• HIV-1整合酶寡聚体结构揭示功能可塑性：病毒内含体组装与RNA结合的新机制

  在艾滋病病毒（HIV-1）漫长的复制周期中，整合酶（Integrase, IN）扮演着双重关键角色：在病毒入侵早期，IN寡聚化成"内含体"（intasome）复合物，催化病毒DNA（vDNA）整合入宿主基因组；而在病毒颗粒组装晚期，IN四聚体结合病毒RNA（vRNA），指导核糖核蛋白复合物（RNPs）有序包装进入衣壳核心。然而，介导这些截然不同功能的IN高级结构组装体一直难以解析，成为领域内数十年的科学难题。更令人困惑的是，IN突变体表现出明显的功能多效性：一些突变（如D64、D116、E152活性位点突变）主要影响DNA整合功能（I类突变），而大多数突变（II类突变）还损害逆转录、病毒颗粒组

  来源：Nature Communications

  时间：2025-10-25

• 蛋白质磷酸化响应的全球比较结构分析揭示构象选择与变构调控新机制

  在细胞生命活动的精密调控网络中，蛋白质磷酸化作为最普遍、最关键的翻译后修饰之一，通过可逆地添加带双负电荷的磷酸基团，精准调控着蛋白质的构象、活性、定位及相互作用。尽管质谱技术的飞速发展使得人类蛋白质组中高达75%的磷酸化位点得以鉴定，但绝大多数磷酸化位点的生物学功能仍笼罩在迷雾之中，成为后基因组时代功能解析的重大挑战。更复杂的是，磷酸化不仅可以直接修饰功能位点（正交效应），更常作为变构效应物，远程调控蛋白质远端区域的功能，而这种变构通讯的分子机制至今仍知之甚少。传统的定点突变模拟磷酸化方法往往无法真实再现磷酸化的行为，而蛋白质数据库中磷酸化结构的 historically limited av

  来源：Nature Communications

  时间：2025-10-25

• 高分辨率空间转录组揭示MCC表皮-真皮微环境差异：空间背景重塑基因表达图谱

  在皮肤癌研究领域，Merkel细胞癌（MCC）一直以其独特的神经内分泌特征和高度侵袭性挑战着临床治疗。这种罕见但致命的皮肤恶性肿瘤虽然被认为起源于上皮细胞，却鲜少在表皮层中被观察到完整的发生发展过程。更令人困惑的是，少数MCC病例中出现的"表皮趋向"现象——即肿瘤细胞侵入表皮层形成癌巢——为研究者提供了一个独特的自然实验场景：当相同的肿瘤细胞置身于不同的微环境中，它们的生物学特性会发生怎样的改变？传统观点认为，癌细胞的恶性行为主要受其内在遗传变异驱动。然而越来越多的证据表明，肿瘤微环境（TME）通过复杂的细胞间相互作用，能够显著影响肿瘤细胞的表型特征。在MCC研究中，一个长期存在的谜团是：那些

  来源：Oncogene

  时间：2025-10-25

• 综述：苦瓜（Momordica Charantia）在糖尿病前期和2型糖尿病患者血糖控制及胰岛素抵抗中的功效：一项符合GRADE标准的随机对照试验Meta分析

  1. 引言全球糖尿病前期患病率持续上升，若不干预可能发展为2型糖尿病（T2D）。这些疾病以高血糖为特征，会增加心血管并发症风险。传统降糖药物因成本、副作用等问题促使人们寻求替代疗法。苦瓜（Momordica charantia）作为传统草药，临床前研究显示其具有降糖潜力，但临床证据存在矛盾。本研究旨在系统评估苦瓜对糖尿病前期或T2D患者空腹血糖（FBG）、糖化血红蛋白（HbA1c）、胰岛素、胰岛素抵抗指数（HOMA-IR）和β细胞功能（HOMA-β）的影响。2. 方法本研究遵循PRISMA指南和PICOS框架，检索截至2025年7月19日的Scopus、PubMed和Web of Scienc

