• 基于超声影像组学的机器学习模型预测乳腺癌表皮生长因子受体表达状态

  引言乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，在中国每年新发病例约35.72万例，占全球发病总数的57.4%。尽管新辅助化疗、手术和辅助治疗等治疗手段不断进步，但优化诊断和治疗策略以改善患者预后仍是当务之急。表皮生长因子受体（EGFR）在细胞增殖和分化中起着关键作用，其过表达会显著加速肿瘤的转移和复发，导致患者总生存期和无病生存期显著降低。因此，EGFR是一个重要的临床治疗靶点。然而，目前检测乳腺癌EGFR过表达主要依赖侵入性方法，这会增加患者不适、操作风险以及总体检测成本和复杂性。开发一种在治疗前非侵入性、高效预测乳腺癌患者EGFR突变风险的方法迫在眉睫，此举可缩短诊断时间，减少对侵入性程序的依赖，

  来源：Frontiers in Oncology

  时间：2025-10-18

• 基于宏基因组学分析高能X射线FLASH放疗通过肠道微生物群缓解急性放射性肠损伤的作用机制

  引言放射治疗是恶性肿瘤的主要治疗手段之一，约60-70%的癌症患者在不同阶段需要接受放疗。然而，放射剂量增加在提高肿瘤局部控制率的同时，也会导致照射野内正常组织副作用风险升高，尤其是腹部和盆腔放疗时易引发急性放射性肠损伤。FLASH放疗（FLASH-RT）作为肿瘤放疗领域的革命性技术，能以超高速率（≥40 Gy/s）在毫秒至微秒级时间内完成照射，在保持相同肿瘤杀伤效力的同时，对正常组织具有显著保护作用。尽管已有研究提示FLASH效应可能与氧化应激、DNA损伤修复等机制相关，但其具体分子机制尚未完全阐明。本研究首次采用临床级紧凑高能X射线源（CHEXs）FLASH-RT设备，通过宏基因组学分析探

  来源：Frontiers in Microbiology

  时间：2025-10-18

• 绵羊尾型性状的全基因组选择信号解析：脂代谢关键基因与育种应用前景

  引言绵羊作为最早被驯化的家畜之一，在肉类、羊毛和奶制品生产中具有重要地位。中国作为绵羊养殖历史悠久的国家，拥有丰富的绵羊品种资源，根据尾脂沉积类型可分为短薄尾、长薄尾、短脂尾、长脂尾和肥臀羊等类型。在绵羊进化过程中，脂尾的形成是对食物资源波动的适应性生存机制——通过积累尾脂储存能量以应对饥荒期。这种能量储存功能在驯化绵羊中仍被保留，成为绵羊尾脂形成的关键进化原因。脂尾性状使绵羊在恶劣环境中具备更强的生存适应性。表型分析与地理气候因素的研究表明，气候类型显著影响薄尾和脂尾绵羊的分布：短脂尾和肥臀羊主要分布于环境较严酷的北方地区，而南方地区则以短薄尾绵羊为主。尾脂中高比例的非末端支链脂肪酸及其独特

  来源：Frontiers in Genetics

  时间：2025-10-18

• 基于可解释机器学习的乳腺癌急性放射性皮炎预测模型：开发与验证研究

  研究背景与目的放射性皮炎（RD）是乳腺癌放疗常见的不良反应，严重影响患者生活质量并增加医疗负担。超过半数患者会出现2级及以上皮炎，可能导致治疗中断。尽管已有研究尝试通过放射组学或多组学模型预测RD，但存在模型泛化性不足、对非线性关系拟合能力有限等问题。本研究旨在开发一种整合多维临床变量、具备可解释性的机器学习模型，以实现对高风险患者的早期识别。研究方法与设计本研究回顾性纳入2024年2月1日至12月19日期间691例接受术后放疗的乳腺癌患者，随访至2025年2月25日。所有患者均接受图像引导调强放疗（IGRT-IMRT），靶区勾画遵循放射治疗肿瘤学组（RTOG）指南。研究收集了31项预测变量，

