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  • 组织学观察和转录组分析揭示了在17β-雌二醇诱导的性别反转过程中,斑点蛇头鱼(Channa maculata)的生殖腺变化

    在水产养殖领域,性别控制是提高养殖效益的重要手段之一。以斑点蛇头鱼(*Channa maculata*)为例,其雄性在生长速度、体型大小以及饲料转化率方面均优于雌性,这使得全雄养殖具有显著的经济和生态优势。然而,由于性别决定机制的复杂性,如何高效、安全地实现性别控制仍然是一个挑战。本文通过结合组织学和转录组学分析,系统探讨了17β-estradiol(E2)诱导的性别反转过程,并揭示了相关基因表达的变化规律,为优化性别控制策略提供了理论依据。### 性别反转的生理基础在斑点蛇头鱼的性别决定过程中,E2作为一种重要的性激素,能够显著影响性别分化和生殖器官的发育。通过实验观察发现,在20天后,无论

    来源:Aquaculture Reports

    时间:2025-10-09

  • 莱茵衣藻中鸟嘌呤存储液泡(GSV)的发现:一种新型氮储备细胞器的超微结构与代谢调控机制

    Significance本研究通过快速冷冻深度蚀刻电子显微镜(QFDEEM)技术首次描述了莱茵衣藻中一种新型细胞器——鸟嘌呤存储液泡(GSV),该技术完整保留了其膜超微结构、鸟嘌呤晶体 endowment 以及在外源氮饥饿与补充过程中的形态变化。同时报道了莱茵衣藻基因组中预测参与鸟嘌呤代谢、分解代谢和转运的基因深度清单,其中多数基因在氮饥饿条件下表达增强。我们提出了一个可经基因敲降和标签蛋白验证的鸟嘌呤循环模型,这些发现为真核微藻代谢生理学研究提供了新范式。Abstract莱茵衣藻的氮循环研究历来聚焦于外源铵/硝酸盐的可用性与摄取。近期通过拉曼显微镜技术,在多种微藻(包括莱茵衣藻)的细胞质中鉴

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 语言全局分析需考量关系、地理与不平衡二元数据:对Koplenig与Wolfer的回应

    针对Koplenig与Wolfer提出的质疑,本研究系统论证了全球语言分析必须处理三个核心问题:类型学数据常呈现不平衡二元分布(如多式综合语罕见)、空间聚类效应以及谱系关联性。通过采用不假设数据分布的可逆跳转马尔可夫链蒙特卡洛(rjMCMC)算法——尽管计算量增加数个量级——团队发现海拔(Altitude)与母语人口规模(L1_population)始终是预测多式综合语分布的最显著因子(后验包含概率PIP=1.000),而小语族(Small_Family)的影响被高估源于其与连续变量的相关性。研究进一步揭示,基于模型拟合度(如AIC)的特征向量选择方法会误选55个空间特征向量,导致过拟合和残留

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 二硫键交联氧化还原敏感性肽缩合物作为高效分子货物细胞递送载体

    生物分子缩合物(Biomolecular Condensates, BCs)是通过相分离形成的粘弹性聚集体,富含蛋白质和核酸,作为无膜细胞器参与生物分子的时空组织。研究者利用二硫键交联设计出可逆相分离肽(Phase-Separating Peptide, PSP)缩合物,其在氧化条件下形成而在还原环境中解离。基于细胞质的高还原特性,该载体能高效递送小分子、多肽、GFP(31 kDa)、DNA(1.7 kbp)及mRNA等不同理化性质的分子货物。实验证实PSP缩合物对DNA和mRNA的转染效率显著优于商业转染试剂,且其性质可根据货物类型和细胞特性进行定制,为细胞递送系统提供了创新性解决方案。

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 时序调控microRNA(miR156)的异时性改变与植物多次幼态持续进化事件相关

