• 牛基因组中lncRNA TUG1染色质互作位点全景解析及其对染色质可及性的调控机制

  在基因组研究的浩瀚星海中，长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）正逐渐成为调控生命过程的暗物质。它们虽然不编码蛋白质，却能通过与DNA、RNA和蛋白质的相互作用，精密调控基因表达和表观遗传状态，影响细胞分化、发育和疾病发生。在畜牧学领域，牛作为重要农业动物，其经济性状的遗传机制解析一直是研究热点。然而，牛基因组中lncRNA如何与特定染色质区域相互作用，这些互作具有怎样的规律和功能，至今仍是未被探索的空白地带。针对这一科学问题，来自德国莱布尼茨农场动物生物学研究所（FBN）的Rosemarie Weikard领衔的研究团队，聚焦于进化上保守的lncRNA T

  来源：Genomics

  时间：2025-10-09

• 单细胞RNA测序数据中线粒体DNA同质与异质性SNVs精准识别新流程的开发与应用

  线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）的突变与多种疾病密切相关，尤其在肌肉、大脑等高能量需求组织中表现突出。这些突变通常以单核苷酸变异（single nucleotide variants, SNVs）的形式存在，并可分为同质性（homoplasmic，所有mtDNA分子携带相同突变）和异质性（heteroplasmic，仅部分mtDNA分子携带突变）两种类型。理解这些SNVs在单细胞水平的分布与特征，对于揭示其致病机制和临床表现形式至关重要。尽管目前已有大量公开的单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）数据，但现

  来源：Genomics

  时间：2025-10-09

• 维生素D结合蛋白(DBP) Gc1f单倍型独立调控生殖结局的机制与临床意义研究

  在生殖医学领域，多囊卵巢综合征(PCOS)和不明原因不孕症患者的生殖结局改善始终是临床研究的重点难点。虽然维生素D的作用已被广泛关注，但作为维生素D运输载体的维生素D结合蛋白(Vitamin D Binding Protein, DBP)在生殖过程中的作用机制却长期被忽视。传统"游离激素理论"认为DBP仅通过调节维生素D生物利用率发挥作用，但DBP本身还具有巨噬细胞激活、脂肪酸运输等多种维生素D非依赖性功能，这提示其可能通过更复杂的机制影响生殖过程。为厘清DBP与生殖结局的关联机制，由Iris Tien-Lynn Lee领衔的研究团队在《Fertility and Sterility》发表了重

  来源：Fertility and Sterility

  时间：2025-10-09

• 蛋白尿仍是猪-非人灵长类异种肾移植成功的关键障碍——高剂量抗CD154单抗方案疗效与局限性的深度解析

  背景：本研究评估了包含高剂量抗CD154单克隆抗体（TNX-1500）的优化免疫抑制方案在基因编辑猪至狒狒肾异种移植中延长移植物存活的效果。尽管基因编辑技术和免疫方案取得进展，肾病范围蛋白尿仍然是重大临床挑战。方法：研究团队对9例接受基因编辑猪肾移植的狒狒采用TNX-1500基础免疫抑制方案。方案包含抗胸腺细胞球蛋白、抗CD20单抗（利妥昔单抗）、C1酯酶抑制剂诱导，以及TNX-1500、雷帕霉素、甲泼尼龙和抗IL-6受体阻断剂（托珠单抗）维持治疗。结果：虽然将TNX-1500剂量从20 mg/kg（低剂量组，n=3）提升至30 mg/kg（高剂量组，n=6）显著改善总体存活期（中位214天

  来源：Transplantation

  时间：2025-10-09

• 利用高岭土黏土粉末增强沼泽红假单胞菌光合生物过程：一种提升光分布与乙酸产量的普适性策略

  在可持续生物制造领域，光合微生物因其能够利用光能将废弃物转化为高附加值产品而备受关注。其中，沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonas palustris）作为一种紫色非硫光合细菌，具有卓越的代谢灵活性，能够利用多种有机底物进行光合异养生长，被广泛应用于橄榄油厂废水、养猪废水、粗甘油等废弃物的处理与资源化。然而，传统生物反应器在培养光合微生物时面临显著挑战——光源通常位于反应器外部，随着细胞密度增加，细胞遮荫效应导致光在培养液中的分布不均，内部区域光照不足，最终限制整体生产效率。虽然已有研究通过设计新型光生物反应器或采用细胞固定化（如生物膜培养）等策略来改善光传递，但这些方法往往需要复杂