  来源：Frontiers in Oncology

  时间：2025-10-18

• 术前NRS2002与GLIM筛查对胃肠道恶性肿瘤患者术后并发症预测价值的对比分析

  2 参与者与方法2.1 研究人群与设计本研究为一项前瞻性队列研究，在三级医疗中心开展。连续入组2019年12月至2024年12月期间计划接受择期根治性手术的新诊断胃肠道恶性肿瘤患者。纳入标准包括：年龄≥18岁；经组织病理学确诊为原发性胃肠道恶性肿瘤（如食管癌、胃癌、结直肠癌）；计划进行以治愈为目的的手术切除；当前恶性肿瘤未接受过任何先前的抗肿瘤治疗（如手术、放疗、化疗或免疫治疗）；并提供书面知情同意书。排除标准包括：存在其他并发性全身恶性肿瘤；急诊手术；基线评估所需的关键临床或营养数据不完整。研究方案经天津市第三中心医院机构审查委员会和伦理委员会批准。所有程序均遵循《赫尔辛基宣言》及其后续修正

  来源：Frontiers in Nutrition

  时间：2025-10-18

• TaPSKR1L-6A过表达通过调控木质素合成增强小麦对纹枯病抗性的机制研究

  TaPSKR1L-6A参与小麦对纹枯病的防御反应通过分析抗感纹枯病的小麦重组自交系（RILs）的RNA-seq数据，研究人员发现位于6A染色体上的类植硫素受体1基因TraesCS6A02G222000.1（命名为TaPSKR1L-6A）在接种纹枯病菌（R. cerealis）菌株Rc207后，抗病RILs中的表达量显著高于感病RILs。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）分析进一步验证，在接种纹枯病菌后，抗病小麦品种CI12633中TaPSKR1L-6A的转录水平显著高于感病品种文麦6号。在四个不同小麦品种中，TaPSKR1L-6A的转录水平在抗病品种CI12633中最高，在山红麦中次之，而在

  来源：Frontiers in Plant Science

  时间：2025-10-18

• 超声与钼靶风险分层策略：中国女性筛查检出不可触及乳腺癌的预后新见解

  背景乳腺钼靶摄影（MG）和超声（US）是目前中国乳腺癌筛查的常规影像学检查手段。先前的研究表明，通过US和MG检测到的不可触及乳腺癌（NPBC）具有相似的生存结局。本研究旨在验证MG阳性/US阴性（MG+/US-）NPBC是否可被视为超低风险癌症的假设。材料与方法研究纳入了2015年至2018年期间在北京协和医院接受活检的3,113例无症状筛查阳性患者。其中，2,591例US阳性患者接受了US引导下活检，371例MG阳性/US阴性患者接受了MG引导下活检。研究分析了患者的临床特征、治疗方案以及5年无病生存期（DFS）和总生存期（OS），并确定了NPBC的预后因素。结果研究共识别出419例US阳

  来源：Frontiers in Oncology

  时间：2025-10-18

• 探究原发性肿瘤内PD-L1表达空间异质性对晚期非小细胞肺癌免疫检查点阻断治疗临床结局的预测价值

  背景程序性死亡配体1（PD-L1）的免疫组化表达是目前唯一获批准的与PD-1/PD-L1免疫检查点阻断（ICB）治疗非小细胞肺癌（NSCLC）疗效相关的生物标志物。然而，不同的肿瘤活检策略可能反映同一肿瘤内PD-L1的显著空间异质性。因此，本研究旨在探讨这种空间异质性对接受两个周期ICB治疗的NSCLC患者PD-L1表达预测价值的影响。方法研究回顾性纳入了2020年1月至2024年3月期间在一家三级医院接受至少两个周期一线ICB治疗的所有连续NSCLC患者，并根据活检策略进行分类。通过经支气管肺活检（TBLB）或经支气管黏膜活检获取原发性肿瘤浅表区域（PTsup）的样本；通过支气管内超声引导下

