• 优化rpoB基因巢式PCR扩增策略提升宿主相关低浓度细菌DNA的宏条形码分析灵敏度

  ABSTRACT研究针对宿主相关微生物组研究中低浓度细菌DNA的检测难题，创新性地开发了基于rpoB基因的巢式PCR扩增策略。作为细菌RNA聚合酶β亚基的编码基因，rpoB因其单拷贝特性和快速进化速率，能提供比传统16S rRNA基因更高的物种级分类分辨率。然而，其高度变异的序列特征导致引物简并性过高，在宿主DNA占主导的样本中扩增效率低下。通过设计外引物（rpoB_F/R）和内引物（Uni_rpoB_deg_F/R）的两步扩增体系，首次将巢式PCR技术应用于宏条形码分析，成功将检测灵敏度提升100倍。INTRODUCTION微生物组研究长期依赖16S rRNA基因的V3-V4区短读长测序，但

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• 急诊科疑似社区获得性肺炎患者床旁分子检测的临床价值：随机对照试验的二次分析

  微生物学检测方法的对决在145例疑似社区获得性肺炎（CAP）患者的呼吸道样本中，床旁聚合酶链反应（POC-PCR）与传统培养法展开正面较量。研究数据显示，POC-PCR以压倒性优势检出187株病原体，远超培养法的34株。其中流感嗜血杆菌（H. influenzae）的检出差异尤为惊人（61 vs 16），肺炎链球菌（S. pneumoniae）的检测一致性也仅31.6%。值得注意的是，当POC-PCR检测浓度达到107 copies/mL时，这两种细菌与专家小组CAP诊断的关联性显著增强，暗示病原体载量可能成为区分定植与感染的客观指标。抗生素治疗的精准导航在67例检出肺炎链球菌和/或流感嗜血杆

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• 产碳青霉烯酶肠杆菌的临床影响与传播：一项基于基因组的中国研究

  ### 一种重要的病原体：产碳青霉烯酶肠杆菌（CPEn）的临床影响与传播近年来，随着抗生素的广泛使用，耐药性细菌的出现成为全球公共卫生领域面临的一个重大挑战。其中，产碳青霉烯酶肠杆菌（Carbapenemase-producing *Enterobacter*，简称CPEn）因其对多种抗生素产生耐药性，尤其是对碳青霉烯类抗生素的耐药性，被认为是一种具有严重临床影响的病原体。这类细菌主要感染住院患者，且在医院环境中具有较强的传播能力，对患者的预后产生重大影响。因此，深入了解CPEn的感染谱、对患者预后的影响以及其在医院内的传播模式，对于制定有效的感染控制策略至关重要。CPEn的临床感染表现多样，

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• 酵母表面展示荧光蛋白复合物的单细胞分析及其在人工纤维素酶体设计中的应用

  Development of a FPC研究团队创新性地构建了荧光蛋白复合物（FPC）作为人工纤维素酶体（DC）的替代模型。该复合物包含三模块支架蛋白（含CBM碳水化合物结合模块和Ac/Bc/Af来源的cohesin结构域）与GFP标记的对接蛋白（FDP），通过物种特异性cohesin-dockerin相互作用（KD=10−12-10−7 M）实现自组装。支架蛋白通过Aga2p锚定在酵母表面，而FDP通过α因子信号肽分泌至胞外，为后续可视化分析奠定基础。Population-wide analysis of FPC expression流式细胞术定量显示：单独表达支架蛋白时64.7%细胞呈现阳

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• 立克次体保守溶血素TlyC在斑点热发病机制中的关键作用及其分子机制研究

  ABSTRACT立克次体（Rickettsia）是一类专性胞内寄生菌，通过吸血节肢动物传播，引发斑点热等致命性血管炎。尽管遗传工具的发展促进了对其宿主-载体互作机制的研究，但立克次体如何在哺乳动物宿主和节肢动物载体两种截然不同的环境中调控毒力功能仍不清楚。细菌溶血素通过孔形成活性和受体互作中和先天免疫，此前研究认为斑疹伤寒群（TG）立克次体（如R. typhi和R. prowazekii）能直接与红细胞（RBCs）作用诱导溶血，而斑点热群（SFG）立克次体（如R. conorii和R. parkeri）无此活性。本研究通过转座子插入变异体（HK27）证实，保守因子TlyC是介导pH、温度和宿主

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• C3H/HeJ小鼠模型中伯氏疏螺旋体与微小巴贝虫长期共感染的互作机制及对莱姆关节炎与巴贝虫病的影响

