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BacExplorer:一体化从头细菌基因组注释平台的开发与应用
随着高通量测序(High-Throughput Sequencing, HTS)技术的普及,微生物学研究正经历革命性变革。每天产生的海量基因组数据使得传统手工注释变得不切实际。虽然近年来涌现出Bactopia、TORMES等细菌基因组分析工具,但它们大多需要使用者具备命令行操作技能,这成为许多微生物学家独立开展研究的瓶颈。更棘手的是,部分商业软件虽提供友好界面,却存在数据隐私隐患或高昂成本。这种技术门槛与科研需求之间的矛盾,在临床病原菌监测、抗生素耐药性(Antimicrobial Resistance, AMR)基因追踪等时效性极强的应用场景中尤为突出。为解决这一难题,来自意大利卡塔尼亚大学
来源:Bioinformatics Advances
时间:2025-11-10
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先天性心脏缺陷的产前护理与围产期区域化医疗
关键点问题 先天性心脏病(CHDs)患儿的产前护理开始时间、产前就诊频率与分娩地点之间有何关联?研究结果 在这项针对伊利诺伊州12,113名先天性心脏病患儿的横断面研究中,与未接受产前护理相比,延迟开始产前护理与在心脏中心分娩的概率增加有关。此外,对于轻度先天性心脏病的患儿,更多的产前就诊次数可降低6.7个百分点的在心脏中心分娩的概率。意义 这些结果表明,产前护理的开始时间和就诊频率都可能影响先天性心脏病患儿获得适当风险级别的护理。
来源:JAMA Network Open
时间:2025-11-10
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抗体药物偶联物与标准化疗在ERBB2阳性晚期乳腺癌中的心脏毒性作用:系统评价与荟萃分析
关键点问题 与含有曲妥珠单抗的标准护理化疗方案相比,新型抗体药物偶联物对ERBB2阳性局部晚期或转移性乳腺癌的心脏毒性效应发生率如何?研究结果 在这项针对9538名患者的系统评价和荟萃分析中,合并分析显示:使用曲妥珠单抗艾坦塞尼时,左心室射血分数(LVEF)下降的发生率为0.94%;使用曲妥珠单抗德鲁克单抗时为4.20%;使用曲妥珠单抗联合化疗时为4.85%;使用曲妥珠单抗、帕妥珠单抗联合化疗时为5.52%。意义 曲妥珠单抗艾坦塞尼导致的LVEF下降发生率最低,而曲妥珠单抗德鲁克单抗、曲妥珠单抗联合化疗以及曲妥珠单抗联合帕妥珠单抗联合化疗的LVEF
来源:JAMA Network Open
时间:2025-11-10
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高心脏风险患者术后输血的保守还是限制性策略:TOP随机临床试验
关键点问题 与限制性输血策略相比,宽松的输血策略是否能够降低高风险心脏事件患者在接受大手术后死亡或重大缺血事件的风险?研究结果 共有1428名术后心脏事件高风险的老兵在接受大手术后,根据宽松或限制性的输血策略接受了输血。两组的主要结局发生率相似(宽松组为9.1%,限制性组为10.1%)。意义 与限制性输血策略相比,宽松的输血策略并未显著降低术后90天的死亡或重大缺血事件发生率。
来源:JAMA -JOURNAL OF THE AMERICAN MEDICAL ASSOCIATION
时间:2025-11-10
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摄入含咖啡因的咖啡还是戒除咖啡以减少心房颤动:DECAF随机临床试验
要点问题 饮用含咖啡因的咖啡对复发性心房颤动(AF)发作的风险是具有益处、有害还是中性影响?研究结果 在这项多中心随机临床试验中,共有200名正在接受心脏复律治疗的持续性心房颤动患者参与研究。与不饮用咖啡的组(64%)相比,饮用咖啡的组(47%)的复发性心房颤动风险显著降低。意义 对于心房颤动患者来说,可以适当考虑饮用咖啡和其他含咖啡因的饮品。 摘要
来源:JAMA -JOURNAL OF THE AMERICAN MEDICAL ASSOCIATION
时间:2025-11-10
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在5年的随访期间,社区居住的老年人所获得的社会支持/网络与抑郁症状之间的关系
摘要研究目的探讨老年人抑郁症状不同情况下所获得的社会支持/网络来源的差异。研究方法数据来源于“年龄、基因/环境易感性-雷克雅未克研究”(Age, Gene/Environment Susceptibility – Reykjavik Study, AGES-Reykjavik)的两期调查:第一期(2002–2006年,样本量N=5,764)和第二期(2007–2011年,样本量N=3,316)。研究使用了七个问题来评估社会支持/网络状况,包括“与朋友/家人见面”、“感觉与家人/朋友关系亲密”、“给子女/朋友打电话”以及“与独居的朋友联系”。同时使用老年抑郁量表(Geriatric Depres
