• 人源多能干细胞向滋养层干细胞分化模型的建立揭示ELF5在人类胎盘发育中的功能非必需性

  胎盘作为胎儿发育过程中至关重要的器官，负责氧气和营养物质的供应以及废物的清除，其功能障碍与多种妊娠疾病如先兆子痫密切相关。滋养层细胞（trophoblast）起源于囊胚的滋养外胚层（trophectoderm, TE），是最早分化的胚胎谱系，主要包括细胞滋养层细胞（cytotrophoblast, CT）、绒毛外细胞滋养层细胞（extravillous cytotrophoblast, EVT）和合体滋养层细胞（syncytiotrophoblast, SCT）。尽管从早期胎盘和囊胚中已成功分离出人类滋养层干细胞（trophoblast stem cell, TSC），但如何从人多能干细胞（h

  来源：Stem Cell Reports

  时间：2025-09-12

• 糖原合酶激酶3（GSK3）是调节性T细胞发育与功能的核心调控因子，揭示自身免疫与肿瘤免疫新机制

  引言调节性T细胞（Regulatory T cells, Treg）是一类表达转录因子FOXP3的CD4+T细胞亚群，在维持免疫耐受及抑制过度免疫反应中发挥关键作用。然而，其在肿瘤微环境中也可能抑制抗肿瘤免疫应答。Treg的发育、稳态及功能受到多种信号通路的精密调控，其中PI3K-Akt-mTOR信号轴尤为关键。该通路下游的一个重要节点是糖原合酶激酶3（Glycogen Synthase Kinase-3, GSK3），它是一种可被Akt磷酸化并抑制的丝氨酸/苏氨酸激酶，拥有GSK3α和GSK3β两个高度同源的亚型。GSK3参与多种细胞过程，其最著名的功能之一是作为β-连环蛋白（β-caten

  来源：Cell Reports

  时间：2025-09-12

• ASCH结构域蛋白的核苷处理机制与功能解析

  研究团队揭示了大肠杆菌源性的ASCH结构域蛋白EcYqfB的催化机制：该酶通过酰胺水解作用将N4-乙酰胞苷(ac4C)转化为胞苷，但其活性仅针对游离核苷而非RNA中的ac4C修饰。通过解析EcYqfB的apo状态和底物结合状态晶体结构，团队阐明了其独特的底物结合口袋构象。体内实验表明，EcYqfB基因敲除并不影响多种RNA中ac4C的整体水平，印证了其专一性核苷代谢功能。研究还解析了小鼠EOLA1和人源TRIP4-ASCH结构域的结构，发现TRIP4-ASCH具备RNA与DNA双重结合能力，而EcYqfB与EOLA1则呈现不同的底物偏好性。这些发现为理解ASCH家族蛋白在核苷处理中的特异性功能

  来源：Structure

  时间：2025-09-12

• 综述：免疫相关肌动蛋白病——免疫缺陷、自身免疫与自身炎症的交汇点

  肌动蛋白细胞骨架在免疫系统中的核心作用肌动蛋白细胞骨架重塑驱动免疫细胞的迁移及其在动态细胞间接触中的参与。研究发现，肌动蛋白细胞骨架动力学在免疫细胞功能中的重要性通过先天性免疫错误（IEIs）的发现得以凸显，这些疾病由单个肌动蛋白调控蛋白缺陷引起，统称为免疫相关肌动蛋白病。此类疾病除增加感染风险外，常伴随广泛的自身免疫和自身炎症表现。淋巴细胞中的肌动蛋白亚网络与功能异常在淋巴细胞中，肌动蛋白亚网络通过调节T细胞和B细胞的激活与功能，维持免疫稳态。例如，WASP（Wiskott-Aldrich syndrome protein）缺陷会破坏T细胞受体的信号传导和免疫突触形成，导致T细胞介导的耐受失

  来源：Nature Reviews Immunology

  时间：2025-09-12

• 减轻行政负担与信息成本对法国早期育儿服务获取中社会不平等影响的随机对照试验

  一项随机对照试验(randomized controlled trial, RCT)探究了行政负担(administrative burden)与信息成本(information costs)如何影响法国早期育儿(early childcare)获取中的社会不平等。该研究发现，针对认知与行为障碍(cognitive and behavioural barriers)提供信息与支持，可消除低收入(low-income)与移民(immigrant)家庭在早期育儿申请上的差距。尽管申请率显著上升，但对低收入社会经济地位(low-SES)和移民家庭的实际入学率(access rates)影响有限。这项

