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  • 外周异染色质锚定是染色质依赖的核机械响应的必要条件

    细胞作为生命的基本单元,时刻承受着组织张力、细胞迁移等机械应力。这些力会通过核膜传递至细胞核内部,引发染色质空间重组、基因表达调控甚至DNA损伤等系列生物学效应。然而,染色质如何将微米级的核形变转化为纳米级的染色质响应,一直是细胞力学领域的核心谜题。尤其令人困惑的是,染色质既表现出液体般的流动性(如端粒蛋白的动态行为),又具备固体样的弹性(如原子力显微镜测量的刚性),这种看似矛盾的性质如何统一解释?来自瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)、波兰西里西亚大学等机构的研究团队在《Nucleic Acids Research》发表重要成果。研究人员通过多尺度聚合物模拟结合微操纵实验,首次阐明异染色质必须

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-08-19

  • 基于FAIR原则的微生物组研究数据共享分级标准与自动化评估工具开发

    微生物组研究正成为生命科学领域的重要驱动力,但海量数据背后隐藏着严峻的共享困境。尽管国际核苷酸序列数据库合作组织(INSDC)等平台已建立数据提交标准,但研究表明约45%的论文无法提供可用的原始测序数据,元数据描述更是存在"千人千面"的混乱现象——同一样本属性可能被标注为7种不同字段名称,这种状况严重阻碍了数据的交叉研究和临床转化应用。针对这一挑战,瑞士联邦理工学院(ETH Zurich)的Lina Kim、Anton Lavrinienko等研究者创新性地提出了双重解决方案:首先设计分级徽章系统(Bronze/Silver/Gold),从数据可获取性和元数据完整性两个维度建立量化标准;其次开

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-08-19

  • 时间分辨框架揭示mRNP加工与组装因子在转录位点的动态招募机制

    在真核细胞中,mRNA的核质转运需要经历复杂的加工与包装过程形成信使核糖核蛋白(mRNP)颗粒。尽管mRNP组装对基因表达至关重要,但其在活细胞中的时空动态仍如"黑箱"。传统染色质免疫沉淀(ChIP)技术难以捕捉单细胞水平的异质性,而TREX复合体(包含THO、Yra1和Sub2)各组分的功能层级关系长期存在争议——究竟是THO复合体主导Yra1的招募,还是存在独立加载途径?这些机制空白严重制约着对RNA代谢异常相关疾病(如癌症和神经退行性疾病)的理解。加州大学戴维斯分校葡萄栽培与酿酒学系(University of California, Davis)的Theresa Wechsler团队开

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-08-19

  • 基因组测序与基因分型错误对多物种溯祖模型下贝叶斯分析的影响研究

    在进化生物学研究领域,高通量测序技术的普及使得科学家能够获取海量基因组数据,但随之而来的数据质量问题日益凸显。特别是在研究近缘物种的进化关系时,多物种溯祖(Multispecies Coalescent, MSC)模型已成为分析基因组数据的标准框架,可用于估算物种树、分歧时间、种群大小以及种间基因流等关键参数。然而这个模型隐含着一个重要前提:输入的序列数据必须完全准确。现实中,受限于测序成本、样本质量等因素,许多研究不得不采用低深度测序策略,这可能导致碱基识别和基因分型错误,进而影响分析结果的可靠性。英国伦敦大学学院(University College London)遗传、进化与环境系的研究

    来源:Molecular Biology and Evolution

    时间:2025-08-19

  • 反义非编码SINEUP和环状RNA中IRES元件的反式翻译调控机制及其生物学意义

    反义非编码RNA中IRES元件的翻译调控机制invSINEB2序列的IRES活性验证研究团队首先解析了天然SINEUP RNA——AS Uchl1的核心功能元件。通过构建靶向DJ-1 mRNA的合成SINEUP(SINEUP-DJ-1),证实其72nt的反义结合域(BD)与倒置SINEB2(invSINEB2)效应域(ED)协同作用,使DJ-1蛋白表达提升1.8倍而不影响mRNA水平。蔗糖梯度离心和电泳迁移实验(EMSA)显示,invSINEB2特异性结合40S核糖体亚基,而删除该序列导致SINEUP丧失促进靶mRNA多聚核糖体关联的能力。双荧光素酶报告系统证实,invSINEB2在顺式作用中

