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人类黑色素瘤基因组的肿瘤样本采集、DNA提取、覆盖度分析以及突变检测算法的优化
摘要 总结:对癌症患者的肿瘤进行全基因组测序(WGS)是识别新型和已知具有临床应用价值的基因组靶点最全面的方法。然而,对临床样本进行WGS的实际操作细节尚未得到充分明确。 本研究旨在测试样本制备、测序参数和生物信息学算法对人类黑色素瘤样本大规模WGS分析的准确性和成本效益的影响。 研究对黑色素瘤细胞系(n = 15)和新鲜冷冻的黑色素瘤肿瘤(n = 222)进行了WGS分析,确定了适合该项目的覆盖度水平和最佳突变检测算法。 将黑色素瘤组织样本的测序覆盖度从36X提高到132
来源:Pathology - Journal of the RCPA
时间:2025-10-25
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重新评估经H&E染色的血栓标本,并通过免疫组化检测磷酸化的Stat5蛋白,以进行骨髓增生异常综合征(MDS)/骨髓增殖性肿瘤(MPN)的组织学诊断
摘要 总结:目前很少有研究全面分析骨髓凝块的组织病理学发现,以用于诊断造血细胞发育异常。特别是,只有少数研究评估了苏木精-伊红(H&E)染色的应用,而这种染色方法通常被认为不如梅-吉姆萨(May-Giemsa)染色方法具有丰富的信息量。在本研究中,我们使用H&E染色和免疫组化技术来探讨骨髓凝块样本在诊断中的实用性。研究对象包括患有骨髓增生异常综合征(MDS)和骨髓增生异常/恶性增殖性肿瘤(MDS/MPN)的患者,这些疾病涵盖了慢性粒单核细胞白血病(CMML)、缺乏费城染色体的非典型慢性粒细胞白血病(aCML)以及幼年粒单核细胞白血病
来源:Pathology - Journal of the RCPA
时间:2025-10-25
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胃型宫颈内瘤变中的泡沫腺变化
摘要 摘要:泡沫状腺体(Foamy Gland, FG)改变是一种在前列腺和胰腺腺癌中最常见的形态学改变,其特征是细胞胞质中出现明显的微空泡化,而细胞核外观通常较为平淡。据我们所知,泡沫状腺体改变尚未在内宫颈肿瘤中被描述过。我们报告了4例患有胃型内宫颈肿瘤的患者(3例为浸润性肿瘤,1例为原位癌),在这些患者的肿瘤细胞中,30%–80%的细胞存在泡沫状腺体改变。患者的平均年龄为56.5岁(范围45–66岁),其中3例患者还有性交后出血的症状,宫颈细胞学检查发现非典型腺体细胞。3例病例表现为纯胃型表型,并伴有良性的胃型改变,包括幽门化生
来源:Pathology - Journal of the RCPA
时间:2025-10-25
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乳腺类分泌癌:对其临床病理学和遗传学特征的评估
摘要 摘要:乳腺类分泌癌(MASC)是一种新近发现的唾液腺恶性肿瘤。我们评估了MASC的临床病理特征和长期临床表现。研究回顾了某机构中190例原发性唾液腺恶性肿瘤病例,并结合相关的免疫组化和荧光原位杂交(FISH)技术来识别MASC。共发现9例MASC,主要发生在腮腺,男女发病率相当,平均年龄为36岁。肿瘤大小从14毫米到50毫米不等(平均22毫米)。MASC由形态一致的细胞组成,这些细胞的胞质中含有空泡和嗜酸性颗粒,细胞核较小且具有明显的核仁。所有病例均对S-100、MUC4、CK7和乳蛋白(mammoglobin)呈免疫反应性,
来源:Pathology - Journal of the RCPA
时间:2025-10-25
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增殖标志物(Ki-67、PHH3)在前列腺癌中ERG转位与雄激素受体表达相互关系中的预测价值
摘要 摘要:我们评估了有丝分裂相关标志物磷酸化组蛋白H3(PHH3)和Ki-67在前列腺癌中的预后价值,特别是它们与ERG状态和雄激素受体(AR)表达之间的关系。 在640例接受根治性前列腺切除术的患者中,通过免疫组化方法检测并数字化量化了PHH3和Ki-67的表达水平。结果与临床病理参数(包括生化复发时间)进行了相关性分析。PHH3和Ki-67的预后价值通过Cox回归分析和Kaplan–Meier统计方法进行了评估。 在前列腺癌中,Ki-67和PHH3的平均表达率分别为3.40%(95%置信
来源:Pathology - Journal of the RCPA
时间:2025-10-25
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尼伏鲁单抗(nivolumab)和雷替利单抗(relatlimab)作为转移性葡萄膜黑色素瘤的挽救治疗的成功应用