  来源：Nature Human Behaviour

  时间：2025-09-12

• 基于全血转录组模式的免疫检查点抑制剂疗效预测研究：揭示新型生物标志物与临床结局的关联

  免疫检查点抑制剂（ICIs）的出现彻底改变了多种癌症的治疗格局，然而临床上面临着一个严峻挑战：仅部分患者能从中获益。目前疗效预测主要依赖肿瘤组织特征，如程序性死亡配体1（PD-L1）表达、肿瘤突变负荷（TMB）或错配修复蛋白状态，这些指标需要通过侵入性活检获取，且预测价值有限。近年来研究表明，患者全身免疫状态对ICI疗效具有重要影响，因此开发无创性免疫特征评估方法成为研究热点。全血转录组分析作为一种微创技术，能够全面反映免疫细胞功能状态，但既往研究受限于小样本或有限基因 panel，难以捕捉细微而关键的免疫调控信号。为突破这一瓶颈，研究人员开展了一项创新性研究，通过整合大规模公共数据库与前瞻性

  来源：Cancer Immunology, Immunotherapy

  时间：2025-09-12

• 综述：隐球菌感染：宿主免疫、免疫逃逸及新兴免疫治疗策略

  2 Pattern recognition receptors宿主抵御隐球菌感染的关键起始步骤是固有免疫细胞表面的模式识别受体（PRRs）与病原体相关分子模式（PAMPs）的结合。C型凝集素受体（CLRs）主要识别隐球菌多糖成分：Dectin-1识别β-1,3-葡聚糖，通过ITAM结构域招募Syk激酶，激活CARD9-Bcl10-MALT1复合物，驱动NF-κB和MAPK通路活化，促进T细胞分化和髓系细胞功能调控；Dectin-2识别α-甘露聚糖，通过FcRγ-ITAM激活CARD9信号，抑制Th2应答；Dectin-3直接识别隐球菌荚膜多糖GXM，激活NF-κB和ERK通路；Mincle识别

  来源：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

  时间：2025-09-12

• Lutzomyia longipalpis LL5细胞响应dsRNA病毒模拟物的分泌蛋白质组学分析揭示细胞防御与修复信号机制

  引言白蛉作为利什曼病、巴尔通体病及多种病毒的传播媒介，对公共卫生构成严重威胁。本研究以美洲内脏利什曼病主要媒介Lutzomyia longipalpis的LL5胚胎细胞系为模型，探究其对病原体的免疫应答机制。该细胞系在微生物挑战下展现出由Toll、IMD、Jak-STAT和RNAi通路调控的强烈免疫反应。前期研究发现dsRNA转染可触发非特异性抗病毒反应，其分泌蛋白质组呈现类似干扰素应答的特征。材料与方法LL5细胞在30°C条件下使用含10%胎牛血清的L-15培养基培养。实验组采用含2 ng/mL poly I:C（dsRNA类似物）和4 ng/mL Lipofectin转染试剂的培养基处理，

  来源：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

  时间：2025-09-12

• 牛支原体亚种疫苗候选靶点的多样性及T细胞抗原潜力解析：核心基因组与MHC表位预测揭示新型重组蛋白疫苗开发路径

  Abstract牛支原体亚种（Mycoplasma mycoides subsp. mycoides, Mmm）是传染性牛胸膜肺炎（Contagious Bovine Pleuropneumonia, CBPP）的病原体，该疾病主要影响撒哈拉以南非洲地区的牛群，可造成重大经济损失。当前急需开发有效疫苗以控制CBPP。为此，研究利用公开的15株牛源Mmm非冗余全基因组序列，鉴定出一个包含806个基因的93%核心基因组，其中包含208个外膜和胞外蛋白编码基因中的86个。尽管这些蛋白在序列水平高度保守（包括与牛主要组织相容性复合体MHC I类和II类分子预测表位结合位点），但多个蛋白在MHC I类和

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 整合DNA条形码与分类学：提升木奶果属（叶下珠科）物种界定与系统发育解析