  来源：Frontiers in Oncology

  时间：2025-10-18

• 炎症生物标志物CCL17提升心血管风险分层能力：一项前瞻性队列研究

  炎症是心血管疾病（CVD）发生发展的关键驱动因素，然而现有风险评估模型——如中国动脉粥样硬化性心血管疾病风险（China-PAR）和汇总队列方程（PCE）——在识别中危个体方面存在明显局限。为探索炎症趋化因子CCL17能否优化心血管风险预测，研究团队开展了两项前瞻性队列分析：包括中国顺义队列（n = 706）和英国生物样本库（n = 36,097）。所有参与者基线时均检测了CCL17浓度，并在随访期间追踪主要不良心血管事件（MACE）的发生情况。结果证实，较高的CCL17水平与MACE风险增加独立相关。将CCL17纳入现有风险评估模型后，模型的区分能力和重分类准确性均得到显著提升，尤其在中危人

  来源：Journal of Cardiovascular Translational Research

  时间：2025-10-18

• 钙蛋白酶-1与钙蛋白酶-2在基底A型三阴性乳腺癌中的亚型特异性拮抗作用研究

  在癌症研究领域，钙依赖性半胱氨酸蛋白酶家族——钙蛋白酶（calpain）近年来备受关注。这类蛋白酶通过特异性切割底物蛋白参与细胞骨架重塑、基因转录、凋亡和迁移等多种细胞过程。其中CAPN-1（μ-calpain）和CAPN-2（m-calpain）作为最普遍表达的两个亚型，尽管结构高度相似，但在不同生物学背景下却展现出令人惊讶的功能差异。乳腺癌作为全球女性最常见的恶性肿瘤之一，其高度异质性给治疗带来巨大挑战。特别是三阴性乳腺癌（TNBC）因缺乏雌激素受体、孕激素受体和HER2表达，治疗选择有限，预后较差。以往研究表明，calpain在乳腺癌进展中扮演重要角色，但CAPN-1和CAPN-2的具体

  来源：BMC Molecular and Cell Biology

  时间：2025-10-18

• 非酒精性脂肪肝患者肠道真菌组特征及其与血清代谢组的关联研究

  当我们谈论脂肪肝时，大多数人会想到酒精或高脂饮食的影响，但事实上全球约四分之一人群罹患的非酒精性脂肪肝病（NAFLD）背后，隐藏着更为复杂的发病机制。近年来，科学家们将目光投向了人体内一个长期被忽视的"微生物王国"——肠道菌群。然而，在细菌研究如火如荼的同时，同样栖息在肠道内的真菌群落却鲜少有人关注。这些真核微生物虽然数量上不占优势，但其代谢产物和免疫调节功能可能对肝脏健康产生深远影响。在NAFLD疾病谱中，从单纯性脂肪肝到非酒精性脂肪性肝炎（NASH），乃至肝硬化和肝细胞癌（HCC）的进展过程，始终伴随着代谢紊乱和慢性炎症。传统研究多聚焦于细菌通过"肠-肝轴"影响疾病进程，例如肠道屏障功能受

  来源：BMC Microbiology

  时间：2025-10-18

• 皮肤微生物组与代谢组整合分析揭示银屑病发病机制中的微生物-代谢互作网络

  银屑病作为一种慢性炎症性皮肤病，困扰着全球约2-3%的人口，其典型的红斑鳞屑皮损不仅影响外观，更给患者带来沉重的心理负担。尽管科学家已发现IL-23/IL-17轴在疾病发生中的关键作用，并开发出相应的生物制剂，但银屑病的具体病因和触发因素仍笼罩在迷雾之中。近年来，研究焦点逐渐转向皮肤微环境——这个由微生物、宿主细胞和代谢物共同构成的复杂生态系统。已有证据表明，银屑病患者的皮肤微生物组成发生改变，代谢通路也出现紊乱，但这两者之间如何相互作用、共同推动疾病进展，仍是一个待解的科学谜题。为揭开这一谜团，来自山东大学和青岛大学的研究团队在《BMC Microbiology》上发表了最新研究成果。他们招