  长期共感染的动态互作研究通过C3H/HeJ小鼠模型系统评估了伯氏疏螺旋体（B. burgdorferi）N40株与微小巴贝虫（B. microti）的16周共感染效应。实验设计分为四组：单纯N40感染、单纯B. microti感染、共感染及对照组。结果显示，B. microti在急性期（3周）的寄生虫血症峰值在共感染组显著降低（雄性：5.1% vs 28.4%；雌性：12.0% vs 29.1%），但16周后仍可检测到低水平（<1%）持续感染。性别差异与脾脏病理雌性小鼠的脾肿大在16周时仍显著（单纯B. microti组脾重增加7.7倍），而雄性小鼠则趋于缓解。共感染组的脾重介于单纯感染

  来源：Microbiology Spectrum

  时间：2025-08-13

• 禽波氏杆菌毒力调控因子BvgS介导营养诱导丝状化机制及其致病意义

  ABSTRACT禽波氏杆菌(Bordetella avium)作为禽类呼吸道传染病波氏杆菌病的病原体，其致病机制长期被认为由双组分毒力调控系统BvgAS主导。然而最新研究发现，该菌在富含营养的培养基(TB)中会呈现显著的丝状化现象，这种形态转变与经典毒力调控网络存在未知关联。通过筛选获得两个独立的不形成丝状体的突变株9b-6和10a-1，全基因组测序揭示它们均在bvgS基因存在特异性突变——前者携带10个氨基酸插入(p.R687_V688insLLPYSDSLGR)，后者发生D580Y点突变。引人注目的是，完整敲除bvgS的菌株仍保留丝状化能力，暗示这些突变可能将细菌锁定在特定的调控状态。IN

  来源：Journal of Bacteriology

  时间：2025-08-13

• 综述：胶质母细胞瘤中单核细胞来源巨噬细胞的新见解

  MDM的浸润与激活单核细胞通过CCR2/CCL2信号轴从骨髓迁移至胶质母细胞瘤（GBM）微环境。人类单核细胞分为经典（CD14++CD16−）、中间型（CD14+CD16+）和非经典（CD14+CD16++）亚群，而小鼠则为Ly6C+CCR2+炎症单核细胞和Ly6C−CCR2−巡逻单核细胞。GBM中PDGF-BB通过PDGFRβ通路诱导周细胞分泌IL-33，促进MDMs在血管周围定植。血脑屏障（BBB）破坏后，MDMs在缺氧核心区极化为免疫抑制表型，高表达ARG1、TGF-β和PD-L1。MDMs的功能多样性加速异常血管化缺氧-MDMs通过NF-κB-p50/HIF-1α轴分泌VEGF-A，促

  来源：Research

  时间：2025-08-13

• 基于机器学习的柑橘园作物系数动态估算框架：提升地中海地区农业水资源利用效率

  在地中海气候区，气候变化正加剧水资源短缺，而农业用水占全球淡水消耗的70%。柑橘作为该地区主要经济作物，其高耗水特性与有限水资源间的矛盾日益突出。准确估算作物系数(Kc)是优化灌溉的关键，但传统方法依赖昂贵的涡度协方差(EC)系统或复杂的卫星遥感技术，难以大规模应用。巴勒莫大学工程学院(University of Palermo, Italy)的研究团队创新性地将机器学习与季节性趋势分解相结合，开发了一套经济高效的Kc动态估算框架。研究采用2018-2022年西西里柑橘园的田间监测数据，包括太阳辐射、温湿度、风速等气象参数和土壤含水量(SWC)。通过多层感知器(MLP)、随机森林(RF)和k近

  来源：Computers and Electronics in Agriculture

  时间：2025-08-13

• 综述：肿瘤血管生成微环境中的代谢作用机制

  生理性血管生成胚胎发育初期通过血管发生（Vasculogenesis）形成原始血管网络，随后由血管生成（Angiogenesis）主导扩展。成年后血管生成仅见于伤口愈合等特定场景，其核心是内皮细胞（ECs）在促血管因子（如VEGF-A、FGF-2）与抑制因子（如血栓孢素-1）的动态平衡下被激活。缺氧通过稳定HIF-1α上调VEGF表达，而VEGFR2介导的ERK/MAPK和PI3K/Akt通路驱动EC迁移增殖。EC表型可塑性表现为尖端细胞（Tip Cells）与茎干细胞（Stalk Cells）的分化，前者高表达DLL4-Notch信号引导血管定向生长。病理性血管生成与肿瘤肿瘤超过2mm3时会

