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细菌源谷胱甘肽信号介导植物-微生物适应性权衡以增强植物缺硫耐受性
研究表明植物硫(S)稳态失衡会引发根际微生物组组成及其硫代谢功能的协同变化。通过构建包含18个菌株的合成根际细菌群落(SynCom),研究人员成功挽救了拟南芥(Arabidopsis)和十字花科叶类蔬菜在缺硫条件下的生长缺陷。这种促生特性在SynCom成员中具有广泛的分类学分布,其中细菌组合对宿主生长既产生协同效应也呈现中性作用。值得注意的是,SynCom成员间更强的竞争性互作能为宿主带来更大的适应性优势,暗示着跨王国(植物-微生物)适应性权衡机制的存在。通过化学筛选、基因敲除突变体验证及靶向代谢组学分析,最终鉴定出微生物源谷胱甘肽(glutathione, GSH)是协调这一跨王国适应性权衡
来源:Cell Host & Microbe
时间:2025-09-28
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脆弱拟杆菌蛋白酶Bfp1通过激活宿主PAR2介导肠道炎症与疼痛机制研究
蛋白酶激活受体2(Protease-activated receptor 2, PAR2)作为肠道屏障功能、炎症和疼痛调控的核心分子,其信号通路异常与炎症性肠病(IBD)和肠易激综合征(IBS)密切相关。本研究通过构建PAR2功能性筛选体系,对多样化肠道微生物库进行扫描,发现多种细菌可分泌切割PAR2的蛋白酶。利用基于不可逆共价抑制剂的化学蛋白质组学技术,研究人员鉴定出脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)分泌的先前未被表征的丝氨酸蛋白酶Bfp1。实验证实Bfp1能在多细胞模型和小鼠体内切割并激活PAR2,进而破坏上皮完整性、诱发伤害性感受器敏化,并导致结肠炎症和腹痛。该研究首
来源:Cell Host & Microbe
时间:2025-09-28
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MRC2表达调控急性髓系白血病干细胞代谢机制及其功能研究
HighlightMRC2表达可区分急性髓系白血病(AML)中的白血病干细胞(LSC)与非LSC群体。通过原代患者样本验证发现,MRC2+细胞具有显著增强的体外克隆形成能力、干细胞特性相关转录组特征,以及在小鼠异种移植模型中更强的致白血病能力。进一步研究表明MRC2在AML细胞中具有功能性作用,能介导胶原蛋白的高效摄取,从而支持其糖酵解代谢活动。这些发现凸显了功能性表面标志物在识别LSC及解析其独特生物学特性方面的重要价值。Introduction急性髓系白血病(AML)是一种侵袭性血液肿瘤,即使采用新型治疗方案仍具有高死亡率1。当造血干细胞(HSC)或造血干祖细胞(HSPC)获得关键突变并转
来源:Cancer Letters
时间:2025-09-28
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靶向DDX3调控免疫信号通路:攻克三阴性乳腺癌与炎性乳腺癌的新策略
免疫组化将4μm厚组织切片置于SuperFrost载玻片上,经脱蜡、水化后,用含0.3%过氧化氢的缓冲液阻断内源性过氧化物酶15分钟。抗原修复采用pH6.0的10mM柠檬酸盐缓冲液煮沸30分钟,冷却后PBS冲洗。切片在湿盒中与1:1000稀释的兔源DDX3多克隆抗体孵育1小时。DDX3在IBC样本中表达上调相当比例的IBC被归类为TNBC亚型,我们前期研究发现匹配的TNBC原发与转移样本中,DDX3在转移灶中表达升高。为进一步阐明DDX3在IBC中的作用,我们对47例IBC样本进行免疫组化分析。值得注意的是,IBC样本的稀缺性使每个数据点都具有重要意义。图1A展示了DDX3在IBC组织中的显著
来源:Cancer Letters
时间:2025-09-28
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抑郁症状轨迹与代谢综合征、炎症及心脏代谢疾病的纵向贝叶斯网络分析
HighlightMaterials and methods数据源自荷兰抑郁与焦虑研究(NESDA),一项针对抑郁与焦虑障碍病因及病程的纵向队列研究。研究设计与方法详见Penninx等(2021)的详细说明。基线时共纳入2981名18-65岁参与者,其中社区来源占19.0%、初级医疗占54.0%、专业心理健康机构占27.0%(2004-2007年招募)。所有参与者均有抑郁或焦虑障碍病史。Generalised mixed models样本量N=1059,基线平均年龄42.4±12.5岁,女性占比68.0%。分析变量描述见表1(含各波次抑郁发生率——基线时所有受试者均符合重度抑郁障碍临床诊断)。
来源:Brain, Behavior, and Immunity