摘要 寻找有效的全身性疗法来治疗转移性葡萄膜黑色素瘤仍然是一个持续的挑战。尽管免疫检查点抑制剂常被用于治疗这种疾病,但响应率和生存结果仍然不佳。在本病例报告中,我们介绍了两名经过大量预治疗的转移性葡萄膜黑色素瘤患者,他们在接受尼伏鲁单抗(PD-1抑制剂)与relatlimab(LAG-3抑制剂)联合治疗时表现出显著的疗效。我们重点介绍了关于葡萄膜黑色素瘤肿瘤免疫微环境的持续研究,以及LAG-3抑制剂作为有效治疗策略的潜在作用。
来源:Melanoma Research
时间:2025-10-25
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自身免疫性疾病中肾小球肾炎的病理生理学
摘要 通俗语言总结 综述目的 自身免疫性肾小球肾炎(GN)是由于自反应性体液免疫和细胞免疫在肾脏中相互作用而引发的。免疫荧光和电子显微镜技术有助于对GN进行分类;然而,为了实现个性化治疗,还需要更多的分层策略。我们旨在基于免疫荧光和电子显微镜结果,回顾与GN相关的疾病的病理生理学特征及临床病理分类。此外,我们还试图整合来自多组学和空间分析的机制见解,以阐明在IgA血管炎/肾病、狼疮性肾炎、抗肾小球基底膜疾病以及抗中性粒细胞胞浆抗体相关血管炎中,驱动损伤和修复的细胞“邻域”的组成和空间结构。 最新研究发现 尽管不同疾病的致
来源:Current Opinion in Rheumatology
时间:2025-10-25
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炎症性肠病中基底隐窝异型增生、锯齿状上皮改变及p53免疫组化的新进展与争议
Highlight诊断要点尽管大多数IBD中的异型增生病变仅凭形态学即可诊断,但某些病例,特别是那些出现在发炎黏膜中的病例,或细微的异型增生变化(例如基底隐窝异型增生),在没有辅助研究的情况下可能难以识别。在这种情况下,p53免疫组化虽然并非异型增生的确定性标志物,但有助于其检测。目前,对于解读阳性p53染色模式尚无普遍接受的标准,尽管文献中通常描述为三种主要模式:1)在细胞核弥漫性强阳性(“过表达”模式),通常表明存在TP53错义突变;2)细胞核染色完全缺失(“无效”模式),表明存在无义突变或移码突变;以及3)在异型增生区域出现异常的细胞质染色,这可能代表p53的错误定位。重要的是,反应性或
来源:Human Pathology
时间:2025-10-25
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手术时机对自然关节化脓性关节炎患者长期预后的影响:基于DOOR评分系统的多中心队列研究
关节红肿热痛,活动受限,甚至高烧不退——这可能是自然关节化脓性关节炎(Native Joint Septic Arthritis, NJSA)发出的危险信号。作为一种严重的肌肉骨骼感染,NJSA可导致关节破坏、长期功能障碍、全身性并发症,甚至死亡。及时识别和有效管理是改善预后的关键,其中手术清创或关节引流等感染源控制措施扮演着核心角色。尽管2023年发布的《自然关节化脓性关节炎手术和抗生素治疗(SANJO)共识》建议在诊断后24小时内进行手术干预,但这一推荐基于低质量证据(C2级),且缺乏关于延迟手术对长期结局影响的有力数据。以往的研究多关注短期结局或单一终点,难以全面反映手术时机对患者整体预
来源:Open Forum Infectious Diseases
时间:2025-10-25
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缺氮向日葵中咖啡酰奎宁酸形成的动力学研究——作为生长与防御权衡框架的验证
摘要 关于植物将碳资源分配给生长或防御的机制方面,已有大量研究。本研究通过比较缺氮条件下向日葵在不同时间尺度上的碳同化速率和次生代谢产物生成速率,来检验生长-防御权衡框架。研究发现,在缺氮条件下,叶片和根部组织中咖啡酰奎宁酸衍生物的积累量增加,但这仅占同化碳的一小部分。此外,在缺氮情况下,木质素的生成并未增加。未被用于叶片扩展的“多余”碳主要被分配到根部用于营养生长过程。最后,咖啡酰奎宁酸生物合成的调控机制体现在羟基肉桂酰辅酶A:奎宁酸羟基肉桂酰转移酶3的表达上调。尽管植物体内的氮浓度下降较晚,但仍无法确定生理碳氮平衡的变化在多大程
来源:Journal of Experimental Botany
时间:2025-10-25
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Aurantiochytrium limacinum SR21 游动孢子的趋化性
