-
基于分类器驱动生成对抗网络的抗菌肽优化设计新策略
在抗生素耐药性危机日益严峻的今天,抗菌肽(AMP)作为传统抗生素的有力替代品备受关注。这些天然存在的短肽分子具有广谱抗菌活性,其通过破坏细菌细胞膜发挥作用的机制大大降低了耐药性发展风险。然而,将抗菌肽成功转化为临床治疗药物面临重大挑战:许多在实验室表现出优异抗菌活性的肽类在体内应用中因对宿主细胞的毒性作用(特别是溶血活性)而失败。这种疗效与安全性的平衡成为抗菌肽设计的核心难题。传统计算方法如反馈生成对抗网络(FBGAN)在抗菌肽生成方面展现出潜力,但其基于预设阈值的序列选择机制存在固有缺陷。这种"筛选-替换"策略可能导致模型过度拟合已知模式,限制新肽序列的多样性,同时分类器的误判可能引入噪声数
来源:Briefings in Bioinformatics
时间:2025-10-26
-
细胞外囊泡:组织稳态中细胞间通讯的复杂粒子阵列
部分亮点一些在生理性组织稳态中描述的EVs功能自20世纪90年代末和21世纪初的这些开创性研究以来,在广泛的生理和病理情况中,关于EVs功能的报道日益增多。胚胎发育是最早的例子之一,研究表明EVs携带脂质结合形态发生素(Greco等人,2001;Matusek等人,2014)(近期综述见Gustafson和Gammill,2022;Cooper和Scholpp,2024)。然而,有更多的研究描述了EVs在成年期生理学中的作用:近期……一个悬而未决的问题:EVs在体内释放时的作用尽管有大量研究在体外描述了EVs的生理功能,但EVs在体内情况下对细胞间通讯过程的实际贡献,由于操纵EVs释放仍然具有
来源:Cells & Development
时间:2025-10-26
-
Mincle受体介导的炎症反应在金黄色葡萄球菌骨感染中的作用机制研究
在骨科感染领域,金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是最常见的骨髓炎致病菌,其感染会引发严重炎症和进行性骨破坏。传统观点认为,骨组织中的成骨细胞(osteoblasts)和破骨细胞(osteoclasts)主要承担骨形成和骨吸收功能。然而近年研究发现,这两种骨细胞同样具备免疫调节功能,能够通过表达模式识别受体(PRR)感知病原体相关分子模式(PAMP),在感染引发的异常骨重塑中发挥关键作用。其中,巨噬细胞诱导性C型凝集素(Mincle)作为一种与酪氨酸激活基序耦合的PRR,能识别多种病原体的糖脂成分并启动炎症介质产生,但在骨细胞中的功能尚未明确。为阐明骨细胞是否通过Mi
-
光诱导电子转移增强含Ir(III)复合物和羧基荧光素的Bombesin金属肽的肿瘤靶向光动力活性
癌症治疗一直是医学界面临的重大挑战,传统的化疗方法虽然有效,但往往伴随着严重的全身性毒性反应,这限制了药物剂量并影响了治疗效果。正是在这样的背景下,光动力疗法(PDT)作为一种具有高时空精度的局部治疗手段,受到了越来越多的关注。PDT的核心在于光敏剂(PS),它在特定波长的光照射下,能利用组织中的氧气产生具有细胞毒性的活性氧(ROS),如单线态氧(1O2),从而选择性杀伤癌细胞。然而,第一代光敏剂,如基于卟啉的衍生物,存在组织穿透深度浅、光捕获能力差以及肿瘤靶向性不足等局限性,这大大限制了其疗效。为了克服这些障碍,科学家们将目光投向了新型光敏剂的设计。其中,具有[Ir(C^N)2(N^N)]+
来源:Bioorganic Chemistry
时间:2025-10-26
-
L-NAME口服补充加速糖尿病小鼠肾病进展:一种新型可诱导疾病模型的建立与评价
结果L-NAME治疗导致血压升高、肾功能下降及蛋白尿增加与对照组相比,接受两种剂量L-NAME治疗的小鼠体重增加更少(图1.A),饮水量也有所减少(图1.B)。血糖水平(图1.C)未受L-NAME浓度影响。两种剂量的L-NAME均导致脉搏下降(图1.D),但只有80mg/kg/天的剂量显著升高了收缩压(图1.E)。此外,L-NAME治疗显著降低了肾小球滤过率(GFR)(图1.F),并提高了尿 albumin-to-creatinine ratio(图1.G),表明肾功能受损。L-NAME诱发肾脏组织学病变肾脏切片的过碘酸雪夫(PAS)染色显示,接受80mg/kg/day L-NAME治疗的小鼠
来源:Biochemical and Biophysical Research Communications
时间:2025-10-26
