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寨卡病毒通过损害小梁网自噬流促进眼部感染及病理损伤的机制研究
寨卡病毒在小梁网中的感染机制与自噬调控ZIKV高效感染小梁网并引发免疫失调寨卡病毒(ZIKV)亚洲株PRVABC59能在原代人小梁网细胞(HTMC)中高效复制,48小时达到病毒峰值。感染触发模式识别受体(RIG-I/MDA5)和干扰素刺激基因(ISG15/OAS2/MX1)的早期抗病毒反应,但后期转为促炎因子(IL-6/TNF-α/IFNγ)的爆发式释放,显示免疫调控失衡。透射电镜(TEM)直接观察到病毒颗粒定位于自噬小体,而免疫共染色证实其复制中间体dsRNA与晚期内体标志物Rab7和溶酶体标志物LAMP1共定位,揭示病毒对自噬区室的劫持。自噬流的双重调控:激活与阻断ZIKV感染显著增加脂化
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-09-09
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SARS-CoV-2病毒活性标志物的精准评估:亚基因组RNA检测在免疫功能低下患者中的临床应用价值
ABSTRACT准确评估病毒活性的方法对免疫功能低下患者的隔离时长和抗病毒治疗至关重要。尽管细胞培养(CC)是金标准,但其存在操作复杂、耗时长等局限。本研究通过前瞻性分析285份鼻咽拭子样本,发现针对E基因的亚基因组RNA(sgRNA)检测在预测病毒活性方面表现卓越:灵敏度达0.99,特异度0.96,阳性预测值(PPV)0.97,阴性预测值(NPV)0.99,显著优于基因组RNA(gRNA)检测(特异度仅0.24)和Ct值阈值法(Ct≤25时准确度0.88)。IMPORTANCE在免疫功能低下人群中,区分传染性病毒与非活性残留对临床决策具有特殊意义。sgRNA作为病毒复制过程中特有的转录产物,
来源:Microbiology Spectrum
时间:2025-09-09
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综述:原核生物中相邻基因的翻译耦合
邻近基因在原核生物中的协同表达原核基因通常以操纵子形式排列,功能相关基因相邻分布。这种组织方式通过多种机制协调表达:所有基因共转录为单一mRNA;上游基因翻译沉默会引发极性效应(polarity),由Rho或FttA终止因子介导转录提前终止;核糖体还可通过影响RNA二级结构调控下游基因的翻译终止。原核ORF的紧密排布特征原核基因组具有高基因密度(0.8-1.2基因/千碱基),约1/3基因存在重叠。最典型的-4 nt间距构型(NTGA)占主导,该结构约束下游基因第二密码子仅能编码7种氨基酸。基因对间距分布呈现跨物种保守性,-4 nt、-1 nt和-8 nt间距构型显著富集。空间耦合ORF的翻译联
来源:Journal of Bacteriology
时间:2025-09-09
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尿素酶促进金黄色葡萄球菌在类皮肤环境中的pH稳态与生长
尿素酶在皮肤环境中的核心作用金黄色葡萄球菌(S. aureus)是皮肤软组织感染(SSTIs)的主要病原体,其定植能力与皮肤酸性环境(pH 4.5-5.8)下的适应性密切相关。研究发现,皮肤表面丰富的尿素(4-12 mM)通过尿素酶(ureABCEFGD operon)分解为氨和二氧化碳,显著提升胞内pH(实验证实ΔpH达0.5单位),并中和胞外环境。RNA-seq数据显示,在类皮肤培养基(SLM)和小鼠皮肤模型中,尿素酶基因表达显著上调,提示其在皮肤定植中的必要性。尿素代谢的双重效益通过构建ureD::Tn突变株,研究者发现尿素酶缺失导致SLM中细菌生长速率降低(倍增时间延长1.5倍),且2
来源:Journal of Bacteriology
时间:2025-09-09
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美国德克萨斯州亚热带地区腐生型子囊菌新分类群的系统发现与谱系重构
在真菌分类学领域掀起新篇章!美国德克萨斯州亚热带地区的长期野外工作取得重大突破,研究人员在子囊菌门(Pezizomycotina)中描绘出令人振奋的分类新图景。通过多基因系统发育分析,那些曾经"身份模糊"的真菌终于找到了自己的进化位置。在座囊菌纲(Dothideomycetes)的舞台上,研究团队精彩演绎了三幕分类大戏:首先为Pleosporales目中的Taeniolella multiplex建立了新属Piepenbringia,将其与Kirschsteiniotheliales目的模式种T. exilis明确区分;其次在四胞球壳科(Tetraplosphaeriaceae)中描述了Ern
来源:Mycologia
时间:2025-09-09
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综述:TCR/BCR二次重排在自身免疫性疾病中的作用:分子机制、致病作用及治疗前沿
