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整合多组学数据揭示癌症染色体臂缺失驱动基因的新框架
癌症研究领域长期面临一个核心难题:虽然90%的实体肿瘤都存在非整倍体现象,但导致特定染色体臂反复缺失的真正驱动基因却大多未知。非整倍体作为癌症的标志性特征,其形成机制和功能影响一直是科学家们关注的焦点。每个染色体臂缺失事件会影响数百甚至数千个基因,如何在众多基因中精准识别出真正的"司机"基因,成为领域内的重大挑战。以往的研究主要关注染色体臂的整体特征与缺失频率的关系,例如肿瘤抑制基因的密度和效力。然而,这些研究未能直接鉴定具体的驱动基因。随着癌症基因组图谱等大型数据库的建立,以及高通量测序技术的成熟,研究人员现在有机会从多组学角度深入探索这一难题。在这项发表于《Cell Reports》的研究
来源:Cell Reports
时间:2025-10-25
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纳米抗体抑制状态下人胆汁盐转运蛋白NTCP的高分辨率结构揭示其非活性构象机制
在肝脏生理和病毒感染的舞台上,钠-牛磺胆酸共转运多肽(NTCP)扮演着双重关键角色:一方面作为肝细胞基底膜上负责胆汁盐摄取的关键转运蛋白,维持着肠肝循环的平衡;另一方面又是乙型肝炎病毒(HBV)和丁型肝炎病毒(HDV)入侵肝细胞的分子门户。尽管其生理和病理意义重大,但关于NTCP如何协调钠离子与胆汁盐的协同转运,以及病毒如何利用这一转运蛋白实现感染,仍存在诸多未解之谜。近年来,NTCP的结构生物学研究取得了突破性进展。2022年,多个研究团队首次报道了NTCP的冷冻电镜结构,揭示了底物结合位点和钠离子结合位点的空间排列。然而,关于NTCP转运机制的两个对立假说始终悬而未决:一种观点认为NTCP
来源:Structure
时间:2025-10-25
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综述:TGFβ信号通路在结缔组织疾病中的作用:从生物学到临床应用
TGFβ信号通路:结缔组织疾病的纤维化与免疫失调的核心驱动力结缔组织疾病(CTDs)是一组以慢性炎症、免疫系统功能紊乱和组织纤维化为特征的全身性自身免疫性疾病,常见类型包括系统性硬化症(SSc)、系统性红斑狼疮(SLE)、类风湿关节炎(RA)和干燥综合征(SS)。转化生长因子-β(TGFβ)信号通路作为一把“双刃剑”,在CTDs的病理进程中扮演着核心角色。在生理状态下,它维护组织稳态和免疫耐受;而在病理状态下,其过度激活则驱动病理性纤维化、慢性炎症和免疫逃逸。TGFβ调控CTDs纤维化进程的分子机制TGFβ介导的纤维化过程是CTDs病理的核心。该过程涉及成纤维细胞活化、细胞外基质(ECM)重塑
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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新型炎症标志物及其与高甘油三酯血症相关急性胰腺炎严重程度的关联
急性胰腺炎(Acute Pancreatitis, AP)是一种常见的消化系统急症,其全球年发病率约为每10万人34例。随着代谢性疾病的增加,高甘油三酯血症(Hypertriglyceridemia, HTG)已成为中国继酒精之后第二常见的急性胰腺炎诱因,占所有急性胰腺炎病例的21%。HTG相关性急性胰腺炎(Hypertriglyceridemia-associated Acute Pancreatitis, HTG-AP)患者相较于非HTG相关性急性胰腺炎(Non-triglyceride-related Acute Pancreatitis, NTG-AP)患者,更容易出现并发症和器官衰竭
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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METTL3对MALAT1的m6A修饰作用在小鼠败血症引起的急性肾损伤中促进焦亡和炎症反应
在当今医学研究中,急性肾损伤(AKI)是一种严重的临床问题,尤其是在败血症的背景下,其引发的急性肾损伤(SAKI)对患者的生存率和预后产生深远影响。SAKI不仅会导致肾脏功能的急剧下降,还可能引发慢性肾病,从而加重患者的病情并增加治疗难度。因此,探索SAKI的发病机制和潜在的治疗靶点对于改善临床预后具有重要意义。近年来,非编码RNA(ncRNA)和表观遗传调控机制在细胞死亡和炎症反应中的作用逐渐受到关注。其中,长链非编码RNA MALAT1 在多种疾病中显示出调控炎症和细胞死亡的功能,但其在SAKI中的具体作用机制尚不明确。与此同时,m6A修饰作为一种普遍存在的RNA表观遗传修饰,被证实与多种
