• 匈牙利黑头鸥（Chroicocephalus ridibundus）中具有IV型内部核糖体进入位点（IRES）的新型禽杯状病毒基因组

  在本研究中，研究人员利用下一代测序（Next Generation Sequencing, NGS）、逆转录聚合酶链反应（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, RT-PCR）和Sanger测序方法，在匈牙利采集的黑头鸥（Chroicocephalus ridibundus）粪便标本中检测并鉴定了一种分类学上新型的禽杯状病毒。杯状病毒株gull/HA15097/HUN/2018（PZ810127）的完整基因组长度为8,845个核苷酸，长度显著突出，其5′端具有IV型内部核糖体进入位点（Internal Ribosomal Entry S

  来源：Archives of Virology

  时间：2026-09-04

• 线粒体单倍型与青海巴美猪的肠道微生物群落组成及生长相关性状相关

  摘要背景肠道微生物受宿主遗传和环境因素的影响，可能与生长相关性状有关。本研究分析了 108 头在相同条件下饲养的成年青海巴美猪，以评估线粒体单倍型、肠道微生物群与生长相关性状之间的关联。基于线粒体 DNA (mtDNA) D-环变异的单倍型鉴定出六个单倍型，单倍型多样性 (Hd) 和核苷酸多样性 (Pi) 值分别为 0.553 和 0.199%，表明群体遗传多样性较高 (Hd 0.5)。结果选择了三个主要单倍型 (Hap1, n = 68; Hap2, n = 12; Hap5, n = 22) 进行肠道微生物群比较。观察发现单倍型之间多样性存在显著差异 (P < 0.05)。在门水平上，Ha

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 整合转录组学和蛋白质组学分析揭示了ω-3多不饱和脂肪酸抑制白色念珠菌生物膜形成过程中氧化磷酸化作用的改变

  摘要 背景 Candida albicans 生物膜对传统抗真菌药物具有极高的耐受性，这给临床治疗带来了巨大挑战。Omega-3 多不饱和脂肪酸（PUFAs），尤其是二十二碳六烯酸（DHA）和二十碳五烯酸（EPA），具有抗生物膜活性，但其作用机制尚未完全明了。 方法 本研究采用整合的转录组学和蛋白质组学方法来探究 DHA 和 EPA 对 C. albicans 1 mM）处理后的生物膜细胞接受了 RNA-seq 和 DIA 蛋白质组学分析，确定了差异表达的基因（DEGs）和蛋白质（DEPs），并进行了 KEGG 通路分析。 结果 在 1 mM 的浓度下，DHA 和 EPA 均能抑制生物膜的

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 从岩盐中分离的耐盐植物促生细菌弗氏柠檬杆菌 S5 用于缓解小麦 (Triticum aestivum L.) 盐胁迫的基因组与生理学研究

  摘要全球范围内，盐渍化是土壤退化的主要原因之一，威胁着农业和粮食安全。盐胁迫影响植物的离子和渗透平衡，对生理、形态和生化代谢产生负面影响。盐胁迫产生活性氧（ROS），损伤 DNA，导致植物细胞死亡，并最终降低作物生产力。耐盐植物生长促进细菌（ST-PGPB）因能缓解盐胁迫而广为人知。在本研究中，以喜马偕尔邦一处盐矿遗址的石盐为目标，用于分离 ST-PGPB。共分离出十二种细菌菌株，并选定了一种潜在的 PGPB Citrobacter freundii S5 用于本研究。 利用生理生长谱分析、PGP 属性和全基因组测序对 PGPB-S5 进行了生物勘探。此外，还评估了其在盐胁迫下对小麦（Trit

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• EnhancerDetector：通过可解释深度学习从人类到果蝇的增强子发现

  摘要背景解读增强子如何在 DNA 中编码调控信息仍然是基因组学的一个核心挑战，因为测序速度超越了功能注释。一个关键问题是增强子是否拥有一致的、基于序列的增强子相关特征——此处称为“增强子性（enhancerness）”——能够在不同物种、细胞类型和实验检测中将其与其他基因组区域区分开来。确认其存在性和可学习性在生物学上既是根本性的，也是可扩展基因组注释所必需的。结果我们引入了 EnhancerDetector，这是一个基于卷积神经网络的跨物种增强子预测框架，结合了高精度和生物学可解释性。在人类数据上训练的 EnhancerDetector 在人类、小鼠和果蝇数据集上均取得了强劲的表现，在精确率

