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  • 综述:皮肤中的自然杀伤细胞:深入探索这一被忽视的次级淋巴器官多重功能的独特机遇

    背景作为连接先天与适应性免疫的关键效应细胞,自然杀伤细胞(NK)通过识别"缺失自我"或异常蛋白直接杀伤靶细胞,或通过分泌IFN-γ和TNFα激活适应性免疫。不同于传统认知,最新研究揭示皮肤作为人体最大器官,其独特的免疫微环境包含CD56brightCD16neg的组织驻留NK细胞(trNK),这些细胞与循环NK细胞(cNK)在表型和功能上存在显著差异。单细胞测序技术将循环NK分为NK1(细胞毒性)、NK2(细胞因子分泌)和NK3(可塑性)三个亚群,而皮肤trNK则表现出CD49a+CD69+的组织驻留特征。皮肤trNK细胞的起源之谜皮肤trNK与肝脏、子宫trNK共享T-bet依赖性发育途径,

    来源:Frontiers in Immunology

    时间:2025-08-12

  • 综述:TGF-β超家族在子宫内膜异位症中的作用:系统性综述

    TGF-β超家族在子宫内膜异位症中的分子机制引言子宫内膜异位症(EMS)是一种以功能性子宫内膜组织异位生长为特征的慢性妇科疾病,全球育龄女性发病率达5-10%,主要症状包括痛经、慢性盆腔疼痛和不孕。尽管其病因尚未完全阐明,近年研究发现TGF-β超家族通过调控细胞增殖、分化和免疫微环境,成为EMS发病的关键驱动因素。TGF-β超家族信号通路TGF-β超家族成员通过经典Smad和非经典途径传递信号:经典Smad通路:配体(如TGF-β1、BMP2)结合受体后,磷酸化R-Smads(如Smad2/3或Smad1/5/8),与Smad4形成复合物转入核内调控基因表达。抑制性Smad6/7则通过负反馈调

    来源:Frontiers in Immunology

    时间:2025-08-12

  • 肾脏移植前基于HLA和非HLA细胞外抗原抗体检测的抗体介导损伤风险评估

    引言在肾移植(KT)领域,抗体介导排斥(ABMR)是影响移植物长期存活的主要障碍。尽管供体特异性人类白细胞抗原抗体(HLA-DSA)是ABMR的核心驱动因素,但约30%-60%的ABMR病例缺乏可检测的HLA-DSA。近年研究发现,非HLA抗体可能通过自身免疫或同种免疫机制参与这一过程,但其在移植前风险评估中的作用尚不明确。材料与方法研究纳入121例肾移植受者,包括46例ABMR/MVI患者和75例无损伤对照,采用Luminex多重检测技术分析60种非HLA抗体。通过中位荧光强度(MFI)比值总和评估抗体负荷,并结合Banff 2017分类进行组织学诊断。结果移植前发现:87%患者存在非HLA

    来源:Frontiers in Immunology

    时间:2025-08-12

  • 乳酸调节生物过程的新兴机制

    乳酸曾经被认为只是糖酵解过程中的无害副产物,但如今被广泛认识到它在细胞代谢和生理调节中扮演着复杂且重要的角色。乳酸的双重功能——既是代谢底物又是代谢信号分子——表明其在生物系统中具有广泛的调控作用。这种代谢分子的特性使其能够根据细胞的能量状态调节细胞功能,从而支持适应性变化。在细胞和整个生物体中,乳酸的产生、运输和利用是长期研究的热点,也仍然是一个活跃的研究领域。本文将探讨乳酸在特定细胞环境中的作用,特别是其作为代谢信号分子的机制,并强调乳酸在多种生物过程中的调节功能。乳酸的生成是细胞能量代谢过程中的一个重要环节。在有氧条件下,细胞通过氧化磷酸化获得更多的ATP,而在缺氧条件下,乳酸则是唯一的

    来源:Annual Review of Cancer Biology

    时间:2025-08-12

  • B细胞在实体瘤中的作用

    B细胞在实体瘤中的作用具有双重性,既可能促进肿瘤生长,也可能抑制肿瘤发展。这一现象为癌症免疫治疗提供了新的思路,同时也带来了挑战。近年来,研究者对B细胞在肿瘤微环境(TME)中的功能有了更深入的理解,揭示了其在抗肿瘤免疫中的关键作用。然而,随着对B细胞功能多样性的认识不断加深,科学家们也逐渐意识到某些B细胞状态可能通过免疫调节机制促进肿瘤进展。本文将探讨B细胞在实体瘤中的这两种功能,并总结当前针对B细胞功能调控和免疫治疗的研究进展。### B细胞的抗肿瘤功能B细胞在抗肿瘤免疫中扮演着重要的角色,其主要功能包括通过抗体产生、抗原呈递和细胞因子分泌来对抗肿瘤。在某些情况下,B细胞可以形成三级淋巴样