    来源:Nucleic Acids Research

    时间:2025-08-19

  • 因果枢纽:解析复杂疾病遗传异质性的结构因果模型与变异发现新策略

    在复杂疾病研究中,遗传异质性如同一个难解的谜团——相同临床表现的患者可能由完全不同的遗传机制驱动。传统全基因组关联分析(GWAS)虽能识别风险位点,却无法解析个体间的因果差异。更棘手的是,常见变异与罕见变异在疾病发生中的协同作用长期缺乏有效分析方法。这种认知空白直接阻碍了精准医疗的发展,因为不同遗传背景的患者可能需要差异化的干预策略。针对这一挑战,贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的研究团队在《美国人类遗传学杂志》(AJHG)发表创新性研究。他们开发的"因果枢纽"方法,巧妙利用结构因果模型中"碰撞偏倚"这一传统被视为干扰因素的现象,将其转化为发现遗传异质性的有力

    来源:AJHG

    时间:2025-08-19

  • 非洲裔人群肺癌遗传易感性研究揭示新风险位点与生物学通路

    这项突破性研究首次系统描绘了非洲裔人群的肺癌遗传图谱。科研团队采用全基因组关联分析(GWAS)技术,在6,490名非洲血统个体中锁定15q25.1区域的关键单核苷酸多态性(SNP)rs17486278,该位点显示强效风险效应(比值比OR=1.34,p值达4.52×10−12)。更令人振奋的是,3p12.1、8q22.2等四个基因组区域首次被证实与肺癌相关。通过整合欧洲和亚洲人群数据进行的跨祖先荟萃分析,研究者将显著位点扩展至17个,其中4q35.2区域与先前报道的用力呼气容积(FEV1)存在遗传重叠。研究团队运用生物信息学(in silico)手段,发现AC012184.3、烟碱型胆碱受体α3

    来源:AJHG

    时间:2025-08-19

  • 动态度量揭示着丝粒蛋白周期重塑规律——人类染色体分离的分子调控新机制

    染色体精确分离是细胞分裂的核心事件,其错误会导致肿瘤等疾病的典型特征——非整倍体。作为染色体分离的"指挥中心",着丝粒(kinetochore)由100多种蛋白质组成复杂动态结构,但长期以来科学家对其组装时序和调控机制缺乏系统认识。传统研究多聚焦有丝分裂期,而对G1/S/G2等间期阶段的着丝粒"前体"(pre-kinetochore)变化知之甚少,这严重限制了对染色体分离全周期调控的理解。威斯康星大学麦迪逊分校(University of Wisconsin-Madison)的研究团队在《Nature Communications》发表突破性成果。他们开发了精确定量免疫荧光技术(qIF),首次

    来源:Nature Communications

    时间:2025-08-19

  • 转录因子Prdm1a调控斑马鱼侧线毛细胞命运转换的机制及其在听觉再生中的潜在意义

    在脊椎动物中,机械感觉毛细胞对听觉和平衡功能至关重要,但哺乳动物耳蜗毛细胞一旦损伤便无法再生,导致永久性听力丧失。相比之下,斑马鱼等非哺乳动物却能通过侧线系统实现毛细胞的持续再生。这种再生能力差异背后的分子机制一直是科学家们探索的焦点。美国斯托瓦斯医学研究所(Stowers Institute for Medical Research)的Jeremy E. Sandler和Ya-Yin Tsai等研究人员在《Nature Communications》发表的研究,揭示了转录因子Prdm1a在决定毛细胞命运中的关键作用,为理解毛细胞亚型特异性分化提供了新见解。研究人员运用了多项关键技术:通过EN

    来源:Nature Communications

    时间:2025-08-19

  • 靶向递送锁核酸的脂质纳米颗粒显著缓解肠道炎症——30倍剂量降低的突破性疗法

    炎症性肠病(IBD)治疗领域长期面临一个关键挑战:如何实现核酸药物的精准递送?锁核酸(Locked Nucleic Acids, LNA)作为第三代反义寡核苷酸(ASO),虽具有高结合亲和力,但因其结构刚性导致的细胞摄取障碍和所需高剂量引发的毒性,临床应用受到限制。这一困境促使科学家们将目光投向目前最成熟的非病毒递送系统——脂质纳米颗粒(LNP)。以色列特拉维夫大学(TAU)的Dan Peer团队与罗氏(Roche)公司合作,在《Nature Communications》发表了一项突破性研究。研究人员设计了一套创新解决方案:利用可电离脂质构建的LNP作为"分子快递车",装载抗炎LNA直达病灶

    来源:Nature Communications

    时间:2025-08-19

  • 锂离子电池正极材料超快直接再生与升级回收通用方案研究

    随着全球电气化进程加速,锂离子电池(LIBs)已成为能源存储领域的核心器件,但其有限寿命导致的资源浪费问题亟待解决。与传统冶金法不同,这项研究开创性地提出了正极材料直接再生策略——就像给衰老细胞实施精准修复手术,通过X射线衍射(XRD)和电感耦合等离子体(ICP)等诊断工具评估废LiMn2O4的"病因",随后采用两种创新疗法:基础版固相再生技术(类似细胞培养)耗时约32小时;进阶版焦耳加热技术则如同给材料施加"电击复苏",5小时内即可诱导非平衡反应,在材料内部构建有益的结构缺陷和元素梯度分布。令人振奋的是,这些技术不仅能将废正极"治愈"如初,更能实现功能升级——就像基因编辑改造细胞,将废料转化

