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  • 基于信号通路优化的培养体系显著提升犬诱导多能干细胞分化潜能

    在生物医学研究领域,伴侣犬自然发生的疾病日益成为极具价值的转化疾病模型。虽然诱导多能干细胞(iPSC)技术已经彻底改变了人类生物医学研究格局,但犬iPSC(ciPSC)技术仍处于发展初期,缺乏稳健的犬特异性iPSC培养基配方和分化方案。现有ciPSC系虽然能满足多能性验证的基本标准,但其向功能细胞的分化能力尚未实现,这严重阻碍了ciPSC在多个领域的应用。先前研究表明,不同ciPSC系在当前培养基中存在异质性,表现为多能性基因表达水平不一致和体内分化潜能不稳定,这表明要么ciPSC的多能性不足以产生功能细胞,要么未知因素影响了其分化。因此,优化培养条件以维持ciPSC作为同质群体,可能改善其分

    来源:Stem Cell Reports

    时间:2025-09-20

  • RECODE平台实现单细胞数据全面降噪:跨组学整合分析的新突破

    在生命科学领域,单细胞测序技术革命性地实现了在单个细胞水平解析基因组和表观基因组信息,为人类细胞图谱(Human Cell Atlas)等大型项目提供了关键技术支撑。然而,海量数据背后隐藏着两大技术瓶颈:一是由分子检测率不均导致的技术噪音(technical noise),特别是基因漏检(dropout)现象,使得真实生物信号被掩盖,难以识别肿瘤抑制事件等细微生物学现象;二是不同实验条件引入的批次效应(batch effects),导致跨数据集比较时出现非生物性偏差。虽然已有多种插补(imputation)和整合方法被开发,但传统方法通常依赖降维处理,无法同时解决两种噪音问题,且会丢失全维度基

    来源:Cell Reports Methods

    时间:2025-09-20

  • Python反应-相互作用-扩散模拟器PyRID:高效模拟复杂生物分子系统的布朗动力学新工具

    在当今分子生物学研究领域,科学家们越来越关注细胞内复杂分子系统的动态行为。这些系统通常由大小不一、种类繁多的分子和蛋白质组成,以极高的密度存在于细胞中。细胞膜和细胞器结构限制了分子运动的空间,而跨膜蛋白(如离子通道)不仅需要在膜表面移动,还要与细胞内外的蛋白质发生相互作用。传统的热力学方法往往假设系统是孤立的,但生物细胞各个部分持续与周围环境交换离子、蛋白质等物质,这使得计算机模拟面临巨大挑战。尽管已有一些优秀的模拟工具(如MCell、Smoldyn和ReaDDy)被开发出来,但它们各自存在局限性。MCell擅长在复杂三维细胞环境中模拟反应-扩散过程,但缺乏内置的力相互作用支持;Smoldyn

    来源:Cell Reports Methods

    时间:2025-09-20

  • 急性肾损伤通过破坏转硫途径诱发肠道损伤的机制研究:谷胱甘肽耗竭与微生物群失调的作用

    急性肾损伤(Acute Kidney Injury, AKI)是临床常见的危重症,以肾功能急剧恶化为特征,常发生于肾脏移植、外科手术或危重患者中。尽管肾脏替代疗法不断进步,AKI仍具有高死亡率,尤其当累及多器官时。研究发现,AKI不仅损害肾脏本身,还会引发远端器官损伤,其中肠道是最常受累的器官之一。AKI可导致肠道炎症、微生物群失调以及肠道屏障功能受损,形成“肠漏”,但这一过程的具体机制尚未完全阐明。氧化应激作为AKI和远端器官损伤的重要介质,其与肠道微生物群的相互作用仍知之甚少。因此,探究AKI如何通过氧化应激影响肠道健康,特别是抗氧化防御系统的关键组成部分——谷胱甘肽(Glutathion

