• 自监督深度学习驱动的无参考空间转录组解卷积方法SURF：突破组织微环境解析的技术瓶颈

  1 引言空间转录组技术（ST）的革命性突破使得组织内基因表达的空间定位成为可能，但多细胞分辨率平台（如Visium、Slide-seq）的混合信号问题制约了单细胞水平解析。现有解卷积方法可分为依赖单细胞参考（如Cell2location、DestVI）和无参考方法（如STdeconvolve、BayesTME），前者受限于样本可及性和批次效应，后者则普遍忽视基因非线性互作和空间关联。SURF的创新性体现在三方面：1）采用自监督深度学习框架，通过多层感知机（MLP）捕捉基因复杂互作；2）引入狄利克雷分布约束确保细胞类型比例（CTP）的生物学合理性；3）首创基于空间-表达双模态的对比学习策略，将相

  来源：Advanced Science

  时间：2025-08-28

• 基于胶体金免疫层析技术的唾液腺苷脱氨酶2（ADA2）快速抗原检测及其在DADA2和胸膜结核诊断中的应用

  引言腺苷脱氨酶2（ADA2）作为腺苷代谢的关键酶，其活性异常与免疫紊乱和癌症密切相关。研究团队此前开发的ELISA法已证实唾液ADA2检测可诊断头颈癌和ADA2缺乏症（DADA2）——一种以血管炎、早发性中风和骨髓衰竭为特征的罕见遗传病。然而，传统检测成本高且依赖专业设备，亟需开发便捷的快速检测技术。材料与方法样本来源：9例经Sanger测序确诊的DADA2患者（中位年龄18岁）和59名健康志愿者参与研究。胸膜结核（TB）组纳入41例患者，非TB组48例，样本来自西班牙Lleida大学医院的生物样本库。关键技术：1.重组ADA2制备：通过慢病毒载体转染293T细胞，经肝素柱和凝胶过滤纯化获得高

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-08-28

• 重庆地区疫苗上市后安全监测研究（2006-2021）：基于国家自发报告数据库与多方法数据挖掘的信号分析

  引言中国疫苗上市后安全监测主要依赖国家免疫规划信息管理系统（CNAEFIS），其框架与世界卫生组织（WHO）标准一致。重庆作为西部人口超3300万的超大城市，城乡、民族、年龄结构复杂，2006年起通过CNAEFIS报告不良反应（AEFI）数据。然而，2011年前缺乏个体化电子免疫登记系统（EIRS），2019年前自费疫苗数据录入不全，导致AEFI发生率计算偏差。为弥补这一局限，研究引入美国疾控中心（CDC）的比例报告比（PRR）和WHO乌普萨拉监测中心的贝叶斯置信传播神经网络（BCPNN）等数据挖掘技术，通过频数失衡分析识别疫苗与不良反应的潜在关联信号。材料与方法1.0，BCPNN的IC025

  来源：Human Vaccines & Immunotherapeutics

  时间：2025-08-28

• CRISPR转录读出技术揭示NELF调控流感病毒转录并触发干扰素反应的新机制

  Significance人类几乎所有细胞都具备通过产生干扰素（IFN）来感知和应对病毒感染的能力。干扰素反应的时机和强度直接影响疾病进程，而宿主与病毒均进化出精细调控机制。传统基于选择的筛选方法难以全面鉴定干扰素表达的调控因子，本研究开发的CRISPR转录读出技术（CRITR-seq）通过关联基因编辑与特定启动子活性，揭示了流感病毒生命周期与人类转录机器的关键互作节点。Abstract病毒感染时干扰素的转录对细胞内在免疫至关重要。研究者开发了CRITR-seq技术，将CRISPR引导序列与目标启动子活性关联。应用该方法发现，负延伸因子（NELF）复合体的缺失会同时增强流感转录和干扰素表达。研究

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-08-28

• 综述：基于低共熔溶剂的生物质可持续食品蛋白提取技术

  引言核酸分离技术是分子诊断和精准医疗的核心环节。传统液相提取法涉及有毒有机溶剂（如苯酚-氯仿），操作繁琐且易造成DNA降解。相比之下，固相提取法凭借其环保特性（减少有机溶剂使用）和操作简便性成为研究热点。磁性纳米颗粒(MNPs)因其超顺磁性、生物相容性和可功能化表面，成为核酸分离的理想载体，但存在氧化敏感性和非特异性结合等问题。实验材料与方法研究团队通过水热法制备四氧化三铁(Fe3O495%的壳聚糖(CS)，最终通过液相沉积自组装将La(OH)3杂交到磁性壳聚糖表面。材料通过扫描电镜(SEM)、X射线衍射(XRD)等表征显示：La3+成功整合后形成多孔结构，比表面积达89.42 m2/g，饱和