    来源:Annual Review of Cancer Biology

    时间:2025-08-12

  • 癌症中转录增强子的遗传和表观遗传失调

    增强子是基因表达调控中不可或缺的一部分,它们是一类非编码DNA序列,通过与转录因子和染色质调控因子的相互作用,在复杂的基因组结构中协调基因表达程序。然而,增强子的基本功能可能会因遗传和表观遗传的改变而受到干扰,从而导致异常的增强子激活或调控重排,这在癌症的发生过程中扮演了重要角色。通过分析异常的增强子景观,科学家们发现了一些新的亚型定义的基因组特征,如增强子劫持(enhancer hijacking),并识别出与疾病相关的转录调控因子,这些因子可能是开发针对增强子的治疗策略的重要靶点。本文旨在探讨增强子研究的最新概念和技术,讨论遗传、表观遗传和拓扑结构的变化如何干扰增强子调控以促进癌基因表达,

    来源:Annual Review of Cancer Biology

    时间:2025-08-12

  • 体内增殖细胞中线粒体呼吸链的独特本质

    在生物体内,线粒体呼吸链(RC)的功能对于细胞的增殖具有核心意义,尤其在癌症细胞、CD4+和CD8+ T细胞以及内皮细胞中表现得尤为突出。线粒体不仅是细胞能量生成的关键器官,还在生物合成过程中发挥着重要作用,通过氧化三羧酸(TCA)循环提供必要的中间产物,这些产物能够被导向合成脂质、蛋白质和核苷酸等关键分子。因此,线粒体呼吸链不仅是细胞生存和增殖的基础,更是维持生命活动的重要引擎。然而,对于其他一些增殖性细胞,如调节性T细胞(Tregs)和干细胞,线粒体的作用则有所不同。这些细胞在增殖过程中并不依赖线粒体的功能,但线粒体通过多种信号机制决定了它们的命运和功能。这一双重角色表明,线粒体在不同的细

    来源:Annual Review of Cancer Biology

    时间:2025-08-12

  • 软模式作为跨尺度低维生物系统的预测框架

    在自然界中,生物系统通常面临各种扰动,包括热力学波动、外部环境变化以及基因突变。尽管生物系统由成千上万个相互作用的组件构成,但近年来的高通量实验表明,它们对扰动的响应却出乎意料地具有低维特征:变化局限于可能的众多变化中仅少数几种模式。本篇综述文章旨在探讨一种统一的动态系统框架——“软模式”(soft modes),以解释和分析生物系统中的低维度现象,从分子层面到生态系统层面。我们主张,这种软模式框架不仅能够概括经典发育生物学中的某些概念,如表型复制、双重缓冲和全局表型互作(epistasis),还能够对不同尺度的生物系统做出非平凡的预测。虽然部分预测已被实验验证,但我们讨论了软模式如何为蛋白质

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 质量光度测量

    ### 质量光度技术及其在生命科学中的应用质量光度技术(Mass Photometry, MP)是一种用于测量溶液中生物大分子质量的创新方法。与传统的标记型光学检测不同,MP通过直接测量质量实现了对生物分子的定量分析,从而能够在混合物中识别不同的分子种类并确定其相对丰度。这一技术不仅适用于蛋白质及其同源或异源寡聚体,还能够用于检测核酸、脂类和糖类等广泛类型的生物分子。MP的核心优势在于其能够定量分析分子异质性、相互作用能量以及动力学特性,使其在生命科学领域迅速得到应用和推广。#### 质量光度的原理与优势质量光度技术的原理基于光的散射现象。当光线照射到一个物体上时,该物体的极化特性会引发光的散

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 单根细胞骨架纤维的力学特性

    细胞骨架是细胞内部复杂的网络结构,由不同类型的生物大分子构成,这些分子在细胞内承担着多种关键功能。它们的机械特性对于理解这些功能至关重要,因为细胞骨架不仅支撑细胞形态,还参与细胞运动、信号传递、物质运输等重要过程。尽管这些生物大分子通常被视作具有一定刚性的结构,但研究表明它们的机械行为远比简单的“刚性杆”模型复杂。细胞骨架中的微管、肌动蛋白丝和中间丝是三种主要的结构类型,它们在细胞内的作用机制各有不同,但都受到其结构和生化特性的影响。此外,这些丝状结构的机械性能还与细胞环境密切相关,包括其组装方式、与其他蛋白的相互作用以及外界力的响应。因此,研究这些丝状结构的机械性能不仅有助于揭示其在细胞内的