    来源:iScience

    时间:2025-09-20

  • 二价mRNA疫苗加强针在K18-hACE2小鼠中比突破性感染更有效增强对XBB.1.5的免疫保护

    随着新冠病毒SARS-CoV-2的持续进化,奥密克戎变异株特别是XBB亚系展现出显著的免疫逃逸能力,给疫苗保护效果带来严峻挑战。XBB.1.5作为重组谱系代表,其刺突蛋白发生大量突变,能够逃逸由先前感染或疫苗接种所诱导的免疫力。尽管二价mRNA疫苗(同时包含原始株和奥密克戎BA.4/5成分)已在2022年9月作为加强针投入使用,并在针对多数奥密克戎变异株时显示出更强和更广泛的中和抗体反应,但其对XBB谱系的防护效果仍较为有限。与此同时,奥密克戎突破性感染在真实世界频繁发生,其免疫激活效果与疫苗加强孰优孰劣尚不明确。在此背景下,研究者利用K18-hACE2转基因小鼠模型,系统比较了二价mRNA疫

    来源:iScience

    时间:2025-09-20

  • 星形胶质细胞分泌多效蛋白(PTN)失调导致唐氏综合征神经元结构与功能缺陷的机制研究

    在神经发育领域,唐氏综合征(Down syndrome, DS)作为最常见的遗传性智力障碍疾病,其神经系统异常表现为大脑体积减小、树突分枝减少和突触密度降低。尽管传统研究多聚焦于神经元自身缺陷,近年研究发现星形胶质细胞(astrocyte)分泌的蛋白质组在神经环路形成中起着关键调控作用。值得注意的是,DS患者和模型小鼠的星形胶质细胞存在显著的分泌蛋白紊乱,但具体哪些分子参与其中以及能否通过干预这些分子改善神经功能仍不清楚。针对这一科学问题,Brandebura团队在《Cell Reports》上发表了他们的最新研究成果。他们借助Ts65Dn(一种广泛使用的DS小鼠模型)和条件基因敲除技术,结合

    来源:Cell Reports

    时间:2025-09-20

  • 遗传杂交揭示微小隐孢子虫毒力相关基因组位点:GP60糖蛋白的关键作用及正向遗传学框架建立

    隐孢子虫是一种在全球范围内引起儿童腹泻病和婴幼儿死亡的重要病原体,尤其在营养匮乏和卫生条件较差的地区造成严重负担。尽管感染普遍,但个体感染结局差异巨大,可从无症状携带到致命性疾病。这种变异性由宿主免疫状态、遗传背景、环境因素和病原体基因型共同决定。然而,由于缺乏有效的遗传操作工具和体内研究模型,隐孢子虫的致病机制及宿主-病原体互作关系至今仍不明确。尤其值得注意的是,不同隐孢子虫菌株在毒力、持久感染能力和宿主适应性上存在显著差异,但其遗传基础一直未被揭示。为了系统解析隐孢子虫毒力的遗传决定因素,Sebastian Shaw、Xue Li等研究人员在《Cell Reports》上发表了最新研究成果

    来源:Cell Reports

    时间:2025-09-20

  • 牛磺酸转运通过调控离子稳态成为NLRP3炎症小体激活的关键代谢检查点

    炎症反应是机体防御病原体入侵的重要机制,但过度激活则会引发多种自身免疫性疾病和感染相关病理损伤。NLRP3炎症小体作为细胞内重要的多蛋白复合物,在感知病原体或危险信号后激活caspase-1,促进白细胞介素-1β(IL-1β)和IL-18等促炎因子的成熟释放,并引发细胞焦亡(pyroptosis)。尽管代谢重编程已被证实是炎症小体激活的核心特征,但大多数研究集中于能量代谢和脂质代谢领域,氨基酸代谢特别是牛磺酸代谢的调控作用仍知之甚少。由Peter Rossi-Smith和Rachel P.J. Lai等学者在《Cell Reports》发表的研究,通过非靶向代谢组学技术发现牛磺酸代谢通路是NL

