• 铁缺乏通过改变筛管细胞分化的基因调控网络调控植物生长的机制研究

  在自然界中，植物需要不断适应变化的环境条件来优化自身的生长发育。铁作为植物必需的微量元素，其缺乏不仅影响代谢过程，还会改变根毛、皮层和内胚层等细胞的分化模式。然而，铁缺乏如何调控细胞分化的分子机制尚不明确。筛管作为韧皮部的主要功能单位，其分化过程包括核降解、细胞壁增厚和筛孔形成三个关键阶段，为研究细胞分化提供了理想模型。发表在《Nature Communications》的这项研究，以拟南芥根系筛管为模型系统，深入探讨了铁缺乏如何影响筛管细胞分化的时空进程及其调控机制。研究人员开发了一套半自动图像分析方法，能够精确量化核形态变化与细胞分化进程的关联。为了解析铁缺乏影响筛管分化的调控网络，研究团

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• 高分辨率蛋白质组学揭示疟原虫感染致唾液腺结构破坏及唾液-血淋巴蛋白交换新机制

  在疟疾传播链中，疟原虫孢子体必须成功入侵蚊子唾液腺后才能传播给新的宿主。然而，这一关键阶段的生理和生化变化长期以来如同黑箱般难以窥探。随着杀虫剂耐药蚊株的出现，疟疾在一些地区死灰复燃，开发新的阻断传播策略迫在眉睫。唾液腺作为孢子体传播的瓶颈环节，其与寄生虫的相互作用机制亟待阐明。发表在《Nature Communications》上的这项研究，首次通过高分辨率蛋白质组学揭示了疟原虫感染对按蚊唾液腺的深远影响。研究人员发现，孢子体入侵不仅改变唾液腺蛋白质组成，更引发唾液与血淋巴之间前所未有的蛋白交换现象。这种交换源于孢子体对唾液腺结构的物理破坏，进而影响唾液的组成和功能，可能改变蚊子的吸血行为，

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• SLC45A4作为过氧化物酶体腐胺转运体调控GABA从头合成的新机制

  在细胞代谢的复杂网络中，溶质载体(SLC)转运蛋白家族扮演着至关重要的角色，它们如同细胞的"门户"，负责调控各种离子和代谢物跨膜运输。人类基因组中已有450多个SLC基因被注释，但令人惊讶的是，约30%的成员仍属于"孤儿转运体"——它们的生化功能和底物特性至今成谜。这种认知缺口严重制约了我们对细胞代谢调控网络的理解，也阻碍了相关疾病治疗策略的开发。SLC45A4正是这样一个充满谜团的转运蛋白。早期研究基于其与拟南芥蔗糖转运体的同源性，推测它可能是一种质子(H+)关联的蔗糖转运体。然而，这种推测与它在癌症中的复杂表现形成了鲜明对比：在骨肉瘤中SLC45A4表达与肿瘤抑制正相关，而在胰腺导管腺癌中

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• G4mer：基于RNA语言模型的转录组范围G四链体识别及疾病变异功能解析新工具

  在基因表达的复杂调控网络中，RNA G四链体(RNA G-quadruplexes, rG4s)作为一种重要的调控元件日益受到关注。这些由鸟嘌呤富集区域形成的特殊二级结构，在翻译调控、可变剪接和多聚腺苷酸化等关键生物学过程中发挥着重要作用。然而，由于技术限制，我们对于遗传变异如何影响rG4形成及其功能后果的理解仍然有限。传统计算方法往往难以准确预测非经典rG4亚型，且在长序列上的表现不佳，这限制了我们从全转录组层面系统解析rG4功能及其与疾病关联的能力。针对这一挑战，来自宾夕法尼亚大学和北卡罗来纳大学教堂山分校的研究团队在《Nature Communications》上发表了题为"G4mer:

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• 在天然无序肽中直接检测NH-π氢键：为蛋白质非经典相互作用提供实验证据

  在结构生物学的微观世界里，氢键如同维持蛋白质大厦的钢筋水泥，决定着蛋白质的立体结构和功能动态。然而，在众多氢键类型中，有一类特殊的非经典氢键——XH-π相互作用，特别是NH-π氢键，长期以来如同“暗物质”般存在：理论预测其广泛存在，但实验证据却寥寥无几。这类涉及π电子的氢键被认为在蛋白质的折叠、稳定和功能发挥中扮演着重要角色，尤其是在天然无序蛋白（IDP）中，它们可能为理解这些缺乏固定结构的蛋白质如何行使功能提供关键线索。传统上，科学家们主要关注的是常规氢键，即由电负性原子（如O、N）作为供体和受体的相互作用。而非经典的XH-π氢键，其中芳香环的π电子云作为氢键受体，其研究面临着巨大挑战。在折

