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基于IASLC指南与生物信息学整合策略的肺癌克隆起源鉴定研究
在肺癌诊疗领域,多灶性非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer, NSCLC)的精准管理始终是临床实践的难点。当患者肺部同时出现多个肿瘤病灶时,准确判断这些病灶是相互独立的原发癌(Separate Primary Lung Carcinomas, SPLC)还是同一原发肿瘤的肺内转移(Intrapulmonary Metastases, IPM),直接关系到TNM分期方案的制定、治疗策略的选择以及预后评估的准确性。传统鉴别主要依赖组织学评估,但在形态学相似的情况下往往难以定论。随着分子生物学技术的发展,通过基因突变谱分析肿瘤克隆相关性已成为新的突破口。国际肺癌研究协会
来源:Journal of Thoracic Oncology
时间:2025-10-25
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基于真实数据集评估Scribe与数据库搜索引擎在宏蛋白质组学中的性能比较
在微生物组研究领域,科学家们越来越关注微生物群落的功能活性而不仅仅是物种组成。质谱-based(基于质谱)的宏蛋白质组学(metaproteomics)技术应运而生,它能够直接鉴定和定量复杂微生物群落中表达的数千种蛋白质,从而揭示微生物之间的功能相互作用。然而,这条探索之路并非坦途。宏蛋白质组学数据分析面临着一个核心挑战:如何将串联质谱(tandem mass spectrometry)图谱与庞大的蛋白质序列数据库进行高效且准确的比对。传统的数据库搜索算法(database search algorithms)虽然广泛应用,但在处理宏蛋白质组学数据时,常常在鉴定数量与鉴定准确性之间难以两全。要
来源:Journal of Proteomics
时间:2025-10-25
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法洛四联症与颅缝早闭:由新型致病性PRKD1变异引起的CHDED综合征家族病例中的差异性表现
摘要先天性心脏病和外胚层发育不良综合征(CHDED综合征,MIM:617364)是一种常染色体显性遗传疾病,由PRKD1 T),该变异来自其受影响的父亲。转录分析证实,这个PRKD1剪接变异导致第14外显子完全缺失。有趣的是,该患者表现出新的扩展表型,包括先天性心脏病(室间隔缺损)和矢状颅缝早闭,从而拓宽了CHDED综合征的表型范围。受影响的父亲仅有先天性心脏病(室间隔缺损),但没有颅缝早闭。需要进一步的功能研究来阐明PRKD1基因序列变异与患者出现的颅缝早闭之间的关联。
来源:Journal of Human Genetics
时间:2025-10-25
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单核RNA测序显示,选择性PPAR-Delta激动剂Seladelpar主要通过激活PPAR-Delta靶基因来影响肝细胞和胆管细胞的功能
在肝脏疾病的研究中,PPARs(过氧化物酶体增殖物激活受体)作为关键的调节因子,已被广泛认为在肝脏代谢、炎症调控、胆汁酸合成以及纤维化进程中扮演重要角色。其中,PPARD(PPAR delta)因其在脂肪代谢、能量调控和抗炎作用中的潜在价值,成为近年来关注的焦点。本研究围绕选择性PPARD激动剂Seladelpar的肝细胞作用展开,旨在深入理解其在单细胞水平上的靶向效应。Seladelpar作为一种已获批用于原发性胆汁性肝硬化的药物,其临床效果已被证实,但其具体作用机制仍存在未知之处。通过对单细胞核RNA测序(snRNA-seq)和批量RNA测序的结合,本研究揭示了Seladelpar对肝脏不
来源:PPAR Research
时间:2025-10-25
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黑水虻谱系中消化、免疫和嗅觉功能基因家族的扩张演化及其适应性意义
在昆虫世界中,有些物种拥有令人惊叹的生存能力。黑水虻(Hermetia illucens)便是这样一个奇特的例子——这种全球分布的腐食性昆虫能够将有机废弃物高效转化为蛋白质,成为可持续农业和废物处理领域的明星物种。然而,科学家们一直好奇:是什么遗传机制支撑了黑水虻对分解环境的特殊适应性?与其他亲缘物种相比,它的基因组有何独特之处?为了解答这些问题,剑桥大学的研究团队在《Heredity》杂志上发表了一项开创性研究。他们通过对两个密切相关的双翅目昆虫科——腐木蝇科(Stratiomyidae,包括黑水虻)和食蚜蝇科(Asilidae)——进行系统的比较基因组分析,揭示了结构变异(Structur
来源:Heredity
时间:2025-10-25
