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  • 胰腺癌非编码基因组研究新突破:增强子区域复发性体细胞突变的功能表征

    Abstract尽管胰腺导管腺癌(PDAC)的编码基因组已被详细表征,但其非编码基因组的特征仍相对未被探索。本研究利用全基因组测序(WGS)技术,在两个独特的患者队列中研究了编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码-非增强子区域)。研究发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症比未经治疗的癌症具有显著更高的突变负荷。然而,尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,每个区域的突变相对比例仍保持不变。与其他非编码区域相比,增强子的突变数/Mb较低。增强子还具有独特的突变特征,其中SBS39富集。根据预测的人类和小鼠基因组同源区域的重叠情况,将增强子序列分为保守和非保守区域,并对保守区域进行复发性体细胞突变的

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺癌保守增强子区域体细胞突变的功能与临床意义研究

    Abstract胰腺癌的编码基因组已被详细表征,但非编码基因组的特征仍相对未被探索。本研究利用全基因组测序技术,在两个独特的患者队列中研究了编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码非增强子区域)。研究发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症比未经治疗的癌症具有显著更高的突变负荷。然而,尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,每个区域的突变相对比例仍保持不变。与其他非编码区域相比,增强子区域的突变/Mb数量较低。增强子还具有独特的突变特征,富含SBS39。根据预测的人类和小鼠基因组同源区域的重叠情况,将增强子序列分为保守和非保守区域,并对保守区域进行复发性体细胞突变的筛选。研究发现,保守增强子区域中的

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺癌保守增强子突变:非编码基因组的新视角与功能影响

    Abstract胰腺导管腺癌(PDAC)的编码基因组已被详细表征,但非编码基因组的特征仍相对未被探索。本研究利用全基因组测序(WGS)技术,在两个独特的患者队列中研究了编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码-非增强子区域)。研究发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症比未经治疗的癌症具有显著更高的突变负荷。然而,尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,每个区域的突变相对比例得以保持。与其他非编码区域相比,增强子区域的突变数/兆碱基(mut/Mb)较低。增强子还具有独特的突变特征,富含SBS39。增强子序列根据人类和小鼠基因组中预测的同源区域重叠情况被分为保守和非保守区域,并对保守区域进行了复发性体

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺癌非编码基因组中保守增强子突变的功能特征研究

    Abstract研究团队通过全基因组测序(WGS)对两个独特患者队列的编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码非增强子区域)进行系统性分析。研究发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症比未经治疗的癌症具有显著更高的突变负荷。尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,但每个区域的突变相对比例保持不变。与其他非编码区域相比,增强子区域的突变数量/Mb较低,且具有独特的突变特征(SBS39富集)。通过筛选人类和小鼠基因组中预测的同源区域,研究人员在保守增强子区域发现复发性体细胞突变主要与已知胰腺发育和癌症相关的转录因子(如KLF5和TP63)相关。RNA测序数据显示,携带增强子突变的癌症表现出显著差异的转录

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺导管腺癌(PDAC)增强子中的突变特征:保守区域复发突变与基因表达调控的新发现

    Abstract胰腺癌的编码基因组已被详细表征,但非编码基因组的特征仍相对未被探索。我们使用全基因组测序研究了两个独特患者队列中的编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码非增强子区域)。我们发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症的突变负担显著高于未经治疗的癌症。然而,尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,每个区域的突变相对比例得以保持。与其他非编码区域相比,增强子的突变数/Mb较低。增强子还具有独特的突变特征,富含SBS39。根据预测的人类和小鼠基因组中直系同源区域的重叠情况,将增强子序列分为保守和非保守区域,并对保守区域筛选复发性体细胞突变。我们发现,保守增强子区域中的复发性体细胞突变在很大程

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺癌非编码基因组中保守增强子突变的功能与临床意义研究

    Abstract胰腺癌的编码基因组已被详细表征,但非编码基因组的特征仍待探索。本研究利用全基因组测序技术,在两个独特的患者队列中研究了编码和非编码基因组(启动子、增强子和非编码非增强子区域)。研究发现,在所有四个基因组区域中,经过治疗的癌症比未经治疗的癌症具有显著更高的突变负荷。然而,尽管存在治疗诱导的遗传瓶颈,每个区域的突变相对比例得以保持。与其他非编码区域相比,增强子的突变数/Mb较低。增强子还具有独特的突变特征,表现为SBS39的富集。根据预测的人类和小鼠基因组同源区域重叠情况,将增强子序列分为保守和非保守区域,并对保守区域进行复发性体细胞突变筛查。研究发现,保守增强子区域中的复发性体细