    来源:Nature Protocols

    时间:2025-08-19

  • 综述:胰岛组织巨噬细胞在免疫稳态和1型糖尿病中的作用

    胰岛巨噬细胞的免疫调节中枢地位作为胰岛微环境的"哨兵细胞",驻留型巨噬细胞通过持续分泌IL-1β、TNF-α等细胞因子维持组织稳态。单细胞转录组分析揭示了CD68+CX3CR1+和CD206+两个主要亚群,其空间分布特征暗示与β细胞的特殊毗邻关系。M1/M2极化失衡触发糖尿病进程在T1D发病过程中,促炎型M1(CD86+iNOS+)巨噬细胞比例显著增加,而抗炎型M2(CD163+Arg1+)群体减少。这种极化转换导致胰岛内IL-12/23-STAT4通路的异常激活,进而促进自身反应性T细胞浸润。值得注意的是,巨噬细胞来源的外泌体miR-155-5p可直接抑制β细胞的胰岛素分泌功能。双向通讯的分

    来源:Clinical Reviews in Allergy & Immunology

    时间:2025-08-19

  • IGFBP3介导的时空协调性IGF信号通路促进小鼠心肌再生的机制研究

    Highlight我们揭示了一个主要由内皮细胞和心肌细胞构成的旁分泌信号轴,该轴通过IGF信号通路时空协调性地激活心肌细胞增殖——这是新生儿心脏再生的核心机制。具体而言,我们发现IGF结合蛋白IGFBP3(兼具IGF依赖和非依赖功能)在心脏再生中的关键作用:损伤后,内皮细胞在梗死周边区特异性表达IGFBP3,该蛋白结合IGF2后,被邻近表达的蛋白酶PAPPA2水解,从而释放游离IGF2激活受体信号。Section snippets方法详细实验方法见补充材料。IGFBP3在新生儿心肌梗死后表达于内皮细胞等心脏细胞谱系通过转录组筛选比较再生期(P1)和非再生期(P14)心脏的分泌蛋白差异,我们发现

    来源:Journal of Molecular and Cellular Cardiology

    时间:2025-08-19

  • YAP1::TFE3融合蛋白介导内皮-间质转化在血管内皮瘤中的关键作用及机制研究

    引言血管内皮瘤(EHE)是一种罕见的血管肉瘤,其分子特征为WWTR1::CAMTA1或YAP1::TFE3(YT)基因融合。尽管既往研究认为EHE的发病机制与Hippo通路异常激活相关,但YT驱动的生物学特性尚未明确。本研究通过构建内皮细胞模型,首次揭示了YT通过非经典途径诱导内皮-间质转化(EndMT)的机制。研究方法团队利用慢病毒载体在永生化小鼠内皮细胞(MS1)和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)中诱导表达YT融合蛋白,通过RNA测序、免疫印迹和功能实验(划痕实验、悬浮培养)分析表型变化。关键突变体包括:1.YTS94A:破坏TEAD结合域2.YTΔdd:删除TFE3的bHLH-LZ二聚化域

    来源:Molecular Oncology

    时间:2025-08-19

  • 杨树木质部表达的葡糖醛酸酯酶通过调控木质素与葡糖醛酸木聚糖的γ-酯键降低生物质抗降解性并促进生长

    1 引言木质生物质作为可再生资源面临利用瓶颈,木质素-碳水化合物复合物(LCC)形成的分子交联是导致生物质抗降解性(recalcitrance)的主因。其中γ-酯键(GE)连接木质素γ-OH与木聚糖4-O-甲基葡糖醛酸(MeGlcA),占LCC总量的三分之一,但缺乏直接证据。本研究通过在杂交杨(Populus tremula × tremuloides)木质部特异性表达白腐真菌Phanerochaete carnosa的葡糖醛酸酯酶(PcGCE),首次在活体植物中验证GE键的生物学功能。2 结果2.1 转基因构建与表达采用木材特异性启动子(WP)驱动PcGCE在次生壁形成期表达,RT-qPCR