  来源：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics

  时间：2025-08-13

• 光系统II光损伤与激发能淬灭的时间分辨荧光研究：拟南芥模型揭示修复机制新见解

  亮点本研究首次在拟南芥中同步分析了开放（Fo）和关闭（Fm）反应中心条件下光抑制对PSII荧光寿命的影响，揭示了核心复合物中淬灭体的形成机制，并推翻FtsH依赖的淬灭体降解假说。材料与方法实验使用野生型拟南芥、缺乏外周天线的chlorina突变体，以及FtsH2缺陷突变体var2-1和var2-5。通过条纹相机时间分辨荧光系统，在添加修复抑制剂林可霉素（lincomycin）或水的对照组中，测量不同光强处理后的荧光衰减动力学。结果Fm条件下：chlorina突变体数据显示，光抑制淬灭体直接形成于PSII核心复合物，与外围天线无关。Fo条件下：光抑制导致PSII平均荧光寿命增加，但FtsH突变体

  来源：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

  时间：2025-08-13

• 高氧浓度对透化骨骼肌纤维线粒体功能及过氧化氢生成的影响机制研究

  在探索细胞能量工厂——线粒体的奥秘时，科学家们长期面临一个两难困境：体外实验中需要高氧环境确保线粒体充分"工作"，但过量的氧气又可能引发"氧化风暴"。这个矛盾在骨骼肌研究中尤为突出，因为肌肉收缩高度依赖线粒体产生的能量。以往研究多聚焦于孤立线粒体，但这类模型丢失了细胞原有的三维结构特征。透化肌纤维技术虽能保留线粒体的天然微环境，却因氧扩散限制不得不使用超高氧浓度（常达300 mmHg以上），这种"拔苗助长"的操作是否会反噬线粒体功能？美国退伍军人事务部盐湖城医疗中心老年研究教育临床中心（Geriatric Research, Education, and Clinical Center, Ge

  来源：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

  时间：2025-08-13

• 基于深度对比学习的抗体NGS数据可视化工具deepNGS Navigator：实现高效克隆家族识别与功能聚类

  在抗体药物研发领域，海量的B细胞受体(BCR)测序数据就像一座未被充分挖掘的金矿。随着高通量测序技术的发展，单次实验就能产生数百万条抗体序列，这些数据蕴含着免疫系统对抗原应答的完整"作战方案"。然而，如何从这数据海洋中精准识别具有治疗潜力的抗体克隆，却成为困扰研究人员的难题。传统方法如系统发育树分析受限于计算效率和不完整的种系数据库，而常规降维可视化技术又难以保持序列间的功能关联性。更棘手的是，骆驼等非模式生物的抗体研究还面临种系注释缺失的挑战。针对这些瓶颈，Genentech公司Prescient Design团队开发了革命性的deepNGS Navigator分析平台。这项发表在《Bioi

  来源：Bioinformatics

  时间：2025-08-13

• 不同基质来源黑水虻幼虫粉替代鱼粉对斑马鱼生长、肠道健康及繁殖性能的影响研究

  随着全球水产养殖业快速发展，鱼粉(FM)作为传统蛋白源面临资源枯竭和价格攀升的双重压力。据统计，当前水产饲料消耗了全球70%的鱼粉产量，而野生鱼类资源的持续衰退使得寻找新型可持续蛋白源成为行业迫切需求。在此背景下，昆虫蛋白因其高转化效率和低碳特性脱颖而出，其中黑水虻(Hermetia illucens)幼虫粉(BSFLM)更因其卓越的营养价值和适应多种有机废物的能力备受关注。然而，不同培育基质如何影响BSFLM的营养成分及其在鱼类饲料中的应用效果，仍是亟待解决的科学问题。意大利比萨大学兽医科学系的研究团队在《Aquaculture Reports》发表的最新研究中，创新性地采用草莓加工副产物(

  来源：Aquaculture Reports

  时间：2025-08-13

• 底物结构决定p97和RAD23A/B介导的人细胞蛋白酶体降解途径

  在真核细胞中，泛素-蛋白酶体系统(UPS)如同精密运行的"蛋白质回收站"，负责清除错误折叠或损伤的蛋白质。然而，这个系统如何根据底物特性选择不同降解途径，一直是领域内悬而未决的核心问题。东京大学医学科学研究所蛋白质代谢分部的Yi Ding等研究人员在《The Journal of Biochemistry》发表的研究，通过精巧的实验设计揭开了这一谜题。研究人员采用稳定转染的HCT116细胞系，结合CHX追踪实验、Ub-AQUA/PRM（绝对定量质谱）和DIA-MS（数据非依赖性采集质谱）技术，系统比较了Ub-GFP和Ub-GFP-tail两种底物的降解机制。通过siRNA筛选、免疫共沉淀-质谱