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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铁代谢的改变及其在皮肌炎患者中载铁蛋白重链的作用
铁代谢与自身免疫性疾病之间的关系一直是一个备受关注的研究领域。本文聚焦于皮肌炎(Dermatomyositis, DM)这一典型的自身免疫性疾病,探讨其与铁调节机制之间的潜在联系。DM是一种以皮肤病变和肌肉无力为特征的疾病,其病理机制尚未完全阐明。近年来,研究发现铁代谢在炎症反应、缺氧状态、线粒体功能障碍以及多种细胞死亡形式中扮演重要角色,而这些机制都与DM的发病过程密切相关。因此,本研究旨在分析DM患者体内关键铁调节蛋白的变化及其可能的病理作用。铁代谢调控是一个复杂的过程,涉及系统性与细胞内多个层面的交互作用。在系统层面,铁的吸收和释放主要由肝细胞分泌的肝细胞生长因子(hepcidin)和其
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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TIMP4作为膜性肾病的潜在补充生物标志物和治疗靶点:一项多组学研究及临床验证
膜性肾病(Membranous Nephropathy, MN)是一种免疫介导的肾小球疾病,其特征是肾小球基底膜增厚和亚上皮免疫沉积。尽管全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies, GWAS)已经揭示了MN的风险位点,但这些遗传变异与疾病发生机制之间的功能联系仍不清楚。因此,识别与MN相关的生物标志物和潜在治疗靶点对于深入理解其发病机制以及开发更有效的治疗策略具有重要意义。本研究通过一种多阶段的分析框架,结合蛋白质组学和转录组学的关联研究,系统性地筛选出与MN相关的生物标志物。该方法不仅整合了GWAS数据,还通过蛋白质组学和转录组学的分析手段,对潜在的分
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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巨噬细胞衍生的外泌体BMPR2在急性肺损伤中调节肺泡上皮修复及细胞间相互作用
急性肺损伤(ALI)与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)仍然是重症患者中导致发病率和死亡率的主要原因之一,目前针对该病症的治疗手段仍较为有限。尽管已有研究表明,巨噬细胞来源的外泌体在组织修复过程中扮演着重要的细胞间通讯媒介角色,但其在ALI中的具体分子机制仍不完全明确。本研究旨在探讨巨噬细胞来源的含有骨形态发生蛋白受体2(BMPR2)的外泌体在促进爆震诱导性急性肺损伤(BLI)修复中的作用。为了深入了解巨噬细胞来源的外泌体如何影响肺泡上皮细胞的功能,研究团队构建了一种体外爆震损伤模型,采用MEL-12肺泡上皮细胞和J774A.1小鼠巨噬细胞进行实验。通过超速离心法分离巨噬细胞来源的外泌体,并使用多
来源:Journal of Inflammation Research
时间:2025-10-25
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通过DNA甲基化在小鼠乳腺癌细胞中表达G-四链结构相关基因BRCA1、CDH1和RASSF1
摘要背景G-四聚体(G4)结构在关键基因组区域中较为丰富,能够调控基因表达和染色体稳定性。然而,它们在新发DNA甲基化中的作用仍不清楚。DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)和DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)对癌症的发生和发展至关重要。本研究探讨了G4结构在调控DNMT3A和DNMT3B表达以及其在乳腺癌中的表观遗传功能中的作用。方法利用G-四聚体形成序列映射工具(Quadruplex forming G-Rich Sequences Mapper)、圆二色光谱技术和凝胶迁移实验鉴定了DNMT3A和DNMT3B中的G4结构。同时评估了G4稳定剂吡啶唑汀(pyridostatin)对乳腺癌4T
来源:Epigenomics
时间:2025-10-25
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法国脑膜炎球菌ACWY四价和B群疫苗接种策略的数学建模与影响评估