来源:Clinical Gerontologist
时间:2025-11-10
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发酵时间对饲喂发酵中药残渣的肉牛的营养价值、益生菌成分及生长性能的影响
本研究围绕中药残渣的发酵处理及其作为饲料资源的应用展开,重点探讨了不同发酵时间对发酵后中药残渣营养成分、生物活性物质以及益生菌含量的影响。中药残渣通常是在提取有效成分后产生的副产品,因其纤维含量高、味道强烈,往往难以直接作为饲料使用。然而,这些残渣具有较高的营养价值和潜在的饲料价值,通过发酵处理可以有效改善其适口性和营养特性。因此,如何优化发酵时间以最大化其作为饲料的利用效率,成为本研究关注的核心问题。在实验设计中,研究人员选取了中药残渣作为发酵基质,并辅以玉米芯、大豆粕和小麦麸作为辅助材料。发酵过程采用了乳酸菌和枯草芽孢杆菌两种益生菌菌株,同时加入了一定比例的纤维素酶,以促进发酵效果。实验组
来源:Journal of Applied Animal Research
时间:2025-11-10
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综述:接受经皮冠状动脉介入治疗的急性冠状动脉综合征患者长期使用口服抗血小板药物的安全性
摘要引言对于接受经皮冠状动脉介入治疗的急性冠状动脉综合征(ACS)患者,目前的标准治疗方案是持续12个月的双抗血小板治疗(DAPT),即同时使用阿司匹林和P2Y12抑制剂。然而,DAPT会增加出血风险。为了优化治疗效果,应根据患者的具体风险状况调整DAPT的疗程和用药强度。涵盖的内容已经测试了多种不同强度和疗程的双抗血小板治疗方案。对于缺血风险较高的患者,可以考虑增加DAPT的用药强度或延长疗程;而对于出血风险较高的患者,则应考虑减少抗血小板药物的用量、降低P2Y12抑制剂的剂量,或更换作用较弱的P2Y12抑制剂。血小板功能检测和基因检测有助于辅助决策。此外,抗血小板药物还具有一些特定的不良反
来源:Expert Opinion on Drug Safety
时间:2025-11-10
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综述:双GIP/GLP1受体激动剂(tirzepatide)在糖尿病和肥胖症中的疗效与安全性:一项系统评价和网络荟萃分析
摘要背景蒂尔泽帕肽(Tirzepatide)在减轻体重和控制2型糖尿病及肥胖患者的血糖方面显示出良好效果,但其不同剂量下的相对疗效和安全性仍不明确。方法我们进行了一项PROSPERO注册的系统性回顾和网络荟萃分析,纳入了截至2024年7月的随机对照试验。这些试验比较了蒂尔泽帕肽(每周5毫克、10毫克或15毫克)与安慰剂、胰岛素或GLP-1受体激动剂在2型糖尿病和/或肥胖成人患者中的疗效。采用随机效应模型估计平均差异(MD)或相对风险(RR),并通过SUCRA评估治疗效果排名,并用CINeMA对证据确定性进行评级。结果共纳入13项随机对照试验(14,007名参与者)。与胰岛素相比,蒂尔泽帕肽具有
来源:Expert Opinion on Drug Safety
时间:2025-11-10
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静脉输液刺激对健康麻醉猫内皮糖萼的即时影响
这项研究探讨了在健康的麻醉猫中,通过静脉输注大量短时间的液体(即所谓的“液体挑战”)对微循环中内皮糖萼的影响。内皮糖萼是一层覆盖在血管内壁的凝胶状结构,对于维持血管通透性和防止液体外渗至关重要。在严重疾病状态下,内皮糖萼的损伤可能会导致微血管功能障碍,从而引发组织水肿和液体超载,这在临床上可能带来严重的后果。因此,理解不同种类静脉输液对内皮糖萼的具体影响,尤其是在猫这种对液体耐受性较低的动物中,具有重要的临床意义。研究中使用了两种常见的静脉输液:一种是缓冲平衡等张晶体液(Hartman’s solution),另一种是合成胶体(130/0.4羟乙基淀粉,简称HES)。实验设计采用了随机对照的方
来源:The Veterinary Journal
时间:2025-11-10
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澳大利亚牛群中肠球菌属的抗菌素耐药性、基因组学及公共卫生相关研究