  来源：Metabolism

  时间：2025-10-25

• 通过单细胞转录组学揭示小麦根系对盐胁迫的细胞类型特异性和品种特异性响应

  土壤盐碱化是威胁全球农业生产力的关键非生物胁迫之一。它不仅影响作物的生长、发育和产量，还会损害土壤健康，破坏生态平衡。目前，世界上约20%的可耕地受到盐碱化的困扰，每年造成的经济损失超过270亿美元。随着气候变化、不合理的灌溉方式和不可持续的耕作方法的持续影响，预计到2050年，超过50%的可耕地将面临盐碱化问题。因此，解析作物在盐碱胁迫下的分子机制，对于培育高抗盐品种至关重要，这为应对盐碱化和人口增长带来的挑战提供了希望。为了应对这一问题，先进的基因组技术成为不可或缺的工具。单核RNA测序（snRNA-seq）是一种突破性的高通量技术，能够以单细胞分辨率对细胞转录组进行测序，揭示细胞异质性、

  来源：Plant Biotechnology Journal

  时间：2025-10-25

• PtrC2H2.2-6-PtrCYP86A7/A8模块通过调控角质层和蜡质生物合成途径来增强杨树的耐旱性

  植物的角质层是其抵御外界环境胁迫的重要屏障，主要由角质（cutin）和蜡质（wax）组成。角质层在植物生存中起着至关重要的作用，它不仅能够有效减少非气孔水分散失，从而增强植物的抗旱能力，还能保护植物免受紫外线辐射、病原体侵害等。近年来，随着全球干旱现象的加剧，科学家们对植物如何通过调控角质层来增强其抗旱能力的研究逐渐深入。其中，CYP86A基因家族在角质和蜡质生物合成中扮演着关键角色，然而其表达调控机制仍不明确。本文通过一系列实验，揭示了PtrC2H2.2-6这一C2H2型转录因子在调控角质层形成中的作用，以及其与PtrPPK1之间的相互作用如何影响植物的抗旱能力。PtrC2H2.2-6是一种

  来源：Plant Biotechnology Journal

  时间：2025-10-25

• 具有共同祖先核心结构域的F1-ATP酶在定子环中的功能与结构表征

  本研究聚焦于F1-ATP酶的进化起源及其旋转步进机制。F1-ATP酶是一种广泛存在于生物体中的关键酶，其主要功能是催化ATP的合成或水解。在自然界中，已知的F1-ATP酶展现出多种旋转步进模式，包括3步、6步和9步循环。然而，这些模式的进化来源仍然存在疑问。为了探索这一问题，研究人员采用祖先序列重建（Ancestral Sequence Reconstruction, ASR）技术，推测出一种可能的祖先F1-ATP酶的催化β亚基和非催化α亚基，并将这些关键功能区域融合到一种热稳定性较高的F1（来自Bacillus PS3的TF1）中，从而构建出一个稳定的嵌合酶。通过冷冻电镜（Cryo-EM）分

  来源：Protein Science

  时间：2025-10-25

• 一项全面的蛋白质组结构分析表明，海洋古菌中存在尚未被发现的功能域

  摘要 海洋古菌是海洋生态系统中的关键成员，能够在极端条件下生存繁衍。然而，由于这些物种难以分离和培养，相关研究仍面临诸多挑战。本研究探讨了海洋古菌的蛋白质组是否与其他模式生物具有不同的特性。通过使用AlphaFold2预测的蛋白质结构，我们分析了蛋白质长度、盐桥、氢键、相对表面积以及二级结构组成等特征。研究结果表明，海洋古菌的蛋白质通常体积更小，在结构组成上比真核生物更加稳定。利用深度学习技术对蛋白质进行向量化处理，并结合UniProt注释进行分析，我们可视化了蛋白质序列、结构、家族及功能之间的关联。同时，我们对相似的蛋白质进行聚