-
叶绿体酪蛋白激酶2(Chloroplast CASEIN KINASE 2)通过sHSP26的磷酸化作用及逆向调节HSFA3来增强玉米的热耐受性
摘要 叶绿体对热胁迫非常敏感。虽然我们之前已经证明,定位于叶绿体中的小热休克蛋白26(sHSP26)能够保护玉米(Zea mays)的光合系统免受热损伤,并且会经历热胁迫诱导的磷酸化作用,但这种磷酸化作用所涉及的激酶及其在玉米耐热性中的功能意义仍然不清楚。在这项研究中,我们发现了玉米中一种定位于叶绿体的酪蛋白激酶2(cpCK2)。ZmcpCK2的表达在ABA和热胁迫下会上调。遗传学证据表明,与野生型植物相比,Zmcpck2-KO系在热胁迫下表现出更严重的叶绿体结构损伤、较低的ABA含量以及更高的热敏感性。值得注意的是,ABA预处理可
来源:Plant Physiology
时间:2025-10-26
-
新型eRF3a降解剂CC-90009联合低剂量庆大霉素增强表皮松解症无义突变通读治疗
在遗传性皮肤疾病领域,隐性营养不良型表皮松解症(Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa, RDEB)和交界型表皮松解症(Junctional Epidermolysis Bullosa, JEB)因基因突变导致皮肤脆性增加,患者终身伴随严重水疱和瘢痕形成。其中,无义突变(Nonsense Mutation)引发的提前终止密码子(Premature Termination Codon, PTC)是重要致病机制之一,约占RDEB病例的25%,而在JEB的LAMB3基因突变中占比高达80%。此类突变使mRNA翻译提前终止,生成截短且无功能的蛋白,如Ⅶ型胶
来源:Molecular Therapy Nucleic Acids
时间:2025-10-26
-
多尺度分子动力学模拟确定了SNX-482/KV4.3的结合决定因素
摘要门控修饰肽毒素优先结合到电压感应域KV4.3电压门控钾通道上,但这种相互作用的分子机制仍不清楚。通过无约束的多尺度分子动力学(MD)模拟,我们能够重现门控修饰毒素(如来自巨型狼蛛Hysterocrates gigas的SNX-482)在膜界面与KV4.3钾通道的自发结合过程,从而克服了传统对接方法的局限性。该方法揭示了两种可能的结合构象,这两种构象都涉及KV4.3的S3-S4连接区,其中一个构象还包括孔区残基。通过替换模型中的残基,并量化SNX-482(浓度为1 μM)对非洲爪蟾卵母细胞中表达的KV4.3通道激活电压依赖性的影响,我们确定只有S3-S4连接区对于维持SNX-482的结合是必
来源:Biophysical Journal
时间:2025-10-26
-
生物膜相中脂质亚扩散的模拟与广义朗之万方程研究
摘要在生物膜中,脂质的运动行为与布朗粒子的经典扩散行为存在偏差,即表现出“异常”扩散现象。那么,这种异常扩散行为在凝胶相、波纹相和流体生物膜相中的变化情况如何呢?在本研究中,我们对二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱(DMPC)双层膜在三种不同相态下的全原子分子动力学(MD)进行了模拟,并利用广义朗之万方程(GLE)框架对结果进行了分析。该分析重点关注了在相对较短的皮秒至纳秒时间尺度上的亚扩散行为,揭示了分子在从振动运动向非谐运动转变过程中的局部约束和瞬态笼效应。研究发现,波纹相和凝胶相表现出强烈的瞬态笼效应及持久的记忆效应,从而导致显著的亚扩散行为。研究还探讨了氢键在脂质限制中的作用,表明其对相依赖的分子有
来源:Biophysical Journal
时间:2025-10-26
-
基于次指数模型推断揭示病毒进入的复杂动力学机制
在分子生物物理学领域,病毒如何进入宿主细胞是一个充满挑战的科学问题。这一过程本质上涉及病毒颗粒与细胞膜之间一系列复杂的随机相互作用,最终导致病毒遗传物质释放到细胞质中。传统的研究方法通常测量大量病毒颗粒的平均行为,但这种“群体平均”数据往往会掩盖单个病毒颗粒行为的关键细节,就像听一场交响乐的总和声而无法分辨每件乐器的独奏部分。单病毒技术(single-virus techniques)的出现,使得科学家能够像使用高灵敏度麦克风聆听每件乐器一样,实时观测单个病毒颗粒的入侵过程,记录下从触发融合到完成融合的精确“等待时间”。然而,从这些宝贵的单事件数据中提取准确的动力学机制信息并非易事。当实验只能