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-04

• 使用含载脂蛋白E3的纳米盘靶向溶酶体膜蛋白酸性鞘磷脂酶

  研究人员开发了一种基于纳米盘（nanodisc, ND）的平台，将重组酸性鞘磷脂酶（acid sphingomyelinase, ASM）嵌入由载脂蛋白E3（apolipoprotein E3, apoE3）围绕的磷脂双层中，以实现向溶酶体的靶向递送。研究人员设计了一种融合蛋白，包含ASM的关键催化片段，其一端带有跨膜螺旋（transmembrane helix, TM-ASMcat）。纯化的TM-ASMcat与磷脂及apoE3的N端（N-terminal, NT）结构域重组，以促进ND的形成（TM-ASMcat-ND）。理化表征显示，制备物中同时存在TM-ASMcat（35 kDa）和apo

  来源：The Journal of Membrane Biology

  时间：2026-09-04

• 林麝（Moschus berezovskii）麝香分泌期间内分泌、代谢组学、取食、行为和肠道微生物组的协同变化及探索性个体内关联

  摘要背景雄性林麝会经历一个季节性的麝香分泌期，并伴有显著的生理和行为变化。然而，在此期间个体内部是否同时发生内分泌和代谢重塑、与摄食相关的变化以及肠道微生物组变化尚不清楚。我们对圈养成年雄性个体进行了个体内配对研究，采样时间分别为麝香分泌前和分泌期间，间隔约为三周。我们整合了血清激素谱、非靶向血清代谢组学、粪便 16S rRNA 基因测序以及饲养记录中的采食量、活动和休息时间，以表征这一季节性转变。结果与分泌前期相比，分泌期间血清中的睾酮、雌二醇和孕酮水平较高，而甲状腺素和皮质醇无显著差异。非靶向 LC-MS 谱显示，分泌期间雄激素结合物、2-甲氧基 -17β-雌二醇以及与皮质醇/可的松相关的

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 源自中国一例致死性人类病例的日本立克次体 YC21 株：比较基因组学与感染表型的实验表征

  摘要背景日本立克次体 引起日本斑点热 (JSF)，这是东亚新兴的一种严重蜱传疾病。我们最近从中国首例实验室确诊的致命性 JSF 病例中分离出了 YC21 株。本研究旨在表征这种单一临床来源分离株的基因组特征和感染表型，而不是为了确定其相对毒力。结果在系统发育上，YC21 聚类于第 III 支系，该支系包含所有中国分离株和一个日本株。第 II 和第 III 支系共享黏附蛋白基因 rOmpB/Sca5 中一个保守的 15 个碱基对缺失。YC21 基因组存在变异，包括在分析的数据集中确定的两个 YC21 特异性单核苷酸多态性 (SNPs) 以及表面抗原基因的改变。在体外，在标准化的 Vero 细胞实

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 玉米秸秆青贮过程中莠去津的转化及其对青贮微生物群落和饲料安全的影响

  ## 摘要阿特拉津是一种在玉米生产中广泛使用的三嗪类除草剂，用于饲料的玉米秸秆中的残留物可能危害饲草安全。然而，阿特拉津在青贮条件下的变化过程及其与发酵微生物群落的关系仍知之甚少。蜡熟期收获的玉米秸秆被分为未处理的对照组（CK）和三个添加阿特拉津的处理组，浓度分别为0.5 mg/kg鲜重（FM；1b）、2.5 mg/kg FM（5b）和5.0 mg/kg FM（10b）。在青贮后0、3、7、15、30和60天采集样品，定量检测阿特拉津母体化合物（ATZ）及其主要转化产物羟基阿特拉津（HA）、脱异丙基阿特拉津（DIA）和脱乙基阿特拉津（DEA）。同时测定了营养组成、发酵质量和好氧稳定性，并分别通

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 与绒山羊胚胎毛囊发育相关的细胞质lncRNA MSTRG.18075.2：真皮成纤维细胞表型及候选chi-miR-145-5p/WNT16调控轴

  摘要背景长链非编码 RNA（lncRNAs）是发育基因表达的重要调节因子，但它们在绒山羊胚胎毛囊形态发生的关键时期中的作用尚不清楚。本研究旨在鉴定与早期毛囊发育相关的时空特异性 lncRNAs，并评估一种候选细胞质 lncRNA 及其在体外真皮成纤维细胞模型中的潜在调节关系。结果时间筛选鉴定了 32 个候选 lncRNAs，它们在胚胎第 55 天表现出短暂、阶段特异性的表达变化，表明该阶段可能代表与胚胎毛囊形态发生相关的重要转录调节窗口。富集分析显示，在第 55 天与第 45 天以及第 65 天与第 55 天的比较中，Wnt 相关基因集呈正富集；然而，这一发现并不构成对 Wnt 通路活性的直接