  来源：Biotechnology Advances

  时间：2025-10-09

• 揭示干扰素基因对三阴性乳腺癌免疫微环境的影响：治疗靶点的鉴定与ceRNA调控网络构建

  引言乳腺癌（BC）是全球女性最常见的恶性肿瘤之一，而三阴性乳腺癌（TNBC）作为其特殊亚型，约占浸润性乳腺癌的15%–20%，具有高度异质性、侵袭性和复发率高的特点。由于缺乏特异性靶点和有效的靶向疗法，TNBC的治疗主要依赖手术联合全身化疗，但常规术后辅助化疗效果不佳，残留转移灶常导致肿瘤复发。因此，鉴定新的分子生物标志物对TNBC的早期诊断、预后和复发监测至关重要。干扰素（IFN）作为一种多功能细胞因子，在抗病毒活性、抗增殖和免疫调节中发挥关键作用。IFN通过诱导凋亡、阻断细胞周期和激活免疫调节功能，发挥直接和间接的抗肿瘤效果。例如，IFN-β信号可抑制TNBC中癌细胞的干性，而IFN信号的

  来源：Frontiers in Bioinformatics

  时间：2025-10-09

• 便携式磁珠邻近延伸检测平台MagPEA-POCT：实现样本进-结果出的超灵敏多重蛋白标志物检测

  Section snippetsMaterials and Chemicals抗体偶联过程使用羧基功能化磁珠Dynabeads MyOne（货号#65011）。磺基琥珀酰亚胺基-4-(N-马来酰亚甲基)环己烷-1-羧酸酯（sulfo-SMCC，货号#22322）用于交联反应，蛋白浓度测定采用Thermo Fisher Scientific（美国马萨诸塞州）的Pierce BCA蛋白检测试剂盒（货号#23225）。Zeba脱盐柱（7 kDa截留分子量，0.5 mL，货号#89883）以及两种40 kDa截留分子量的脱盐柱（货号#87766和#87767）均购自同一供应商。Overall work

  来源：Biosensors and Bioelectronics

  时间：2025-10-09

• 基于纳米抗体功能化石墨烯晶体管的戊型肝炎抗原多基因型数字化检测：从开发到优化的端到端测试方案

  HighlightMaterials实验材料：蛋白胨、酵母提取物和葡萄糖购自Britania公司。Na2CO3、Na2HPO4、H3PO4和蔗糖来源于Cicarelli，而二甲基甲酰胺（DMF）、HEPES缓冲液、NaHCO3和KH2PO4购自Anedra。KCl、咪唑、甘油和二甲基亚砜（DMSO）采购自Biopack。EDTA和Tris-HCl购自Gibco。苯甲基磺酰氟（PMSF）和二硫苏糖醇（DTT）来自Roth公司。DNA酶、Triton洗涤剂和镍氮三乙酸（Ni-NTA）树脂购自罗氏公司。氯化钠、...Production of HEV ORF2 proteinsHEV ORF2蛋白制

  来源：Biosensors and Bioelectronics

  时间：2025-10-09

• 磁性可回收催化剂与碱循环策略协同促进木屑水热液化：提升生物油产率与品质的四倍突破

  随着化石燃料储量的日益减少及其对环境造成的负面影响持续加剧，全球能源体系面临严峻挑战。尽管可再生能源的发展势头迅猛，但化石燃料仍是当前全球能源的主导来源。日益紧迫的气候危机要求我们迅速转向更可持续的能源，生物质能因其碳中和、成本效益高和资源广泛等优势而备受关注。其中，木质纤维素生物质（Lignocellulosic Biomass, LB）作为最丰富的陆地生物质形式，主要由纤维素、半纤维素和木质素组成，但其高氧含量和复杂的聚合物结构使其难以直接高效增值利用，必须经过显著的脱氧和解聚过程。在众多生物质转化技术中，热化学转化技术如热解和水热液化（Hydrothermal Liquefaction,

  来源：Biomass and Bioenergy

  时间：2025-10-09

• 细胞色素c氧化酶Ferryl态至氧化态转变的热力学研究及其质子泵送机制解析

  Highlight生物系统中的氧活化通过金属中心（主要是铁和铜）实现，这些中心存在于金属酶中。这种活化发生在含血红素和非血红素铁的酶中，通过瞬时形成高价铁(IV)-氧中间体（ferryl物种）完成。这些高价系统在多种血红素酶的催化中观察到，如过氧化物酶、血红素过氧化氢酶、加氧酶、卤化酶和呼吸氧还原酶[1][2][3][4][5]。INTRODUCTION呼吸血红素铜氧还原酶（HCOs）在能量转换中催化分子氧还原为水，同时将释放的化学能转化为跨膜电化学质子梯度。该梯度由两种机制建立：1）在活性中心消耗的“底物质子”的矢量转移，用于形成水；2）将额外的“泵送质子”从负侧（N-side）易位至正侧（