时间:2025-09-28
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碳点在植物(表)基因组学中的新兴应用
摘要碳点(Carbon Dots, CDs)在生命科学领域具有广泛的应用。本论坛重点介绍了碳点在植物基因组学和表观基因组学方面的最新研究成果,包括其在基因转录中的作用、作为DNA、RNA及农用化学品载体在基因表达/沉默中的功能,以及在基因组和表观基因组研究中的实用性。同时提出了潜在的未来研究方向。
来源:TRENDS IN Biotechnology
时间:2025-09-28
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健康与癌变前列腺免疫微境解析:单细胞测序揭示Trem2+巨噬细胞、中性粒细胞亚群及T细胞耗竭在PTEN缺失模型中的动态演变
前列腺免疫微环境的细胞组成与稳态特征在健康小鼠前列腺中,单核吞噬细胞(MNPs)包含树突状细胞(cDC1、cDC2)、单核细胞(经典单核细胞P1、活化单核细胞P2和Ly-6C−MHCII+细胞P3)以及三种组织驻留巨噬细胞亚群:CD11b−巨噬细胞、Tim4−巨噬细胞和Tim4+巨噬细胞。其中巨噬细胞占髓系细胞的76%,是前列腺中最主要的免疫群体。空间分布上,CD11b−巨噬细胞表达高水平CX3CR1,形成上皮内网络结构;Tim4+巨噬细胞定位于血管周围,高表达Lyve-1、FolR2和CD206,具备高效血液源性配体清除能力;Tim4−巨噬细胞则分布于间质区域。通过骨髓嵌合实验和CCR2−/
来源:OncoImmunology
时间:2025-09-28
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RALF-油菜素内酯信号环路调控拟南芥下胚轴细胞形态的分子机制
植物细胞在生长发育过程中面临着一个至关重要的平衡难题:它们必须在维持细胞壁完整性的同时,精确调控细胞壁的修饰以实现各向异性生长。这种精细的平衡由细胞壁-质膜界面感知的信号所调控,即细胞壁信号传导(CWS)。近年来,快速碱化因子(RALF)家族分泌肽及其结合伴侣在调控植物生长、生殖和免疫应答中发挥着关键作用。油菜素内酯(BR)信号通路在协调细胞壁状态和细胞生长中扮演着核心角色,细胞壁-BR反馈环路的紊乱会导致组织和细胞完整性的严重缺陷。然而,细胞壁状态如何传递给BR信号通路仍然很大程度上未知。发表在《Current Biology》上的这项研究揭示了RALF肽作为细胞壁状态与BR信号通路之间的关
来源:Current Biology
时间:2025-09-28
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SPCA2介导的STIM1-ORAI1非钙库依赖性激活调控分泌上皮细胞基底CFTR活性的新机制
在分泌上皮细胞中,离子和液体的定向转运对维持器官生理功能至关重要,而囊性纤维化跨膜电导调节因子(CFTR)的活性是决定上皮离子分泌的关键限速步骤。CFTR的功能受到环磷酸腺苷(cAMP)和钙离子(Ca2+)信号的精细调控,这两种信号系统的协同作用如何实现时空特异性调控,尤其是在未受刺激的细胞中如何维持基础分泌活性,长期以来是领域内的重要科学问题。以往研究主要集中在细胞在激素或神经刺激下的激活机制,而对基底状态下CFTR的活性调控了解甚少。尤其令人困惑的是,在未受刺激的分泌上皮细胞中,CFTR仍保持一定的基础活性,这对于维持管腔表面的液体平衡和保护功能至关重要。这种基础活性的分子机制及其组织特异
来源:Current Biology
时间:2025-09-28
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磷信号与油菜素内酯通路交互新模块RLI1-OsPUB77-OsBZR3调控水稻株型建成
植物株型是影响作物产量的关键农艺性状。水稻(Oryza sativa)在磷酸盐匮乏(Pi deficiency)环境下会表现出分蘖数减少和叶片直立性增强的表型,这与油菜素内酯(brassinosteroid, BR)信号通路被抑制时的表现相似。本研究鉴定到磷信号相关转录因子RLI1a在低磷条件下解除对E3泛素连接酶基因OsPUB77的抑制,积累的OsPUB77通过泛素化修饰BR信号通路关键因子OsBZR3,进而抑制BR信号传导并塑造紧凑株型。值得注意的是,OsPUB77 U-box结构域的自然变异位点(OsPUB77R530与OsPUB77I530)表现出功能差异:OsPUB77R530因与E
来源:Molecular Plant
时间:2025-09-28
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综述:核输出受体CRM1/XPO1及其多样货物