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• 遗传性线粒体DNA突变重塑巨噬细胞炎症因子反应并加剧小鼠体内I型干扰素信号传导

  在我们身体的每个细胞里，都存在着一个微小的“能量工厂”——线粒体。它们不仅负责为我们提供能量，还扮演着细胞信号枢纽的重要角色。线粒体独特之处在于它们拥有自己的遗传物质，即线粒体DNA（mtDNA）。当这些mtDNA发生突变时，就会引起一系列被称为“原发性线粒体病”的罕见遗传性疾病，影响着大约每5000人中就有1人。尽管临床观察发现线粒体病患者更容易发生严重感染和全身性炎症反应综合征（SIRS），但科学家们对于遗传性mtDNA突变究竟如何影响我们的免疫系统，特别是先天免疫反应，了解甚少。巨噬细胞作为先天免疫系统的关键成员，其功能高度依赖于线粒体的代谢重编程。以往的研究多集中于核基因编码的线粒体蛋

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• Bacteroidota蛋白转运与滑行运动共享新机制：二硫键介导的外膜蛋白与移动轨道的共价偶联

  在人体肠道和自然环境中广泛存在的Bacteroidota菌门，既是重要的共生菌，也是牙周炎、败血症等疾病的机会性病原体。这类细菌拥有两大“看家本领”：一是通过滑行运动在固体表面快速移动，二是利用Type 9分泌系统（T9SS）将毒力因子等蛋白质转运至细胞表面。长期以来，学者们推测这两种过程共享能量传递链，但二者如何具体偶联仍是不解之谜。更令人困惑的是，非运动的致病菌（如牙周炎主要病原体Porphyromonas gingivalis）同样依赖T9SS，其能量传递机制是否与运动菌株存在进化关联？这一问题亟待解答。为揭开这一谜题，牛津大学Xiaolong Liu等研究人员聚焦于模式滑行细菌Flav

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• 结核分枝杆菌蛋白分泌新机制：ESX-4系统与外膜EsxUT-EsxEF超复合体协同调控致病性

  结核病作为全球最致命的传染病之一，其致病元凶结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）的生存策略一直是微生物学研究的热点。这种病原体通过复杂的蛋白分泌系统在宿主细胞内立足，其中ESX（Type VII secretion systems）家族的五套分泌系统尤为关键。传统观点认为，每套ESX系统独立运作，分泌特定效应蛋白执行不同功能：ESX-1介导吞噬体逃逸，ESX-3负责铁离子摄取，ESX-5转运PE/PPE蛋白等。然而，这种“各司其职”的模型无法解释病原体在感染过程中如何协调这些系统的时空激活。更令人困惑的是，结核菌的外膜通透性极低，效应蛋白如何跨越这道屏障始终是未

  来源：Nature Communications

  时间：2025-11-21

• HPV16病毒附着后中和机制研究：揭示Gardasil疫苗诱导抗体长效保护的关键

  人乳头瘤病毒（HPV）疫苗被誉为肿瘤防治领域的里程碑，其针对高危型HPV（如HPV16）引发的宫颈癌等疾病展现出近乎完美的防护效果。尤其令人惊奇的是，即使仅接种单剂疫苗，多数接种者也能建立持久的“灭菌免疫”，即终生不再受相应HPV型别感染。这种强大的保护力主要归功于疫苗诱导产生的高水平、持久存在的型别特异性中和抗体。然而，一个关键科学问题始终悬而未决：HPV感染过程异常缓慢，病毒从结合细胞表面到完成内化需要数小时之久，抗体是否能在病毒附着于细胞后仍能有效拦截感染？传统观点认为，中和抗体主要通过阻止病毒与细胞的初始结合来发挥作用。但美国国家癌症研究院（National Cancer Instit

  来源：npj Vaccines

  时间：2025-11-21

• 有限疫苗供应下的猴痘防控策略优化：单剂与双剂MVA-BN接种方案的比较研究

  猴痘病毒（MPXV）的持续爆发，特别是非洲中东部流行的分支I型病毒，已被世界卫生组织宣布为国际关注的公共卫生紧急事件。更令人担忧的是，该病毒在儿童中的病死率高达约2%，甚至更高。尽管第三代疫苗MVA-BN（Jynneos）在真实世界研究中显示出良好的保护效果——单剂有效性达74%，双剂达82%——但全球疫苗供应严重不足。以刚果民主共和国（DRC）为例，其人口超过1.1亿，而截至2025年2月，整个非洲仅收到约54万剂疫苗，远低于非洲疾控中心估计的控制疫情所需的1000万剂。在这种疫苗极度短缺的情况下，一个关键问题摆在了公共卫生决策者面前：是应该遵循传统的双剂接种方案（间隔4周），还是将有限的疫