  来源：The Journal of Biochemistry

  时间：2025-08-13

• 基于自分泌ECM的成熟心肌类器官模型在阿霉素心脏毒性研究中的突破

  这项突破性研究构建了革命性的心脏类器官培养体系——通过摒弃传统人工ECM，巧妙利用成纤维细胞自主分泌天然细胞外基质(ECM)的特性，成功解决了类器官结构松散和功能不成熟的行业痛点。实验采用诱导多能干细胞(iPSC)分化的心肌细胞，通过心肌肌钙蛋白T(cTNT)和肌球蛋白轻链2(MYL2)免疫荧光染色结合基因表达谱分析，证实了模型具备成年心肌特征。在阿霉素(Doxorubicin)心脏毒性机制研究中，该模型展现出惊人的病理模拟能力：药物处理组类器官不仅出现体积萎缩和胶原沉积增加的结构异常，更伴随搏动频率下降和节律紊乱等功能障碍。二维培养实验进一步揭示，阿霉素会激活成纤维细胞、诱导内皮细胞发生内皮

  来源：Toxicological Sciences

  时间：2025-08-13

• 全基因组SNP揭示狭域寄生植物Psittacanthus auriculatus的遗传混合与隔离机制

  这项突破性研究解密了金雀花桑寄生(Psittacanthus auriculatus)在墨西哥瓦哈卡干旱山谷中的进化密码。科研团队采用基因分型测序技术(GBS)获取69个样本的全基因组单核苷酸多态性(SNPs)数据，配合物种分布模型(SDM)和近似贝叶斯计算(ABC)分析，绘制出这种寄主专一性植物的遗传图谱。数据显示该物种明显分化为两大遗传集群：西部山谷群体（北部种群）和中部山谷群体（南部种群）。有趣的是，在历史隔离的北部种群中还发现了更精细的遗传亚结构。通过生态位建模重建发现，末次盛冰期(LGM)的栖息地收缩与片段化是造成这种分化的关键驱动力，而间冰期（末次间冰期和现代）的气候变暖则促进了种

  来源：Plant and Cell Physiology

  时间：2025-08-13

• 臭氧胁迫与干旱对大豆光合作用及产量的叠加效应研究

  当对流层臭氧浓度升高与干旱天气在农田同步出现时，这两种环境胁迫因子如何影响作物生理机制？科学家们采用创新的自由臭氧富集技术(FACE)，配合可拦截40%降雨的遮雨棚，对大豆(Glycine max)展开为期三年的田间实验。令人惊讶的是，100 ppb的臭氧浓度会持续削弱大豆的光合器官功能：核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)的羧化效率下降17%，光合电子传递链(ETR)的最大容量降低9%。通过监测土壤含水量、脱落酸(ABA)与气孔导度(gs)的动态关系，研究发现臭氧并未破坏大豆应对干旱的自我保护机制——气孔仍能正常响应土壤干旱信号。在产量构成方面，臭氧暴露导致单株结荚数和籽粒

  来源：Plant Physiology

  时间：2025-08-13

• 芳香酶抑制剂与低剂量睾酮对青春期延迟男孩骨密度及骨结构影响的随机对照研究

  这项开创性研究揭示了性激素在青春期骨骼发育中的精妙调控机制。研究人员采用随机对照设计，通过外周定量计算机断层扫描(pQCT)技术，对27名青春期延迟男孩进行了为期12个月的追踪观察。受试者被随机分配接受来曲唑(2.5 mg/天)或睾酮(1 mg/kg/4周)治疗。结果显示，睾酮治疗组在3个月内就展现出更显著的骨形成标志物升高，包括Ⅰ型前胶原氨基端延长肽(P1NP)和骨特异性碱性磷酸酶(BAP)。特别值得注意的是，治疗6个月时，睾酮组胫骨远端骨矿物质含量(BMC)增幅显著高于来曲唑组(18.1 vs -1.8 mg/mm)，这一差异具有统计学意义(p=0.043)。有趣的是，两组中睾酮水平的变化

  来源：European Journal of Endocrinology

  时间：2025-08-13

• 原发性醛固酮增多症中醛固酮抑制试验(SST/CCT)的诊断不一致性与临床局限性研究

  这项研究对原发性醛固酮增多症(primary aldosteronism, PA)诊断领域的金标准检测方法提出了重要质疑。传统采用的盐水抑制试验(saline suppression test, SST)和卡托普利挑战试验(captopril challenge test, CCT)在531例高概率PA患者的验证中展现出令人担忧的诊断波动性——根据检测标准不同，PA确诊率竟出现47.8%到97.2%的巨大跨度。更值得注意的是，这两种本应相互验证的检测方法之间存在10.9%-51.6%的结果矛盾率。研究团队特别聚焦临床确诊的典型PA病例时发现，即便在这些理论上无需依赖抑制测试的明确病例中，SST

  来源：European Journal of Endocrinology

  时间：2025-08-13

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