  来源：BMC Microbiology

  时间：2025-10-18

• 环状RNA景观图谱揭示新型circ_0018908调控华西牛骨骼肌发育的关键作用

  在中国畜牧业快速发展的背景下，肉牛产业作为重要组成部分直接关系到农业经济发展和人民生活水平提升。华西牛作为具有自主知识产权的新品种，以其优异的日增重、屠宰率和净肉率受到广泛关注。然而，骨骼肌作为占成年哺乳动物体重40%-60%的组织，其发育质量直接影响肉类产量和品质，其中环状RNA（circRNA）作为一种新型调控分子，其在该过程中的作用机制尚未明确。以往研究表明，circRNA具有组织特异性表达特征，且在物种间存在显著差异。例如在秦川牛中发现的circHUWE1可通过吸附miR-29b调控AKT3基因表达，而circTTN则能通过miR-432影响IGF2/PI3K/AKT信号通路。但这些研

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-10-18

• 古老活化石鹦鹉螺DNA甲基化图谱揭示无脊椎动物表观遗传进化新线索

  在浩瀚的海洋深处，栖息着一种被称为"活化石"的神秘生物——鹦鹉螺(Nautilus pompilius)。这种古老的头足类动物保留了4亿多年前的原始特征，包括独特的外壳和简单的针孔眼结构，成为研究生物进化的珍贵窗口。然而，尽管鹦鹉螺在形态进化研究方面备受关注，科学家们对其表观遗传调控机制，特别是DNA甲基化这一重要修饰方式却知之甚少。DNA甲基化作为一种关键的表观遗传修饰，在基因表达调控、染色质结构和组蛋白修饰等生物学过程中发挥着重要作用。随着高通量测序技术的发展，研究人员发现不同物种间的DNA甲基化模式存在显著差异。脊椎动物通常表现出全基因组范围的甲基化模式，而无脊椎动物的甲基化景观则更为多

  来源：BMC Genomics

  时间：2025-10-18

• PAHG数据库：人类多基因家族的系统基因组学解析与进化资源构建

  在脊椎动物演化长河中，基因复制事件如同基因组的“创造力引擎”，通过单基因复制、片段复制（SSD）和全基因组复制（WGD）等多种机制，催生了大量多基因家族。这些家族成员在人类基因组中占比高达20%~30%，不仅赋予生物体功能多样性，更与免疫应答、神经发育等关键生命活动密切相关。然而，尽管多基因家族的重要性日益凸显，科学界仍缺乏一个整合进化历史、共线性关系和功能注释的标准化资源。现有数据库如HUGO和ENSEMBL虽提供基础分类，但缺乏跨物种系统发育分析及共复制事件的深度解析，限制了研究者对基因家族演化动态的全面理解。为解决这一难题，由Quaid-i-Azam大学和国家基因组科学中心等机构的研究团

  来源：BMC Genomic Data

  时间：2025-10-18

• 基于蛋白质语言模型的细菌毒力因子预测新框架pLM4VF的开发与验证

  细菌感染已成为全球第二大死亡原因，每年导致约1370万人死亡，尤其对发展中国家造成严重公共卫生负担。在这一严峻背景下，毒力因子(Virulence Factors, VFs)作为细菌致病性的关键要素，通过促进宿主侵袭、免疫逃逸和组织损伤等过程加剧感染程度。然而传统实验方法鉴定VFs存在耗时费力、通量低的局限，而现有机器学习预测方法又面临特征提取落后、预测框架简单以及忽视G+/G-细菌差异三大挑战。为解决这些难题，海南大学刘洪团队在《BMC Biology》发表研究，开发出创新性预测框架pLM4VF。该研究首次将ESM蛋白质语言模型(Protein Language Models, pLMs)引