ABSTRACT自身免疫性疾病(Autoimmune Diseases, AIDs)是一类免疫系统错误攻击自身组织的疾病,其核心发病机制涉及免疫耐受的破坏。在适应性免疫中,T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的二次重排(Secondary Rearrangement)通过淋巴细胞发育过程中的多次V(D)J重组实现,而这一过程中的受体编辑缺陷可能导致自身反应性克隆的产生,进而驱动AIDs的发生发展。分子机制与致病作用TCR/BCR的二次重排通过RAG1/RAG2介导的V(D)J重组机制,在初级重排失败或自身反应性逃逸时被激活。研究表明,胸腺和骨髓中异常的二次重排会导致自身反应性T/B细胞克
来源:IMMUNOLOGICAL INVESTIGATIONS
时间:2025-09-09
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丁酸盐通过cAMP-PKA/mTOR轴调控溃疡性结肠炎Treg/Th17平衡的分子机制研究
这项研究揭示了短链脂肪酸丁酸盐(butyrate)在溃疡性结肠炎(UC)中的关键作用机制。通过葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠UC模型,研究人员发现丁酸盐能剂量依赖性改善体重下降、结肠缩短和脾肿大等病理特征,显著降低疾病活动指数(DAI)和脾脏指数(SI)。组织学分析显示,丁酸盐不仅缓解肠道炎症,还通过抑制α-SMA和胶原蛋白表达阻断纤维化进程。更引人注目的是,丁酸盐通过双向调节环磷酸腺苷-蛋白激酶A(cAMP-PKA)和雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路,重塑了调节性T细胞(Treg)与辅助性T细胞17(Th17)的平衡。流式细胞术证实丁酸盐可逆转DSS引起的Treg比例下降和促炎因子IL-
来源:IMMUNOLOGICAL INVESTIGATIONS
时间:2025-09-09
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含三对二硫键的S-糖基化糖肽素的结构表征与生物活性研究
在微生物天然产物领域,糖肽素(glycocins)作为核糖体合成翻译后修饰肽(RiPPs)的重要亚类,因其独特的O/S-糖基化修饰和抗菌活性备受关注。然而目前已知的糖肽素结构多样性有限,特别是含多对二硫键的S-糖基化成员更属罕见。传统C39蛋白酶对双甘氨酸(GG)切割位点的严格限制,也阻碍了新糖肽素的发现与表征。为解决这些问题,Martini等研究者通过基因组挖掘,从嗜热厌氧杆菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum和Ornithinibacillus bavariensis中鉴定出两个新型糖肽素生物合成基因簇(BGC)。研究采用异源表达、质谱分
来源:Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology
时间:2025-09-09
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综述:利用人工智能实现高效微生物生产
AI赋能微生物生产:从蛋白质设计到智能发酵AI-enabled enzyme mining and engineering微生物生产依赖功能酶构建合成途径,但传统方法如多重序列比对(MSAs)效率低下。AI通过深度学习(DL)模型(如AlphaFold3)精准预测未解析蛋白质结构,加速酶挖掘。例如,扩散模型架构显著提升蛋白-配体复合物预测精度。此外,机器学习(ML)指导的理性设计(如单点饱和突变文库优化)将酶工程周期缩短60%,突破活性与特异性瓶颈。AI-enabled transcription factor (TF) mining and engineering代谢失衡是限制产量的关键因素
来源:Bioresource Technology
时间:2025-09-09
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SARS冠状病毒E蛋白通过不对称脂质层厚度耦合驱动膜曲率变形的分子机制
Highlight实验设置我们使用Martinize工具将SARS-CoV E蛋白五聚体(PDB ID: 5X29)粗粒化(coarse-grained),并通过Insane工具将其嵌入不同厚度的均质膜中(含100% POPC及其他9种膜系统)。体系初始尺寸为40×40×25 nm3,确保每层至少含2,600个脂质分子。长程膜弯曲仅意外压缩时出现当使用绝对位置约束(absolute position restraints)通过谐波势固定蛋白骨架时,膜表现出长程曲率(图3 A&B)。膜最初呈现鞍形构象,曲率甚至延伸至体系边缘——但这种效应源于模拟参数(如refcoord_scaling=