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通过点突变和结构突变构建高产蛋白酵母突变株及其在类胡萝卜素生产中的应用
章节亮点菌株和前培养实验所用菌株包括:C. acetobutylicum ATCC 824 (= DSM 792)、Clostridium pasteurianum ATCC 6013 (= DSM 525)、C. butyricum DSM 5431 和 Clostridium tyrobutyricum CNRZ 510。孢子储存于6°C的强化梭菌培养基(RCM, Difco™)中,该培养基每升蒸馏水含:蛋白胨10 g、牛肉浸膏10 g、酵母提取物3 g、葡萄糖5 g、氯化钠5 g、可溶性淀粉1 g、半胱氨酸盐酸盐0.5 g、醋酸钠3 g、琼脂0.5 g。结果在可控生物反应器中对C. ac
来源:Journal of Biotechnology
时间:2025-10-25
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哺乳动物与细菌衔接蛋白作为共去抑制对激活E3泛素连接酶WWP2的新机制
在细胞生命活动的精密调控网络中,泛素化修饰犹如分子世界的"死亡标签",而执行这一关键过程的E3泛素连接酶中,NEDD4家族成员WWP2(WW Domain Containing E3 Ubiquitin Protein Ligase 2)扮演着重要角色。这种酶参与从细胞分化到T细胞免疫的多种生理过程,但其活性受到严格调控,通常处于自抑制状态。就像被锁住的工具箱,需要特定"钥匙"——即含有PY基序(Proline-Tyrosine motif)的衔接蛋白(Ndfips)才能激活。然而,这些"钥匙"如何精确解锁WWP2的催化活性,特别是病原体如何劫持这一系统,一直是领域内待解之谜。沙门氏菌作为典型
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-10-25
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EB1与EB3蛋白液液相分离特性的差异及其对微管功能的调控意义
在细胞这个繁忙的都市中,微管(microtubules)如同纵横交错的交通要道,负责细胞内物质运输、维持细胞形态和分裂等重要生命活动。这些动态的蛋白纤维由αβ-微管蛋白(tubulin)异二聚体聚合而成,其正末端(plus end)的“建设”与“拆除”过程受到一群被称为正末端追踪蛋白(microtubule-plus-end-tracking proteins, +TIPs)的精密调控。其中,末端结合蛋白(End-binding proteins, EBs)作为+TIP网络的核心成员,扮演着“项目经理”的角色,负责招募其他伙伴蛋白到微管末端,共同调控微管的动态不稳定性(dynamic inst
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-10-25
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一种含有解聚蛋白结构域和金属蛋白酶结构域以及血栓调节蛋白基序(ADAMTS18)的蛋白质能够切割纤维连接蛋白,并抑制其纤维形成的过程
在生命科学领域,细胞外基质(Extracellular Matrix, ECM)的重塑是组织发育、维持和修复过程中至关重要的机制。ECM是由多种结构蛋白和细胞外分子构成的复杂网络,它不仅为细胞提供物理支持,还通过调控细胞行为参与多种生理和病理过程。因此,识别和理解ECM重塑的调控因子,对于深入研究组织稳态以及相关疾病的发生机制具有重要意义。ADAMTS18是ADAMTS蛋白酶家族的一个成员,该家族由19种锌依赖性金属蛋白酶组成,参与多种生理和病理过程,包括血管生成、关节炎、支气管肺发育不良和癌症等。尽管ADAMTS18已被报道与多种疾病相关,但其具体功能和作用机制仍未完全阐明,这使其在科学界具
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-10-25
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评估一次性盘式连续离心机从细胞培养液中回收单克隆抗体的效果
摘要 为了净化哺乳动物细胞培养液,已经开发出了多种技术,包括沉淀、絮凝、深度过滤、微过滤和离心。对于处理量在2000至5000升之间的情况,连续离心后进行深度过滤是首选方法。该过程首先通过连续离心去除细胞和大颗粒杂质,然后再过滤小颗粒杂质及部分污染物。新型的一次性离心机旨在防止交叉污染,并模仿传统连续离心机的操作方式,对其性能进行了评估,重点关注其对细胞裂解以及后续过滤和纯化过程的影响。结果表明,一次性离心机在降低上清液的浊度和乳酸脱氢酶(LDH)水平方面表现更优,说明其造成的细胞裂解程度低于传统离心机。经过测试,分离负荷系数在0
来源:Biotechnology Progress