脑膜炎球菌病(Invasive Meningococcal Disease, IMD)一直是全球范围内的重大公共卫生挑战,其高病死率和可能导致严重后遗症的特点令人担忧。这种由脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)引起的疾病,根据其荚膜多糖成分可分为12个血清群,其中A、B、C、W、X和Y六个血清群导致了全球绝大多数病例。在法国,每年约有500例IMD病例报告。自从2010年引入C群脑膜炎球菌疫苗(MenC)的强制性接种后,法国的IMD流行病学格局发生了显著变化。目前,大多数病例由B、W和Y血清群引起,而A和X血清群在法国并不流行。特别值得注意的是,2022年法国开始推荐所
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东欧与中亚地区公众疫苗信心现状及影响因素研究
在欧洲地区,疫苗信心研究长期聚焦于欧盟27个成员国,而对世界卫生组织欧洲区域中更广泛的东欧、巴尔干、高加索和中亚国家关注不足。这种研究空白令人担忧,因为现有零星证据表明这些地区的疫苗信心水平普遍较低,且疫苗接种覆盖率堪忧——例如北马其顿和波黑的麻疹-腮腺炎-风疹(MMR)疫苗覆盖率分别仅为71%和58%,远低于世界卫生组织推荐的95%标准。格鲁吉亚面临高HPV相关癌症负担与低HPV疫苗接种率的双重挑战。COVID-19大流行更加凸显了全球范围内疫苗接受度的显著差异,促使国际社会重新重视疫苗信心的监测工作。为填补这一研究空白,来自伦敦卫生与热带医学院的研究团队在《Vaccine》期刊发表了关于东
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基于树状数据挖掘与近实时监测的老年人呼吸道合胞病毒疫苗安全性评估
Highlight背景两种呼吸道合胞病毒(RSV)疫苗——辉瑞的Abrysvo和葛兰素史克的Arexvy,于2023年在美国获批上市。然而,针对≥60岁老年人群的大规模安全性评估尚未广泛发表。我们通过疫苗安全数据链(VSD)对接种疫苗的成人开展了两项互补性研究。方法快速循环分析(RCA)采用序贯队列设计,对近实时数据进行双周分析,比较接种后两个风险区间(1–21天、1–42天)内12项预设结局的发生率与对照区间的发生率。监测期为2023年8月1日至2024年9月28日,共13个VSD站点中的9个参与。对具有统计学意义的信号进行病历审查,并对确认的结局进行重新分析。基于树状数据挖掘的自对照分析旨
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Rab5 GTP酶介导ROP信号传导的定向作用,从而为花粉萌发建立极性
摘要极性的建立是所有真核生物中反复出现的进化现象。在被子植物中,花粉的萌发过程会形成极性,这对繁殖至关重要,同时也构成了物种间杂交的障碍。植物中的Rho蛋白(ROPs)及其鸟嘌呤核苷酸交换因子8(RopGEF8)通过其在质膜上的极性分布以及下游活动的不对称激活,对花粉萌发过程起着关键作用。目前尚未明确花粉萌发过程中RopGEF8与ROPs在质膜上形成极性关联的具体机制。我们发现,经典的Rab5 GTP酶(这些酶参与囊泡运输的调控)与植物特有的Rab5 GTP酶协同作用,共同调控花粉萌发。有趣的是,Rab5 GTP酶在此过程中的作用并不依赖于它们自身的GEFs(鸟嘌呤核苷酸交换因子);相反,Ra
来源:Nature Plants
时间:2025-10-25
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恩尼汀与脱氧雪腐镰刀菌烯醇在赤霉病主要病原体种间生长竞争中的体外作用机制研究
赤霉病(Fusarium Head Blight, FHB)是威胁全球谷物生产的重大病害,不仅造成作物减产,更因其病原菌产生的霉菌毒素污染粮食而危及人畜健康。禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)作为FHB的优势病原菌,能够产生强毒性的脱氧雪腐镰刀菌烯醇(Deoxynivalenol, DON),而来自镰刀菌 Tricinctum 物种复合群(FTSC)的木贼镰刀菌(Fusarium avenaceum)则是恩尼汀(Enniatins, ENNs)的主要生产者。在田间条件下,这些镰刀菌物种常共存于同一麦穗,导致DON与ENNs等多种毒素共同污染。然而,这些次级代谢产物如何影响病
来源:Microbiological Research
时间:2025-10-25
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由三重态光酶分隔的对映选择性能量转移催化
摘要酶的区室化是一种普遍存在的生化机制,自然界利用这一机制在物理上分离的环境中同时进行但化学上不兼容的代谢过程。然而,在均相催化中,如何将特定的反应组分空间限制在特定区域内以防止不必要的反应路径发生是一个重大挑战。在这里,我们通过整合人工三重态光酶和定制的三重态淬灭剂,实现了区室化的对映选择性能量转移催化。被限制在蛋白质腔内的光敏剂能够实现对1-萘酚衍生物的对映选择性[2+2]光环加成反应;而外部溶液则通过战略性引入的淬灭剂来抑制直接激发引起的消旋背景反应,这是不对称光催化中的一个基本难题。这项研究不仅扩展了人工光酶的应用范围,还提出了一种独特的生物催化方法,能够以空间分辨率精确控制反应过程,
