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tRNAProL中m1G37修饰通过抑制四碱基配对阻止+1移码的分子机制
12345678978854321在蛋白质合成过程中,核糖体必须严格维持mRNA的阅读框架以确保翻译准确性。然而,某些特殊序列如富含重复核苷酸的"滑动密码子"容易导致核糖体发生移码错误,产生功能异常的毒性蛋白。tRNAPro家族成员尤其容易在缺乏N1-甲基鸟苷(m1G37)修饰时诱发+1移码,但其分子机制尚不明确。美国埃默里大学(Emory University)的研究团队通过整合smFRET和冷冻电镜技术,系统研究了tRNAProL(GGG反密码子)在核糖体上的动态行为。研究发现m1G37修饰能显著改变tRNA的构象能量景观:在滑动密码子CCC-C背景下,未修饰tRNAProL更易形成P/E
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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贝叶斯多模型推断提升细胞信号转导预测准确性:以ERK通路为例
在细胞生物学领域,理解复杂的信号转导网络如同破解生命活动的密码本。其中,细胞外调节激酶(ERK)信号通路作为调控细胞增殖、分化的核心通路,其动态特性一直是研究热点。然而,由于细胞内中间步骤难以完全观测,科学家们常需依赖简化假设建立数学模型,导致同一通路存在多种模型版本。这种"模型不确定性"严重影响了预测可靠性——就像用不同比例尺的地图导航,可能得到截然不同的路线规划。针对这一挑战,加州大学圣地亚哥分校(University of California, San Diego)的研究团队在《Nature Communications》发表创新研究。他们开发了贝叶斯多模型推断(MMI)框架,通过整合
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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持续氧合大封装系统实现高密度胰岛素分泌细胞的存活与功能维持
在治疗1型糖尿病(T1D)的探索中,细胞替代疗法展现出治愈潜力,但长期免疫抑制的毒副作用成为临床转化的主要障碍。封装技术通过物理隔离免疫攻击成为理想解决方案,然而缺氧问题始终制约着该技术的发展——胰岛β细胞具有极高的氧耗率(2.1 pmol/min/IEQ),而皮下移植部位氧分压常低于10 mmHg,加之纤维囊形成进一步阻碍氧扩散。传统化学供氧材料持续时间短,而经皮充氧装置又存在操作繁琐、体积庞大等问题,使得临床所需的高密度胰岛封装(300,000-770,000 IEQ)难以实现。针对这一系列挑战,来自康奈尔大学的研究团队在《Nature Communications》发表了突破性解决方案。
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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铜绿假单胞菌跨膜协作机制:III型分泌系统介导的钙离子信号通路驱动胞内病原体逃逸
在微生物与宿主的永恒博弈中,铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)堪称"变形大师"。这种机会致病菌既能引发烧伤创面感染、角膜溃疡等局部病变,又可导致危及生命的肺部感染。传统观点将其归类为胞外病原体,但越来越多的证据显示其具备惊人的环境适应能力——通过入侵上皮细胞形成胞内生态位。更令人惊讶的是,同一菌群会分化成两个截然不同的亚群:快速增殖的胞质菌(表达III型分泌系统T3SS)和缓慢复制的空泡菌(对抗生素耐受)。这种"双面策略"如何形成?是否存在某种神秘的群体协作机制?这些谜团长期困扰着微生物学家。美国加州大学伯克利分校的研究团队在《Nature Communication
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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海胆胚胎微小微粒体通过独特代谢调控和内质网不对称分布驱动原肠胚形成的机制研究
在胚胎发育的奇妙旅程中,如何建立正确的体轴方向是生命最初的关键挑战。组织者细胞(organizers)作为发育过程中的"指挥中心",通过分泌信号分子指导周围细胞的命运决定。尽管一个世纪前就发现了著名的Spemann-Mangold组织者,但究竟是什么赋予这些细胞独特的诱导能力仍是一个谜团。海胆胚胎中的微小微粒体(micromeres)作为经典的组织者模型,在16细胞阶段通过不对称分裂形成,具有调控胚胎模式的能力,但其背后的代谢基础始终未被揭示。布朗大学(Brown University)的研究团队在《Nature Communications》发表的研究中,首次揭示了微小微粒体通过独特的代谢特