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • 胰腺癌非编码基因组新发现:保守增强子突变调控胰腺谱系基因的新机制

    胰腺导管腺癌(PDAC)的非编码基因组景观引言尽管胰腺导管腺癌(PDAC)的编码基因组已被详细表征,但其非编码基因组的特征仍相对未被探索。本研究利用两个独特的患者队列进行全基因组测序(WGS),系统研究了编码区和非编码区(包括启动子、增强子及其他非编码区域)的突变特征。研究发现,接受治疗的癌症在所有四个基因组区域的突变负荷均显著高于未治疗癌症,但各区域的相对突变比例在治疗诱导的遗传瓶颈后仍得以保持。材料与方法研究纳入了10例晚期PDAC患者的86个肿瘤样本和10个正常样本(其中4例未治疗,6例接受过化疗)。通过WGS(中位覆盖度76.5×)检测体细胞突变,并使用Treeomics进行系统进化分

    来源:Cancer Research Communications

    时间:2025-10-18

  • ZT-5483靶向抑制人TNKS1弓形虫抗寄生活性的计算与实验研究

    Highlight结构分析揭示TNKS1活性位点存在可成药口袋对TNKS1催化结构域(PDB ID: 2RF5)的三维晶体结构进行分析,以探究其小分子结合潜力。该结构根据其二级结构元素着色,如图1a所示。使用Discovery Studio Visualizer中的配体口袋预测工具进行分析,在TNKS1的活性位点识别出一个可成药口袋(图1b)。该口袋以绿色网格表示,突出了其空间排列。讨论TNKS1在调节细胞过程(包括端粒维持、有丝分裂和各种信号通路)中起着关键作用,这些过程对于寄生虫的生存和增殖至关重要[11]。靶向宿主Wnt信号通路,特别是通过抑制TNKS1,可以破坏这一通路,并显著削弱寄生

    来源:Molecular and Biochemical Parasitology

    时间:2025-10-18

  • 加那利群岛开阔海域微塑料与海洋垃圾的垂直分布与组成特征研究(0-1200米深度)

    海洋塑料污染已成为全球性环境问题,每年有数百万吨塑料废弃物进入海洋。尽管人们对海表漂浮的塑料垃圾关注较多,但对深海环境中微塑料(Microplastics, MPs)的垂直分布、组成及降解过程仍知之甚少。传统观点认为,像聚乙烯(Polyethylene, PE)和聚丙烯(Polypropylene, PP)这类低密度塑料会漂浮在海面,但越来越多的证据表明,它们也能通过生物附着、聚集等过程沉降到深海。加那利群岛位于北大西洋副热带环流区,是海洋垃圾的热点区域,为研究塑料污染在开阔海域的垂直输运和最终归宿提供了理想场所。在此背景下,研究人员在《Marine Pollution Bulletin》上发

    来源:Marine Pollution Bulletin

    时间:2025-10-18

  • 宏进化物种适应度下降驱动演化支系的兴衰规律

    地质时间尺度上物种多样性波动的驱动机制始终存在争议。研究者通过构建新型系统发育模型——化石整合生灭扩散模型(fossilized birth–death diffusion),对涵盖现存与灭绝物种的27个植物、节肢动物和脊椎动物辐射支系进行演化历史分析。该模型能连续追踪成种(speciation)与灭绝(extinction)速率的动态扩散过程,并整合地层学相关的化石形成速率。研究揭示支系多样性呈现典型的兴衰动态:快速成种推动多样性初期增长,而多样性减缓与下降主要受灭绝速率变化调控。这些模式不符合基于适应辐射(adaptive radiations)或多样性依赖(diversity depen

    来源:Nature Ecology & Evolution

    时间:2025-10-18

  • 金黄色葡萄球菌细胞色素P450脱羧酶对C18单不饱和脂肪酸的脱羧机制:光谱、结构与动力学研究

    在绿色化学和可持续能源领域,如何高效地将可再生资源转化为高附加值化学品一直是科学家们面临的重大挑战。脂肪酸作为自然界最丰富的生物质资源之一,其转化利用技术备受关注。自然界中存在着一类特殊的酶——细胞色素P450(Cytochrome P450, CYP)过氧化物酶,它们能够以过氧化氢(H2O2)为唯一氧化剂,催化脂肪酸的脱羧反应生成终端烯烃,这些烯烃正是"即用型"生物燃料的重要组成成分。在P450酶超家族中,CYP152家族成员展现出独特的催化能力。其中,来自Jeotgalicoccus sp. ATCC 8456的OleTJE是最具代表性的脂肪酸脱羧酶,它能将饱和脂肪酸转化为α-烯烃。然而,