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 内在无序蛋白的膜结合

    细胞膜在细胞及其细胞器的调控中扮演着关键角色,不仅提供了细胞活动的物理边界,还为多种生物学过程提供了重要的平台。近年来,研究发现膜结合(membrane association)对无序蛋白(intrinsically disordered proteins, IDPs)或无序区域(intrinsically disordered regions, IDRs)的调控作用,成为理解细胞膜功能的关键。这种结合不仅影响蛋白质的定位和功能,还可能通过减少维度效应,与液-液相分离(liquid-liquid phase separation, LLPS)产生类似的功能,例如促进蛋白质相互作用和聚集。通过多

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 生化网络中的信息处理

    生命系统以其对物质、能量和信息的受控流动为特征。尽管生物物理学界在前两个方面取得了显著成果,但对信息流动的研究却更具挑战性,仅在进化理论和神经科学中有一些零散的成功案例。然而,过去二十年中,生物物理学、定量生物学与工程学之间的跨学科研究已经推动了对分子尺度信息流动的新兴数学语言的发展。这些信息流动是生命核心过程发生的地方,从环境信号的检测与转换,到遗传信息的读取或复制,再到触发适应性细胞反应。这些过程由复杂的生化反应网络协调完成,这些网络在常温下运行,处于非平衡态,并且使用低拷贝数的多种分子物种,这些分子之间的相互作用具有有限的特异性。本文回顾了如何利用信息论量来形式化生化网络中的信息流动,如

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 线粒体复合物I和ATP合酶的冷冻电镜成像

    在细胞能量代谢过程中,线粒体扮演着至关重要的角色。作为细胞的“能量工厂”,线粒体通过氧化营养物质(如葡萄糖、氨基酸和脂肪酸)产生化学能,最终转化为三磷酸腺苷(ATP),为细胞的基本功能提供动力。ATP不仅在细胞质中广泛存在,还通过其在各种细胞活动中的作用,如细胞分裂、运动和发育,成为生命活动的核心驱动力。在这个过程中,电子传递链(ETC)和ATP合酶是两个关键的分子机器,它们通过协同作用将能量从氧化反应传递至ATP合成。近年来,冷冻电镜(Cryo-EM)技术的发展为研究这些复杂结构提供了革命性的手段,使得科学家能够以前所未有的精度解析线粒体复合物I和ATP合酶的构象变化及其在能量转换中的功能机

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 分子水平超分辨率荧光成像

    在过去的三十年中,荧光显微镜技术经历了革命性的进展,特别是在实现分子级分辨率方面。这种技术的突破主要源于一系列创新方法的发展,例如受激辐射耗损(STED)显微镜、光激活定位显微镜(PALM)和随机光学重建显微镜(STORM)。其中,单分子定位显微镜(SMLM)在提高图像分辨率方面表现尤为突出,尽管其速度相较于STED较慢,但通过克服荧光标记的光漂白限制,实现了更高的分辨率。特别值得一提的是DNA点积累用于纳米尺度地形成像(DNA-PAINT)技术,它通过不断更换荧光标记来持续更新信号,从而显著提升了SMLM的性能。此外,低温荧光显微镜(cryo-fluorescence microscopy)

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 膜蛋白折叠途径中的新兴模式

    膜蛋白折叠研究的进展,从最初简单的系统如细菌视紫红质(bR)逐步扩展到复杂的结构如ATP结合盒(ABC)转运蛋白和电压门控离子通道。随着技术的不断进步,如单分子力谱学和体内力谱分析,我们如今能够以氨基酸分辨率详细研究膜蛋白的折叠路径。这些蛋白质在膜环境中经历复杂的能量景观,受到缺乏疏水折叠和脂质双分子层粘滞性的双重影响,从而限制了折叠速度。此外,许多跨膜(TM)螺旋展现出较低的疏水性,以支持其功能需求,但同时也增加了膜插入的能量障碍,这种现象体现了功能与折叠能力之间的进化权衡。膜蛋白的折叠过程通常由内质网(ER)伴侣蛋白如Sec61转位子和ER膜蛋白复合体(EMC)辅助完成,这些伴侣蛋白在蛋白