    研究表明,发育过程中幼年性状持续产生伴随成年性状减少或缺失的现象(称为幼态持续,neoteny),可能由两种机制引起:调控幼年与成年性状转换时序的基因(时序基因)变异,或成年性状发育必需基因(靶基因)的改变。为探究这两种机制在幼态持续起源中的相对贡献,科研人员以金合欢属(Acacia Mill.)植物为模型展开研究。该属包含早期完成营养阶段转换(vegetative phase change)的物种,以及保持永久幼年状态或延迟转换的物种。通过将营养阶段转换时序映射到金合欢属分子系统树上,发现永久幼年态独立进化了多次,且在某些近缘物种中与营养阶段转换延迟相关。在三个典型案例中,营养阶段转换的缺失

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 内在无序连接区与末端结构域协同驱动蛛丝蛋白液-液相分离组装机制及人工纺丝应用

    蜘蛛的aciniform蛛丝(aciniform silk)是一种兼具卓越韧性(toughness)和弹性(elasticity)的蛋白质纤维,主要用于包裹猎物和构筑卵囊内层。尽管大壶状腺丝(ampullate silk)和卵囊丝(eggcase silk)的形成机制已被广泛研究,但aciniform蛛丝蛋白(AcSp1)的自组装分子机制仍不明确。本研究首次发现AcSp1的内在无序连接区(intrinsically disordered linkers, IDRs)通过驱动液-液相分离(liquid–liquid phase separation, LLPS)在溶液中主导蛛丝蛋白组装过程。其N

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 蝴蝶拟态超基因的功能性遗传元件解析:以dsx为核心的发育调控新机制

    发育过程需要众多基因在时空上的协同作用,但许多物种却能演化出截然不同的表型。这种复杂的平衡多态性常由超基因(supergene)控制——即多个紧密连锁的基因座共同调控复杂表型的发育。超基因在自然界中广泛存在,但由于其功能位点及变异机制的模糊性,其进化与功能机制长期未被阐明。以凤蝶属(Papilio polytes和Papilio alphenor)的拟态多态性为例,其翅膀拟态与非拟态表型的切换由doublesex(dsx)超基因的不同等位基因控制。研究发现:拟态等位基因通过获得六个新型顺式调控元件(cis-regulatory elements, CREs)及一次染色体重排(inversion

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • Ikzf1/Myb复合物通过lncRNA irf8调控中性粒细胞发育的机制及其在髓系疾病中的意义

    作为免疫系统的关键执行者,中性粒细胞通过快速炎症反应清除微生物和碎片,对维持健康至关重要。发育过程中,中性粒细胞与巨噬细胞共享共同的祖细胞,其命运受转录程序的精密调控。本研究揭示转录因子Ikzf1和Myb在中性粒细胞中富集,二者形成复合物靶向irf8基因,并通过调控元件诱导长链非编码RNA(lncRNA)irf8-2的表达。该lncRNA通过Zfp36l1调控irf8剂量,从而偏袒中性粒细胞命运。实验表明,Ikzf1过度激活促进中性粒细胞生成并抑制巨噬细胞分化,而Ikzf1与Myb同时缺失(非单独突变)会显著损害中性粒细胞发育并扩大巨噬细胞池。irf8-2缺失导致中性粒细胞发育缺陷和巨噬细胞增

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-10-09

  • 基于人群的沙眼衣原体基因型在眼部和泌尿生殖道样本中的一致性研究:瑙鲁的高流行区证据

    ABSTRACT沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)可引起性传播的泌尿生殖道感染和眼部感染,后者多发生于儿童之间,是致盲性疾病沙眼的病原体。尽管两类感染通常由不同的菌株引起,但有证据表明泌尿生殖道株系可能感染眼部并引起结膜炎,暗示成人或青少年可能通过手指接触将病原传播给儿童。本研究在瑙鲁——一个眼部和泌尿生殖道感染均高流行的地区——开展了首项基于人群的沙眼衣原体基因型分析,旨在明确两类感染之间是否存在交叉传播。INTRODUCTION沙眼衣原体是一种可感染眼部、泌尿生殖道和肛门上皮的细菌。沙眼是由眼睑结膜组织对沙眼衣原体眼部感染产生的炎症反应所致。2024年4月,估计有1.