摘要 研究了Aurantiochytrium limacinum SR21对90种不同化合物的趋化反应,这些化合物包括糖类、有机酸、醇类、氨基酸、胺类、芳香化合物、亚砜类、维生素、核苷以及无机化合物。虽然游动孢子显著被几种氨基酸吸引,但它们对典型的营养物质(如糖类或有机酸)没有反应,这表明趋化性可能并不直接参与其营养物质的寻找。游动孢子也被香草醛所吸引,而香草醛是木质素的一个组成部分,也是陆地植物细胞壁的主要成分。这表明Aurantiochytrium物种可能通过木质素参与了陆地和海洋之间植物生物量的碳循环。对响应香草醛的化合物与不
来源:Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
时间:2025-10-25
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二倍体月季坐果遗传基础解析:LG3主效QTL的发现与育种应用
月季,这种被誉为全球最受欢迎的观赏植物,其栽培历史可追溯至中国汉代。然而,月季的价值远不止于观赏,其花朵和果实(称为hip)在药用、食用和化妆品领域有着广泛应用。特别是月季果,富含酚酸、维生素C、类胡萝卜素、生育酚等多种高价值植物化学物质,显示出抗氧化、抗癌、抗糖尿病、抗菌、心脏保护、免疫调节和神经保护等多种生物活性潜力。在欧洲,月季果育种项目致力于改良果实大小、果肉百分比和维生素C含量,以充分利用这些益处。尽管月季果经济价值显著,但月季坐果(即子房在授粉后发育成果实的过程)的遗传基础却一直未被探索。月季坐果受到多种因素影响,包括亲本遗传结构、倍性水平、环境条件(如温湿度)、花粉来源、数量、形
来源:Current Plant Biology
时间:2025-10-25
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综述:B1类G蛋白偶联受体激活和信号传导位置的变构调节
引言G蛋白偶联受体(GPCRs)是细胞膜上最大的受体家族,负责响应细胞外信号分子(如激素、神经递质)并调控多种生理过程。传统观点认为,GPCRs激活后仅在质膜上产生第二信使环磷酸腺苷(cAMP)。然而,近十年的研究,特别是对甲状旁腺激素1型受体(PTH1R)的研究,揭示了cAMP也可以在受体内化后的内体中通过不同途径持续产生。这篇综述以B1类GPCRs(分泌素家族)为重点,特别是PTH1R作为典型代表,探讨了变构调节如何影响其激活、信号传导以及信号在细胞内的空间位置偏向。B1类GPCRs的构象景观截至目前,蛋白质数据库中已有149个B1类GPCRs的结构。对这些结构进行主成分分析(PCA)发现
来源:Current Opinion in Structural Biology
时间:2025-10-25
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花旗松与红桤木在太平洋西北地区不同林分条件下的树干锥度变化研究
在森林经营和木材加工领域,树干锥度(即树干直径随高度增加而减小的速率)是影响木材出材率和利用率的关键指标。不同树种在不同生长环境下的树干锥度存在显著差异,这种变异直接影响着从森林到木材产品的整个价值链。特别是在太平洋西北地区,花旗松(Pseudotsuga menziesii var. menziesii)和红桤木(Alnus rubra)作为重要的商业树种,其树干锥度变化规律一直缺乏系统研究。传统上,林业工作者往往采用统一的锥度模型进行木材产量预测,忽略了不同林分条件对树干形态的影响,这导致在实际应用中存在较大误差。为了解决这一问题,加拿大林务局加拿大木材纤维中心的Isabelle Duch
来源:Canadian Journal of Forest Research
时间:2025-10-25
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木灰施用对砂壤土团聚体结构的有限影响及其对土壤碳稳定的启示
随着全球对可再生能源需求的持续增长,生物能源生产规模不断扩大,其中木质生物质燃烧产生的木灰如何处理成为亟待解决的问题。目前大量木灰被直接填埋,不仅占用土地资源,其含有的碱性物质和营养元素也未能有效利用。与此同时,北方森林地区广泛分布的粗质地布鲁尼索尔土(Dystric Brunisol)因其黏土含量低(<20%)、结构脆弱、团聚体形成能力差等特点,面临土壤有机碳(SOC)稳定性挑战。这类酸性土壤(pH 3.5-7.1)能否通过木灰改良提升团聚体稳定性,进而增强碳固存能力,成为研究者关注的重点。为此,悉尼-林·伯纳迪(Sydney-lyn Bernardi)等人在《Canadian Journa
来源:Canadian Journal of Soil Science
时间:2025-10-25
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土壤改良剂单施与混施对磷素形态转化的调控效应:降低磷流失风险的同时维持植物有效性
