• 揭秘植入物与骨组织的 “互动密码”：Mg 基和 Ti 植入物周围骨生长及矿化的计算模型研究

  在生物医学领域，植入物是帮助骨骼愈合的重要手段。然而，目前对于植入物与人体组织之间的相互作用，尤其是骨组织的愈合和重塑过程，仍存在诸多未知。传统的实验研究不仅成本高昂、耗费大量人力，而且难以全面深入地探究其中复杂的机制。在研究可降解植入物材料时，如何准确评估其在体内的降解过程以及对周围骨组织的影响，成为了科研人员面临的一大挑战。同时，不同类型植入物，如可降解的镁（Mg）基合金和永久性的钛（Ti）植入物，在促进骨愈合方面的效果差异也亟待明确。正是在这样的背景下，为了深入了解植入物与骨组织的相互作用机制，优化植入物设计，提高骨愈合治疗效果，相关研究人员开展了此项研究。研究人员来自多个国外机构，他们

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 拓扑熵：革新图划分助力 TAD 识别与单细胞聚类的关键力量

  在生命科学研究的广袤领域中，生物图结构的复杂性一直是困扰科研人员的难题。比如在研究基因组时，Hi-C 接触图谱能形成基因组区域的有序图，从中识别拓扑相关结构域（TADs）至关重要，因为 TADs 与表观遗传和转录活动密切相关，其边界变化可能引发癌症和发育障碍。然而，现有方法在捕捉生物图复杂结构细节方面存在不足，像一些基于熵的 TAD 识别方法，面对噪声时效果不佳。在单细胞研究领域，单细胞测序技术虽为解析细胞功能多样性带来机遇，但现有聚类方法也存在缺陷，比如部分方法对噪声敏感，还有些需要预先设定聚类数或计算后才能确定聚类数 ，缺乏能同时具备多种功能的方法。为了突破这些困境，研究人员开启了一项意义

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 揭秘基因组语言模型：谁是预测 G - 四链体的 “最佳选手”？

  在生命科学的神秘领域中，基因组学研究一直是探索生命奥秘的关键路径。随着深度学习技术的飞速发展，大语言模型（LLMs）在基因组学领域逐渐崭露头角，它们就像拥有神奇魔力的 “解码器”，试图解读基因组中隐藏的各种信息，预测不同的功能基因组元件。然而，目前有一个棘手的问题摆在研究者面前：面对种类繁多的 LLMs，哪一种才是最适合特定下游任务的 “得力助手” 呢？尤其是在生成全基因组注释这项复杂而重要的工作中，选择合适的模型更是至关重要。这个问题就像一把尚未解开的锁，阻碍着基因组学研究进一步深入发展。为了攻克这一难题，来自国外的研究人员踏上了探索之旅，他们聚焦于 G - 四链体（GQ，一种非 B DNA

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 基于AlphaFold与加速分子动力学模拟的真菌疏水蛋白I/II类结构解析及构象动态研究

  在真菌王国中，疏水蛋白(HFB)是一类具有"生物表面活性剂"特性的神奇分子。这些7-15 kDa的小蛋白能自发在气液界面形成两亲性单层膜，帮助真菌形成疏水性孢子、菌丝等结构，在自然界中扮演着"分子建筑师"的角色。尽管HFB在生物传感器涂层、药物递送系统和医疗植入物等领域展现出巨大应用潜力，但科学界对其精确三维结构的认知仍存在显著空白——蛋白质数据库(PDB)中仅有少数HFB结构被解析，且传统同源建模方法往往只能预测具有序列相似性的区域。面对这一挑战，匈牙利的研究团队将目光投向了人工智能辅助的结构预测技术。他们选取了具有代表性的4种HFB蛋白：来自Schizophyllum commune的SC

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 精准优化蛋白质组学缺失值填补策略：提升质谱数据分析可靠性

  在生命科学研究的大舞台上，蛋白质组学就像一位神秘的舞者，通过研究蛋白质的各种特性，为我们揭示细胞活动的奥秘，帮助我们理解生理变化、疾病机制，甚至找到治疗疾病的关键靶点。基于质谱（MS）的蛋白质组学技术，更是为研究人员提供了高分辨率的 “显微镜”，能对生物样本中的肽、蛋白质等进行高通量定量分析。然而，这个 “显微镜” 却存在一个棘手的问题 —— 缺失值（MVs）。在蛋白质组学数据中，MVs 频繁出现，就像在精美的画卷上出现了许多斑点，严重影响了数据的完整性和后续分析的可靠性。这些缺失值产生的原因多种多样，比如肽的含量可能低于仪器的检测极限，样本处理过程中蛋白质的降解或酶解不完全，还有数据处理时未