来源:Biophysical Journal
时间:2025-10-26
-
商业胶体银中的银离子毒性:来自Huh-7细胞高内涵成像的分子机制研究
本研究围绕商业银纳米颗粒(AgNPs)产品对人类肝癌细胞系Huh-7的细胞毒性展开,旨在评估其潜在健康风险并推动相关监管标准的建立。尽管银纳米颗粒作为一种新兴的纳米材料,因其独特的物理化学性质和潜在的生物活性受到广泛关注,但其作为膳食补充剂的市场推广并未基于充分的科学依据。研究结果表明,这两种市售的银纳米颗粒产品——Almacura(AL)和Prata Vida(PV)——在较低浓度下即可对Huh-7细胞产生显著的毒性效应,这提示我们需要重新审视银纳米颗粒的生物安全性和其在人体内的潜在危害。银纳米颗粒通常以水溶液的形式存在,其中可能含有游离银离子(Ag⁺)以及纳米颗粒本身。这两种成分在细胞毒性
来源:Nanotoxicology
时间:2025-10-26
-
中国深圳一例严重发热伴血小板减少综合征的病例特征:临床与免疫学分析
本研究旨在对深圳首次本土获得的严重发热伴血小板减少综合征(SFTS)病例进行深入的免疫学和病原学分析。该病例是由Dabie带状病毒(DBV)感染引起的,为深圳地区SFTS的首次本土病例,且是该地区首次发现DBV基因重排现象。通过动态采集病例及其密切接触者的血清样本,结合荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测病毒RNA,以及酶联免疫吸附测定(ELISA)检测特定的IgM和IgG抗体,研究人员得以全面分析病毒的遗传特征及可能的传播途径。此外,病毒的L(大)、M(中)和S(小)基因片段通过PCR扩增后,使用Sanger测序技术进行序列分析,以识别可能的突变位点及其潜在的生物学意义。随后,进行
来源:Virus Research
时间:2025-10-26
-
单桩支撑海上风机时变多灾害易损性:老化效应与耦合荷载作用分析
随着全球海上风电装机容量的快速增长,单桩支撑结构因其施工便捷、成本可控等优势,已成为当前海上风电场的主流支撑形式。这些矗立于恶劣海洋环境中的巨型结构,不仅需要长期承受风、浪、流等环境荷载的持续作用,在环太平洋地震带等区域还面临地震威胁。更严峻的是,在长达25-40年的设计使用年限内,支撑结构会因腐蚀、冲刷等老化效应不断劣化,导致结构动力特性发生改变。传统设计方法通常基于结构初始状态进行校核,未能充分考虑老化过程与多灾害耦合作用的协同效应,这为海上风电场的长期安全运营埋下了隐患。在此背景下,南安普顿大学张子亮博士及其合作者在《Soil Biology and Biochemistry》发表研究,
来源:Soil Biology and Biochemistry
时间:2025-10-26
-
综述:GLI1基因改变的头颈部间叶源性肿瘤
AbstractGLI1-altered mesenchymal tumors represent a novel category of soft tissue neoplasms primarily identified through advanced molecular techniques like next-generation sequencing (NGS). This review concentrates on those occurring in the head and neck region, detailing their clinicopathological c
来源:Seminars in Diagnostic Pathology
时间:2025-10-26
-
综述:胆管上皮前驱病变
胆管上皮前驱病变胆管上皮前驱病变是胆管癌(CCA)多步骤发病机制中的关键起始步骤。主要包括三种公认的实体:胆管内瘤变(BilIN)、胆管内乳头状肿瘤(IPNB)和胆管内管状乳头状肿瘤(ITPN-B)。这些病变涵盖了平坦型和肿块型,并呈现出广泛的形态学、免疫表型和分子谱系。尽管其分类部分类似于胰腺前驱病变,但胆道病变展现出独特的结构模式、分子改变和表型变异性。肿块型上皮内肿瘤胆管内乳头状肿瘤(IPNB)和胆管内管状乳头状肿瘤(ITPN-B)是独特的肿块型上皮肿瘤,以导管内结节或乳头状突起为特征。这些肿瘤通常发生于大的肝内或肝外胆管,由于其显著的腔内生长,常导致胆管扩张。临床上,它们是侵袭性腺癌的
来源:Seminars in Diagnostic Pathology