来源:Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes
时间:2025-09-09
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综述:分子静电计40年
分子静电计:膜表面静电的纳米尺度探针引言1987年Seelig团队提出的"分子静电计"概念,揭示了磷脂酰胆碱(PC)头部基团独特的静电感应能力。磷酸胆碱头部强达24德拜的P--N+偶极子,能通过构象变化响应膜表面正负电荷,如同纳米级静电计。这一发现源于2H NMR对氘代胆碱的观测——当膜表面存在电荷时,胆碱基团会沿 bilayer normal(膜法线)方向发生特征性倾斜。基础发现典型实验采用α或β位氘代POPC(1-棕榈酰-2-油酰磷脂酰胆碱)脂质体,通过Pake双线谱测量四极分裂值ΔνQ。研究发现:阳离子使α位ΔνQ增大而β位减小,阴离子则呈现相反趋势,这种"镜像响应"证实了磷酸胆碱的通用
来源:Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes
时间:2025-09-09
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N端依赖性蛋白降解之谜:MK-/MR-降解子的验证与内源性蛋白稳定性的矛盾解析
在生命活动中,蛋白质的降解调控如同精密的"分子时钟",而N端降解规则(N-Degron)通路就是其中关键的发条机制。这条通路通过识别蛋白质N端特定氨基酸序列,决定其是否被泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解。近年来,科学家们发现了一个有趣的现象:在酵母和哺乳动物中,N端含甲硫氨酸(M)后接碱性残基(K/R)的蛋白(如MK-/MR-序列)会被快速降解,但大规模蛋白质组学研究却未能在内源性蛋白中观察到这一规律。这种"实验室数据"与"真实世界"的差异,如同分子生物学领域的"暗物质"之谜,引发了加拿大阿尔伯塔大学Lina Alhourani团队的好奇心。为解开这个谜团,研究人员设计了两组精巧的实验。一方面
来源:Biochemistry and Biophysics Reports
时间:2025-09-09
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雌激素周期调控人类围排卵期葡萄糖味觉敏感性的机制研究
最新研究发现,人类围排卵期会出现有趣的味觉变化现象。当雌二醇水平达到峰值时,女性对葡萄糖的味觉敏感性显著提升,这种"甜蜜感知增强效应"具有鲜明的代谢特异性——只针对能激活ATP敏感钾通道(KATP)的可代谢甜味剂。100 ng/mL)测试其对葡萄糖、三氯蔗糖和甲基-D-吡喃葡萄糖苷(MDG)的味觉阈值。结果显示,只有葡萄糖检测阈值在雌激素高峰期明显降低(p<0.05),而两种不能代谢的甜味剂则保持稳定。机制上,这种现象可能与胰腺β细胞中的发现相呼应:雌二醇通过关闭味蕾细胞上的KATP通道,增强葡萄糖信号传导。有趣的是,受试者对900 mM葡萄糖溶液的喜好度在排卵期也呈现上升趋势(p=0.06)
来源:Chemical Senses
时间:2025-09-09
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综述:减轻脉搏血氧测定中黑色素引起的偏差:光学、算法、工程、硬件和建模工具
光学干扰:黑色素如何扭曲血氧信号传统脉搏血氧仪依赖660 nm(红光)和940 nm(近红外)双波长测量,但黑色素作为广谱吸收剂,在可见光波段产生显著干扰。研究表明,黑色素浓度增加会导致红光路径长度差异扩大,尤其在低氧状态(SaO2 <70%)下误差加剧。例如,蒙特卡洛模拟显示,菲茨帕特里克VI型皮肤(高黑色素)的SpO2读数可能虚高8%。反射式探头因几何结构更易受肤色影响,而窄带光源可减少50%信号变异。算法与工程解决方案:从光谱解混到动态校准多波长系统(如622-940 nm组合)通过梯度提升回归降低误差,而机器学习模型利用个体拓扑角(ITA)数据可将均方根误差从5.44%降至0.82%。
来源:Sensing and Bio-Sensing Research
时间:2025-09-09
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乙烯调控马铃薯块茎休眠的转录组与代谢组学机制研究
马铃薯作为全球第四大粮食作物,其块茎采后贮藏面临严峻的发芽问题。传统抑芽剂氯苯胺灵(CIPC)因致癌风险被欧盟禁用,而低温贮藏又会导致还原糖积累影响加工品质。乙烯作为一种天然植物激素,虽已知能抑制发芽,但其分子机制尚不明确。这项发表在《Postharvest Biology and Technology》的研究,通过多组学技术揭示了乙烯协调激素网络维持块茎休眠的精确调控机制。研究采用Russet Burbank品种块茎,设置连续15周乙烯处理(10 µL L−1)和3周恢复期。通过表型观察、转录组测序和靶向激素检测,系统分析了初级分生组织和块茎肉质部的响应特征。关键发现包括:【乙烯处理延迟发芽