    来源:Journal of Inorganic Biochemistry

    时间:2025-10-18

  • 细胞色素P450血红素周围可氧化氨基酸的保护作用与进化分布研究

    亮点• 细菌P450酶中酪氨酸(Tyr)是最接近血红素的可氧化氨基酸,而真核酶中色氨酸(Trp)占主导地位• 真核酶中常见的结构基序:色氨酸与血红素D-丙氨酸(D-propionate)形成氢键• 细菌CYP102A1中类似位置的色氨酸被证实可延长酶催化寿命• 真核酶中的色氨酸可能发挥类似的保护作用结论细胞色素P450酶通过色氨酸、酪氨酸和半胱氨酸残基形成的空穴传递链,为高反应性中间体(如化合物I/CI和化合物II/CII)提供了重要的保护机制。我们对188个P450酶结构的分析表明,原核与真核酶在最近可氧化氨基酸的分布上存在显著差异:细菌酶偏好酪氨酸(占最近残基的三分之二),而真核酶中色氨酸

    来源:Journal of Inorganic Biochemistry

    时间:2025-10-18

  • WT1基因突变对急性髓系白血病异基因造血干细胞移植结局的影响:一项EBMT登记处的多中心回顾性队列研究

    WT1基因作为转录因子,在细胞增殖、分化和凋亡中扮演双重角色,其突变常见于5%-10%的急性髓系白血病(AML)患者,既往研究多认为与化疗耐药和不良预后相关。然而,WT1突变对异基因造血干细胞移植(HSCT)结局的影响始终存在争议:部分研究提示移植后复发风险升高,另一些则未观察到显著差异。这种不确定性源于既往样本量小、移植比例低且缺乏多中心验证。为此,欧洲血液和骨髓移植学会(EBMT)急性白血病工作组(ALWP)开展了一项大规模回顾性研究,旨在明确WT1突变是否真正影响AML患者在首次完全缓解(CR1)期接受HSCT的长期生存。研究团队从EBMT登记处筛选2015-2023年间703例接受HS

    来源:Bone Marrow Transplantation

    时间:2025-10-18

  • 基于毛细管电泳-界面诱导电流检测器研究单羧酸解离状态及其与MCT1的相互作用

    通过新型通用界面诱导电流检测器(IICRD)与毛细管电泳(CE)联用,研究人员首次实现对15种单羧酸(MAs)解离状态的高灵敏度分析。与传统二极管阵列检测器(DAD)仅能获得单一低灵敏度峰值不同,IICRD在电流电泳图(CR-EGs)中清晰呈现两个信号峰:通过添加电荷中性标记物并结合pKa计算,明确鉴定其为中性形式[MA±]与单价阴离子[MA−]。定量分析表明该方法检测限低至40 μM,线性范围跨越10−6至10−2 M。创新性结合非固定化细胞毛细管电泳(NICCE)技术,首次揭示MAs不同解离状态与单羧酸转运蛋白1(MCT1)的动态结合特性,成功获取细胞膜上MCT1的结合动力学参数与分子数量

    来源:ELECTROPHORESIS

    时间:2025-10-18

  • 台湾-琉球岛弧苔藓栖息跳甲(鞘翅目:叶甲科:跳甲亚科)的复杂演化与生物地理历史

    引言岛屿是研究物种多样化、物种形成和生物地理学的绝佳模型系统。岛屿物种的进化起源主要有两种情景:隔离分化(vicariance)和扩散后异域成种(allopatric speciation following dispersal)。素有“东方加拉帕戈斯”之称的台湾-琉球岛弧是东亚岛屿生物多样性研究的关键区域之一,拥有许多著名的特有物种。该岛弧的地质历史和古地理仍存在相当大的不确定性。台湾-琉球岛弧的动物区系深受隔离分化和扩散事件的影响。飞行能力的丧失是促进昆虫(尤其是甲虫)物种辐射的关键特征之一。飞行能力丧失的甲虫扩散能力有限,但常在热带山脉和群岛中形成微特有物种的辐射,偶尔的扩散事件会扩展其