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-10-09

  • 热带北太平洋四种新型微绿藻病毒的基因组多样性与全球分布

    病毒分离与特征四种HiMcV病毒株(McV-KB2、McV-KB3、McV-KB4和McV-SA1)从夏威夷凯恩奥赫湾(Kāne‘ohe Bay)和北太平洋ALOHA站点的表层海水中分离获得。透射电镜显示McV-SA1病毒颗粒呈二十面体形态,衣壳直径约142-160纳米,符合已知微绿藻病毒特征。宿主范围试验表明这些病毒对7株微绿球藻具有差异化的裂解能力,其中McV-KB2和McV-KB3可感染6株宿主,显示较广的宿主谱系。基因组结构与进化分析病毒基因组长度介于205-212 kb之间,GC含量在41%-44.9%范围内。通过Mauve全基因组比对发现,McV-KB3、McV-KB4和McV-S

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-10-09

  • 牛肝脓肿病原体溯源新发现:后肠道作为潜在致病菌来源的机制与临床意义

    引言:牛肝脓肿的经济与健康负担牛肝脓肿(Liver abscesses, LA)是育肥牛养殖业中的重大经济负担,主要导致肝脏及内脏废弃,更重要的是严重影响牛只生长性能、胴体产量和品质。长期以来,肝脓肿被认为是由瘤胃来源的细菌通过门脉血液转移至肝脏引发的多微生物感染。其中,坏死梭杆菌(Fusobacterium necrophorum)的两个亚种——坏死梭杆菌亚种(subsp. necrophorum)和基础梭杆菌亚种(subsp. funduliforme)——是最主要的病原体,其次为化脓隐秘杆菌(Trueperella pyogenes)和肠道沙门氏菌(Salmonella enterica

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-10-09

  • 产甲烷古菌中最小SufB2C2复合物作为[4Fe-4S]簇支架的功能与演化研究

    引言铁硫(Fe-S)簇是最古老且通用的无机辅因子,存在于所有生命域中。它们通过氧化还原化学和路易斯酸型催化作用,支持生物能量学、生物合成和遗传调控等多种生化过程。Fe-S簇的生物合成包含两个基本步骤:簇组装和转移。在组装过程中,半胱氨酸脱硫酶(通常是一种依赖磷酸吡哆醛的酶)从游离L-半胱氨酸中提取硫,而生理性铁供体尚不明确。随后,铁和硫在支架蛋白上结合,从头形成新生簇。在转移步骤中,预组装的簇通过ATP依赖的伴侣蛋白直接或通过Fe-S簇载体蛋白间接递送到目标脱辅基蛋白。负责Fe-S簇生物合成的蛋白质机制因生物和环境条件而异。细菌拥有三种已知机制:NIF、ISC和SUF系统。其中SUF系统在微生

    来源:Microbiology Spectrum

    时间:2025-10-09

  • 铜绿假单胞菌分泌的呼吸毒素HQNO通过脂肪酸积累抑制金黄色葡萄球菌SaeRS双组分系统调控的毒力因子表达

    ABSTRACT铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是定植于囊性纤维化(CF)患者气道中的两种主要病原体。随着年龄增长,P. aeruginosa 逐渐取代 S. aureus 成为气道中的优势菌种,此过程与患者症状恶化相关。这种负相关性部分源于 P. aeruginosa 分泌的次级代谢产物和毒力因子对宿主细胞及其他细菌的拮抗作用。其中多种代谢物能抑制 S. aureus 的呼吸作用。SaeRS 是 S. aureus 中的一个双组分调控系统(TCRS),负责调控众多毒力基因的转录。SaeRS 调控基因的转