  来源：BMC Biology

  时间：2025-10-18

• 溶组织内阿米巴RabD2通过多泡体途径调控宿主细胞粘附的分子机制

  在肠道寄生虫感染领域，溶组织内阿米巴(Entamoeba histolytica)引起的阿米巴病每年导致全球数万人死亡，其致病机制的核心是寄生虫与宿主肠上皮细胞的粘附作用。这一过程主要由寄生虫表面的Gal/GalNAc凝集素介导，特别是其重链亚基Hgl。然而，寄生虫如何动态调控这一关键毒力因子的表达和膜定位，至今仍是未解之谜。发表在《BMC Biology》上的这项研究，首次揭示了RabD2这一独特的GTP酶在溶组织内阿米巴多泡体(Multivesicular Bodies, MVB)形成和毒力调控中的核心作用。研究人员发现，RabD2不仅通过其N端独特的谷氨酸-赖氨酸(EK)富集基序发生高阶

  来源：BMC Biology

  时间：2025-10-18

• 基因调控网络动态模拟新工具GRiNS：集成RACIPE与布尔伊辛框架的Python库

  在系统生物学研究领域，理解基因调控网络(GRN)的复杂动态行为一直是核心挑战。随着高通量技术的发展，我们能够推断出基因间的因果关系网络，但如何准确模拟这些网络的动态行为却面临巨大困难。传统的建模方法需要精确的参数化，而生物系统的参数往往难以准确测量，特别是在网络规模增大时，参数空间呈指数级增长，使得常规模拟方法难以实施。针对这一挑战，印度科学研究院的Harlapur等研究人员开发了GRiNS（基因调控相互作用网络模拟器），这一Python库创新性地整合了两种主流的参数无关模拟方法。研究团队通过系统比较开关网络(TS)与自激活开关网络(TSSA)的动态特性，以及分析22节点的上皮-间质转化(EM

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2025-10-18

• 复合芽孢杆菌制剂通过多通路协同抑制苹果腐烂病的机制与应用研究

  在东北地区广泛种植的寒富苹果因其优良风味和抗寒性备受青睐，然而一种名为苹果腐烂病的真菌病害正悄然蔓延，成为制约苹果产业发展的隐形杀手。这种由Cytospora mali(Cma)病原菌引起的病害，会导致树枝腐烂、树势衰弱，严重时甚至造成整株死亡，给果农带来巨大经济损失。当前主要依赖化学杀菌剂的防治手段不仅存在环境污染风险，还可能诱发病原菌抗药性。面对这一困境，开发环境友好型的生物防治替代方案迫在眉睫。在这项发表于《Annals of Microbiology》的研究中，沈阳农业大学刘志华团队另辟蹊径，将目光投向了新疆野生果林土壤中的天然微生物资源。研究人员设想，自然界中是否存在能够有效抑制Cm

  来源：Annals of Microbiology

  时间：2025-10-18

• 铁掺杂相变纳米滴通过光热与饥饿治疗协同增强铁死亡用于癌症治疗

  在癌症治疗领域，铁死亡疗法作为一种新兴的抗肿瘤策略备受关注。这种疗法通过Fenton反应破坏癌细胞，其中Fe2+催化H2O2分解产生高毒性的羟基自由基(·OH)。然而，肿瘤组织内催化剂和反应物的不足严重限制了其临床应用效果。同时，肿瘤微环境的弱酸性和正常体温也阻碍了Fenton反应效率。如何突破这些瓶颈，实现高效的铁死亡治疗，成为研究人员面临的重要挑战。针对这一难题，哈尔滨医科大学的研究团队在《Journal of Nanobiotechnology》上发表了一项创新性研究，开发了一种多功能纳米平台——葡萄糖氧化酶(GOx)负载的Fe-单宁酸(TA)网络修饰相变纳米滴(PND@GOx@Fe-T

  来源：Journal of Nanobiotechnology

  时间：2025-10-18

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