进入21世纪以来,抗菌药物耐药性(AMR)已成为全球公共卫生领域面临的一大挑战。作为一类常见的肠道共生菌,肠球菌在人类和动物的消化系统中广泛存在,但在特定条件下可以成为机会性病原体,引发严重的感染,如败血症、尿路感染等。特别是近年来,肠球菌对多种抗菌药物的耐药性在澳大利亚的临床环境中显著上升,这引发了科学界和医疗工作者对耐药菌传播途径和防控措施的深入研究。尽管已有研究指出猪和鸡可能是肠球菌耐药性的次要来源,但牛群中肠球菌的耐药情况仍存在争议。因此,有必要对澳大利亚牛群中的肠球菌进行系统性的分析,以明确其耐药特征及其与人类感染源之间的遗传关系。本研究的背景源于肠球菌在全球范围内的耐药性问题。肠球
来源:Veterinary Microbiology
时间:2025-11-10
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磺胺类药物和复方新诺明对兽医病原体的最低抑菌浓度:这些老抗生素的新数据
本研究聚焦于兽用抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC)分布及其在抗菌药物敏感性测试(AST)中的应用价值。随着全球对抗微生物耐药性(AMR)问题的关注度不断提高,如何科学合理地使用抗生素成为兽医学领域的重要议题。为了更好地支持这一目标,研究团队旨在通过分析几种关键兽用病原体对多种磺胺类药物和甲氧苄啶(trimethoprim)的MIC数据,为缺乏明确解释标准的药物建立初步的流行病学截断值(ECOFFs),并进一步提出可能的抗菌药物临床断点(CBPs)。### 抗菌药物使用现状与挑战在兽医学中,抗菌药物的使用不仅关系到动物健康,还对人类公共卫生构成潜在威胁。为了优化抗菌药物的使用,世界卫生组织(WHO
来源:Veterinary Microbiology
时间:2025-11-10
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糖皮质激素代谢:在心理神经内分泌学领域及更广泛领域的科学探索之旅
Jonathan Seckl的科研生涯始于一段特殊的历史背景。他出生于20世纪50年代的伦敦,是二战期间逃离种族灭绝的难民移民的孩子。这种出身使他从小就对教育充满渴望,而这种渴望也成为他日后投身医学研究的动力。在1970年代,他进入伦敦大学学院学习医学,这一时期正值神经科学快速发展的阶段,几位诺贝尔奖得主的教诲让他坚定了从事学术研究的决心。随后,他获得了一个难得的奖学金,跟随Stafford Lightman教授在帝国理工学院的医学系攻读博士学位,这一选择虽略显冒险,却为他打开了通往神经内分泌学的大门。在博士研究期间,他逐渐认识到压力相关的神经内分泌调控机制的复杂性,并在接下来的几十年中一直致
来源:Psychoneuroendocrinology
时间:2025-11-10
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一名患有动脉干畸形的新生儿的术后超说明书药物治疗及药物护理面临的挑战:病例报告
常见动脉干(Truncus Arteriosus, TA)是一种严重的先天性心脏病,其特点是心脏发育过程中未能将主动脉和肺动脉正确分开,形成单一的动脉干,该动脉干从室间隔缺损处发出,同时负责全身、肺部和冠状动脉的血液循环。由于血液混合流动,TA患者在出生后立即面临严重的心力衰竭风险,因此需要迅速且准确的诊断以恢复正常的血流动力学,防止多器官损伤,并提高治疗成功的可能性。TA的治疗以手术为主,随后辅以药物治疗,患者需终身接受定期医学随访。尽管手术是根本性治疗手段,但术后仍需长期的药物管理,包括控制心力衰竭、预防血栓形成、管理感染风险等。TA在先天性心脏病中的发病率相对较低,约占所有先天性心脏病的
来源:PHARMACIA
时间:2025-11-10
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综述:Strongyloides stercoralis 强直性蠕虫病合并血栓形成:病例报告的系统回顾
Strongyloides stercoralis(简称SS)是一种通过土壤传播的肠道寄生虫,其感染在全球范围内较为普遍,尤其是在卫生条件较差的热带和亚热带地区。尽管大多数SS感染呈无症状或轻微表现,但在某些特定人群中,如免疫功能受损者,感染可能发展为严重的并发症,包括Strongyloides超感染综合征(SHS)或广泛性强直利虫病。这些情况通常与高死亡率相关,且在临床实践中常被忽视。近年来,随着对SS感染及其并发症的研究深入,一些新的临床表现和病理机制逐渐被揭示,其中与血栓形成相关的并发症引起了广泛关注。### 强直利虫病与血栓形成的关系强直利虫病的严重形式,即SHS,通常发生在免疫功能受
来源:New Microbes and New Infections
时间:2025-11-10
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氟西汀通过影响代谢组学特征,增强了小鼠因阿片类药物引起的便秘所伴随的抑郁症的治疗效果