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-04

• 用于短期致癌性评估的独立构建的携带突变人源 HRAS 基因的转基因小鼠模型的构建与评价

  摘要本研究旨在构建并评估一种独立生成的转基因小鼠模型，应用于短期致癌性评估。含有内含子点突变的突变人 HRAS 片段通过细菌人工染色体转基因技术插入 C57BL/6JGpt 小鼠中，最终生成了 BALB/c;B6J-Tg(hHRAS)16/Gpt 小鼠，简称 HRAS 小鼠。对 HRAS 小鼠中插入的人 HRAS 片段进行了表征，显示在 19 号染色体上有五个串联拷贝。收集了 HRAS 小鼠的基线概况，包括生化、血液学、免疫表型、生存和致癌数据。为了评估 HRAS 小鼠的肿瘤易感性，我们在根据良好实验室规范进行的短期致癌性评估中，对 HRAS 小鼠施加了 N-亚硝基-N-甲基脲 (MNU)。H

  来源：Transgenic Research

  时间：2026-09-04

• I型和II型菌毛在肺炎链球菌性脑膜炎的发病机制中，介导肺炎链球菌跨血脑屏障细胞的转运过程

  摘要背景肺炎链球菌是一种常见的病原体，可引发肺炎和中耳炎，同时也是人类细菌性脑膜炎的最主要致病菌。先前的研究表明，肺炎链球菌菌株可以是无菌毛的、具有I型菌毛的和/或具有II型菌毛的，而肺炎链球菌的菌毛能够促进其在宿主体内的附着并引发炎症。然而，肺炎链球菌菌毛在通过人体血脑屏障（BBB）迁移到脑部从而引发脑膜炎的过程中所起的作用尚不清楚。结果由于目前没有标准的、含有编码I型和II型菌毛相关基因的全基因组序列的肺炎链球菌菌株，因此从一名脑膜炎患者身上分离出一种血清型19F的肺炎链球菌菌株SP007，该菌株同时具有编码I型和II型菌毛的基因，并对其全基因组DNA序列进行了测序（GenBank: CP