  来源：Protein Science

  时间：2025-10-25

• 综述：新辅助化疗后淋巴结评估中的问题与未把握的机遇

  新辅助化疗后淋巴结评估中的问题与未把握的机遇引言新辅助化疗（NACT）已成为局部晚期或肿瘤较大的乳腺癌患者的标准治疗方案，其目标在于缩小病灶以实现保乳手术。随着NACT联合免疫治疗的应用普及，深入理解淋巴结在治疗后的功能和结构变化变得尤为关键。目前临床依赖影像学（如MRI和超声）和病理评估治疗反应，但前者灵敏度有限（MRI检测淋巴结转移的灵敏度仅33.93%），后者则缺乏标准化评估体系。当前实践与局限现有淋巴结评估主要遵循TNM分期和残留癌症负担（RCB）系统，重点关注转移淋巴结的数目、最大转移灶尺寸以及病理完全缓解（pCR）的判定。然而，这种模式忽略了对淋巴结实质内残留病变特征（如纤维化、巨

  来源：The Journal of Pathology

  时间：2025-10-25

• 成纤维细胞特异性蛋白Palladin通过MRTF–SRF信号通路促进肾脏纤维化

  在慢性肾脏疾病（CKD）的进展过程中，纤维化是一个普遍存在的病理特征，它不仅导致肾功能的逐渐丧失，还可能引发其他器官的损害和高死亡率。纤维化的发生通常与异常的伤口愈合机制相关，表现为细胞外基质（ECM）的沉积和成纤维细胞/肌成纤维细胞的积累。TGF-β1作为纤维化的重要驱动因子，其信号通路在多个器官中被证实与纤维化过程密切相关。然而，尽管已有研究揭示了TGF-β1如何通过调控细胞骨架动态影响纤维化进程，关于细胞骨架相关蛋白是否直接参与纤维化机制仍存在诸多未解之谜。本文通过系统分析人类蛋白组数据和小鼠模型，揭示了palladin这一细胞骨架相关蛋白在肾纤维化中的关键作用，并进一步阐明其与MRTF

  来源：The Journal of Pathology

  时间：2025-10-25

• 非紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌的遗传学特征

  摘要 皮肤鳞状细胞癌（cSCC）是第二常见的皮肤癌类型，主要由累积的紫外线暴露引起。然而，cSCC也可能在无紫外线暴露的情况下发生，例如在慢性溃疡、疤痕、隐性营养不良性大疱性表皮松解症（RDEB）以及化脓性汗腺炎（HS）等炎症性皮肤病部位。关于非紫外线诱导的皮肤癌，目前了解甚少。本研究旨在描述非紫外线诱导的cSCC的临床、病理和遗传特征。我们收集了31例非紫外线诱导cSCC患者的临床和病理数据，其中5例来自HS，4例来自慢性腿部溃疡，8例来自RDEB。从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本中提取DNA，并使用下一代测序（NGS）技

  来源：The Journal of Pathology

  时间：2025-10-25

• ERAP1 的 2 型和 10 型等位基因以不同的方式调节黑素细胞的免疫肽组

  ERAP1，即内质网氨基肽酶1，是一种在免疫系统中具有重要影响的多态性酶。它通过调控由MHC I类分子（即人类中的HLA I类分子）呈现的肽序列，对适应性免疫反应起到关键作用。这种酶的活动不仅影响免疫反应，还可能对癌症和自身免疫性疾病的发生与发展产生深远影响。ERAP1的多态性体现在其不同的等位基因中，这些等位基因在人群中分布广泛，并与多种疾病有关联，包括自身免疫性疾病如银屑病和贝赫切特病。研究发现，某些常见的ERAP1等位基因会改变其酶的活性，从而影响免疫肽组的组成，进而影响免疫系统的识别能力。在本研究中，科学家们提出了一种假设，即ERAP1等位基因的变异可能会导致免疫肽组的广泛变化，从而触