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• LongReadSum：长读长测序数据质量控制与信号汇总的高效利器

  近年来，长读长测序技术取得了显著进展，牛津纳米孔技术（Oxford Nanopore Technologies，ONT）和太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences，PacBio）的技术让人们能够对长达数十到数千碱基对（kb）的序列进行高精度测序。2023 年，Illumina 也推出了自己的高精度 Complete Long Read 技术。这些技术的进步使得长读长测序在基因组学研究中得到了广泛应用，例如在基因组组装、变异检测、甲基化分析等方面发挥着重要作用。然而，长读长测序数据的质量控制面临诸多挑战。一方面，虽然有一些针对短读长测序数据的成熟 QC 工具，如 FastQC，

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 探索三阴乳腺癌基因奥秘：种族差异与关键靶点的深度解析

  在乳腺癌的研究领域中，三阴乳腺癌（TNBC）如同一个棘手的难题，一直困扰着科学界。TNBC 是乳腺癌中最具侵袭性的亚型，在非裔美国女性群体中尤为猖獗。与白人女性相比，非裔美国女性患 TNBC 的风险更高，死亡率更是高出 40%，且在 40 岁以下的非裔美国女性中，乳腺癌的发病率在所有种族里位居榜首。更令人担忧的是，即使考虑到营养、医疗资源获取等社会经济因素，这种死亡率的差异依然显著存在。以往大多数关于乳腺癌相关基因的研究，主要基于欧洲裔患者的样本，导致研究结果难以推广到其他种族背景的患者身上。此外，从有限的数据集中提取准确全面的信息也困难重重。为了攻克这些难题，来自国外研究机构的研究人员开展了

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• AI 助力流感抗体活性预测：开启精准免疫治疗新篇章

  在流感病毒肆虐的当下，流感 A 病毒给全球健康带来了巨大挑战。它每年在美国就影响约 2000 - 4000 万人，且由于其快速突变和动物宿主传播，在资源有限国家易引发严重疾病甚至死亡。单克隆抗体（mAbs）作为治疗多种疾病的有力武器，在流感防治方面也极具潜力，然而其研发过程漫长且成本高昂。传统的预测抗体与抗原结合活性的方法，如分子动力学（MD）和分子对接等，要么计算成本高，要么准确性欠佳。在这样的背景下，开发高效准确的预测模型迫在眉睫。国外研究人员开展了一项旨在利用人工智能（AI）模型预测抗流感 A 血凝素（HA）抗体结合和受体阻断活性的研究。研究成果发表在《Computational and

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 综述：多孔碳模型的新视角

  1. 引言活性炭（AC）凭借高比表面积（500 - 3000 m²/g）、可调节孔隙率（微孔 < 2nm 至介孔 2 - 50nm）以及可修饰的表面化学性质，在环境、能源和工业领域应用广泛。然而，其复杂的层级结构给精确表征和原子尺度建模带来挑战。传统实验技术，如 X 射线衍射（XRD）、高分辨率透射电子显微镜（HRTEM）和拉曼光谱等，虽能提供部分结构信息，但存在空间分辨率限制或无法实时捕捉分子动力学等问题。先进计算方法，像巨正则蒙特卡罗（GCMC）、分子动力学（MD）和混合反向蒙特卡罗（HRMC）等，整合实验数据与物理化学原理，推动了活性炭研究的发展。1.1. 活性炭的形成活性炭主要由碳原子

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 基于自回归模型的激酶 - 底物预测：解锁细胞信号通路的关键密码

  在生命的微观世界里，细胞时刻进行着复杂而有序的活动，其中激酶特异性磷酸化扮演着至关重要的角色。它如同精密的开关，调控着细胞信号传导，维持细胞的正常生理功能。一旦这一过程出现异常，就如同开关失灵，各种疾病便可能乘虚而入，像癌症、糖尿病、神经退行性疾病以及发育障碍等。然而，目前科学家们面临着一个棘手的问题：即使在研究较为深入的模式生物中，大多数激酶的底物仍然是未解之谜。而且，现有的预测激酶 - 底物关系的方法并不可靠，传统的计算方法往往聚焦于特定位点的磷酸化预测，存在诸多局限性，比如依赖预定义且不完整的激酶 - 底物关系，使用短肽来代表底物，忽略了激酶与蛋白质底物之间更广泛的相互作用等 。为了攻克

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 发现与解析：毕赤酵母（Komagataella phaffii）中与生长速率相关的长链非编码 RNA（lncRNAs）