时间:2025-10-25
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一种用于在日晒后自我评估皮肤健康状况的紧凑型光学传感器
本研究围绕紫外线(UV)暴露对皮肤的影响展开,重点探讨了一种新型的便携式皮肤健康监测设备的开发及其在实际应用中的潜力。紫外线是导致黑色素瘤及其他皮肤癌的主要环境风险因素,而过度的紫外线暴露不仅会引发皮肤炎症反应,还可能对皮肤健康造成长期损害。因此,如何准确评估皮肤在紫外线暴露后的反应,如红斑(erythema)和色素沉着(pigmentation),成为皮肤健康监测技术的重要课题。当前市场上已有多种紫外线监测设备,但它们通常依赖于用户自述的皮肤类型(phototype)分类,无法实时、定量地检测皮肤的动态变化,且在非临床环境中应用受限。此外,一些基于手机摄像头的紫外线色度贴片虽然具备一定的便携
来源:Advanced Sensor Research
时间:2025-10-25
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菲律宾非洲猪瘟暴发情况下农场层面基本繁殖数的估算
非洲猪瘟(African Swine Fever, ASF)自2019年进入菲律宾以来,对当地养猪业造成了严重冲击,影响了从家庭农场到商业养殖场,以及本土野猪种群。该病毒的传播模式对有效防控策略的制定至关重要,然而,目前对农场层面的传播规律仍缺乏清晰认识,且尚未有全面分析结合国家和岛屿级数据的研究。本研究利用2019年至2022年的ASF爆发数据,对菲律宾及其三大主要岛屿——吕宋、维萨亚斯和棉兰老岛,分别估计了农场层面的基本再生数(R_h),以揭示不同区域的传播动态并识别其独特模式。研究结果表明,虽然长期来看ASF的R_h趋于接近1,暗示其正在向地方性流行转变,但R_h并未始终低于1,说明疫情
来源:Transboundary and Emerging Diseases
时间:2025-10-25
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从埃塞俄比亚北贡德尔地区的农业土壤中分离出的产有机酸丝状真菌的多样性
在现代生物技术和工业应用中,真菌扮演着不可或缺的角色。尤其是丝状真菌,因其能够高效地分解有机物质并产生多种代谢产物,包括酶、有机酸、抗生素等,而在许多领域展现出巨大的潜力。这些代谢产物不仅对生态环境具有重要影响,还广泛应用于食品、农业、制药、清洁和化妆品等行业。有机酸作为一类重要的生物活性化合物,因其在工业中的广泛应用而备受关注。例如,柠檬酸、醋酸和葡萄糖酸等有机酸被广泛用于食品添加剂、pH调节剂、溶剂以及医药和化妆品的生产中。因此,研究丝状真菌在不同农业土壤中对有机酸的生产能力,不仅有助于理解其生态功能,还可能为可持续工业应用提供新的资源和方向。本研究聚焦于埃塞俄比亚北贡达地区的农业土壤中,
来源:Scientifica
时间:2025-10-25
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综述:成纤维细胞生长因子在细胞和癌症代谢中的作用
受体酪氨酸激酶受体酪氨酸激酶(RTK)是广泛表达的跨膜受体大家族,通过催化靶蛋白磷酸化调控细胞增殖、代谢、运动和存活等关键过程。其结构高度保守,包含胞外配体结合域、单次跨膜螺旋和胞内酪氨酸激酶域。配体结合诱导受体二聚化,通过解除自抑制和反式自磷酸化激活激酶域,进而招募含SH2或PTB结构域的细胞内信号蛋白,激活PI3K/Akt、MAPK、PLCγ和JAK/STAT等核心信号通路。RTK信号失调与癌症发生发展、代谢性疾病和遗传 disorders 密切相关。其中成纤维细胞生长因子受体(FGFR)及其配体FGF不仅在胚胎发育和器官形成中发挥重要作用,更在成年组织稳态(包括细胞代谢调控)中扮演关键角
来源:FEBS Letters
时间:2025-10-25
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子宫细胞外囊泡能够模拟产后负能量平衡对奶牛的长期影响
在这项研究中,科学家们探讨了奶牛在产犊后经历的负能量平衡(NEB)对子宫环境的长期影响,以及这种影响是否可以通过子宫液中的小细胞外囊泡(UF-EVs)传递给未受代谢挑战的子宫上皮细胞。研究发现,高NEB水平的奶牛在60天产犊后(DPC)的子宫环境不利于胚胎发育,而UF-EVs能够再现这一现象,表明它们可能在代谢挑战下调节子宫反应。这些发现对理解奶牛生殖健康和提高繁殖效率具有重要意义。### 1. NEB与子宫功能的关系奶牛在产犊后常常经历负能量平衡,这是由于奶牛的代谢需求超过其摄入的营养。这种状态可能导致生殖细胞功能受损,进而影响整体的生育能力。特别是,高浓度的非酯化脂肪酸(NEFA)和β-羟
来源:Molecular Reproduction and Development
时间:2025-10-25