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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基于保留时间的计算策略实现复杂脂质中脂肪酸双键位点的高通量精准定位
在生命科学领域,脂质分子中碳碳双键(C=C)的精确位置如同隐藏的密码,直接影响着细胞信号传导、膜流动性和炎症反应等关键生理过程。尽管质谱技术已能解析脂质的脂肪酸组成,但传统方法在双键位点鉴定上仍面临巨大挑战——要么需要昂贵的专用仪器如电子活化解离(EAD)装置,要么涉及危险的臭氧诱导解离(OzID)化学处理,这些方法不仅灵敏度受限,还难以兼容常规的高通量分析。这种技术瓶颈严重阻碍了科学家们深入理解ω-3与ω-6脂肪酸在炎症、神经退行性疾病和癌症中的差异化作用机制。来自奥地利格拉茨大学(University of Graz)和美国加州大学圣地亚哥分校(University of Californ
来源:Nature Communications
时间:2025-08-12
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基于系统生物学的全细胞与无细胞百日咳疫苗免疫反应评估:转录组与翻译组联合分析揭示保护性免疫差异机制
百日咳的卷土重来给全球公共卫生敲响警钟——尽管无细胞百日咳疫苗(DTaP)因低不良反应在90年代全面替代了全细胞疫苗(DTP),但流行病学数据显示,DTaP接种者免疫力衰退更快,导致突破性感染激增。更令人担忧的是,灵长类实验证实DTaP仅能预防发病却无法阻断传播,而DTP兼具双重保护作用。这种保护效力的差异背后隐藏着怎样的免疫机制?传统血清学方法难以揭示的分子层面答案,正等待系统生物学方法的破解。来自美国范德堡大学等机构的研究团队在《npj Vaccines》发表了一项开创性研究。他们首次将核糖体图谱(Ribosome Profiling, RP)技术引入疫苗学研究,结合RNA测序(RNA-S
来源:npj Vaccines
时间:2025-08-12
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婴儿免疫应答的全细胞与无细胞百日咳疫苗免疫学特征解析:为下一代疫苗设计提供新见解
百日咳(pertussis)作为全球儿童十大死因之一,每年导致约24万例5岁以下儿童死亡。尽管无细胞百日咳疫苗(DTaP)因不良反应少已在高收入国家取代全细胞疫苗(DTP),但其免疫保护效果会随时间显著减弱。更令人担忧的是,动物实验显示DTaP虽能减轻症状,却无法阻止百日咳杆菌的鼻咽定植和传播。这一困境促使科学家深入探究两类疫苗的免疫机制差异。为破解这一难题,范德堡大学医学中心(Vanderbilt University Medical Center)的C. Buddy Creech团队联合秘鲁营养研究所等机构,对56名健康婴儿进行了前瞻性研究。通过RNA测序(RNA-Seq)和核糖体分析(R
来源:npj Vaccines
时间:2025-08-12
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活细胞中H2O2的化学遗传学检测与定量新策略
过氧化氢(H2O2)作为需氧代谢的天然产物,在细胞信号传导中扮演关键角色。传统检测方法面临特异性不足、定量困难等挑战。最新开发的化学遗传学方案巧妙利用工程化血红素过氧化物酶APEX2,通过靶向表达于特定亚细胞区室,结合外源性荧光/化学发光底物,将细胞内H2O2转化为可检测信号。与既往可逆的基因编码探针不同,APEX2通过不可逆的底物转化直接反映H2O2的真实水平,避免硫醇氧化-还原平衡的干扰。该方案详细涵盖三大核心环节:APEX2细胞系的构建(3天完成)、荧光/发光检测体系的建立(1-2小时)、以及实际应用案例演示。特别值得注意的是,该方法支持灵活搭配不同底物——使用Amplex Red可进行
来源:Nature Protocols
时间:2025-08-12
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黑色素瘤诱导的树突状细胞免疫无能转化过程中蛋白质组与分泌组的特征分析揭示IDO1、组织蛋白酶和豆蔻酰化酶活性增强
在肿瘤免疫治疗领域,树突状细胞(DC)作为专职抗原呈递细胞,其功能缺陷是制约疗效的关键瓶颈。尤其令人困惑的是,黑色素瘤患者体内存在大量CD14+CD163+ DC3亚群,这些细胞不仅丧失激活CD8+ T细胞的能力,还表现出显著的免疫抑制特性。尽管已知肿瘤分泌的IL-6、M-CSF等因子可诱导DC2向DC3转化,但这一过程中蛋白质网络的全局性变化仍是未解之谜。荷兰奈梅亨大学医学中心(Radboud University Medical Center)的研究团队在《Molecular 》发表的重要研究,通过整合定量蛋白质组学和创新代谢标记技术,首次绘制了黑色素瘤诱导DC免疫无能转化的分子图谱。研究
来源:Molecular & Cellular Proteomics
时间:2025-08-12
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中性粒细胞胞外诱捕网通过干扰调节性T细胞分化加剧牙周炎病理进程