来源:Postharvest Biology and Technology
时间:2025-09-09
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抑郁与焦虑障碍中基底前脑对内在脑网络的调控机制研究
这项突破性研究揭示了基底前脑调控网络在精神疾病中的精密失衡机制。通过超高场强7特斯拉功能磁共振(7T fMRI)扫描147名受试者(含70名抑郁/焦虑跨诊断患者),采用频谱动态因果模型(sDCM)解码了内侧隔核/斜角带(Ch1–3)、迈内特基底核(Ch4)和腹侧苍白球与两大核心脑网络的功能对话。健康大脑呈现典型的Ch1–3→DMN兴奋性传导和Ch4→前岛叶激活通路,而患者组却出现戏剧性反转:Ch4向DMN发送强力抑制信号,同时向岛叶的兴奋驱动异常增强。这种胆碱能通路(Ch4区域富含乙酰胆碱神经元)的全域性失调,如同"脑网络交响乐"中失控的低音部,可能导致DMN(涉及自我反思)与突显网络(负责威
来源:Nature Mental Health
时间:2025-09-09
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精神病多基因负荷的世代演变:基于丹麦人群的精神分裂症、抑郁症、自闭症及ADHD二十年队列研究
近二十年来,精神疾病的发病率持续攀升,但鲜有研究探讨诊断患者的多基因遗传负荷(polygenic burden)是否随时间变化。这项基于丹麦iPSYCH2015人群的病例-队列研究给出了突破性发现:通过对1981-2008年间出生的41,132名随机亚队列成员和60,293名精神分裂症谱系障碍(schizophrenia spectrum disorders)、抑郁症(depression)、自闭症(autism spectrum disorder, ASD)或注意缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder, ADHD)患者的追踪分析,研究人
来源:Nature Mental Health
时间:2025-09-09
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三种叶甲虫谱系特异性正向选择靶点与其共享寄生蜂防御能力的对应关系研究
在自然界中,寄生蜂与宿主的军备竞赛是进化生物学中最激烈的对抗之一。寄生蜂通过产卵杀死宿主幼虫,而宿主则发展出复杂的免疫机制(如包囊反应)来抵抗入侵。然而,这种互作的遗传基础在非模式生物中仍知之甚少。三种近缘叶甲虫(Galerucella pusilla、G. tenella和G. calmariensis)为这一难题提供了独特视角:它们共享同一寄生蜂天敌Asecodes parviclava,却展现出截然不同的防御能力——G. pusilla能高效包囊蜂卵,G. calmariensis几乎无防御力,G. tenella介于两者之间。这种表型差异是否源于免疫基因的差异化进化?这正是Xuyue
来源:Heredity
时间:2025-09-09
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口服异维A酸治疗获得性真皮斑状色素沉着症的多中心回顾性研究:121例疗效与安全性分析
这项跨越全球七大区域的多中心研究,揭示了口服异维A酸在攻克获得性真皮斑状色素沉着症(ADMH)中的突破性表现。研究者们对2014-2024年间121例患者数据进行深度挖掘,发现每日20 mg剂量的异维A酸经过8个月治疗,能让所有Riehl黑变病(RM)患者和90.4%的扁平苔藓样色素沉着(LPP)患者告别色素困扰。特别令人振奋的是,63%的RM患者和33%的LPP患者获得了肉眼可见的显著改善。研究还发现了疗效的"黄金组合":病程短于5年、Fitzpatrick III-VI型皮肤(亚洲、拉丁美洲常见肤色)的患者对治疗响应更佳。就像精准解锁色素沉着的密码,局部病灶患者(p = 0.0012)和治
来源:Pigment Cell & Melanoma Research
时间:2025-09-09
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综述:增强园艺作物对复合非生物胁迫抗逆性的策略
1 引言气候变化导致干旱、盐碱和极端温度等非生物胁迫呈复合叠加趋势,造成全球园艺作物减产超50%。不同于单一胁迫,复合胁迫会产生协同(synergistic)、拮抗(antagonistic)或叠加(additive)效应,其机制涉及光合抑制、膜结构损伤及激素失衡。破解这一难题需整合育种、嫁接、纳米技术和生物刺激剂等跨学科策略。2 抗逆品种选育2.1 常规育种传统方法如群体选择和杂交育种已培育出多重抗性品种,例如耐旱热双胁迫的番茄品种"Pusa Sadabahar"。野生近缘种(如胡萝卜野生种)是重要抗性基因库,但存在育种周期长、成本高等局限。2.2 分子育种分子标记辅助选择(MAS)和全基因
来源:Physiologia Plantarum
时间:2025-09-09