    来源:Cell Reports

    时间:2025-09-20

  • CD7调控慢性感染中终末耗竭CD8+ T细胞存续的关键机制及其在肿瘤免疫中的意义

    在慢性病毒感染和肿瘤发展过程中,CD8+ T细胞常常会进入一种称为“耗竭”(exhaustion)的功能失调状态。这种状态表现为效应功能减弱、抑制性受体(如PD-1、Tim-3等)表达上调,并伴随独特的转录和表观遗传特征。尽管免疫检查点阻断(ICB)疗法在部分患者中取得显著成效,但多数情况下T细胞应答依然短暂,终末耗竭T细胞最终难以避免凋亡的命运。因此,寻找调控终末耗竭T细胞存活与功能的关键分子,已成为免疫治疗领域的重要课题。在此背景下,Sean Hyslop、William H. Hudson等团队在《Cell Reports》上发表了一项研究,系统揭示了CD7——一个以往研究较少但高表达于

    来源:Cell Reports

    时间:2025-09-20

  • PI3Kδ通路免疫失调的双刃剑效应:两例罕见病例揭示的新见解与临床挑战

    在免疫学的复杂调控网络中,磷酸肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)通路犹如一把双刃剑,其细微的活性变化可能导致截然不同的临床结局。近年来研究发现,PI3Kδ通路的异常活化与活化PI3Kδ综合征(APDS)密切相关,患者表现为反复感染、淋巴增殖和自身免疫现象。然而,这条通路的低活化状态却较少被报道,其临床表征与超活化状态存在显著差异,这种双向失调机制成为免疫缺陷领域的新兴研究热点。发表于《Immunologic Research》的研究通过两例极具代表性的病例,揭示了PI3Kδ通路相关免疫失调的临床异质性和管理挑战。第一例患者携带PIK3R1基因新型杂合突变(c.5A>T, p.Tyr2Phe),

    来源:Immunologic Research

    时间:2025-09-20

  • X连锁无丙种球蛋白血症患者单核细胞亚群与HLA-DR表达:揭示先天性免疫代偿机制及支气管扩张预测新指标

    Bruton酪氨酸激酶(BTK)在先天性免疫细胞中表达,其缺失可能影响X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)患者的单核细胞功能,进而调控感染易感性和炎症反应。本研究通过流式细胞术分析59例XLA患者和37例健康对照,鉴定三类单核细胞亚群:经典(CD14++CD16−)、中间(CD14++CD16+)和非经典(CD14lowCD16++),并检测其人类白细胞抗原DR(mHLA-DR)表达强度(平均荧光强度, MFI)。单核细胞可塑性通过经典/中间单核细胞(CMIM)比值评估。XLA患者群体包含38例儿童(平均10.46±4.81岁)和21例成人(25.09±6.18岁)。与健康对照相比,患者经典单核细

    来源:Immunologic Research

    时间:2025-09-20

  • NPGS苏丹高粱种质资源揭示新型抗锈病R基因簇(Rp2)及其在禾本科作物中的保守性功能

    材料与方法研究对268份美国国家植物种质系统(NPGS)苏丹高粱核心种质进行了为期4年(2014-2021)的多环境锈病抗性评价。在波多黎各伊莎贝拉和玛雅圭斯两个试验点采用完全随机设计,使用1-5级严重度评分标准(1=无病斑,5=66%-100%叶面积感染)进行表型鉴定。通过基因分型测序(GBS)获得的183,184个SNP中筛选5,366个无连锁标记进行群体结构分析,采用固定和随机模型循环概率统一(farmCPU)模型进行GWAS分析,利用PLINK进行连锁不平衡(LD)区块界定。抗性种质筛选与群体分布四年多点鉴定发现18个稳定抗病(评分<2.0)种质,其中PI 568621、PI 5693