  在生命科学的微观世界里，长链非编码 RNA（lncRNAs）宛如神秘的精灵，虽不编码蛋白质，却在众多细胞过程中施展着关键魔法。近年来，随着研究的深入，lncRNAs 在真核生物中的多样作用逐渐崭露头角，在酵母这类单细胞生物的研究中也取得了不少进展。不过，在工业生产中常用的非传统酵母 —— 毕赤酵母（Komagataella phaffii）里，lncRNAs 却像是被隐藏在迷雾之中，有待进一步探索。此前，虽有研究尝试对毕赤酵母的 lncRNAs 进行注释，但都存在局限性。比如，Schneider 团队受 RNAseq 数据文库制备方法的限制，对反义 lncRNAs 的注释不够准确；Sun 团队

  来源：Computational and Structural Biotechnology Journal

  时间：2025-05-07

• 玉米淀粉和 κ- 卡拉胶包封益生菌对奇努克鲑生长与免疫的影响：开拓水产养殖新路径

  在水产养殖业蓬勃发展的当下，却遭遇了疾病频发的困境。随着养殖规模不断扩大，各种病毒、细菌和寄生虫引发的疾病接踵而至，给养殖户带来了巨大损失。传统上，人们依靠疫苗和抗菌药物来对抗这些疾病，可近年来，这些方法逐渐暴露出诸多问题。一方面，疫苗和抗生素的效果越来越不尽如人意，病原体不断进化，对它们产生了抗性；另一方面，这些药物在环境中的残留，对生态环境造成了破坏，还可能威胁人类健康。在这样的背景下，寻找替代策略迫在眉睫，益生菌作为一种绿色、安全的选择，进入了科研人员的视野。来自国外研究机构的研究人员，针对玉米淀粉和 κ- 卡拉胶作为益生菌包封剂，开展了一项针对奇努克鲑（Oncorhynchus tsh

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 揭秘大口黑鲈 MsCL-P1：多功能 C 型凝集素在免疫防御中的关键作用

  在水产养殖的广阔天地里，大口黑鲈（Micropterus salmoides）可是一位 “经济明星”，尤其在中国和亚洲等地区，它为养殖户们带来了可观的收益。然而，就像平静的湖面总会泛起涟漪，疾病成了大口黑鲈养殖产业的 “拦路虎”。这些疾病不仅威胁着大口黑鲈的健康，还影响着养殖产业的可持续发展。为了深入了解病原体与宿主之间的 “战争”，探寻大口黑鲈体内关键的免疫奥秘，研究人员踏上了探索之旅。此次研究成果发表在《Comparative Immunology Reports》上。在这场探索中，研究人员主要运用了序列分析、重组蛋白表达与纯化、酶联免疫吸附测定（ELISA）、凝集试验、碳水化合物结合特异

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 生物絮团养殖与海水养殖牙鲆受无乳链球菌感染后的生理变化差异及意义探究

  在水产养殖的世界里，牙鲆（Paralichthys olivaceus）是一种重要的养殖鱼类。然而，细菌疾病却如同隐藏在暗处的 “杀手”，时刻威胁着牙鲆的健康，给水产养殖业带来巨大的经济损失。其中，无乳链球菌（Streptococcus iniae）作为一种危害极大的病原菌，可引发多种鱼类疾病，导致大规模死亡。在传统的海水养殖模式下，面对病原菌的侵袭，牙鲆的健康状况令人担忧。而新兴的生物絮团养殖技术，被认为有可能为鱼类提供更好的保护，减少疾病的侵害。但这一技术在应对无乳链球菌感染时，效果究竟如何呢？二者之间存在哪些差异？这些问题亟待解决，这也促使研究人员开展了相关研究。来自国外研究机构的研究人

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 禁食与不同光周期对家蟋蟀免疫功能的影响：关乎养殖与健康的重要发现

  在当今世界，人口数量不断增长，寻找新的蛋白质来源变得愈发重要。昆虫，因其丰富的营养价值，逐渐成为备受瞩目的潜在食物资源。家蟋蟀（Acheta domesticus）凭借其易于养殖和高营养的特点，更是成为了人们关注的焦点。然而，在昆虫养殖的过程中，却存在着诸多问题。一方面，食用昆虫时的食品安全问题引发担忧。由于昆虫肠道内微生物负载较高，可能会对人体健康造成潜在威胁。为了解决这一问题，人们通常会在昆虫安乐死前对其进行 24 - 48 小时的禁食处理，希望借此减少微生物数量。但近期研究发现，禁食对家蟋蟀的微生物负载并无影响，反而可能影响昆虫的行为和福利，还可能对其免疫系统造成潜在风险。另一方面，昆虫

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 150mg/kg 角黄素添饲，开启日本沼虾生长与免疫提升新篇

