• Rubia cordifolia 内参基因在不同组织及非生物胁迫条件下的表达稳定性评估

  ```摘要背景Rubia cordifolia L是一种常用于临床实践的传统中药。随着对R. cordifolia研究的深入，确定稳定的内参基因对于基因表达研究变得至关重要。全面的文献检索显示，无论是国内还是国际上都尚未有关于R. cordifolia内参基因筛选的报道。本研究采用定量实时PCR（RT-qPCR）技术评估了几种候选内参基因在R. cordifolia中的表达稳定性。鉴定出能在不同组织及多种应激条件下稳定表达的内参基因，为该植物的基因表达研究奠定了重要基础。结果本研究使用四种算法（geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCt）分析了12种候选参考基因在R. c

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• GC偏向性基因转换替换深度保守的核受体基序：单孔目动物中虚假正选择信号的产生机制

  摘要背景GC偏向性基因转换（gBGC）是一种与重组相关的过程，它无论对蛋白质有何影响，都会使G/C等位基因相对于A/T等位基因得以固定，是分子进化分析中虚假正选择信号的已知成因。在特定的保守编码元件中，被捕获到gBGC固定了改变蛋白质的变异并在此过程中产生了虚假选择信号的例子仍然罕见。LXXLL核受体（NR）基序是多细胞生物转录中最为保守的相互作用模块之一，使其成为一项严格的检验案例。结果在包含48个物种的有足类样本中，所有非单孔目物种的NCOA1蛋白的NR1基序均保守为LVQLL，而在现存的两种单孔目动物——鸭嘴兽和短吻针鼹中，该基序均固定为PGQLP。多条证据表明该变异由gBGC产生而非适

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• 融合双模态信息与监督对比学习的药物-靶点相互作用预测模型DHF-DTI

  摘要背景预测药物-靶点相互作用（DTI）的高效计算方法对于药物发现、缩短开发周期和降低成本至关重要。尽管深度学习在该领域取得了显著进展，但现有方法在处理多模态数据时往往难以充分利用不同模态之间的互补信息。此外，仅依赖分类损失难以在潜在空间中学习到具有高区分度的特征表示，这严重限制了模型的鲁棒性和域泛化能力。结果为解决上述问题，本研究提出了DHF-DTI，一种双模态神经网络模型，整合了药物和蛋白质的序列信息与图结构信息以进行DTI预测。为实现模态间的深度信息交互，本文设计了交叉注意力与双线性融合模块（CABFusion），该模块在捕捉全局上下文依赖的同时增强了局部特征的细粒度融合。为进一步改善泛

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2026-10-17

• 工程化甲基营养菌以乙醇为碳源从头合成肉桂酸

  摘要背景开发能够将乙醇转化为增值产品的微生物平台对下一代碳循环生物炼制至关重要。Methylorubrum extorquens PA1 是一种能够同化乙醇的兼性甲基营养菌，然而其从乙醇合成芳香化合物的代谢潜力尚未得到探索。结果在此，我们首次报道了在甲基营养菌中从乙醇从头合成肉桂酸（CA）。代谢物分析表明，乙醇同化受到乙酸转化为乙酰-CoA效率低下的限制。过表达内源乙酰-CoA合成酶（MeACS1）抑制了胞外乙酸积累，并提高了在乙醇上的生长。为建立CA生物合成模块，我们引入了海洋链霉菌苯丙氨酸脱氨酶（SmEncP），实现了L-苯丙氨酸向CA的转化。为增强前体供应，我们通过共表达来自大肠杆菌的反

  来源：Biotechnology for Biofuels and Bioproducts

  时间：2026-10-17

• 芥子酸对甲霜灵所致睾丸损伤的保护作用及其与Nrf2/HMGB1/NF-κB信号通路的关联研究

  摘要**背景**甲霜灵（ACP）过量已被证实会通过加重氧化应激和炎症而导致睾丸损伤。芥子酸（SNPA）是一种广泛存在于多种天然产物中的酚酸。尽管已有实验证实了其抗氧化活性，但尚不明确其是否能够对抗ACP的毒性。本研究旨在评估SNPA对于ACP所致睾丸损伤的保护作用，其中ACP是一种常用于害虫防治的新烟碱类杀虫剂。**方法**通过连续14天以20 mg/kg剂量口服给予小鼠ACP，以诱导睾丸毒性。SNPA的睾丸保护功效通过连续14天以两种不同剂量（10 mg/kg和20 mg/kg）口服给予进行评估。使用酶联免疫吸附测定（ELISA）试剂盒测定血清生殖激素水平以及睾丸氧化应激、抗氧化系统、炎症和

  来源：European Journal of Medical Research

  时间：2026-10-17