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氯巴 Zam 与皮质类固醇在治疗伴有睡眠中棘波活动的发育性和癫痫性脑病(D)EE-SWAS)中的疗效比较:一项多中心观察性研究的结果
这项研究聚焦于一种罕见的儿童癫痫综合征——发育性与癫痫性脑病伴睡眠期尖波-慢波活动((D)EE-SWAS),探讨了两种初始治疗方法——糖皮质激素与氯硝西泮(clobazam)在改善患者日常功能和安全性方面的效果。研究结果为临床实践中治疗该疾病的策略提供了新的视角,尤其是在对治疗反应的评估上,显示出糖皮质激素可能在某些方面优于氯硝西泮。(D)EE-SWAS是一种与认知和行为功能障碍密切相关的癫痫综合征,其特点是睡眠期间几乎持续的尖波-慢波放电(Spike-Wave Discharges, SWDs),通常发生在非快速眼动睡眠(NREM)阶段,占超过85%的睡眠时间。尽管这种状况通常在青春期后自行
来源:Epilepsia
时间:2025-10-25
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男性生殖系统和细胞在孕前暴露于3.5 GHz辐射后的损伤:产后一年的影响
摘要 本研究探讨了产前暴露于3.5 GHz射频辐射(RFR)对雄性生殖健康的长期影响。将怀孕的Wistar Hannover大鼠分为对照组、妊娠全程暴露组(3T RFR)和妊娠后期暴露组(2T RFR),每组每天暴露2小时。在12个月时对雄性后代进行安乐死并分析其睾丸情况。与对照组相比,3T RFR组的生精小管直径和上皮细胞高度显著降低(调整后的p值分别为0.03和9.71 × 10^−8),Johnsen评分也较低(调整后的p值为0.022)。精子形态异常情况显著增加(调整后的p值为0.036)。2T和3T组的γ-H2AX免疫染
来源:Annals of the New York Academy of Sciences
时间:2025-10-25
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经导管主动脉瓣置换术中使用自膨胀瓣膜时,主动脉狭窄和反流患者的血流动力学变异性
这项研究聚焦于经导管主动脉瓣置换术(TAVR)在主动脉瓣狭窄(AS)和主动脉瓣反流(AR)患者中的应用效果差异,特别关注了自膨式瓣膜(SEVs)在不同环形解剖结构下的表现。研究团队通过对患者进行回顾性分析,评估了瓣膜植入后血流动力学参数的变化,并结合1年的随访数据,深入探讨了瓣膜选择与患者预后之间的关系。该研究为临床中TAVR的适应症选择提供了新的视角,尤其是在考虑瓣膜环大小和瓣膜病理差异的前提下。主动脉瓣狭窄和反流是两种常见的主动脉瓣疾病,它们在病理机制、血流动力学表现和治疗策略上存在显著不同。AS通常由退行性钙化或先天性二叶式瓣膜异常引起,导致瓣膜叶增厚、僵硬,进而引发血流阻力增加、左心室
来源:Cardiovascular Therapeutics
时间:2025-10-25
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儿童急性早幼粒细胞白血病(APL)并发弥散性血管内凝血(DIC)的风险因素:CCLG-APL 2016研究的启示
摘要 本研究旨在识别儿童急性早幼粒细胞白血病(APL)患者中弥漫性血管内凝血(DIC)的早期风险因素,尤其是重度DIC(4-5级)。来自全国38家医院的186名儿童APL患者参与了由中国儿童白血病研究组(CCLG)-APL 2016研究。根据诱导治疗期间DIC的发生情况和严重程度,这些患者被分为不同组别。在诱导治疗期间,52.2%的患者出现了DIC,其中7.5%的患者发展为4-5级DIC。DIC组与非DIC组在初始白细胞(WBC)≥5×10^9/L、初始血小板(PLT)≤26×10^9/L以及三氧化二砷(ATO)使用情况方面存在显
来源:British Journal of Haematology
时间:2025-10-25
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通过将野生Vigna radiata var. sublobata中的收获前发芽抗性基因引入栽培绿豆,开展育种前的准备工作
本研究围绕豆科作物绿豆(*Vigna radiata*)中一种常见的生理问题——收获前萌发(Pre-harvest sprouting, PHS)展开,旨在通过引入野生绿豆品种的抗性基因,开发出具有更强抗PHS能力的绿豆品种。绿豆作为全球重要的蛋白质来源之一,在素食者群体中尤为重要,其蛋白质含量大约在15%-30%之间,远高于谷物类作物。此外,绿豆富含复杂碳水化合物、膳食纤维、维生素和矿物质,对于改善营养不良和微量营养素缺乏具有重要作用。然而,PHS问题对绿豆的产量和质量造成了严重威胁,特别是在降雨频繁、湿度高的成熟阶段,导致种子质量下降和市场价值降低。为了应对这一挑战,研究团队在印度马哈拉施
来源:Frontiers in Plant Science
时间:2025-10-25