在当今农业生产中,磷肥的施用对保障作物高产至关重要,但过量磷素通过径流和淋溶进入水体,已成为导致湖泊、河流富营养化的主要非点源污染。特别令人担忧的是,施入土壤的磷肥中仅有不到20%能被作物吸收利用,其余大部分都蓄积在土壤中,成为潜在的环境风险源。面对这一挑战,如何在不影响作物磷营养供应的前提下,有效减少土壤中可溶性磷的流失,成为农业与环境领域亟待解决的科学问题。近期发表于《Canadian Journal of Soil Science》的一项研究为此提供了新见解。由加拿大温尼伯大学领衔的研究团队系统探讨了单施与混施化学改良剂对土壤磷素形态转化的影响。研究人员选取了明矾(KAl(SO4)2·1
来源:Canadian Journal of Soil Science
时间:2025-10-25
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加拿大粪肥改良土壤氧化亚氮排放研究30年回顾:进展、差距与政策启示
在应对气候变化的全球行动中,准确估算农业温室气体排放已成为科学界和政策制定者共同关注的焦点。作为重要的温室气体之一,氧化亚氮(N2O)的全球增温潜势是二氧化碳的298倍,而农业土壤是其重要排放源。在加拿大,粪肥改良土壤产生的N2O排放量估计达到1525千吨二氧化碳当量,但这一估算的准确性受到多种因素的挑战。加拿大幅员辽阔,气候、土壤、养殖类型和管理实践的多样性使得N2O排放测量异常复杂。尽管加拿大研究人员数十年来一直在研究粪肥改良土壤的N2O排放,但缺乏对研究进展的系统评估。现有研究是否充分反映了排放的空间分布?研究方法是否足以支持精准的排放因子开发?这些问题的答案对于制定科学的气候政策和合理
来源:Canadian Journal of Soil Science
时间:2025-10-25
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河流连通性对维持新西兰溪流褐鳟种群的重要性——基于29年监测的生态学研究
在全球范围内,为满足人类需求而对大型河流进行的改造工程,往往对鱼类种群产生不利影响。新西兰的许多大型河流支撑着重要的休闲褐鳟(Salmo trutta)渔业,然而,关于流量改变如何影响褐鳟栖息地连通性的认知却十分有限。河流廊道的连通性,特别是纵向连通性(指河流上下游之间的物质、能量和生物体的传输路径),是维持鱼类完成其生命史过程的关键。当大坝、堰堤等水利设施阻断河流,或流量调节改变自然水文节律时,像褐鳟这类需要进行长距离迁徙的物种便会受到严重威胁。因此,理解河流连通性在褐鳟种群维持中的作用,对于平衡水资源开发利用与生态系统保护至关重要。为了深入探究这一问题,研究人员菲利普·G·杰利曼(Phil
来源:Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
时间:2025-10-25
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咖啡果壳生物炭对酸性土壤短期改良效应研究:以越南Gia Lai省罗布斯塔咖啡与黑胡椒种植系统为例
在越南中央高地的Gia Lai省,连绵的罗布斯塔咖啡和黑胡椒种植园构成了当地农业经济的支柱。作为全球最大的罗布斯塔咖啡出口国和重要黑胡椒产地,越南却因长期集约化种植陷入发展困境:过度施肥和连作栽培导致土壤pH值持续下降,土壤酸化问题日益严重,随之而来的土传病害频发已成为制约作物产量的关键因素。面对这一严峻挑战,由Long Nguyen Van领衔的国际研究团队在《Canadian Journal of Soil Science》发表了一项创新性研究,探讨利用咖啡加工副产物——咖啡果壳制备的生物炭,作为生态友好型土壤改良剂对酸性土壤的修复潜力。研究团队在Gia Lai省的咖啡和黑胡椒种植园设置了
来源:Canadian Journal of Soil Science
时间:2025-10-25
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在贝宁北部的帕拉库地区,不同土地利用方式和不同土壤深度下,土壤的水文物理性质有何差异?
Sissou Zakari|Sékaro Amamath Boukari|Pierre G. Tovihoudji|M. Gloriose B. Allakonon|Imorou Fousseni Ouorou Barrè|Irénikatché P.B. Akponikpè水力学与环境建模实验室(HydroModE-Lab),农学系,BP 123 Parakou,贝宁 天然森林。裸土的田间持水量和毛细持水能力较低,而柚木种植园的这些指标较高。草地的水分储量较高,裸土较低;此外,水分储量与土壤水力传导性呈正相关,且农业用地的水力传导性值最高。研究表明,裸土在水分保持和水力传导性方面表现较差,这
来源:Canadian Journal of Soil Science
时间:2025-10-25