  在水产养殖领域，提升甲壳类动物的生长和免疫性能一直是备受关注的重要课题。随着人们对水产品需求的不断增加，如何让养殖的虾类等生物更健康、生长更快，成为了科研人员努力攻克的难题。就拿日本沼虾来说，它是一种具有重要经济价值的淡水虾类，生长速度相对较快，对低温有一定耐受性，繁殖周期较短，在多个国家的淡水水域都有分布，是极具养殖潜力的品种。但在实际养殖过程中，要想充分发挥其养殖优势，还面临诸多挑战，其中开发适合它的专用饲料，以促进其在养殖条件下的生长，就是亟待解决的关键问题。在此背景下，来自国外的研究人员针对这一现状展开了深入研究。他们以日本沼虾为研究对象，聚焦角黄素这一从海洋藻类、蘑菇等提取的天然类胡

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• PACAP-38 饲料对大西洋鲑抗肠炎红嘴病免疫作用的关键突破

  在水产养殖蓬勃发展的当下，却面临着诸多严峻挑战。水产养殖作为全球增长最快的食品产业，2023 年全球产量高达 1855 万吨，为数百万人提供生计，对保障粮食可持续性意义重大。然而，细菌感染和疾病爆发成为集约化养鱼的 “心腹大患” 。像肠炎红嘴病（ERM），由 Yersinia ruckeri 引发，会给鲑鱼养殖带来惨重损失，患病鱼会出现眼球突出、口腔和喉咙皮下出血等症状。长期以来，抗生素广泛用于治疗水产疾病，但这也导致了抗菌耐药（AMR）问题日益严重，水生环境中 90% 的细菌至少对一种抗生素耐药。因此，寻找替代治疗方法迫在眉睫。在此背景下，国外研究人员开展了一项关于两种不同 PACAP-38

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 揭秘早期脊椎动物中 Caspase 3 对 Gasdermin Ec 的调控机制：开启细胞焦亡研究新视角

  在生命科学的微观世界里，细胞死亡的调控机制一直是科学家们关注的焦点。细胞焦亡（pyroptosis）作为一种程序性坏死性细胞死亡方式，在免疫防御和炎症反应中扮演着关键角色。Gasdermin（GSDM）家族则是执行细胞焦亡的重要 “执行者”，其成员通过形成孔道，导致细胞肿胀、膜破裂并释放促炎细胞因子，引发炎症免疫反应。在这个大家族中，GSDME 从鱼类到哺乳动物广泛存在。鱼类作为早期祖先脊椎动物，拥有独特的 GSDME 同源物，如 GSDMEa、GSDMEb 和最近发现的 GSDMEc。其中，GSDMEc 仅在部分鱼类中存在，它的功能和调控机制却如同神秘的 “黑匣子”，让科研人员充满好奇又困惑

  来源：Comparative Immunology Reports

  时间：2025-05-07

• 综述：回收炭黑：活化、脱矿及在橡胶基体中应用的全面综述

  1. 引言近年来，汽车行业蓬勃发展，2022 年轮胎产量超 23 亿条。大量废旧轮胎（ELT）产生，其处理成为难题。部分 ELT 被非法丢弃或堆放，占用填埋空间、引发火灾、污染环境。欧盟等地区通过立法促进 ELT 的材料和能源回收。轮胎主要由硫化天然橡胶、丁苯橡胶（41 - 45%）、钢（13 - 15%）、炭黑（约 28%）及其他化合物组成。目前，ELT 的回收方式包括机械回收、能源回收和热解。机械回收生产的橡胶颗粒在合成草皮等应用中引发担忧；能源回收存在污染问题。热解则可产生能源和有市场价值的产品，如回收炭黑（rCB），成为一种有前景的回收方式。2. 热解制备 ELT：原始 rCB 与商业

  来源：Carbon Resources Conversion

  时间：2025-05-07

• 生命早期感染住院与青壮年癌症风险降低的关联：一项基于丹麦人群的队列研究

  论文解读癌症发病率在青壮年群体中的持续攀升已成为全球公共卫生焦点。尽管筛查技术进步部分解释了这一现象，但越来越多的证据表明，生命早期的环境暴露可能在癌症发生中扮演关键角色。尤其引人注目的是，急性感染与慢性感染的致癌作用似乎存在"双刃剑"效应——前者可能具有保护作用，而后者如HPV（人乳头瘤病毒）和EBV（Epstein Barr病毒）则明确与特定癌症相关。然而，关于儿童期急性感染与成年后癌症风险的关联，既往研究受限于回顾性设计、样本量不足及回忆偏倚等问题，亟需高质量的前瞻性证据。在此背景下，丹麦哥本哈根大学医院领衔的研究团队开展了一项开创性工作。研究者利用覆盖1930-1996年出生人群的哥本

  来源：Cancer Epidemiology

  时间：2025-05-07

知名企业招聘：