    来源:Plant Biotechnology Journal

    时间:2025-08-19

  • 镰状细胞性状个体的甲基化谱特征及其临床意义

    这项开创性研究深入解析了镰状细胞性状(sickle cell trait, SCT)携带者独特的DNA甲基化(DNA methylation)特征。研究人员采用全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)技术,在红细胞前体细胞中检测到超过15,000个差异甲基化区域(DMRs),其中HBB基因簇的Hyper-DMRs与胎儿血红蛋白(HbF)表达水平呈显著负相关。值得注意的是,位于BCL11A增强子区域的低甲基化状态与γ-珠蛋白基因(HBG1/HBG2)的持续激活存在强关联性。研究还发现TET2介导的5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)修饰在SCT个体中呈现动态变化模式,这些表观遗传特征可能成为预测血管闭塞危象(

    来源:Epigenetics

    时间:2025-08-19

  • 尼日利亚孕妇黄热病病毒与西尼罗病毒既往免疫对正黄病毒暴露后妊娠结局的影响研究

    Abstract在撒哈拉以南非洲地区,黄热病病毒(YFV)和西尼罗病毒(WNV)与寨卡(ZIKV)、登革热(DENV)、基孔肯雅病毒(CHIKV)等虫媒病毒共同流行。这项研究首次系统评估了孕妇既往YFV/WNV暴露对正黄病毒感染后妊娠结局的影响。通过对216名尼日利亚孕妇的血清学分析,发现50.5%存在YFV IgG,5.1%存在WNV IgG。多因素逻辑回归显示,YFV/WNV血清阳性与孕妇症状显著相关,而CHIKV IgM则与异常婴儿结局风险升高2.38倍相关。Introduction虫媒病毒对孕产妇和儿童健康的威胁在热带地区尤为严峻。虽然ZIKV、DENV和CHIKV感染与不良妊娠结局的

    来源:Emerging Microbes & Infections

    时间:2025-08-19

  • 金黄色葡萄球菌蛋白酶表达的全基因组关联分析揭示其致病调控新机制

    蛋白酶活性检测方法的验证与局限通过酪蛋白水解实验评估金黄色葡萄球菌蛋白酶活性时发现,四种主要蛋白酶(锌金属蛋白酶Aur、丝氨酸蛋白酶SspA、半胱氨酸蛋白酶SspB和丝氨酸蛋白酶样酶SplF)的转座子突变体显著降低水解活性。值得注意的是,该检测方法对ScpA和SplB-E蛋白酶不敏感,提示其可能受培养条件限制或酶活性叠加效应影响。全局毒力调控因子AgrA和SarZ的失活显著降低蛋白酶活性,而CodY和SigB缺失则增强活性,证实该体系可有效反映调控网络变化。临床分离株的表型异质性对134株USA300型MRSA临床分离株的分析揭示:血流感染菌株蛋白酶活性中位数(35%)显著低于携带菌株(52%

    来源:Virulence

    时间:2025-08-19

  • 综述:N6-甲基腺苷RNA甲基化对病毒性肝炎的调控作用

    m6A甲基化:病毒性肝炎的隐形调控者1. 引言HBV、HCV和HDV是全球慢性肝炎的主要病原体,可导致肝纤维化、肝硬化和肝细胞癌(HCC)。尽管现有疗法能抑制HBV复制,但共价闭合环状DNA(cccDNA)的持续存在仍是治愈难点。近年研究发现,m6A作为RNA中最丰富的表观遗传修饰,通过"写入器"(METTL3/14复合物)、"擦除器"(FTO/ALKBH5)和"阅读器"(YTHDF蛋白)的动态调控网络,深刻影响肝炎病毒的命运。2. HBV复制中的m6A调控HBV pgRNA的5'和3'端ε结构域1907位腺苷(A1907)是m6A修饰热点。5'端甲基化通过促进pgRNA与核心蛋白结合增强核衣

    来源:Emerging Microbes & Infections

    时间:2025-08-19

  • 无细胞百日咳疫苗加强免疫后抗百日咳毒素IgG抗体亲和力发展的免疫记忆影响研究

    研究背景与设计百日咳作为疫苗可预防疾病,其发病率在疫苗接种覆盖率高的国家仍出现回升现象。研究团队在芬兰、荷兰和英国三地开展多中心临床试验,招募365名受试者(儿童、青少年、年轻成人和老年人),采用标准化Tdap3-IPV疫苗(Boostrix™-IPV)进行加强免疫。通过采集基线、接种后1个月和1年的血清样本,创新性地采用6.5M和3.5M尿素作为离液剂,建立抗PT IgG抗体的亲和力指数(AI)检测体系,批内变异4.1%,批间变异9.3%。核心发现1.国家间差异:荷兰和英国受试者基线AI显著高于芬兰(p<0.01),可能与各国百日咳流行率差异相关。荷兰队列接种后AI普遍下降,而英国儿童和青少

    来源:Emerging Microbes & Infections

    时间:2025-08-19


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