• 珊瑚礁栖居海百合Cenometra bella近T2T基因组组装揭示棘皮动物染色体融合与适应性进化

  摘要背景海百合是高度保守的棘皮动物，自早奥陶纪以来便保留了古老特征，使其成为经典的"活化石"，对于研究进化和生物多样性具有不可估量的价值。它们的演化稳定性体现在形态变化极小、固着生活方式以及异常缓慢的演化速率上，使它们成为海洋类群中独一无二的存在。然而，长期以来缺乏高质量的基因组资源，阻碍了对早期棘皮动物谱系基因组演化的深入探究。结果本研究利用PacBio HiFi和Hi-C技术，首次呈现了珊瑚礁栖居海百合Cenometra bella的近端粒体到端粒体（T2T）基因组组装（354.7 Mb，12条染色体，GCI得分 = 75.0837）。该组装展现出卓越的连续性（contig N50 = 2

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• 维生素K2同源物及植物乳杆菌在结直肠癌小鼠模型中的抗炎与免疫调节作用研究

  摘要背景结直肠癌（CRC）是全球重大的健康负担，慢性炎症在其发生和发展中起重要作用。肠道微生物群在调节宿主免疫应答中具有重要作用，特定菌种可能通过产生生物活性代谢物（包括维生素K2，VK2）来影响抗癌反应。先前的研究已证实VK2同源物具有抗炎和潜在抗癌特性，且肠道细菌（尤其是乳杆菌）具有产生VK2的能力。我们在水合胺/葡聚糖硫酸钠（AOM/DSS）小鼠模型中评估了合成维生素K2（VK2）同源物（VK2-MK4、VK2-MK7、VK2-MK9）及植物乳杆菌菌株自然产生的VK2的抗炎特性。结果对BALB/c雌性小鼠进行了临床、组织病理学和微生物学评估，采用下一代测序和经典培养方法对肠道微生物群进行

  来源：BMC Biology

  时间：2026-10-17

• 低氧预处理毛囊间充质干细胞外泌体通过miR-205-5p/CDH11轴维持线粒体动力学及自噬治疗代谢功能障碍相关脂肪性肝病

  **摘要**代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）因其复杂的发病机制与代谢紊乱密切相关，但目前仍缺乏有效的治疗策略。毛囊间充质干细胞（HF-MSC）来源的外泌体（Exos）在多种疾病治疗中显示出显著疗效，其中经低氧预处理的Exos（Hy-Exos）效果更强。然而，Hy-Exos在MASLD中的治疗潜力尚不明确。本研究通过游离脂肪酸（FFA）刺激AML12细胞和高脂饮食处理小鼠，建立了MASLD实验模型。在细胞和小鼠模型中评估了Exos和Hy-Exos的治疗效果，并进行了miRNA测序以鉴定二者之间的差异。利用生物信息学分析鉴定miRNA的目标基因及相关通路，并进行后续验证。通过联合免疫荧光染

  来源：Journal of Nanobiotechnology

  时间：2026-10-17

• IGBP1新错义变异与X连锁智力障碍的关联研究

  摘要在最初报告免疫球蛋白结合蛋白1（IGBP1，OMIM 300139）突变与X连锁智力障碍（XLID）相关后，我们在一名受影响的先证者中发现了一种新的IGBP1T, p.L49F）。该患者表现为智力障碍、全面发育迟缓和胼胝体发育不良，这些表型与OMIM 300139中先前记录的表型一致。功能实验表明，IGBP1 L49F变异改变了其与蛋白磷酸酶2A催化亚基α（PP2Ac）和钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIα（CaMKIIα）的结合，破坏了CaMKIIα磷酸化稳态。我们的研究结果提示，IGBP1 L49F变异可能是该患者所观察到的XLID表型的合理遗传候选变异。图形摘要

  来源：Human Genomics

  时间：2026-10-17

• 综述：老年人群心血管风险评估：传统风险模型局限性与多维度临床决策框架构建

  摘要全球人口老龄化加速正在加重老年人的心血管疾病（CVD）负担。传统风险模型主要评估心血管事件的短期发生概率；然而，老年人群特有因素，包括衰弱、多病共存、死亡竞争风险和个人偏好，会显著影响预测结果和治疗决策。因此，仅依赖传统风险评分不足以充分反映该人群的整体风险状况和潜在获益。老年人的心血管风险涉及与年龄相关的心血管变化以及多种老年人群特有修饰因素，表明需要建立更全面的风险评估范式。本研究采用叙述性综述方法结合结构化文献检索，整合国内外心血管指南、风险预测模型及相关研究，系统审视传统心血管危险因素和老年人群特有修饰因素。我们分析了现有预测工具在这类以衰弱和多病共存为特征的人群中的局限性，并构建

  来源：European Journal of Medical Research