  来源：npj Vaccines

  时间：2025-11-21

• CDKN2A相关肿瘤谱新发现：配对肿瘤-正常测序揭示双等位基因失活模式

  在遗传性肿瘤研究领域，CDKN2A基因一直被视为家族性非典型多痣黑色素瘤（FAMMM）综合征的关键驱动基因。该基因通过不同剪接方式编码两个重要的肿瘤抑制蛋白——p16INK4A和p14ARF，分别通过调控细胞周期和p53通路发挥抑癌作用。传统观点认为，CDKN2A胚系致病变异（PV）主要导致黑色素瘤和胰腺癌风险升高，但临床观察发现携带者还会出现神经系统肿瘤、肉瘤等多种恶性肿瘤，这引发了重要科学问题：这些非经典肿瘤是随机发生还是由CDKN2A驱动？不同异构体（p16INK4A vs p14ARF）是否对应不同的肿瘤谱系？解答这些问题对制定精准筛查策略至关重要。为系统揭示CDKN2A相关肿瘤谱系，

  来源：npj Precision Oncology

  时间：2025-11-21

• 结膜黑色素瘤基因组分析揭示中等肿瘤突变负荷及与皮肤黑色素瘤的基因组重叠

  在眼科肿瘤领域，结膜黑色素瘤（Conjunctival Melanoma, CJM）是一种极为罕见但极具侵袭性的恶性肿瘤。它起源于结膜基底层的黑色素细胞，仅占所有眼部黑色素瘤的5%-10%，每年发病率约为每百万人0.24至0.80例，并且在美国有上升趋势，这主要归因于紫外线辐射（Ultraviolet Radiation, UVR）暴露的增加。临床上，CJM既可以原发，也可以由原发性获得性黑变病（Primary Acquired Melanosis, PAM）或已有的痣恶变而来。尽管有效的局部治疗方法存在，但CJM以其高发病率和高死亡率著称，局部复发率高达40%，淋巴结转移率约为15%，疾病特

  来源：npj Precision Oncology

  时间：2025-11-21

• PathOrchestra：一个用于计算病理学的综合性基础模型，涵盖了100多种多样化的临床级任务

  PathOrchestra 是一种在病理学领域中具有广泛应用前景的新型基础模型，其设计和应用展示了人工智能在医疗诊断中的巨大潜力。随着病理图像的复杂性和多样性不断上升，传统的诊断方法在面对海量高分辨率图像时面临着诸多挑战，包括数据标注的困难、计算资源的高需求以及模型在临床场景中的适用性问题。PathOrchestra 通过其独特的训练策略和广泛的数据来源，成功克服了这些障碍，实现了对多种病理任务的高效处理和准确分类，为病理学领域的数字化和智能化提供了有力支持。PathOrchestra 的训练数据来源于三个不同的中心，涵盖了 21 种组织、器官和系统，共计 287,424 张全切片图像（WSI

  来源：npj Digital Medicine

  时间：2025-11-21

• 可解释AI困境：知识失衡下青光眼专科AI转诊辅助的挑战与启示

  在初级眼保健体系中，青光眼作为不可逆性致盲眼病，其早期识别与及时转诊至专科医生至关重要。然而当前面临双重挑战：一方面，眼科医生数量无法满足日益增长的筛查需求，验光师作为前线服务提供者，其转诊决策存在显著差异；另一方面，专科人工智能(AI)虽能通过分析视觉视野(VF)、光学相干断层扫描(OCT)等多模态数据实现高精度预测，但其依赖有限数据子集与潜在伪相关性的特点，与临床医生基于病理生理学知识和上下文经验的决策模式形成“知识失衡”。这种失衡导致人类与AI的协作效率受限——当人类性能低于AI时，使用者难以判断何时信任算法或坚持自身判断。为破解这一困境，约翰斯·霍普金斯大学团队在《npj Digita

  来源：npj Digital Medicine

  时间：2025-11-21

• 基于乳腺DCE-MRI早期肿瘤体积缩减预测三阴性乳腺癌新辅助治疗病理完全缓解的影像学生物标志物研究

  三阴性乳腺癌（TNBC）作为乳腺癌中侵袭性较强的亚型，约占所有乳腺癌病例的20%，其雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人表皮生长因子受体2（HER-2）表达均为阴性。新辅助系统治疗（NAST）已成为早期TNBC的标准治疗方案，不仅可降低肿瘤分期、提高保乳手术机会，还能通过体内评估治疗反应为预后提供重要参考。然而，TNBC具有高度异质性，患者对NAST的反应差异显著，病理完全缓解（pCR）率在18%至65%之间波动。实现pCR的患者通常预后更佳，但如何早期准确识别潜在pCR人群仍是临床面临的重大挑战。目前，动态增强磁共振成像（DCE-MRI）因其高软组织分辨率和可重复性，已成为监测乳腺癌治