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 真核生物转录因子中DNA相互作用的机制

    ### 欧基亚利克基因调控因子的复杂性与动态机制在生物系统中,基因调控是维持生命活动和细胞功能的核心过程之一。无论是原核生物还是真核生物,调控因子都必须识别特定的DNA序列,高效地搜索并结合这些序列,以帮助招募或阻止转录机器。然而,真核生物中的调控因子面临更加复杂的挑战。与原核生物的简单序列识别不同,真核生物的基因调控机制涉及庞大的多染色体基因组,DNA与染色质重塑和表观遗传修饰的动态相互作用,以及调控因子内部的无序区域和其对短DNA基序的识别能力。这些特性不仅塑造了调控因子的功能多样性,也揭示了其在DNA相互作用中的新机制,推动了我们对真核生物基因调控范式的重新认识。#### 基因调控因子的

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 生物能量学与细胞特征的进化

    生命在地球上的演化历程中,经历了无数复杂的转变,最终形成了今天多样化的细胞结构。从最简单的原核细胞到复杂的真核细胞,各种细胞特征的出现和演化不仅改变了细胞的形态和功能,也深刻影响了其适应环境的能力。然而,这些细胞特征并非仅仅是生物功能的增强,它们还伴随着一定的能量消耗,这种能量负担是细胞维持生命活动的基础之一。因此,理解这些特征对细胞适应性(即“适应度”)的影响,是探讨生命演化过程的关键。### 一、细胞特征的适应度影响在生命演化过程中,细胞特征的引入往往伴随着一定的代价,这种代价主要体现在能量消耗上。比如,细胞膜的形成、细胞器的构建、细胞运动结构如鞭毛的发育,都需要细胞投入资源,而这些资源的

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 染色质状态遗传的机制:从酵母到人类

    DNA甲基化和组蛋白修饰在真菌与哺乳动物的染色质结构中扮演着关键角色,这些表观遗传机制不仅影响基因表达调控,还决定了遗传信息的稳定性。本文旨在探讨DNA甲基化和组蛋白H3K9甲基化如何通过特定的酶和蛋白质复合体,在细胞分裂过程中实现表观遗传记忆的传递。在哺乳动物中,DNA甲基化通常与组蛋白H3K9三甲基化紧密相关,而在真菌中,这一机制则由DNMT5酶主导。这种差异表明,不同物种的表观遗传系统在进化过程中形成了独特的调控策略。DNA甲基化是指在DNA分子中特定的胞嘧啶(CpG二核苷酸)上添加甲基基团的过程。这一修饰在哺乳动物中具有显著的表观遗传记忆功能,能够确保细胞在分裂后仍保留特定的基因表达模

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 蛋白质折叠与生物热力学:生物热力学如此高效,我们真的应该感到惊讶吗?

    蛋白质的功能和动态特性是理解其生物学行为的核心。在研究蛋白质折叠过程中,我们不仅需要关注其折叠后的稳定状态(即天然态构象集合NSE),还必须深入探讨其未折叠状态(即变性态构象集合DSE)的特性。变性态构象集合通常被认为是蛋白质在失去其天然构象后所处的一种状态,其内部结构的多样性可能会对稳定性计算造成干扰。然而,通过一系列实验方法和理论模型,我们发现即使在不同的环境条件下,DSE的热力学性质仍然具有高度的一致性,这为蛋白质折叠的热力学研究提供了可靠的基础。蛋白质折叠是一个复杂的过程,涉及到多种物理化学因素的相互作用。例如,氢键、疏水作用、熵变和能量变化等都会影响折叠路径和稳定性。在许多情况下,蛋

    来源:Annual Review of Biophysics

    时间:2025-08-12

  • 呼吸系统的空间转录组学

    近年来,随着单细胞基因组学技术的迅速发展,我们对肺部和气道中细胞类型异质性和可塑性的理解取得了显著进展。然而,现在面临的挑战是如何在三维空间中理解这些细胞类型之间的相互作用,以实现肺功能的正常运作,包括维持气流和气体交换,同时防止感染。为了解决这一问题,新型空间解析基因表达技术的迅速崛起,以及结合机器学习和深度学习的计算工具,为这一挑战提供了新的希望。本文将回顾最常用的空间分析流程,探讨其优势与局限性,并概述机器学习和人工智能在提升空间数据解读方面的最新进展。这些技术有望彻底改变我们对呼吸系统在健康与疾病状态下的理解,并展示在肺发育、新冠状病毒(COVID-19)、肺癌和肺纤维化等领域的研究成

    来源:Annual Review of Physiology

    时间:2025-08-12


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