  来源：International Journal of Biological Macromolecules

  时间：2025-08-28

• 综述：复杂肿瘤微环境中DNA甲基化异质性的定量方法、影响因素及临床意义

  复杂肿瘤微环境中的DNA甲基化异质性细胞表型可塑性DNA甲基化(5mC)异常是肿瘤发生发展的关键因素，表现为原癌基因调控区低甲基化和抑癌基因高甲基化。TP53启动子高甲基化可加速肝癌进展，而MYC增强子低甲基化会激活侵袭性肿瘤细胞。重复序列如LINE-1低甲基化与结直肠癌染色体不稳定性相关，而CpG岛高甲基化通过招募MeCP2和HDACs导致染色质压缩。CD8+ T细胞中DNMT3a调控记忆前体细胞分化，CAFs的TGF-β通路甲基化改变则影响其促肿瘤活性。DNA甲基化异质性特征单细胞水平甲基化呈二元分布(0/1)，但组织样本因细胞混合常呈现中间值。检测技术包括：•全基因组：WGBS、MeDI

  来源：Genes & Diseases

  时间：2025-08-28

• 辅助生殖技术(IVF/IUI)与自然受孕新生儿结局的同胞对照研究：治疗因素与潜在生育障碍的双重影响

  在辅助生殖技术(ART)日益普及的今天，一个关键问题始终悬而未决：试管受精(In Vitro Fertilization, IVF)和宫腔内人工授精(Intrauterine Insemination, IUI)等技术的应用，是否会增加新生儿不良结局的风险？这个问题牵动着无数准父母和生殖医学工作者的心。传统观点认为，不良结局可能源于父母本身的生育障碍(subfertility)，但越来越多的证据提示，ART操作过程本身可能也扮演着重要角色。为了厘清这个复杂的问题，Matthew R. Reeder领衔的研究团队在《Fertility and Sterility》上发表了一项独具匠心的同胞对照研

  来源：Fertility and Sterility

  时间：2025-08-28

• 工业硫酸盐木质素的工程化：酯化方法在木质素纳米粒子自组装中的关键作用

  在追求可持续发展的今天，寻找石油基产品的生物替代品成为科研热点。木质素作为植物细胞壁中含量第二丰富的天然芳香族聚合物，每年全球制浆工业产生约7000万吨副产品，但仅有不到2%被高值化利用。这种"取之不尽却用之不竭"的矛盾，源于木质素复杂的化学异质性和结构不确定性。特别是通过kraft工艺获得的工业木质素，其β-O-4'键断裂、缩合反应等化学变化，使得分子量分布更宽、酚羟基含量更高，虽然改善了在碱性和部分有机溶剂中的溶解性，但也给纳米材料的可控制备带来了挑战。木质素纳米粒子(LNPs)因其独特的性能在化妆品抗氧化剂、抗癌药物载体、农药控释系统等领域展现出应用潜力。然而，如何通过分子设计精确调控L

  来源：Biomacromolecules

  时间：2025-08-28

• 综述：纳米技术驱动的器官移植进展：器官保存、缺血再灌注损伤、免疫调节和移植后监测的多维策略

  纳米技术驱动的器官移植革命1. 纳米材料增强的器官灌注系统传统器官保存技术如静态冷保存（SCS）和低温/常温机械灌注（HMP/NMP）面临氧化损伤和微生物污染的挑战。Ye团队开发的N-烷基-O-HTCC纳米材料通过HMP递送，整合了抗菌、抗氧化和药物载体功能，显著提升肾脏保存效果。而白蛋白缀合的纳米铈（Alb-NC）在人类肝脏NMP试验中表现出卓越的ROS清除能力（Ce3+/Ce4+ ∼2.2），使谷胱甘肽水平提升94%。植物源性纳米囊泡等新型生物材料通过生物正交化学实现巨噬细胞靶向治疗，展示了多通路协同干预的潜力。2. 缺血再灌注损伤的纳米治疗策略IRI的核心机制是活性氧（ROS）爆发导致的

  来源：Materials Today Bio

  时间：2025-08-28

• 局部晚期乳腺癌患者早期放射性皮炎的风险因素分析：VMAT与IMRT技术的比较研究

  乳腺癌是全球女性发病率最高的恶性肿瘤，每年新增病例达230万。对于局部晚期乳腺癌患者，术后放疗是降低复发率的关键手段，但放射性皮炎作为最常见的急性毒性反应，严重影响患者生活质量甚至导致治疗中断。尤其值得关注的是，早期出现的放射性皮炎往往预示着更高等级皮肤损伤风险。然而，目前关于局部晚期乳腺癌患者早期放射性皮炎风险因素的研究仍存在空白，特别是不同先进放疗技术（如VMAT和IMRT）对皮肤毒性的影响机制尚未阐明。为解答这些问题，Chih-Chieh Chang等研究人员开展了一项回顾性研究，纳入128例接受IMRT或VMAT治疗的局部晚期单侧乳腺癌患者。研究通过提取患者 demographics、