近年来,诱导多能干细胞(iPSCs)在医学研究中的应用日益广泛,尤其是在神经退行性疾病的机制研究和药物开发领域。iPSCs通过将特定的重编程因子引入体细胞中,能够重新获得类似胚胎干细胞的多能性,从而成为一种强大的研究工具。这种技术不仅能够复制患者的基因组背景,还能够支持大规模的细胞培养,为疾病模型的构建提供了独特的优势。在神经退行性疾病研究中,iPSCs的应用正逐步扩展,涵盖从基础机制研究到药物筛选的多个方面,成为推动疾病治疗进展的重要力量。### iPSCs的潜力2006年,Yamanaka团队首次成功生成诱导多能干细胞(iPSCs),这一突破为再生医学和药物研究开辟了新的方向。iPSCs的
来源:Neuroscience Research
时间:2025-11-10
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微重力环境下的数字孪生建模:一种用于预测性和个性化空间医学的框架
人类在太空飞行过程中会暴露于一系列复杂的生理应激因素中,这些因素共同作用于心血管、肌肉骨骼、免疫和神经系统,导致其功能发生显著变化。随着航天任务的持续进行,生物医学监测所产生的数据量庞大,但往往缺乏连贯性,包括生理数据、组学信息、影像资料以及行为指标等。然而,这些数据通常是在任务结束后进行分析,无法在飞行过程中实时用于指导干预措施。因此,一种全新的医学管理方式正在被提出,即通过数字孪生技术,建立个性化的航天员健康模型,以实现更精准的健康管理。数字孪生是一种计算模型,它通过整合实时数据流、重新校准内部参数以及预测未来状态,实现对物理实体的动态模拟。最初起源于航空航天工程领域,数字孪生被用于预测飞
来源:Life Sciences in Space Research
时间:2025-11-10
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环境温度与肾绞痛风险:一项系统评价和荟萃分析
随着全球气候的变化,极端气温对人类健康的影响日益受到关注。本研究通过对现有文献的系统回顾和荟萃分析,探讨了日常环境温度与肾绞痛之间的关系,发现高温对肾绞痛风险具有显著影响,而低温的影响则不显著。这一研究结果不仅有助于理解极端气候对肾脏健康的具体影响,也为制定有效的预防和应对措施提供了科学依据。### 高温对肾绞痛的影响研究结果显示,每天环境温度每升高1°C,肾绞痛的风险就会增加2.4%。这一发现表明,高温可能通过多种机制对肾脏功能产生不利影响。例如,高温会导致脱水和尿液浓缩,这会增加肾结石形成的可能性。肾结石是肾绞痛的主要原因之一,其形成与尿液中矿物质的浓度密切相关。在高温条件下,尿液浓缩使得
来源:Kidney Medicine
时间:2025-11-10
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将一种商业样品提取方案进行调整,以适用于生物安全等级3/4的等离子体代谢组学分析
这项研究探讨了如何在不破坏样本完整性的情况下,改进用于感染研究的代谢组学分析方法。研究团队针对一个国际性的脓毒症观察性队列中的血浆样本,评估了两种不同的处理方式:一种是使用Biocrates公司开发的Absolute IDQ p180商业代谢组学分析流程,另一种是在该流程中加入了有机溶剂提取步骤(即MPLEx方法),以实现对高风险病原体的灭活。研究的核心目标是评估这两种方法在代谢物检测和浓度测量上的表现差异,并探讨如何通过数据整合策略来克服这些差异,从而提升代谢组学分析在高风险感染研究中的应用价值。脓毒症是一种由宿主对感染的过度反应引发的多器官功能障碍综合征,其对全球公共卫生和军事医疗系统都构
来源:Journal of Mass Spectrometry and Advances in the Clinical Lab
时间:2025-11-10
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接受子宫炎治疗的奶牛在临床治愈时间上的差异对其繁殖性能、生产性能以及是否被从牛群中淘汰的影响
本研究探讨了奶牛在临床治愈子宫内膜炎所需时间与泌乳性能(包括繁殖、产奶量和被剔除出牛群)之间的差异。研究采用回顾性队列研究方法,基于佛罗里达州5个奶牛场的3项实验数据。在实验中,患有子宫内膜炎的奶牛被随机分配接受阿莫西林或头孢噻呋治疗,其中一项实验仅使用头孢噻呋。子宫内膜炎的诊断通过Metricheck设备在产后12天内评估阴道分泌物(VD)完成,特征为有异味、水样、红棕色的分泌物(n = 1,410)。诊断当天定义为d 0。共有556头奶牛接受了阿莫西林治疗,854头接受了头孢噻呋治疗。临床治愈在d 5和d 12时进行视觉评估,定义为VD评分≤4。根据诊断时间和治愈情况,奶牛被分为CureD
来源:Journal of Dairy Science
时间:2025-11-10