当牙周炎发生时,中性粒细胞会释放大量像蜘蛛网般的胞外诱捕网(NETs),这些网状结构不仅会引发强烈炎症反应,更会暗中破坏免疫系统的平衡调节。最新研究发现,NETs在牙周组织和血清中异常堆积,像路障般阻挡着具有抗炎作用的调节性T细胞(Tregs)的生成。科研人员通过精巧的小鼠实验模型,用DNase I这把"分子剪刀"剪除NETs后,惊喜地观察到牙槽骨吸收明显减轻,牙龈组织中Tregs的数量和抗炎因子IL-10、TGF-β的表达水平显著提升。体外实验更揭示出有趣现象:当用牙龈卟啉单胞菌脂多糖(P. g-LPS)刺激中性粒细胞产生的NETs,会像磁铁吸走铁屑般,把共培养的初始CD4+T细胞牢牢困住,
来源:Genes & Immunity
时间:2025-08-12
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逆向工程改造的气体发酵产乙酸菌株通过自养适应性实验室进化恢复增强表型
引言全球气候变暖背景下,利用气体发酵技术将工业废气(CO/CO2)转化为燃料和化学品是实现碳中和的重要途径。产乙酸菌(如Clostridium autoethanogenum)因其高效的Wood-Ljungdahl碳固定途径(WLP)成为理想催化剂,但多数基因功能未知限制了其工程化改造。前期适应性实验室进化(ALE)筛选到多个突变菌株,本研究通过逆向工程验证关键基因的功能。实验方法菌株构建:采用CRISPR/Cas9技术删除高频突变基因CLAU_0471,构建RE3菌株,并与先前改造的RE1(Spo0A缺失)和RE2(CLAU_1957 SNP)进行比较。培养条件:在无酵母提取物(YE)的化学
来源:Microbial Biotechnology
时间:2025-08-12
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27-羟基胆固醇(27-HC)通过巨噬细胞-上皮细胞互作加剧哮喘发病机制的分子机制
27-羟基胆固醇(27-HC)作为胆固醇的氧化代谢物,由线粒体细胞色素P450酶——固醇27-羟化酶(CYP27A1)催化生成。这项研究发现,在哮喘小鼠肺组织中,CYP27A1表达显著升高,且肺泡巨噬细胞(AMs)是27-HC的主要来源。这种神奇的氧化固醇不仅能诱导嗜酸性粒细胞趋化因子RANTES和Eotaxin的释放,还能促进肺成纤维细胞向肌成纤维细胞分化,并刺激细胞外基质蛋白的产生。研究团队观察到,27-HC会显著增加哮喘小鼠支气管肺泡灌洗液中总细胞数和嗜酸性粒细胞数量,加剧肺组织炎症细胞浸润和气道高反应性。更令人惊讶的是,气道内的警报素IL-33通过NF-κB信号通路,像一把钥匙一样开启
来源:Immunology
时间:2025-08-12
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嗜水气单胞菌新型蚊媒致病株的鉴定及其对肠道屏障与免疫通路的破坏机制
引言昆虫肠道微生物群在维持宿主稳态中扮演关键角色。蚊虫肠道菌群影响宿主的免疫、发育和传病能力(vector competence)。然而,多数研究仅描述微生物多样性,鲜少探讨单一菌种对宿主的影响。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是水生环境中常见的革兰氏阴性菌,已知能感染哺乳动物和鱼类,但其对蚊虫的致病性尚未明确。本研究从濒死库蚊幼虫肠道中分离出一株嗜水气单胞菌,发现其能通过口服感染导致库蚊和白纹伊蚊死亡,并揭示了其破坏肠道屏障、激活免疫应答的分子机制。材料与方法实验采用实验室饲养的库蚊和白纹伊蚊,通过喂食含菌蔗糖溶液(OD600=15)进行感染。利用抗磷酸化组蛋白H3(
来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
时间:2025-08-12
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综述:LKB1在前列腺癌中的作用:对肿瘤进展和治疗的启示
1 Introduction前列腺癌(PCa)是全球男性第二大高发恶性肿瘤,尽管手术、放疗和雄激素剥夺疗法(ADT)等取得进展,但高危患者仍面临去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的挑战。肝脏激酶B1(LKB1/STK11)作为调控细胞代谢、极性和生长的核心激酶,其功能缺失通过非遗传机制(如表观遗传沉默)驱动PCa进展,尤其在PTEN缺失背景下显著促进转移和谱系可塑性。2 Essential functional modules and cancer-related signaling networks of LKB1LKB1通过形成STRAD/MO25复合体激活AMPK等下游激酶,协调能量应激响应
来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology
时间:2025-08-12