  来源：Archives of Biochemistry and Biophysics

  时间：2025-10-09

• 内体转录组学揭示卡哈尔体通过多泡体运输的降解新机制

  Significance内体是细胞质中膜包被的亚细胞器，作为细胞外囊泡（如外泌体）的生物发生场所，通过分泌特定蛋白质和小RNA参与细胞间通讯和维持细胞稳态。以往研究主要关注外泌体的转录组，但对内体内RNA的身份及其定位机制知之甚少。本研究首次报道了全面的内体转录组，并证明多种核RNA-蛋白质复合物分选进入内体，这一现象此前未被重视。该过程需要内体分选复合物（ESCRT）和细胞内吞区室特征性磷脂的活性。研究为核糖核蛋白（RNP）通过 cytoplasmic endocytic pathway 的循环提供了机制依据。Abstract所有真核细胞都分泌外泌体，这是一种源自内吞区室（即多泡体MVB或晚

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2025-10-09

• 白色念珠菌羟基苯与芳香族氨基酸代谢的功能与调控关联：多组学分析与基因组尺度建模揭示的代谢可塑性新机制

  ABSTRACT白色念珠菌（Candida albicans）作为人类常见共生真菌和机会性病原体，其代谢可塑性是适应宿主环境、逃避免疫攻击和维持毒力的关键。氨基酸代谢稳态对真菌适应性至关重要，特别是在氨基酸饥饿时发生的快速代谢转换可恢复细胞内平衡。本研究通过数据驱动的基因组尺度代谢建模，基于转录组和代谢组分析，揭示了白色念珠菌在氨基酸饥饿条件下的特异性代谢通量和途径活动。研究发现，在氨基酸限制下，Shikimate途径（SHKP）活性改变，同时芳香族氨基酸（AAA）生物合成和羟基苯分解代谢所需的代谢基因簇（MGC）被诱导。表型和转录分析进一步验证了转录因子Zcf25作为该途径儿茶酚分支的核心调

  来源：mSystems

  时间：2025-10-09

• 冠状病毒nsp3/nsp4双膜囊泡孔的结构形成路线图及其对多蛋白加工和复制/转录的启示

  ABSTRACT冠状病毒复制发生在病毒感染期间产生的双膜囊泡（DMV）内。先前研究已确定这些DMV具有由病毒非结构蛋白nsp3和nsp4形成的特征性孔道，这些孔道促进新合成病毒RNA的输出。然而，由非结构蛋白nsp7至nsp16组成的复制机器如何被招募到DMV中仍然是一个谜。基于AlphaFold和先前确定的结构，我们构建了一系列模型，将DMV孔道的形成与nsp5蛋白酶对多蛋白的加工以及切割产物在DMV内的捕获联系起来。我们认为初始孔道由12个nsp3亚基、6个中间未切割多蛋白pp1a′（nsp4–nsp10）和6个pp1ab′（nsp4–nsp16）的各6个亚基形成。该初始结构的形成激活了紧

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-10-09

• 人巨细胞病毒UL78：核定位GPCR在CD34+造血祖细胞潜伏感染再激活中的关键作用与机制研究

  人巨细胞病毒（HCMV）UL78是核定位GPCR且为潜伏感染再激活所必需研究团队通过构建UL78蛋白表达缺失（UL78-2XSTOP）和G蛋白偶联关键位点突变（DRL→DAL）的重组病毒，发现在人胚胎干细胞（hESC）来源的CD34+造血祖细胞（HPC）潜伏感染模型中，缺失UL78或其G蛋白偶联功能虽不影响病毒潜伏建立和基因组维持，但会导致再激活效率显著降低。这表明UL78在再激活过程中发挥不可替代的作用。HCMV UL78通过保守DRL基序特异性偶联Gαi家族蛋白利用纳米荧光素酶（nLuc）互补技术实时监测GPCR与G蛋白的相互作用，发现野生型UL78特异性偶联Gαi，其偶联强度与已知多能偶

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-10-09

• VP5区双氨基酸突变介导人轮状病毒疫苗减毒：来自体外与体内研究的证据

  ABSTRACT多种疫苗如脊髓灰质炎、麻疹和轮状病毒疫苗通过细胞培养中的连续传代得以开发。口服轮状病毒减毒活疫苗已被证明总体安全，但其减毒机制尚不明确。本研究利用新型全质粒反向遗传学系统，人工生成人轮状病毒疫苗株CDC-9（G1P[8]），并分析VP4基因突变对体外适应和体内减毒的影响。结果表明，在Vero细胞连续传代后出现的6个氨基酸突变中，野生型CDC-9 P11在VP4 AA331和AA385处的单点或组合突变与体外复制增强相关，达到与细胞培养适应株CDC-9 P45相当的水平。感染AA331或AA385单点突变体的新生大鼠病毒脱落减少，与传代CDC-9 P45相当。在感染携带AA331