  时间：2026-10-17

• 高芥酸菜籽油油菜基因型的高质量参考基因组组装及脂肪酸相关结构变异鉴定

  摘要背景油菜（Brassica napus L.）是全球重要的油料作物，而高芥酸菜籽油（HEAR）为多种工业应用提供了宝贵的芥酸来源。尽管目前已有多份B. napus参考基因组可用，但高芥酸菜籽油种质中与芥酸合成相关的结构基因组变异仍未得到充分表征。因此，鉴定脂肪酸相关基因中的结构变异（SVs）可能有助于进一步了解高芥酸菜籽油表型背后的基因组变异。结果本研究利用PacBio HiFi长读长测序，构建了高芥酸菜籽油基因型13R4502（UM_B. napus Ver1）的高质量参考引导基因组组装。该组装覆盖约1.03 Gb，约97%的序列锚定到19条伪染色体上，包含107,468个预测蛋白编码基

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• 玻璃化冻融应激对猪卵丘细胞转录组调控的影响及ceRNA网络构建

  # 摘要## 背景卵丘细胞（CCs）已知在驱动减数分裂恢复和协调猪卵母细胞成熟过程中发挥调节作用。然而，其在玻璃化冻融应激条件下对卵母细胞发育的作用尚不明确。## 结果本研究采用全转录组测序，比较了体外成熟后来自新鲜和玻璃化冷冻的猪卵丘卵母细胞复合物（COCs）中卵丘细胞来源的环状RNA（circRNAs）、长链非编码RNA（lncRNAs）、微小RNA（miRNAs）和信使RNA（mRNAs）的表达差异。结果显示，共有2,603个差异表达的mRNAs（DEmRNAs）、27个DEmiRNAs、511个DElncRNAs和89个DEcircRNAs。对这些RNA或其靶基因进行基因本体（GO）分

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• 基于基因组规模模型与氧化还原工程优化 K. phaffii 重组蛋白产量研究

  摘要背景重组蛋白的体外生产在能量消耗和氧化还原辅因子再生方面要求很高。诸如Komagataella phaffii（又称Pichia pastoris）这样的酵母似乎通过增加ATP、NADH或NADPH的再生能力来适应这一高耗费过程的代谢负担。早期研究表明，当以葡萄糖作为唯一的碳源时，提高NADPH的再生能力对重组蛋白的生产有积极影响，而同时对抗NADH/NAD+比例的增加也被证明是有益的。结果为了评估通过引入细胞质NADH激酶和替代NADH氧化酶所导致的NADPH和/或NAD+再生增加的代谢影响，我们首先基于基因组规模模型进行了计算机模拟。接下来，我们在生产Rhizopus oryzae脂肪

  来源：Microbial Cell Factories

  时间：2026-10-17

• 开发双重线粒体qPCR检测以同时检测并区分缅因州蜱虫中的微小巴贝斯虫与鹿巴贝斯虫

  摘要背景通常使用靶向 18S rRNA 基因的 qPCR 检测来筛查蜱虫样本和宿主血液中的 Babesia microti（微小巴贝斯虫），该病原体是美国东北部人类巴贝斯虫病的致病源。在使用多种基于 18S 的检测方法筛查蜱虫中的 B. microti 时，我们观察到结果不一致，这表明可能存在与非目标生物体的交叉反应、灵敏度有限，或两者兼有。这些观察结果突显了需要一种更灵敏且具有物种特异性的 B. microti qPCR 检测，以及需要改进的工具来检测和区分在缅因州蜱虫和脊椎动物宿主中循环的其他 Babesia（巴贝斯虫）物种。方法我们确定 Babesia odocoilei（鹿巴贝斯虫）是

  来源：Parasites & Vectors

  时间：2026-10-17

• 缺氧诱导的HIF-1A通过IL-6/NGF轴驱动胰腺癌神经周围侵犯中癌细胞与雪旺细胞的恶性双向串扰

  **摘要****背景**神经周围侵犯（PNI）是胰腺导管腺癌（PDAC）的关键预后因素，但其微环境驱动因素尚不明确。本研究旨在确定缺氧诱导的缺氧诱导因子1-α（HIF-1A）是否启动了癌细胞与雪旺细胞之间促进PNI的恶性串扰。**方法**在缺氧条件下建立了PDAC细胞与雪旺细胞共培养体系。采用qRT-PCR、Western blot、CCK-8、划痕愈合及Transwell实验评估细胞增殖、迁移及活力。通过染色质免疫沉淀和双荧光素酶报告实验，结合拯救实验，证实了转录调控作用。**结果**HIF-1A在PDAC中表达上调，且与PNI严重程度正相关。机制上，缺氧诱导的HIF-1A与IL-6启动子结

  来源：European Journal of Medical Research

  时间：2026-10-17

• 皖白山羊ADAMTS15基因表达谱、转录调控机制及其与生长性状的关联性分析