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综述:电敏感水凝胶在软骨组织工程中的建模理论综述
电敏感水凝胶作为智能生物材料,在外部电场作用下可发生溶胀、收缩或弯曲。这些特性使其成为软骨组织工程中极具潜力的治疗载体。本文将从建模理论的角度,深入解析其工作机制。1 引言关节软骨作为无血管的结缔组织,其修复能力极弱。电敏感水凝胶通过模拟天然软骨的电化学特性(如扩散电位、流动电位和Donnan渗透压),在电场调控下促进细胞外基质合成。聚电解质水凝胶(如聚苯胺PANi、聚吡咯PPy)和纳米复合材料(如石墨烯、碳纳米管CNTs)是当前研究热点。2 多相混合物/MECe模型该模型通过耦合Poisson方程(描述电势ψ)、Nernst-Planck方程(离子通量Jk)和连续方程,建立电-化-力多场耦合
来源:Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
时间:2025-08-12
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化学工程师能从虾身上学到什么
### 从水蚤的空化机制到化学工程中的应用探索空化现象是一种在液体中通过压力变化引发气泡生成、生长和崩溃的物理过程,这一过程在自然界中广泛存在,并且在许多工程领域中具有重要应用价值。其中,水蚤(snapping shrimp)的空化机制因其高效性和可控性,成为化学工程中探索“过程强化”(process intensification)的灵感来源。水蚤的空化过程不仅为化学反应提供了独特的物理和化学条件,还为可持续技术的开发带来了新的可能性。#### 空化现象的自然灵感水蚤是一种生活在海洋中的小型甲壳类动物,其最引人注目的特性之一是能够通过其不对称的钳子快速闭合,从而在水中生成强烈的空化效应。这种
来源:Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering
时间:2025-08-12
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生物细胞中的物质与生命之间的联系
在科学探索的漫长历史中,关于无生命物质如何转变为生命体的问题一直是一个核心议题。从古希腊哲学家到现代生物学家,科学家们不断尝试揭示生命与非生命之间的本质差异。最初,人们认为生命是一种神秘的“生命力”(vital force),而这种观念在19世纪被巴斯德和布朗等科学家通过实验逐步推翻。随着原子理论的确立和对生命遗传、进化、繁殖独特性的理解,中央狗ma(Central Dogma)被提出,这一模型将生命视为一种信息流动的过程:从DNA到RNA,再到蛋白质。然而,即使在技术高度发展的今天,科学家们仍然无法从原子和分子层面直接合成一个完整的生命体,正如理查德·费曼所说:“我无法创造的东西,我也不理解
来源:Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering
时间:2025-08-12
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萨凡纳河核电站核废料处理中的化学工程应用选例
在核能发展过程中,核废料的处理始终是科学家和工程师面临的一项重要挑战。美国萨凡纳河(Savannah River Site, SRS)自1996年起便开始处理和固化核废料,至今已有超过25年的运营历史。这一长期的实践不仅积累了丰富的工程经验,也推动了相关领域的科学研究进展。随着科学对化学原理理解的深入以及工程固化技术的改进,对核废料处理系统的现状进行回顾显得尤为重要。这项回顾不仅适用于SRS,还可能对其他正在处理核废料的地点产生影响。例如,汉福德(Hanford)核废料处理设施也正在推进其废物清理工作,这使得SRS的经验和技术成果具有更大的参考价值。核废料的处理涉及一系列复杂的化学过程,这些过
来源:Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering
时间:2025-08-12
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定量机械化学:一种连接聚合物物理与软聚合物网络力学之间的化学工具
近年来,机械化学作为一项新兴的化学工具,逐渐成为连接聚合物物理与连续力学在软材料研究中的重要桥梁。通过在承载力强的区域引入对力敏感的分子(称为机械化学响应分子,简称“机械响应子”或“mechanophores”),研究人员能够检测材料中的应力分布和键断裂现象,并通过光学信号的强度来判断这些变化。这种技术在软材料的力学行为研究中展现出巨大的潜力,尤其是在评估材料的损伤区域和应力集中区时,能够提供传统方法难以捕捉的细节信息。本文将从多个角度深入探讨机械化学在软材料断裂研究中的应用及其面临的挑战。### 软材料与机械化学的联系软材料广泛应用于工程和生物医学领域,例如轮胎中的弹性体、密封件中的阻尼材料
来源:Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering
时间:2025-08-12