  来源：Immunology

  时间：2025-10-25

• NFKB1和NFKBIA在免疫球蛋白A血管炎中的作用

  免疫球蛋白A血管炎（IgAV）是一种以小血管壁中异常糖基化的IgA1免疫复合物沉积为特征的炎症性疾病，其发病机制尚不完全明确。尽管已有研究指出该病与B细胞介导的免疫反应密切相关，但具体的遗传因素仍需进一步探索。NF-κB（核因子κB）作为调控B细胞发育、成熟和功能的关键信号通路，已被证实在多种自身免疫疾病中扮演重要角色。NF-κB的典型激活途径涉及两个核心基因：NFKB1和NFKBIA，分别编码NF-κB1（p105）和IκBα（NF-κB抑制因子α）。在许多免疫介导性疾病中，这些基因的变异已被视为潜在的遗传风险位点，但其在IgAV中的具体作用仍不清楚。因此，本研究旨在探讨NFKB1和NFKB

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 基于单细胞RNA序列数据推断的人类中性粒细胞状态转换的数学框架

  人类中数量最多的免疫细胞是中性粒细胞，它们在先天免疫系统中扮演着核心角色。中性粒细胞的功能包括吞噬病原体、释放细胞内容物以及形成中性粒细胞胞外陷阱（NETs），以对抗微生物和其他危险信号。然而，尽管中性粒细胞在免疫防御中至关重要，它们的生理机制和动态变化仍然缺乏深入理解。本研究通过结合单细胞基因表达数据与数学建模，揭示了中性粒细胞在循环系统中的状态转换机制，为理解其异质性和功能提供了新的视角。中性粒细胞的异质性是近年来免疫学研究的热点之一。传统上，中性粒细胞被认为是功能相似的细胞群体，但随着单细胞RNA测序技术的发展，研究发现它们在基因表达上存在显著差异，这种差异可能反映了不同的发育阶段和功能

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 接受利妥昔单抗治疗的原发性肾小球疾病患者肺部感染的风险评估

  本研究聚焦于一项针对接受利妥昔单抗（Rituximab，简称RTX）治疗的原发性肾小球疾病（Primary Glomerular Diseases，PGDs）患者中肺部感染的发生率及其相关风险因素的探索。随着生物制剂在免疫相关肾小球疾病中的广泛应用，其在感染方面的安全性问题日益受到关注。RTX作为一种针对B细胞表面CD20蛋白的单克隆抗体，能够通过抗体依赖性细胞介导的细胞毒作用和补体介导的细胞毒作用，特异性地减少外周B细胞数量，从而抑制自身免疫反应。然而，B细胞的减少也会影响患者的免疫防御能力，使他们更容易发生感染，尤其是肺部感染。本研究纳入了246名接受RTX治疗的PGDs患者，其中绝大多数

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 综述：系统性硬化症自身抗体的临床应用价值：聚焦队列差异与标准化

  引言自身抗体在绝大多数系统性硬化症患者中可被检测，并与特定的临床病程和器官风险密切相关。将自身抗体状态与皮肤亚型和疾病持续时间相结合，可以改善发病率和死亡率的预测。除了预后价值，系统性硬化症特异性自身抗体还可支持诊断分类——特别是在皮肤增厚最小化时（极早期系统性硬化症或无硬皮病）——作为复合评估的一部分，补充甲襞毛细血管镜检查的作用。更广泛地说，这些免疫标志物构成了系统性硬化症临床实践的实用基础，并证实了塑造疾病表现的免疫学影响。方法本综述采用叙述性综述而非系统评价的方法进行。检索了PubMed和Embase（2000年1月至2025年8月），使用了包括系统性硬化症、自身抗体、队列、ACA、A

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 在强直性脊柱炎和银屑病中，使用Janus激酶抑制剂与肿瘤坏死因子抑制剂治疗葡萄膜炎的相对风险：一项目标试验模拟研究