    来源:Systematic Entomology

    时间:2025-10-18

  • 全基因组测序揭示了泰国稻瘟病菌基于单核苷酸多态性的遗传多样性和种群结构

    摘要 由Magnaporthe oryzae引起的稻瘟病是一种对全球水稻生产构成严重威胁的疾病。虽然东南亚是该病原体的起源地,但其在泰国的种群动态尚未得到充分研究。我们分析了191个M. oryzae分离株(其中60个来自泰国,131个来自全球其他地区)的全基因组序列,以探讨其遗传多样性、结构及致病性。系统基因组学分析表明,泰国分离株与其他亚洲种群聚集在一起,但内部种群间的多样性更高,形成了两个主要的遗传群。研究发现,来自泰国东北部和中部雨养低地水稻及灌溉水稻的分离株属于世界组3,而来自北部高地水稻的分离株属于世界组1。这一新的分

    来源:Plant Pathology Journal

    时间:2025-10-18

  • 感受热浪:探究内感受与动机作为劳力性热射病的风险因素

    引言劳力性热射病(Exertional Heatstroke, EHS)是运动竞赛或军事训练等特定背景下体力活动期间可能发生的最严重的热相关疾病。尽管对其生理机制的理解已取得实质性进展,但现有证据表明需要更广泛的模型,同时考虑认知因素。本文引入一个EHS的认知模型,并通过一项使用自我报告措施的病例对照研究进行了初步的实证验证。核心假设是,EHS源于长时间体力活动中成本-收益权衡的破坏——具体而言,由于过度动机导致对表现相关收益的过高估价,以及由于低内感受意识(其特征是对身体内部状态信号处理的破坏)导致对体力消耗成本的过低估价。方法参与者研究招募了51名有EHS病史的病例,来自法国马赛的Lave

    来源:Physiological Reports

    时间:2025-10-18

  • 基于船舶目测观测的东地中海百年风浪气候演变研究

    摘要本研究对东地中海过去一个世纪(1924–2023年)的风浪气候进行了全面分析。以志愿观测船计划框架下开展的目测波浪观测为基础,利用风浪和涌浪高度、周期和传播方向的天然分离观测值,可计算有效波高、主周期、波龄、陡度和波长等海况特征。VOS数据的连续性、观测密度和质量为不同时空尺度的风浪状况和极端波浪统计以及长期趋势评估奠定了坚实基础。材料与方法东地中海的目测波浪观测VOS数据包含风浪和涌浪系统的高度、周期和传播方向,以及风速和风向、云量、海表温度、海平面压力等众多海洋和大气参数。东地中海边界定义为东经30°子午线。该次盆地最早的风速记录可追溯到1858年;波浪方向记录于1886年;波高数据出

    来源:Limnology and Oceanography

    时间:2025-10-18

  • 加纳与尼日利亚跨境犬只贸易引发的人狂犬病定量风险建模及防控策略评估

    在非洲部分地区,犬只贸易和屠宰消费不仅是传统习俗,更是日益增长的产业。然而,随着跨境犬只流动的增加,狂犬病这一致命人兽共患病的传播风险悄然升级。狂犬病病毒(Rabies virus)通过犬类咬伤或伤口接触传播,致死率接近100%,而西非与中非活跃的犬只贸易网络(如加纳-布基纳法索-多哥路线、尼日利亚-乍得-喀麦隆-尼日尔路线)成为病毒扩散的温床。由于缺乏有效的监管和疫苗接种,大量未免疫犬只在市场中流通,屠宰者在处理犬只时面临极高的暴露风险。更严峻的是,许多屠宰者对狂犬病认知不足,操作中缺乏防护措施,进一步放大了疫情暴发的可能性。为量化这一风险,Odita等人在《One Health Outlo

    来源:One Health Outlook

    时间:2025-10-18

  • 基于FNA细胞形态计量学鉴别甲状腺乳头状癌高细胞亚型与经典亚型的临床意义研究

    3)、梭形细胞、尾状细胞以及孤立存在的肿瘤细胞在T-PTC组中出现频率显著更高(p值<0.05)。这些特征在鉴别T-PTC时表现出90%-100%的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,当四种特征同时存在时诊断效能接近100%。值得注意的是,T-PTC的肿瘤细胞还呈现不规则核轮廓等典型形态学改变。该研究证实通过FNA细胞学特征可有效区分甲状腺乳头状癌的不同亚型,为术前制定精准手术方案提供了重要细胞学依据。图文摘要进一步强调,细胞病理学家应重点关注高细胞、梭形细胞及尾状细胞这三类特征性形态学指标。

    来源:Cytopathology

    时间:2025-10-18


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