  来源：npj Breast Cancer

  时间：2025-11-21

• 用于电子显微镜和荧光显微镜的多路复用遗传标签

  摘要本协议为研究人员提供了全面的指导，包括那些电子显微镜（EM）经验有限的研究人员，帮助他们有效地在荧光显微镜和电子显微镜工作中使用基因编码的多通道EMcapsulin报告基因。EMcapsulins是一组模块化的基因报告基因，在细胞培养或模式生物中表达时会在电子显微镜下呈现出不同的形态。本协议详细介绍了如何用荧光EMcapsulins标记感兴趣的细胞或蛋白质，并提供了生化质量控制措施。研究人员还可以根据具体的实验需求调整该协议，以开发定制的EMcapsulin构建体。

  来源：Nature Protocols

  时间：2025-11-21

• FGF8/FGF受体信号通路在融合阳性横纹肌肉瘤的维持和进展中的作用 可供购买

  摘要 我们之前使用了一种融合阳性横纹肌肉瘤（FP-RMS）的肌母细胞模型来证明，FGF8（PAX3-FOXO1（P3F）转录靶点）对于P3F驱动的肿瘤发生是必需的；当FGF8异常表达时，它还能在不受P3F影响的复发性肿瘤中维持肿瘤发生能力。在本研究中，我们发现FGF8、FGFR1和FGFR4在FP-RMS肿瘤中通常高表达。FP-RMS细胞中高水平的FGF8表达使其对FGFR4抑制剂和泛FGFR抑制剂具有高敏感性。虽然下调FGF8会导致对这些抑制剂的敏感性

  来源：Molecular Cancer Therapeutics

  时间：2025-11-21

• MCT8 调节代谢物的吸收和 T 细胞的耗竭，从而促进肝细胞癌中的免疫抑制和肿瘤进展 可购买

  摘要 溶质转运蛋白家族16的成员2（SLC16A2），也称为单羧酸转运蛋白8（MCT8），属于SLC16家族，其在细胞营养物质的运输中发挥着重要作用。本研究探讨了SLC16A2在肝细胞癌（HCC）进展中的作用，特别是其对T细胞功能的影响。我们构建了Slc16a2基因敲除（Slc16a2ko）的C57BL/6小鼠，并通过皮下注射H22细胞来分析体内肿瘤生长和T细胞活性。此外，还将Slc16a2fl/fl小鼠与Cd8aCre小鼠杂交，得到了Slc16a2-C

  来源：Molecular Cancer Therapeutics

  时间：2025-11-21

• 精神疾病大脑的“脑震”：时空复杂性视角下信息整合与分离失衡的发现

  人类大脑，这个宇宙中已知最复杂的系统，其精密的时空组织方式一直是科学家们探索精神疾病病理生理机制的核心。精神分裂症(Schizophrenia, SZ)和双相情感障碍(Bipolar Disorder, BP)等精神疾病，临床表现多样且缺乏可靠的生物标志物，给精准诊断和治疗带来了巨大挑战。近年来，神经影像学技术的飞速发展揭示，特定脑区的时空动力学改变可能是SZ和BP发生和发展的关键。其中，大脑功能连接，即不同脑区在活动上的协同性，被认为是精神疾病的标志性特征之一。然而，传统的基于皮尔逊相关性的功能连接分析主要捕捉的是脑区之间的两两线性关系，难以全面揭示大脑内复杂的高阶相互作用。大脑作为一个高度

  来源：Molecular Psychiatry

  时间：2025-11-21

• 新型基因疗法AVGN7.2的临床前安全性评估：AAV6载体在肌肉萎缩疾病中的毒理学与生物分布研究

  在肌肉萎缩疾病治疗领域，散发性包涵体肌炎（sporadic inclusion body myositis, IBM）作为一种严重影响中老年人群的进行性肌肉退化疾病，至今缺乏有效的药物治疗方案。传统免疫抑制剂不仅无法阻止肌肉萎缩，甚至可能加重病情，这使得开发新型治疗策略迫在眉睫。在这一背景下，基因治疗技术为解决这一难题提供了新的希望。本研究聚焦于一种名为AVGN7.2的新型基因治疗药物，该药物通过肌肉趋向性AAV6（腺相关病毒血清型6）载体递送人源SMAD7基因，利用肌肉特异性CK8启动子实现靶向表达。SMAD7作为activin受体信号通路的关键负调控因子，在肌肉蛋白质合成与降解平衡中发挥重

  来源：Gene Therapy

  时间：2025-11-21

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