    来源:The Plant Genome

    时间:2025-09-20

  • 三裂叶薯高密度遗传连锁图谱构建及形态性状数量性状位点(QTL)定位研究揭示甘薯野生近缘种关键遗传机制

    引言背景三裂叶薯(Ipomoea trifida)作为二倍体野生种(2n=2x=30),被认为是六倍体甘薯(Ipomoea batatas,2n=6x=90)最接近的野生祖先。甘薯是全球重要的粮食作物,但其多倍体特性导致遗传研究进展缓慢。近年来,基因组学工具如数量性状位点(QTL)定位为解析甘薯性状遗传机制提供了新途径。材料与方法研究利用M9×M19杂交产生的210个全同胞群体,通过基因分型测序(GBS)获得26,968个SNP标记。经过过滤后,最终使用6,464个高质量SNP构建遗传图谱。表型数据包括11个形态性状(如叶片形状、叶片数、株高、叶面积等),在秘鲁国际马铃薯中心(CIP)的网室条

    来源:The Plant Genome

    时间:2025-09-20

  • SlEIN2介导的表观遗传网络平衡番茄果实成熟与天然免疫的新机制

    在番茄果实成熟过程中,乙烯和DNA/RNA甲基化发挥着关键作用。研究发现m6A去甲基酶SlALKBH2通过调节m6A修饰调控DNA 5-甲基胞嘧啶去甲基酶基因SlDML2的mRNA稳定性。乙烯信号核心组分SlEIN2(而非下游转录因子SlEILs)显著抑制slein2突变体果实中SlDML2的表达,并优先调控多个成熟关键基因启动子区的非对称CHH甲基化。机制上,SlEIN2直接与SlALKBH2互作,以SlEIN2依赖的方式促进SlDML2表达。此外,RNA导向的DNA甲基化(RdDM)通路组分SlAGO4A和SlAGO4B在slein2果实中上调。野生型果实中沉默SlAGO4A/B会导致早熟

    来源:The Plant Journal

    时间:2025-09-20

  • 紫玉米提取物通过调控AMPK/SIRT1/p53通路拮抗阿霉素诱导的心肌细胞毒性机制研究

    1. 引言阿霉素(Doxorubicin, Doxo)作为广谱蒽环类化疗药物,其临床应用受限于剂量依赖性的不可逆心脏毒性,可导致进行性心肌病和充血性心力衰竭。花青素(Anthocyanins, ACNs)因其抗氧化和抗炎特性被公认具有心脏保护作用。富含花青素的紫玉米提取物(RED)主要含矢车菊素-3-葡萄糖苷(Cyanidin 3-glucoside, C3G)及其乙酰化衍生物,前期研究证实其能减轻小鼠模型中Doxo诱导的心脏毒性。本研究旨在揭示RED通过成纤维细胞生长因子21/AMP活化蛋白 kinase/沉默调节蛋白1(FGF21/AMPK/SIRT1)/p53通路调控心肌保护作用的分子机

    来源:Oxidative Medicine and Cellular Longevity

    时间:2025-09-20

  • 生物性别对体内骨骼肌疲劳代谢基础的影响:无机磷酸盐(Pi)的核心作用与性别差异的代谢机制解析

    本研究通过创新性的间歇性等长单腿膝伸运动模型(60次最大自主收缩,3秒收缩/2秒放松),结合磷磁共振波谱(31P-MRS)和股神经电刺激技术,揭示了生物性别对体内骨骼肌疲劳代谢调控的深层机制。关键发现显示:男性受试者在两次运动试验中均表现出更显著的股四头肌抽搐力(Qtw)下降(P<0.048)。通过实时监测股四头肌内无机磷酸盐(Pi)和氢离子(H+)浓度动态变化,发现Qtw-Pi关系在两次试验中保持高度一致性,而Qtw-H+关系则出现向下偏移。值得注意的是,针对特定代谢物浓度升高引发的收缩功能下降幅度,两性间未呈现显著差异。研究通过相关性分析进一步证实,运动诱导的Qtw下降与Pi积累呈现强相关