  本研究探讨了在轴性脊柱关节炎（axSpA）患者中，使用JAK抑制剂（JAKi）与肿瘤坏死因子抑制剂（TNFi）治疗对新发葡萄膜炎（uveitis）风险的影响。研究结果表明，与TNFi相比，JAKi治疗与较低的葡萄膜炎发生风险相关，这为JAKi在axSpA相关眼炎管理中的应用提供了新的视角。研究采用了一种模拟目标试验的方法，基于真实世界的数据，对JAKi和TNFi的疗效进行了系统比较。axSpA是一类影响脊柱和骶髂关节的慢性炎症性疾病，包括强直性脊柱炎（AS）和某些类型的银屑病关节炎（PsA），同时与银屑病（PsO）密切相关。这类疾病的特点是炎症反应的持续性和多系统受累，其中葡萄膜炎作为常见的非

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• HCC（肝细胞癌）中双孔通道2的缺失增强了CD8+ T细胞的细胞毒性，并通过MAPK通路直接抑制肿瘤生长

  肝癌（HCC）作为全球范围内的重大健康挑战，长期以来因其有限的治疗选择和高死亡率而备受关注。尽管在系统性治疗和免疫治疗领域取得了显著进展，但许多患者仍然对治疗产生耐药性或无法响应，这凸显了寻找新的分子靶点的迫切需求。近年来，溶酶体离子通道在癌症生物学中的作用逐渐受到重视，但其在肿瘤-免疫相互作用中的具体机制尚不明确。本研究聚焦于溶酶体双孔通道2（TPC2）在HCC中的作用，通过基因和药理学方法结合多种功能分析，探索TPC2调控对免疫调节、代谢重编程和细胞内信号通路的影响，并评估其与免疫检查点抑制剂联合治疗的协同效应。研究方法涵盖了从细胞培养到动物实验的多种手段，包括TPC2和TRPML1的基因

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 受损的NLRP3炎性体信号通路会改变巨噬细胞中焦亡途径与凋亡途径中caspase的激活顺序

  NLRP3（NOD-like receptor family pyrin domain-containing 3）炎性小体是先天免疫系统中重要的防御机制之一，它在识别危险信号后，通过依赖caspase-1的细胞焦亡（pyroptosis）和细胞因子释放，参与宿主对病原体入侵或组织损伤的反应。这一机制在维持免疫稳态和清除病原体方面发挥着关键作用。然而，当NLRP3信号通路受损时，宿主是否能够通过其他形式的细胞死亡机制来应对危险信号，仍然是一个未完全解答的问题。本研究通过构建两种模拟NLRP3信号受损的巨噬细胞模型，即延迟触发信号和caspase-1缺陷模型，探索了NLRP3/ASC平台在不同情况

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

• 对败血症患者外周血单核细胞（PBMCs）进行的多组学分析显示，细胞毒性功能普遍受损，同时表达CD69的幼稚CD4+ T细胞数量增加

  ### 感染性疾病的免疫系统反应与多组学分析的进展#### 研究背景感染性疾病在全球范围内对人类健康构成了重大威胁，其中败血症（sepsis）是一种由感染引发的严重疾病，不仅导致高死亡率，还对幸存者的长期健康产生深远影响。败血症的核心特征是宿主免疫系统对感染或创伤的异常反应，这会导致组织和器官的损伤，进而影响患者的生存质量。研究表明，败血症的病程中，免疫系统的功能受到显著干扰，这种干扰不仅发生在感染初期，还会持续到恢复阶段，甚至影响患者未来的健康状况。在败血症的发病过程中，先天免疫细胞（如巨噬细胞和自然杀伤细胞）会识别病原体相关的分子模式（PAMPs）以及损伤相关的分子模式（DAMPs），从而

  来源：Frontiers in Immunology

  时间：2025-10-25

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