  摘要具有血小板反应蛋白基序的ADAM金属肽酶15（ADAMTS15）是ADAMTS金属蛋白酶家族的成员，通过水解细胞外基质中的透明质酸参与组织重塑。研究表明，ADAMTS15在小鼠肌发生过程中有表达，并参与调控肌母细胞融合；然而，其在家畜山羊中的表达调控机制仍知之甚少。本研究首先描绘了皖白山羊各组织中ADAMTS15的表达谱，以及背最长肌在不同发育阶段的表达情况。随后，利用双荧光素酶报告基因检测系统鉴定了ADAMTS15基因的启动子和增强子活性区域，并表征了调控序列的特征。在此基础上，通过桑格测序筛选了启动子和增强子活性区域及ADAMTS15基因中的遗传变异，并分析了其与皖白山羊生长性状的关联

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-10-17

• ROOFS：面向生物标志物发现的稳健特征选择方法综合基准测试Python软件包

  **摘要****背景**特征选择（FS）对于生物标志物发现和临床预测建模至关重要。过去几十年来，关于特征选择的方法学文献已经非常丰富和成熟，提供了广泛多样的算法方法。然而，这些方法学上的许多进展尚未被充分应用于生物医学研究实践中。**结果**为了弥合这一差距，我们提出了ROOFS（RObust biOmarker Feature Selection，稳健的生物标志物特征选择），这是一个Python软件包，旨在帮助研究人员选择最适合其问题的特征选择方法。目前ROOFS支持分类任务，可在用户数据上对多种特征选择方法进行基准测试，并生成报告，汇总一系列全面的评估指标，包括使用乐观校正估计的下游预测性

  来源：BMC Bioinformatics

  时间：2026-10-17

• 重金属离子（HMIs）驱动的智能纳米材料：面向多模式传感、生物计算与信息安全的集成平台

  重金属离子（heavy metal ions, HMIs）被广泛认为是一类持久性环境污染物。然而，它们正日益被用作智能分子系统中的功能性化学输入。本小型综述总结了面向HMI驱动的生物计算和信息安全而开发的智能纳米材料平台。特别强调双模式、多模式和多通道读出策略的集成，这些策略可将选择性离子识别和信号转导事件转化为荧光、比色、电化学和其他可测量响应。通过将这些响应转换为二进制状态，此类平台能够执行多种分子逻辑操作、奇偶函数和算术函数。还讨论了它们在信息安全中的应用，包括基于ASCII和Morse码的加密、多模式隐写密码术（cryptosteganography）以及基于不可见荧光墨水的防伪策略。

  来源：Biotechnology for Sustainable Materials

  时间：2026-10-17

• 肉瘤样分化透明细胞肾细胞癌中CDHR5和UPB1启动子甲基化与表达的关联研究

  摘要背景：透明细胞肾细胞癌（clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）是最常见的肾细胞癌（renal cell carcinoma，RCC）组织学亚型。肉瘤样（去）分化与转移播散及不良预后相关。DNA甲基化改变发生于ccRCC进展过程中，但其在肉瘤样分化出现中的具体作用仍不明确。本研究旨在发现可能识别ccRCC中肉瘤样特征的DNA甲基化生物标志物。结果：研究人员利用癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）进行计算机模拟分析，评估肉瘤样ccRCC（sarcomatoid ccRCC，sccRCC）中差异甲基化基因，寻找与正常细胞

  来源：Epigenetics Communications

  时间：2026-10-17

• 模拟复合肉牛品种非名义后代风险的基因组架构分析

  背景：复合肉牛品种旨在结合不同创始品种的互补特性，同时保留杂交优势的部分效应。婆罗格斯牛名义上定义为5/8安格斯和3/8婆罗门，但相同的全局品种组成可通过不同的基因组架构产生。这一区别可能很重要，因为具有相同婆罗门祖先比例的动物可能在祖先杂合度、纯合祖先组成以及作为亲本时的分离行为上存在差异。本研究的目的是利用受控模拟评估基因组架构是否会影响产生名义婆罗格斯牛祖先范围之外后代的概率。结果：研究人员模拟了两种达到相同预期婆罗门祖先比例0.375的替代途径。尽管两种途径产生了相似的平均婆罗门祖先比例，但直接途径比间接途径产生了更宽的祖先分布，且位于名义区间之外的个体比例更高。将候选种公牛过滤至名义

  来源：Genetics Selection Evolution

  时间：2026-10-17

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