来源:Nature Catalysis
时间:2025-10-25
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硅引发的路易斯对(Lewis pairs)可催化酰胺和酯的α-氘代反应
摘要氘标记化合物在药物发现中起着关键作用,既可作为诊断工具,也可作为氘代药物使用。虽然氢同位素交换技术已广泛应用于活化底物,但对于未活化的酰胺和酯类的催化氘代反应研究仍较为有限,尤其是在适用于敏感药物和聚合物的温和条件下。这一限制阻碍了药物分子和功能材料的后期修饰。本文报道了一种使用协同催化剂(一种硅基路易斯酸和一种三级胺碱)的催化氢同位素交换方法,这两种催化剂共同作用形成“受阻路易斯对”,从而在温和条件下实现高度选择性的氘代反应。该方法能够在多种功能化药物和聚酯中实现高效的氘代引入,包括那些在碱性条件下通常不稳定的化合物,展示了其广泛的适用性。
来源:Nature Catalysis
时间:2025-10-25
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通过合成自复制体的达尔文进化实现光催化功能的选择
摘要达尔文进化论的提出标志着化学系统向生命系统转变的关键一步。此外,达尔文进化论是一种极其强大的创新引擎,但在合成化学系统中这一机制尚未得到充分发展。在这里,我们展示了在两种自我复制分子系统中达尔文进化论的显现:自然选择倾向于那些最能催化自身复制所需前体物质生成的突变体。选择过程基于突变体激活光催化剂的能力,这种光催化剂作为辅助因子可以产生单线态氧,从而提高基于肽的二硫键构建块转化为基于二硫键的复制体前体的速率。选择标准是催化活性这一功能性特征,这使得达尔文进化论成为催化剂开发的工具。这项工作在功能上将自我复制、原代谢和达尔文进化论有机结合在一起,标志着生命从头合成领域的又一次重大进展。
来源:Nature Catalysis
时间:2025-10-25
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铜催化的环丙醇同质曼尼希反应用于手性哌啶的合成
摘要曼尼希反应(Mannich reaction)是实现β-氨基羰基化合物立体选择性合成的最基本反应之一,在有机合成中得到了广泛应用。相比之下,曼尼希反应的类似反应——所谓的同型曼尼希反应(homo-Mannich reaction)虽然具有广泛的应用潜力,但其研究仍相对不足,这种反应能够生成γ-氨基羰基产物。本文报道了一种铜催化的同型曼尼希反应,该反应利用原位生成的亚胺与环丙醇反应,以较高的产率和优异的立体选择性制备了多种手性的2,6-二取代哌啶类化合物。关键在于使用了二酮亚胺配合物铜作为催化剂,这使得该反应能够在空气环境中温和的条件下高效进行。通过将这种方法作为核心反应,我们成功实现了四种
来源:Nature Catalysis
时间:2025-10-25
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树突状细胞与T细胞之间增强的ICOS信号传导特征揭示了人类胆管癌的免疫机制
在研究胆管癌(Cholangiocarcinoma, CCA)的免疫微环境及其对疾病进展的影响时,科学家们发现,肿瘤微环境中的细胞相互作用网络发生了显著的变化。这项研究结合了两个独立的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,其中一个涵盖了完整的组织分析,另一个则专注于免疫细胞的表达特征。通过对这些数据的整合分析,研究者们能够全面描绘出CCA的细胞组成以及不同细胞类型之间的通信模式,揭示了肿瘤相关细胞如何通过复杂的信号网络调控免疫应答,进而影响癌症的发展和治疗效果。在完整的组织数据集中,研究人员利用无监督聚类分析,识别出12种主要的细胞类型,包括恶性细胞、T/NK细胞、B细胞、不同类型的树
来源:HUMAN MUTATION
时间:2025-10-25
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玉米胚乳中的代谢区室化作用,有助于高效合成和储存碳氮同化产物
摘要 碳和氮的代谢过程是胚乳发育及同化物储存的基础,这种空间和时间上的不均匀性表现为玉米籽粒中乳线从顶端向基部的移动。然而,这种不均匀性的代谢特征及其影响仍不明确。 本研究结合了转录组学、代谢组学、酶活性分析以及15N示踪技术,来探讨玉米胚乳发育过程中碳和氮代谢的分布规律。 与胚乳的上部区域相比,基部胚乳(BE)表现出独特的代谢特征:蔗糖合成、氨基酸转氨作用、糖酵解以及三羧酸
来源:New Phytologist
时间:2025-10-25