  通过整合DNA条形码（DNA barcoding）技术与传统分类学方法，本研究对广泛用作食物、药物及建筑材料的木奶果属（Baccaurea）植物进行了深度解析。研究人员选取了rbcL、ITS2和trnH-psbA三种标准条形码区域，对涵盖19个物种的64份样本进行测序分析。采用相似性比对工具（BLAST）和系统发育树构建方法，发现单一片段rbcL的鉴别效率仅为21.1%，而ITS2（89.5%）和trnH-psbA（87.5%）表现出色，组合使用rbcL+ITS2或全组合rbcL+ITS2+trnH-psbA均达到89.5%的高鉴别率。邻接树（Neighbor-Joining tree）显示物

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• AVITI测序系统：挑战Illumina主导地位的低成本全基因组基因分型新方案

  测序技术的革命性进展正在重塑基因组学研究格局。新一代测序技术(NGS)凭借其高通量特性大幅降低了测序成本，其中Illumina系统的合成测序(SBS)技术因其准确性和成本效益占据市场主导地位。然而，Element Biosciences公司开发的Avidity测序技术(AVITI)正在挑战这一格局。研究人员采用三重酶切基因分型测序(3D-GBS)技术和迷你版文库制备方案(NanoGBS)，对40个大麻(Cannabis)样本进行全基因组基因分型比较。研究显示，经过质量过滤后，NovaSeq和AVITI分别获得35.4K和31.9K个高质量单核苷酸变异(SNV)，其中81.2%的变异位点重叠，基

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 高粱多胺氧化酶基因家族全基因组鉴定及其在生长发育与胁迫响应中的功能分析

  通过序列比对方法，研究人员在高粱（Sorghum bicolor L.）中开展了多胺氧化酶（Polyamine Oxidase, PAO）基因的系统鉴定工作。PAO是参与多胺（polyamine）降解代谢的关键酶类，对植物生长发育及逆境胁迫耐受性具有重要调控作用。本研究以拟南芥（Arabidopsis）的PAO为参考模型，利用公共基因组数据库进行全基因组扫描，最终鉴定出6个高粱PAO基因家族成员。这些基因分布于高粱第1、3、6和7号染色体上，多数成员含有8至9个外显子。PAO蛋白的分子量介于53至63 kDa之间，理论等电点（pI）在5.2到8.1范围内。该研究为后续深入探索PAO基因在高粱生

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 内洛尔牛肌内脂肪含量候选基因验证及其调控机制研究

  肌内脂肪是影响肉类感官品质和经济价值的关键因素。内洛尔牛等热带牛种因大理石纹评分（MS）和总脂质（TL）含量较低，在高端市场面临挑战。本研究选取189头公牛中MS和TL表型极端的24个个体（高/低组各12头），通过实时PCR技术验证了文献中报道的差异表达基因，并利用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）分析其蛋白表达水平。结果显示，高肌内脂肪组中FABP4（脂肪酸结合蛋白4）、DGAT1（二酰基甘油酰基转移酶1）、DGAT2、BARX2（同源盒转录因子）、STAT5A（信号转导与转录激活因子5A）和SDC（ syndecan）基因表达显著上调。这些基因参与脂质代谢、脂肪生成和肌肉发育过程。进一

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 基于DNA条形码与形态学的哥伦比亚安第斯山脉Pronophilina蝴蝶单一位点物种界定研究：形态特征与分子操作分类单元(MOTUs)的高度一致性

  Pronophilina蝴蝶（鳞翅目：蛱蝶科：眼蝶亚科：眼蝶族）作为鳞翅目中多样性最高的亚族之一，在哥伦比亚安第斯山脉分布广泛，对山地生态系统具有重要生态意义且呈现高度特有性。尽管其生殖器形态复杂，但同属物种常表现出高度相似的翅斑图案，给传统形态学分类带来挑战。本研究通过分析来自94个先验鉴定形态种的334条细胞色素c氧化酶亚基I（cytochrome c oxidase subunit I, COI）条形码序列，采用四种分子物种界定方法（自动条形码间隙探索/ABGD、优化单一连锁/RESL、泊松树进程/PTP以及自动分区集合物种/ASAP），界定出98-108个分子操作分类单元（MOTUs）

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 甘蓝型油菜‘Mendel’中鉴定出抗四种芸薹根肿菌致病型的第二基因Rcr3Mendel及其遗传定位研究

  引言根肿病由专性寄生菌芸薹根肿菌（Plasmodiophora brassicae）引起，是加拿大油菜产业面临的重大威胁，可导致30%-100%的产量损失。遗传抗性是防治该病的有效策略。甘蓝型油菜（Brassica napus L.）作为全球第二大食用油来源，其生产受到根肿病的严重制约。自2003年加拿大草原地区首次发现根肿病以来，截至2020年已确认超过3300块田间感染区。抗根肿病（CR）油菜品种于2009-2010年在加拿大首次推广，对当时所有主要致病型均有效。然而，到2013年，阿尔伯塔省的两个田间发现第一代CR油菜出现严重症状，表明病原菌已突破原有抗性。为此，加拿大开发了加拿大根肿病