主要核输出受体CRM1三十年前,四篇发表于《Cell》的论文及一篇综述推动了可溶性核转运因子的研究,这些因子介导蛋白质从核内输出。当时,这一研究得益于对leptomycin B(LMB)的鉴定——一种高效且选择性的核蛋白输出天然抑制剂。仅三年后,多个实验室鉴定出CRM1/XPO1(本文统称CRM1)作为主要核输出受体,其与携带核输出序列/信号(NES)的蛋白质相互作用。小GTP酶Ran在其GTP结合状态下,形成核内组装的CRM1-NES/货物-RanGTP三聚体核输出复合物的第三个组分。CRM1是与核孔复合物(NPC)相互作用的组分,负责将输出货物转运跨越NPC。通过后,Ran结合GTP的水解
来源:TRENDS IN Biochemical Sciences
时间:2025-09-28
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基于ABCC1的风险模型显著提升晚期结直肠癌腹膜转移同步诊断效能
结直肠癌(CRC)患者发生腹膜转移(PM)意味着疾病进入晚期阶段。由于早期诊断困难且机制不明,当前治疗选择有限且效果欠佳。研究团队通过31例CRC患者原发肿瘤的标记免定量蛋白质组学分析,筛选出同步性与非同步性PM组的差异表达基因,并采用实时定量PCR(qPCR)、多重免疫组化和常规免疫组化进行验证。研究人员成功构建基于ABCC1的 logistic回归风险模型。该模型在影像学阴性的CRC患者中能有效识别伴有腹膜转移的病例(训练队列AUC=0.892,95% CI: 0.840–0.944;验证队列AUC=0.831,95% CI: 0.729–0.933)。特别在癌胚抗原(CEA)阴性群体中,
来源:British Journal of Cancer
时间:2025-09-28
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从结构视角揭示甲病毒生命周期:病毒复制与组装的分子机制及其抗病毒策略意义
THE ALPHAVIRUS LIFE CYCLE甲病毒属于披膜病毒科(Togaviridae),是由蚊子传播的包膜病毒,具有正义单链RNA((+)RNA)基因组。它们既能感染脊椎动物宿主(包括人类和动物),也能感染无脊椎动物载体,常引起人类疾病,范围从轻度急性发热性疾病到脑炎不等。甲病毒可分为旧世界和新世界病毒,不仅反映地理分布,还反映疾病表现。旧世界甲病毒主要分布在非洲和亚洲,引起人类关节炎性疾病,代表性成员包括基孔肯雅病毒(CHIKV)、奥尼翁尼翁病毒(ONNV)、辛德毕斯病毒(SINV)、罗斯河病毒(RRV)和塞姆利基森林病毒(SFV)。新世界甲病毒包括委内瑞拉马脑炎病毒(VEEV)、
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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RNA结构与病毒-宿主界面:分子模拟与免疫逃逸的新视角
病毒与宿主之间的相互作用是一场持续不断的分子战争,其战场遍布从细胞表面到细胞核的各个角落。近年来,研究发现结构化的RNA元件在这一过程中扮演着关键角色,它们不仅是病毒入侵的“导管”,更是分子“模仿大师”和“嵌合体”,通过模拟宿主已有的RNA-蛋白质和RNA-RNA界面,劫持或颠覆宿主的各种生命机器。病毒RNA结构在病毒-宿主战争的前线病毒RNA是病毒基因组的核心形式或基因表达与复制的中间体。病毒RNA与宿主蛋白的界面是其中最多样化和研究最深入的,因为病毒倾向于利用这些界面来利用和改造宿主蛋白,而非编码自身蛋白。这些界面也为宿主检测病毒感染和激活免疫应答提供了重要途径。病毒RNA对宿主转录机器的
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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甲型流感病毒非经典复制与转录的分子机制及其在感染结局与免疫调控中的新见解
甲型流感病毒(IAV)是一种可引起轻度至重度呼吸道疾病的RNA病毒,其基因组由8条病毒RNA(vRNA)节段组成。近年研究发现,IAV在复制和转录过程中除产生经典RNA产物外,还会生成多种非经典RNA分子,包括mini病毒RNA(mvRNA)、带帽互补RNA(ccRNA)、带帽病毒RNA(cvRNA)以及缺失型病毒基因组(DelVG)等。这些分子的产生并非完全随机,而是受到病毒RNA聚合酶结构和功能特性的精密调控,并在病毒感染和宿主免疫应答中扮演重要角色。IAV RNA聚合酶是由PB1、PB2和PA三个亚基组成的异源三聚体,其核心是位于PB1亚基的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)结构域。该
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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流感病毒转录复制转换的分子计时器:NS2蛋白介导的精细调控机制
