11-04

• 基于联合相似性非负矩阵分解的肿瘤复发多模态关联模式识别新方法

  肿瘤作为一组具有侵袭性生长和组织破坏特征的异质性疾病，术后复发仍是临床面临的严峻挑战。尽管手术切除是主要治疗手段，但放疗通常仅起辅助作用。据统计，术后复发往往需要重复干预，给患者带来沉重经济负担并恶化预后。因此，识别关键复发决定因素并实施及时干预，成为肿瘤学领域迫切需要解决的优先事项。传统研究多聚焦于肿瘤复发的病理特征或分子生物学机制。例如，Zhang等对171例滑膜肉瘤病例进行统计分析，发现较大初始肿瘤、阳性切除边缘、边缘切除、缺乏辅助治疗等多重因素与较高局部复发率相关。分子层面的研究也发现，L1CAM表达可作为肉瘤复发诊断标志物，ZNF703与STK11组合能预测三阴性乳腺癌复发，PSMA

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-11-04

• 综述：胶束在现代样品前处理技术中促进高效可持续实践的作用

  胶束的形成与核心特性胶束是由表面活性剂分子在溶液中自发组装形成的聚集体，当表面活性剂浓度达到临界胶束浓度（CMC）时，这一过程便会发生。CMC是胶束化过程中的一个关键参数，它标志着溶液性质发生显著变化的转折点。胶束主要分为正常胶束和反相胶束两种基本结构。此外，类脂质体（niosomes）和脂质体（liposomes）也作为重要的囊泡系统，在样品前处理方法中发挥着作用。与低分子表面活性剂形成的胶束不同，聚合物胶束呈现出独特的核-壳（core-shell）结构，这种结构允许通过化学修饰来灵活调整其物理化学性质，从而适应不同的应用需求。胶束在样品前处理技术中的应用策略胶束系统因其能提高分析物的溶解度

  来源：Critical Reviews in Analytical Chemistry

  时间：2025-11-04

• 绣球花状仿生氧化镁改性椰壳生物炭在多介质重金属污染修复中的应用：形态创新与机制解析

  随着工业化和城市化进程的加速，重金属污染已成为威胁生态系统安全和人类健康的重大环境问题。铅（Pb）和镉（Cd）作为典型的重金属污染物，通过废水排放进入水环境，随后在水循环作用下渗透至土壤系统，最终被农作物吸收积累，形成"从灌溉水到餐桌"的链式污染风险。这类重金属具有难降解、易富集的特点，即使低浓度暴露也可能通过食物链传递对人体造成神经毒性、肾损伤等危害。传统生物炭材料虽然通过其微孔结构和表面官能团对重金属具有一定吸附能力，但未改性的椰壳生物炭存在比表面积有限、表面官能团数量不足等问题，在复杂污染环境中的修复效果难以满足需求。特别是常规金属氧化物改性生物炭通常采用颗粒负载方式，容易导致孔隙堵塞和

  来源：Journal of Hazardous Materials

  时间：2025-11-04

• 基于玻璃载玻片与基于整张切片图像的透明细胞癌和乳头状肾细胞癌分级方法的比较：一项多队列、国际性的可重复性研究

  摘要 背景与目的 肾细胞癌（RCC）的组织学分级是诊断评估的重要部分。使用全切片成像（WSI）与玻璃切片显微镜进行RCC分级的可重复性研究尚不充分。本研究的目的是直接比较基于WSI和基于玻璃切片的分级方法在透明细胞癌（ccRCC）和乳头状肾细胞癌（pRCC）亚型中的效果。 方法 研究纳入了

  来源：Histopathology

  时间：2025-11-04

• 使用阵列空间灵敏度编码技术评估磁共振成像结合超声和乳腺X线摄影在乳腺癌诊断中的价值

  ### 解读与分析：基于ASSET技术的MRI与超声及钼靶X线联合诊断乳腺癌的临床价值乳腺癌是女性中最常见的恶性肿瘤之一，其早期诊断对于提高治疗效果和生存率具有决定性意义。随着社会的发展和人们对健康问题的关注度提升，乳腺癌的早期发现和准确诊断成为医疗领域的重要课题。医学影像技术的进步为这一目标提供了有力支持，特别是磁共振成像（MRI）、超声检查和钼靶X线摄影等手段，在乳腺癌的筛查和诊断中发挥了关键作用。然而，单一的影像技术在临床应用中仍存在一定的局限性，特别是在图像质量、扫描效率以及对复杂病灶的识别能力方面。因此，如何通过技术整合提升诊断准确率成为当前研究的重点。本研究旨在评估基于阵列空间敏感

  来源：Frontiers in Oncology

  时间：2025-11-04

• 基于表型中心的多组学方法，鉴定了胶质瘤血管生成相关的磷酸蛋白组特征及生物标志物集合，为3P（预测、预防和个性化）医学策略提供支持

  摘要蛋白质磷酸化是肿瘤血管生成中的一个重要分子事件，在胶质瘤中是一个典型的特征。我们假设胶质瘤新生血管组织中的磷酸蛋白组及磷酸化介导的信号网络与对照组存在显著差异。本研究旨在通过整合磷酸蛋白数据和多组学数据，识别胶质瘤血管生成的磷酸蛋白组特征、磷酸化介导的信号通路、激酶-底物网络以及磷酸化生物标志物，以深入理解胶质瘤血管生成的分子机制，发现有效的抗血管生成治疗靶点，并建立与血管生成相关的磷酸化生物标志物特征，用于患者分层、早期诊断和有效的预后评估，从而实现预测性、预防性和个性化医学（PPPM，3PM）的目标。本研究使用激光捕获显微解剖技术从胶质瘤中分离出新生血管组织，随后进行定量磷酸蛋白组学分

  来源：EPMA Journal

  时间：2025-11-04

• 基于跨物种机器学习的细菌形态关键基因快速发现新方法

  在生物学研究中，准确鉴定决定特定功能的基因一直是科学家们追求的核心目标。然而，传统方法如突变体筛选、图位克隆和全基因组关联分析（GWAS）往往局限于单一物种分析，存在耗时长、资源消耗大、难以全面覆盖等固有局限性。随着基因组测序技术的飞速发展，目前已测序的细菌基因组超过43万个，但绝大多数细菌的功能基因仍处于未被探索的"数据孤岛"状态，形成了"数据丰富但知识贫乏"的尴尬局面。这种困境为人工智能特别是机器学习（ML）的应用提供了前所未有的机遇。机器学习以其处理复杂生物数据的强大能力，在预测蛋白质三维结构、基因表达水平分析等方面已取得突破性进展。然而，迄今为止，尚未有机器学习被准确应用于关键生物功能

  来源：BMC Microbiology

  时间：2025-11-04

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