    来源:The Journal of Physiology

    时间:2025-09-20

  • 高海拔适应与妊娠缺氧协同塑造啮齿类胎盘血管发育:跨物种趋同进化机制解析

    摘要妊娠期缺氧(gestational hypoxia)会显著降低包括人类在内的哺乳动物胎儿生长速度和出生体重。而对高海拔缺氧环境的进化适应能够有效缓解这些负面影响,识别这些保护机制为了解环境因素如何与妊娠生理相互作用以影响健康结局提供了关键视角。胎盘作为介导母胎交换的核心器官,其发育过程虽已知受妊娠缺氧调节,但高海拔适应如何与这种发育可塑性相互作用以影响胎盘交换能力仍属未知。本研究利用北美鹿鼠(Peromyscus maniculatus)模型系统,检验了"胎盘交换表面的缺氧依赖性重塑对胎儿生长具有保护作用,因而在高海拔适应个体中会更为显著"的假说。引言高海拔居住与哺乳动物妊娠不良结局风险增

    来源:The Journal of Physiology

    时间:2025-09-20

  • 综述:GSDIb和G6PC3缺乏导致中性粒细胞减少症的病理生理学:1,5-脱水葡萄糖醇的来源、代谢和清除

    1 引言1.1 代谢与修复:维持健康的关键DNA修复对于确保遗传信息准确传递的重要性已获公认,然而,代谢物同样需要修复的理念却较少被关注。事实上,代谢物修复酶的缺陷会导致疾病,这清楚地表明代谢物修复至关重要。生物化学教科书将中间代谢酶描述为对其底物和所催化反应具有高度特异性,但这种特异性并非绝对。许多(若非全部)酶会以比其主要生理反应低103–106倍的速率作用于细胞内结构相似的代谢物。这些副反应看似微不足道,但问题在于产生的异常代谢物并非经典代谢酶的合适底物。若没有特定的代谢物修复酶来清除它们,这些异常化合物会积累至有毒水平。自从L-2-羟基戊二酸尿症被确认为首个先天性代谢物修复错误以来,多

    来源:Journal of Inherited Metabolic Disease

    时间:2025-09-20

  • 茉莉酸信号通过miR858-MdMYB73模块调控苹果酸积累的机制研究

    苹果酸(malic acid)是决定苹果(Malus domestica)果实风味与酸度的关键成分。尽管其代谢的转录调控已被广泛研究,但转录后调控及茉莉酸(JA)的作用仍不清楚。本研究揭示了一条由JA信号、microRNA(miRNA)和液泡转运调控因子共同组成的全新通路:成熟期上调的mdm-miR858直接靶向并切割MdMYB73(液泡H+泵和苹果酸转运的正向调控因子),抑制其下游靶基因MdVHA-A、MdVHP和MdALMT9的表达,从而降低苹果愈伤组织、果实和GL-3植株中的苹果酸含量;干扰miR858则产生相反效应。JA响应转录因子MdMYC2(成熟期表达升高)直接结合mdm-miR8

    来源:Journal of Integrative Plant Biology

    时间:2025-09-20

  • 综述:肥大细胞免疫代谢在2型糖尿病与阿尔茨海默病中的作用

    ABSTRACT2型糖尿病(T2D)与阿尔茨海默病(AD)在病理表现和临床症状上看似截然不同。然而,T2D是AD的一个明确风险因素,并且近期证据表明,这两种疾病在病因学上存在诸多机制上的相似性,其中炎症是核心环节。肥大细胞作为常驻于组织中的哨兵免疫细胞,广泛分布于胰腺、脂肪组织和大脑中。在T2D和AD中,其数量均会增多,并且大量研究普遍表明它们会加剧这两种疾病的进展。不过,关于局部或时序性肥大细胞剔除的研究仍然有限,并且不同的表型与极化状态似乎也影响着肥大细胞在疾病进程中扮演的角色。鉴于T2D与AD在代谢层面存在相似性,例如胰岛素抵抗和脂质向大脑的流入,本综述深入探讨了葡萄糖、胰岛素、胰淀素(

    来源:Journal of Cellular Physiology

    时间:2025-09-20


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