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-10-09

• 基于HiBiT标记假病毒样颗粒平台实现安全快速的病毒中和与抗体依赖性增强作用定量分析

  引言病毒性疾病暴发的频率随着全球互联性、城市化、气候变化及其他社会经济、环境和生态因素的增长而增加。过去十年间，世界经历了多次流行病，包括2014–2016年西非的埃博拉疫情、2015–2016年美洲的寨卡疫情、COVID-19大流行以及Mpox全球卫生紧急事件。在这些新发病毒暴发的同时，人类免疫缺陷病毒（HIV）、肝炎病毒和流感病毒等既定病原体仍然是全球发病和死亡的主要原因。因此，需要新的对策来应对地方性和新出现的病毒威胁。单克隆抗体（mAbs）已成为强大的双模式干预措施，在抗病毒防御中具有特殊作用。凭借其高亲和力和特异性，mAbs可以作为有效的预防和治疗剂，且脱靶效应最小。作为预防剂，mA

  来源：Journal of Virology

  时间：2025-10-09

• 综述：离子转运的动态调控：自身抑制与磷酸化开关

  Highlights植物膜转运蛋白通过自身抑制与磷酸化修饰实现精准调控，维持离子和营养稳态以支持生长与逆境适应。磷酸化作用调控原膜质子泵（AHA）、钾转运体（AKT1、HAK5）及氮营养转运蛋白（NRT、AMT），在波动环境中优化养分吸收与离子平衡。钠转运体SOS1的磷酸化增强耐盐性；阴离子通道SLAC1/ALMT4和液泡转运体CLCa通过调控气孔关闭提升抗旱能力。钙信号通过磷酸化调控流入通道（CNGC、OSCA）和外排泵（ACA、CAX），精细调节与发育和适应密切相关的钙动态。Abstract膜转运蛋白（包括离子通道和载体）对维持植物离子和营养稳态具有重要作用，是生长和抗逆性的基础。这些蛋白

  来源：TRENDS IN Plant Science

  时间：2025-10-09

• 北大西洋热带气旋活动未来变化的高分辨率动力降尺度研究：频率减少与强度不确定性的新证据

  在全球气候变暖的背景下，热带气旋(tropical cyclones, TCs)作为最具破坏性的自然天气现象之一，持续威胁着热带和亚热带地区。这些风暴系统带来的强风、暴雨、风暴潮和洪水等复合灾害，不仅造成巨大经济损失，更导致重大人员伤亡。以北大西洋盆地为例，这里孕育了全球约16%的热带气旋，2005年的卡特里娜飓风和2017年的哈维、艾尔玛和玛丽亚等飓风都造成了灾难性影响。然而，准确预测未来热带气旋活动变化面临巨大挑战。当前全球气候模式(CMIP6)由于分辨率限制，难以捕捉热带气旋生成和发展中的小尺度过程，如对流、飓风眼壁结构、眼壁置换循环以及海气相互作用等。尽管高分辨率模式比较计划(High

  来源：iScience

  时间：2025-10-09

• PHF19通过驱动PRC2核内簇增强三阴性乳腺癌细胞运动性的机制研究

  在癌症研究领域，三阴性乳腺癌（TNBC）因其高度转移性和治疗抗性一直备受关注。多梳抑制复合物2（PRC2）作为表观遗传调控的核心执行者，通过催化组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化（H3K27me3）实现基因沉默，但其在癌症细胞中的亚核空间组织机制至今仍是未解之谜。传统研究多聚焦于PRC2的酶活功能或EZH2的胞质作用，而对核内PRC2的高阶组织结构及其功能后果了解甚少。为了揭示PRC2在TNBC细胞中的空间调控机制，研究人员整合了前沿的空间蛋白质组学技术、超高分辨率显微成像和功能基因组学方法。通过原位光标记蛋白质组学（opto-proteomics）技术，对内源性PRC2核簇进行了无偏性蛋白质组

  来源：Cell Reports

  时间：2025-10-09

• 内肽酶介导大肠杆菌侧壁肽聚糖单链插入机制及其在维持杆状形态中的关键作用

  在微生物学研究领域，细菌如何维持其特定形态一直是个引人入胜的科学谜题。就像建筑师需要精确的蓝图和材料来构建建筑物一样，细菌需要精确调控其细胞壁的合成来维持形态。对于大肠杆菌这样的杆状细菌来说，其典型的杆状形态主要由肽聚糖（PG）细胞壁决定，这种巨大的大分子结构能够抵抗细胞质的膨压。然而，侧壁以恒定直径扩展的分子机制至今仍不清楚。肽聚糖的组装涉及糖基转移酶（聚合聚糖链）和转肽酶（形成肽间交联）的协同作用。传统观点认为，内肽酶通过切割现有的肽聚糖交联，为新合成的聚糖链插入提供空间，这对于维持杆状形态至关重要。但是最近的研究对这一观点提出了挑战，发现通过过量表达溶菌转糖基酶MltD（切割糖苷键而非酰

  来源：Cell Reports

  时间：2025-10-09

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