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• Boana属树蛙Tc1/mariner转座子的分子特性与染色体分布及其在基因组进化中的作用

  通过分子表征与染色体定位技术，研究人员在Boana属树蛙（Anura, Hylidae）中揭示了Tc1/mariner转座子的分布规律。这些转座元件广泛存在于真核生物基因组中，在Boana albopunctata和Boana faber中检测到典型的DD36E特征，而在Boana prasina中则发现了新型DD37E特征。物理定位显示转座子主要分散分布于常染色质区域，部分异染色质区存在少量富集。所有分离得到的转座子均保持高度序列完整性，表明其近期仍处于活跃状态。系统发育分析表明DD37E与已知DD36E/Incomer家族具有紧密进化关系。该发现深化了对Tc1/mariner转座子多样性的

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 揭示脉翅目昆虫基因组的卫星DNA演化与端粒缺失：对染色体稳定性和重复序列快速更新的新见解

  研究团队首次对脉翅目昆虫的卫星DNA组(satellitome)展开深入解析，同步探究了端粒及核糖体DNA(rDNA)的特征。发现该目物种缺乏典型的昆虫端粒 motif（五碱基重复序列），rDNA基因簇虽保持保守的核型（2n=12, XY性染色体系统）但仍呈现种间变异。在Ceraeochrysa cincta与Chrysopa pallens两种草蛉中，卫星DNA(satDNA)占其重复DNA的比例较低且存在显著种间差异，未发现共有satDNA序列，暗示其极快速的序列更新。有趣的是，两个物种中丰度第二的satDNA家族虽序列相似度低，却可能具有共同起源。研究还观察到satDNA与转座元件之间存

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 基于插补多组学数据的甘蓝型油菜单交种预测：一项提高基因组选择准确性的案例研究

  研究背景与意义随着测序技术的飞速发展，植物基因组的组装和表征已达到高分辨率水平。在育种项目中，这些数据与表型信息结合，用于基因组预测（Genomic Prediction, GP），以根据遗传谱选择基因型。尽管单核苷酸多态性（SNP）芯片常用于基因分型，但它们仅捕获全基因组多样性的一部分。为解决这一问题，一种方法涉及使用芯片对整个群体进行基因分型，同时对子集进行全基因组测序（Whole-Genome Sequencing, WGS）或评估基因表达谱，然后通过插补将数据扩展至整个群体。本研究评估了插补的WGS标记（SNP和结构变异（Structural Variations, SV））和表达数据

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 长期使用LHRH-A3对产后母兔卵巢凋亡水平及MMP7基因表达调控机制的研究

  通过分析长期使用促黄体激素释放激素A3（Luteinizing hormone-releasing hormone A3, LHRH-A3）对产后母兔卵巢的影响，研究发现该激素类似物虽广泛用于诱导排卵，但其长期作用机制尚不明确。实验比较了LHRH-A3处理组（A3组）与未处理组（N组）在第5胎后的卵巢样本，Western blot结果显示A3组的Bcl-2/Bax比值显著降低（P<0.01），表明卵巢凋亡水平升高。利用RNA测序（RNA-seq）技术对每组4只兔子的卵巢组织进行转录组分析，共识别出220个差异表达基因（Differentially Expressed Genes, DEG

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

• 基于NGS预校正ONT读长的组装策略实现HiFi级别质量并降低成本

  基因组组装是从片段化测序数据重建完整基因组序列的关键步骤。近年来，第三代测序技术如牛津纳米孔技术（Oxford Nanopore Technologies, ONT）和高保真（HiFi）测序的出现显著提升了组装质量。然而，混合组装方法通常需要同时使用大量HiFi和超长ONT读长，成本较高。为此，本研究探索了一种低成本替代方案：使用低覆盖度的ONT读长，并通过下一代测序（next-generation sequencing, NGS）进行预校正，再输入至ONT专用组装工具中。材料与方法研究使用了来自Ashkenazim Trio（HG002、HG003、HG004）的公开细胞系DNA样本。测序数

  来源：Genome

  时间：2025-09-12

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