1. 引言流感病毒属于正粘病毒科(Orthomyxoviridae),其基因组由8个单股负链RNA节段构成,每个节段与病毒RNA依赖的RNA聚合酶(FluPol)及核蛋白(NP)组装成病毒核糖核蛋白复合体(vRNP)。在感染细胞核内,FluPol催化病毒基因组的转录(合成mRNA)和复制(合成cRNA和vRNA)。这两种过程的动态平衡在病毒生命周期中受到严格调控,感染后期从转录向复制的转换对于子代病毒的高效产生至关重要。2. 流感病毒RNA转录与复制的结构基础FluPol是由PB2、PB1和PA亚基组成的异源三聚体复合物。PB1包含核心催化中心,PB2的帽结合结构域(CBD)和PA的核酸内切酶
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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病毒密码子使用与宿主tRNA修饰的协同进化:从应激响应到广谱抗病毒策略新视角
引言病毒复制周期中,病毒蛋白的高效合成是确保有效复制和子代形成的关键步骤。病毒完全依赖宿主细胞的翻译机制,并进化出多种策略来利用这一系统。翻译过程包括起始、延伸和终止三个阶段。虽然病毒调控翻译起始的机制已有深入研究,但病毒如何影响和利用翻译延伸的过程仍知之甚少。信使RNA(mRNA)中的开放阅读框(ORF)包含影响蛋白质表达的关键信息。遗传密码的简并性使得20种氨基酸由61种密码子编码。同义密码子的使用并非随机,而是存在普遍偏好和生物体特异性倾向。密码子使用偏好与宿主转移RNA(tRNA)的浓度精细匹配。最优密码子在高表达基因中占主导地位,其对应的tRNA丰度较高;而次优密码子使用频率较低,翻
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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病毒调控宿主剪接:感染与RNA加工的新前沿
病毒调控宿主剪接1. 引言信使RNA前体(pre-mRNA)剪接现象的发现源于20世纪70年代对腺病毒(adenovirus, AdV)的研究。长期以来,该领域研究主要聚焦于病毒基因的剪接,而病毒感染对宿主基因剪接的影响及其在宿主-病毒互作中的功能后果直至近十年才迎来研究热潮。剪接过程需由宿主剪接体(spliceosome)执行,该巨分子复合物由U1、U2、U4-U6等小核核糖核蛋白(snRNP)组成,通过识别内含子5′和3′端剪接位点催化内含子去除与外显子连接。选择性剪接(alternative splicing)受RNA结合蛋白(RBP)调控,如通常增强剪接的丝氨酸/精氨酸富集蛋白(SR
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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病毒通过细胞器重塑调控感染结局:从形态功能关系到宿主互作机制
引言:细胞器动态重塑的生物学意义真核细胞的区室化结构通过膜结合细胞器实现,这些细胞器并非静态结构,其功能可通过成分组成、细胞器间互作、定位、形态和丰度的动态重塑进行调节。细胞器重塑与多种细胞信号通路整合,通过改变表面积体积比(SA:V)等基本生物学原理调控功能。膜接触位点(MCSs)介导的细胞器-细胞器互作网络可协调分裂、成熟及膜扩张等过程。鉴于病毒依赖宿主细胞机制完成感染,细胞器重塑成为所有病毒感染的基本特征和结果。线粒体在感染过程中的重塑线粒体作为最受关注的动态细胞器,其嵴结构容纳电子传递链并促进细胞呼吸。病毒通过调控裂变、融合和线粒体自噬三大过程改变线粒体功能:• 裂变与碎片化:丙型肝炎
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28
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病毒与线粒体的博弈:从能量劫持到免疫逃逸的分子机制与治疗前景
2. 线粒体:病毒的易感靶点线粒体作为细胞能量代谢、信号传导和凋亡调控的核心细胞器,在维持细胞稳态中扮演关键角色。其独特结构包括外膜(OMM)、内膜(IMM)、膜间隙(IMS)和基质,其中内膜折叠形成的嵴结构为电子传递链(ETC)和ATP合酶提供了功能平台。线粒体拥有独立基因组(mtDNA),编码13种氧化磷酸化(OXPHOS)相关多肽、2种rRNA和22种tRNA,其余约1,500种线粒体蛋白由核基因编码。线粒体通过三羧酸循环(TCA cycle)、脂肪酸β-氧化(FAO)和电子传递链产生ATP,同时是活性氧(ROS)的主要来源。在病毒感染过程中,线粒体因其在免疫信号传导中的核心地位而成为病
来源:Annual Review of Virology
时间:2025-09-28