  来源：Breast Cancer

  时间：2025-08-28

• 蛋白质语言模型时代下的内在无序区域预测：CAID3评估揭示技术突破与挑战

  蛋白质内在无序预测的技术革新摘要第三届蛋白质内在无序性关键评估（CAID3）揭示了蛋白质语言模型（pLM）在预测内在无序区域（IDR）中的革命性作用。通过DisProt数据库的黄金标准数据，研究团队评估了24种新方法，发现pLM驱动的预测器在连接区（linker）预测中平均精度（APS）提升31%，无序区域预测提升15%。AlphaFold3的结构预测能力与pLM的序列分析形成互补，而新型Binding-IDR基准的引入则凸显了结合位点识别的现存挑战。1 引言内在无序蛋白质（IDP）通过动态构象 ensemble 实现功能多样性，但其异质性使得实验表征困难。核磁共振（NMR）和圆二色谱等技术仅

  来源：Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

  时间：2025-08-28

• 综述：特应性皮炎指南导向性管理方法

  特应性皮炎（Atopic Dermatitis, AD）作为一种复杂异质性疾病，其管理需多维度干预。诊断环节需严格遵循Hanifin & Rajka或UK Working Party Criteria5,6标准，并筛查共病（特应性及非特应性）。关键点• 成功管理依赖正确诊断、患者/照护者教育、触发因素识别及简明治疗计划• 皮肤护理与外用药物（如钙调磷酸酶抑制剂、糖皮质激素）是基石，需足量处方并指导正确涂抹技术• 阶梯治疗：轻中度首选保湿剂+抗炎外用药，重度考虑系统治疗（如度普利尤单抗、JAK抑制剂）触发因素管理环境刺激物（如肥皂、香料）、气源性/接触性过敏原、感染及心理压力均可加剧AD

  来源：Immunology and Allergy Clinics of North America

  时间：2025-08-28

• 基于胶原塑形技术构建人源真皮-表皮皮肤替代物中网状脊结构的简易方法及其稳定性研究

  皮肤作为人体最大的器官，其复杂的微观结构一直是组织工程领域的重点难题。其中，真皮-表皮连接处(DEJ)的波浪状结构——网状脊(Rete ridges, RR)和真皮乳头(Dermal papillae, DP)对皮肤机械强度和营养交换至关重要。然而，现有真皮-表皮皮肤替代物(Dermo-epidermal skin substitutes, DESS)普遍缺乏这种三维结构，导致移植后易发生分层、机械性能不足等问题。尤其对于大面积烧伤、先天性巨痣等患者，功能性皮肤重建的需求尤为迫切。苏黎世大学儿童医院的研究团队在《Experimental Cell Research》发表的研究中，创新性地通过改

  来源：Experimental Cell Research

  时间：2025-08-28

• 基于改进型环介导等温扩增技术快速检测类鼻疽伯克霍尔德菌基因组DNA的新型诊断方法

  在东南亚潮湿的稻田里，一种名为类鼻疽的"隐形杀手"正威胁着农民的健康。这种由类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)引起的疾病，在孟加拉国等热带地区已成为严重的公共卫生问题。患者初期症状与普通感染相似，但传统培养鉴定需要5-7天，往往延误治疗导致高达40%的死亡率。更棘手的是，现有PCR检测虽快却依赖昂贵设备，在广大农村地区难以普及。面对这一困境，来自孟加拉国Ibrahim医学院的研究团队在《Current Research in Microbial Sciences》发表了一项突破性研究。研究人员采用环介导等温扩增(LAMP)技术，通过生物信息学分析锁定TTS

  来源：Current Research in Microbial Sciences

  时间：2025-08-28

• 基于DEM-MBD耦合方法的滚动勺式亚麻精量排种器机理分析与优化研究

  Highlight本研究基于DEM-MBD耦合方法，首次实现了滚动勺式亚麻排种器在黄土高原地区的动态作业模拟。通过创新性地整合RecurDyn软件的CMotion Group功能，成功复现了装置在田间滚动播种的全过程。运动状态与受力分析模拟排种器在0.75/1.00/1.25 m·s−1三种作业速度（对应角速度2.0/2.7/3.3 rad·s−1）下的实际工况。研究发现：随着速度提升，种子在型孔内的流动状态呈现显著变化——合格率下降5.27-6.66%，漏播率增加，而土壤对种子的缓冲作用（DEM）与装置机械力（MBD）的耦合效应直接影响播种均匀性。关键发现• 土壤压缩力与粒子流向可视化揭示了