时间:2025-10-26
-
茉莉酸甲酯采后处理延长黄肉猕猴桃(Actinidia chinensis cv. Jinyan)货架期及其抗病性诱导作用研究
黄肉猕猴桃因其诱人的色泽和独特风味而备受消费者青睐,然而,其采后寿命短、易软化腐烂的特性,给长途运输和市场销售带来了巨大挑战。与传统的绿肉猕猴桃(如‘Hayward’)相比,黄肉品种通常更不耐贮藏。作为典型的呼吸跃变型果实,猕猴桃的成熟软化过程深受植物激素乙烯的调控。目前,商业上常使用1-甲基环丙烯(1-MCP)等乙烯作用抑制剂来延缓果实衰老,但寻找更天然、高效的保鲜方法仍是研究热点。茉莉酸甲酯(Methyl Jasmonate, MeJA)是一种来源于茉莉酸的天然植物激素,在调控植物防御反应、果实成熟衰老以及对生物和非生物胁迫的应答中扮演着关键角色。已有研究表明,外源MeJA处理能够影响多种
来源:Scientia Horticulturae
时间:2025-10-26
-
针对RXR通路以预防三阴性乳腺癌
开放获取
摘要 选择性雌激素受体调节剂(SERMs)和芳香化酶抑制剂(AIs)针对核雌激素受体(ER)的预防性治疗可以防止高风险乳腺癌女性患者出现ER阳性肿瘤,但无法预防ER阴性和三阴性乳腺癌(TNBC)的发生。在这项研究中,我们测试了已在临床试验中评估过的核视黄酸X受体(RXR)激动剂IRX4204和9cUAB30是否能够预防ER阴性和三阴性乳腺癌的发展。研究结果表明,IRX4204在三种ER阴性小鼠模型(MMTV-ErbB2、C3(1)/SV40-TAg和Brca1缺陷模型)
来源:Cancer Prevention Research
时间:2025-10-26
-
高强度间歇运动联合二甲双胍对健康男性血浆脂质组的动态影响研究
在现代社会,保持适度的体力活动对健康至关重要。特别是高强度间歇运动(High-Intensity Interval Exercise, HIIE),即短时间高强度运动与短暂恢复期交替进行的训练方式,已被证明能有效改善胰岛素抵抗和2型糖尿病(Type 2 Diabetes Mellitus, T2DM)患者的心血管代谢指标。与此同时,二甲双胍(Metformin)作为治疗T2DM的一线药物,其与运动结合的效应逐渐受到关注。然而,尽管已知运动能引起多种代谢物(包括脂质)浓度的显著变化,但关于HIIE对血浆脂质组,特别是在二甲双胍存在下的长期动态影响,目前尚缺乏系统性的探索。脂质如神经酰胺(Cer)
来源:Journal of Proteomics
时间:2025-10-26
-
综述:mzPeak:设计一种可扩展、可互操作且面向未来的质谱数据格式
1. 引言质谱(MS)领域在过去十年中经历了重大变革。现代质谱仪能够在更短时间内生成非常庞大的数据集,这为基于MS的组学学科带来了新机遇,但也对数据存储和访问方式提出了严峻挑战。目前,缺乏能够有效管理这些先进仪器产生的海量复杂数据的通用格式。现有主要选项——开放格式mzML和厂商特定格式——均存在明显局限性。mzML作为由人类蛋白质组组织(HUPO)的蛋白质组学标准倡议(PSI)定义的社区驱动标准,其基于XML的文本结构导致文件庞大、数据访问缓慢,难以适应高通量工作流程。而厂商二进制格式虽然针对其仪器性能进行了优化,但通常需要专有软件访问,缺乏互操作性,且长期数据保存存在风险。此外,精准医学(
来源:Journal of Proteomics
时间:2025-10-26
-
美国新发青年起病2型糖尿病的数据驱动亚型分析:妊娠期GCK-MODY与HNF1A-MODY管理策略及结局评估
研究亮点研究设计与参与者本研究为单中心回顾性队列研究,纳入了2011年6月至2023年12月期间就诊于哥本哈根Rigshospitalet糖尿病孕产妇中心的全部GCK-MODY(11名女性18次妊娠)和HNF1A-MODY(11名女性17次妊娠)单胎妊娠病例,并与133名2型糖尿病女性的140次妊娠进行匹配。所有参与者妊娠周期均超过22周。结果GCK-MODY孕妇的糖化血红蛋白(HbA1c)中位数从孕早期(<20周)到孕晚期稳定维持在45–46 mmol/mol,而HNF1A-MODY组(41→37 mmol/mol)和2型糖尿病组(47→41 mmol/mol)则显著下降。尽管未达统计学显著
来源:Journal of Diabetes and its Complications
时间:2025-10-26