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 噬菌体与抗生素联合使用对多重耐药尿路致病性肺炎克雷伯菌的协同作用

  ```摘要多重耐药病原体的全球威胁迫切需要新的控制策略。关于噬菌体与抗生素对这些病原体协同作用的研究正日益受到全球关注。本研究使用了两种先前分离并已鉴定的噬菌体——KPA和KP-PHA-Meh，来评估它们与低浓度头孢哌酮（cefepime）、庆大霉素（gentamicin）和美罗培南（meropenem）联合使用对从一名23岁女性患者尿液中分离出的多重耐药、产生生物膜的致病性Klebsiella pneumoniae菌株的抑制效果。当头孢哌酮浓度为8 μg或美罗培南浓度为1 μg，并与这两种噬菌体以MOI 0.1的比例联合使用时，能够完全抑制浮游细胞的生长；在这些抗生素的更低亚抑制浓度下，也观

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 整合的绝对定量肠道微生物群分析和靶向代谢组学研究揭示了患有幼年特发性关节炎的儿童体内微生物及代谢变化的特征

  摘要背景肠道微生物群的改变与幼年特发性关节炎（JIA）有关，但大多数先前的研究仅依赖于相对丰度分析，缺乏直接的代谢物验证。本研究旨在对JIA儿童的肠道微生物群及短链脂肪酸（SCFA）/有机酸的组成进行定量分析，并识别潜在的生物标志物。结果绝对定量分析显示，JIA儿童与对照组在α多样性方面存在显著差异，包括Pielou均匀度指数、Shannon指数和Simpson指数；而相对定量分析未检测到此类差异。β多样性指数Bray–Curtis差异性在两组间也有显著差异（PERMANOVA，P?

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 彩绘蟾蜍（Harlequin toads）先前感染箭毒蛙壶菌（Batrachochytrium dendrobatidis）会改变其免疫系统与微生物之间的平衡，并在再次感染时提高死亡率

  摘要对于那些需要保护的野生动物物种来说，亟需制定策略来提高它们在面临新出现传染病时的生存率。我们研究了皮肤真菌病原体Batrachochytrium dendrobatidis（Bd）的初次感染如何影响一种高度易感且极度濒危的蟾蜍Atelopus glyphus的后续疾病进程。实验设计包括以下几种情况：(1) 先感染Bd，随后使用伊曲康唑清除病原体并再次感染Bd（Bd-Bd组，n=20）；(2) 先进行模拟感染，然后使用伊曲康唑治疗再感染Bd（mock-Bd组，n=20）；(3) 先感染Bd，随后使用伊曲康唑清除病原体再进行模拟感染（Bd-mock组，n=10）；(4) 先进行模拟感染，然后使

  来源：BMC Genomics

  时间：2026-09-04

• 哈茨木霉中携带额外第三个dsRNA片段的新型partitivirus的分子表征

  **摘要**研究人员报道了从哈茨木霉（*Trichoderma harzianum*）NFCF092菌株中鉴定到的一种新型partitivirus的完整基因组序列，将其命名为哈茨木霉partitivirus 4（*Trichoderma harzianum* partitivirus 4，ThPV4）。与Partitiviridae科的典型成员不同——该科典型成员具有由两个双链RNA（double-stranded RNA，dsRNA）片段组成的双分体基因组，分别编码RNA依赖性RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRP）和衣壳蛋白（capsid prot

  来源：Archives of Virology

  时间：2026-09-04

• 综述：排出的食物泡作为源自原生动物的载体用于细菌持久性与传播

  摘要原生动物是水生、土壤和宿主相关环境中主要的细菌捕食者。在摄食过程中，细菌被内化进入食物泡，这些食物泡通常成熟为含有细菌消化所需分子机器的消化泡。然而，几种细菌物种能够抵抗这一过程，并被包裹在这些食物泡内从原生动物中排出，这些食物泡现在通常被称为排出食物泡（EFVs），以前被描述为“排出小泡”、“粪便颗粒”或“多层小体”。EFVs 不应简单地被视为原生动物消化的废物产物，而应被视为生物生成的储库，能够包装、保护并传播存活的致病菌。在本综述中，我们综合了关于霍乱弧菌、肠沙门氏菌、嗜肺军团菌、空肠弯曲菌、单核细胞增生李斯特菌、大肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌和耻垢分枝杆菌研究的证据，表明与 EFV 相

  来源：Microbial Ecology

  时间：2026-09-04

• 中国北京分离的流行百日咳鲍特菌菌株的生物膜形成与基因组特征

  摘要背景百日咳是由百日咳博德特氏菌（B. pertussis）引起的急性呼吸道感染，近期在中国再次流行。近期研究表明，生物膜形成与B. pertussis的发病机制有关。本研究旨在分析流行分离株的生物膜形成能力，并调查生物膜形成与基因组特征之间的表型 - 基因型关联。结果在 84 株B. pertussis分离株中，69.05% (58/84) 被归类为强生物膜形成菌，而 23.81% (20/84) 和 5.95% (5/84) 分别表现为中等或弱生物膜产生能力。仅有一株分离株 (1/84, 1.19%) 被归类为非生物膜产生菌。与非强生物膜形成分离株相比，强生物膜形成分离株表现出显著更快的

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 源自跳跃假鞘菌并在大肠杆菌中异源表达的重组软骨素酶 B 的生化特性及底物降解模式

  **摘要****背景**软骨素酶 B（CSase B）是一种能够从糖胺聚糖（GAGs）链上特异性切割硫酸皮肤素（DS）结构域的酶，在功能性寡糖制备以及 GAGs 结构和功能研究中发挥着重要作用。然而，迄今为止，仅报道了两种具有高特异性的野生型 DS 降解酶，一种是来自肝素土杆菌（*Pedobacter heparinus*）的 DS 降解酶 *cslB*，另一种是由施氏土杆菌（*Pedobacter schmidaeae*）产生的软骨素 B 裂解酶，名为 *Ps*ChonB。在本研究中，我们从跳跃假土杆菌（*Pseudopedobacter saltans*）中鉴定出一个 PL6 家族基因，命

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

• 生物功能性猫源短乳杆菌（Levilactobacillus brevis）菌株：伴侣动物的潜在益生菌食品辅料

  尽管自源（autochthonous）益生菌应用被认为是宿主特异性环境的标准，但异源（allochthonous）益生菌在自然消除前的通过期间也能提供有价值的生理或治疗益处。本研究评估了七株动物园猫科动物来源的短乳杆菌（Levilactobacillus brevis）菌株的益生菌及生物功能属性，以探讨其在伴侣动物或功能食品行业中的潜在应用。采用体外方法评估其在模拟胃肠道（GIT）条件下的存活率、安全性特征（溶血活性、DNase活性和抗生素敏感性）以及生物功能潜力（抗菌、抗氧化和降胆固醇活性）。所有菌株在溶菌酶（69.0%–96.7%）、胃液（60.7%–91.3%）和胆汁浓度（在1.8%胆汁

  来源：BMC Microbiology

  时间：2026-09-04

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