  来源：Computers and Electronics in Agriculture

  时间：2025-08-28

• 基于反向离子导入的多孔微针连续血糖监测技术：碳点(CDs)在肿瘤生物治疗中的创新应用与机制解析

  亮点聚焦合成方法与表面修饰目前全球研究者已开发多种碳点(CDs)合成策略，主要分为自上而下和自下而上两大路线。部分CDs因光吸收能力较弱需通过元素掺杂（如氮掺杂）或表面修饰（如引入羧基/氨基）来增强其生物抗肿瘤效应。光热疗法(PTT)当肿瘤部位温度升至41-47℃时，CDs能将光能高效转化为热能，选择性杀伤肿瘤细胞。这种非侵入性疗法凭借其精准靶向性和低副作用备受关注，尤其适合与深部肿瘤治疗相结合。光动力疗法(PDT)在特定波长光激发下，CDs作为"纳米光敏剂"可产生活性氧(ROS)，像"分子导弹"般破坏肿瘤细胞。相比传统有机光敏剂（如卟啉类），CDs具有更优的光稳定性和肿瘤富集能力。光催化疗法

  来源：Colloids and Surfaces B: Biointerfaces

  时间：2025-08-28

• Harp算法：跨平台转录组数据协调技术提升组织解卷积精度的创新方法

  在生命科学领域，准确解析组织的细胞组成对理解疾病机制至关重要。当前主流方法存在明显局限：实验方法如单细胞RNA测序(scRNA-seq)会因组织解离导致细胞选择性丢失，而计算方法如数字组织解卷积(DTD)则受限于不同数据集间的技术差异。这种"双重困境"使得研究人员在分析肿瘤、慢性炎症等复杂组织时，常面临数据可信度的严峻挑战。《Bioinformatics》最新发表的Harp算法研究，正是为解决这一核心矛盾而生。该工作由德国雷根斯堡大学的Zahra Nozari团队主导，创新性地提出"数据协调"理念——通过整合流式细胞术测量的细胞比例与转录组参考数据，构建跨平台兼容的解卷积框架。研究团队采用非霍

  来源：Bioinformatics

  时间：2025-08-28

• UnCOT-AD：基于非配对跨组学翻译的阿尔茨海默病多组学整合预测新方法

  随着全球老龄化加剧，阿尔茨海默病(AD)已成为严峻的公共卫生挑战。这种神经退行性疾病以认知功能进行性恶化为特征，目前尚无根治方法。传统诊断主要依赖临床症状和单一组学数据，难以捕捉疾病复杂的分子机制。虽然高通量测序技术的发展带来了转录组、表观基因组等多组学数据，但一个关键瓶颈在于：不同组学数据往往来自不同样本群体，这种"非配对"特性导致现有方法不得不使用生物学意义存疑的人工配对数据，严重影响预测准确性。针对这一挑战，Abrar Rahman Abir等研究者在《Briefings in Bioinformatics》发表的研究中，提出了名为UnCOT-AD的创新框架。该研究首次实现了非配对跨组学

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-08-28

• 基于蛋白质语言模型ESM2的MULoc-Target：精准分类与检测真核蛋白靶向肽的新方法

  在细胞这个精密运转的"分子工厂"中，蛋白质需要被准确运送至特定区域才能发挥功能，这一过程依赖被称为"靶向肽"的短氨基酸序列。尽管科学家已发现线粒体转运肽(MT)、核定位信号(NLS)等8类主要靶向肽，但现有预测工具如TargetP 2.0仅能识别部分类型，且无法精确定位信号位置。更棘手的是，数据库中存在大量未经实验验证的注释，这为机制研究带来不确定性。为解决这些问题，Yuexu Jiang等研究者开发了MULoc-Target系统。该研究首先从UniProt数据库筛选获得实验验证的靶向肽数据，构建UniProt-EC7基准数据集（含5个交叉验证分组）。技术核心在于：1）采用650M参数的ESM

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-08-28

• 基于对比学习的单细胞多组学数据整合框架sCIN：突破跨模态对齐技术瓶颈

  单细胞测序技术的爆发式发展带来了前所未有的细胞分辨率，但同时也抛出了一个关键难题：如何将来自同一细胞群体的不同组学数据（如基因表达和染色质可及性）进行有效整合？这就像试图将用不同语言书写的同一本小说章节重新对齐——每种技术（scRNA-seq、scATAC-seq等）都用自己的"方言"描述细胞状态，导致直接比较变得困难重重。更棘手的是，现有方法在处理非配对数据（即不同组学来自不同细胞群体）时性能急剧下降，严重制约了临床样本的分析潜力。来自德黑兰大学的Amir Ebrahimi团队在《Briefings in Bioinformatics》发表的这项研究，提出了革命性的sCIN框架。该框架灵感源

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-08-28

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