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-10-09

  • 综述:细菌伪接收器结构域的澄清视角

    细菌伪接收器结构域的分类与功能争议细菌伪接收器结构域(Pseudo-Receiver domains, PsRs)是一类在计算生物学中被识别为接收器结构域(Receiver domains)但缺乏关键催化磷酸化反应残基的蛋白质模块。尽管PsRs在自然界中广泛存在(约占细菌接收器结构域的6%),其分子激活与失活机制仍不明确。本文通过厘清四个常被混淆的概念——PsRs本身、具有额外调控机制的接收器、无需磷酸化即可激活的接收器以及无明确伴侣激酶的“孤儿”响应调节因子(Orphan RRs),为PsRs研究提供了新的视角。双组分系统命名与结构基础双组分系统(Two-Component Systems,

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-10-09

  • 胞内谷氨酰胺水平波动响应氮源调控非结核分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)生物膜形成

    非结核分枝杆菌生物膜形成的代谢调控机制非结核分枝杆菌(NTM)能够在人类感染和家庭管道系统中形成生物膜,理解其调控机制有助于更好地治疗和预防NTM感染。葡萄糖在体外驱动NTM聚集,而铵离子抑制聚集,但控制生物膜形成这一早期步骤的调控系统尚未明确。本研究以模式NTM生物耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)为对象,揭示了多种碳氮源对聚集的类似影响,表明细菌可能通过下游整合信号感知营养状态。多种碳氮源影响耻垢分枝杆菌聚集在富含营养的TYEM培养基中,耻垢分枝杆菌先形成聚集体,随后自发分散。添加葡萄糖延长并增强了聚集阶段,而添加铵盐导致早期分散和浮游生长。研究测试了四种不同碳

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-10-09

  • 枯草芽孢杆菌抑制蛋白在膜内互作阻断胞内蛋白酶SpoIVFB活性的机制研究及其在病原菌孢子形成中的调控意义

    INTRODUCTION调控性膜内蛋白酶切(RIP)通路在生命三域中广泛参与关键生物学过程的调控。该通路的核心组分膜内蛋白酶(IP)能够直接在膜内切割底物,释放出的蛋白片段可调控细胞功能。以人类S2P蛋白酶为代表的金属IP参与胆固醇稳态、内质网应激反应等过程,而细菌中的S2P相关金属IP(如枯草芽孢杆菌的SpoIVFB)则调控应激反应、致病性及孢子形成等。在孢子形成过程中,SpoIVFB负责切割前体σ因子Pro-σK,释放出成熟转录因子σK,从而启动母细胞中孢子形成相关基因的转录。SpoIVFB的活性受到两个天然抑制蛋白BofA和SpoIVFA的严格控制,二者与SpoIVFB形成复合体,阻止P

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-10-09

  • 综述:核凝聚体的力学调控与活动

    力学与细胞核内的生物分子凝聚体细胞核在多种基本生物过程中持续受到力学作用,例如受限细胞迁移、渗透压调节以及发育过程中组织层面的大尺度应力。生物分子凝聚体作为一类无膜包被的亚细胞结构,对外部力学扰动具有响应性,这一特性早在二十年前对生殖系p-颗粒(p-granules)的研究中就已观察到。然而,细胞所受的外部力量如何影响亚细胞层次的生理性凝聚过程,以及凝聚体自身如何表现出机械活性,仍是当前新兴的研究方向。力化学调控与相分离近年来的研究逐步揭示了相分离事件在力化学调控方面的分子机制。生物分子凝聚体(包括核仁、 Cajal 小体、组蛋白基因座体等)通过液-液相分离(Liquid-Liquid Pha

    来源:Biophysical Journal

    时间:2025-10-09

  • 霍乱弧菌截短几丁质孔蛋白中肽识别分子机制及其纳米孔传感应用前景

    革兰氏阴性菌中形成纳米孔的膜外蛋白(outer membrane proteins)介导着肽类与小分子的选择性转运。本研究探索了肽段如何被缺失天然N端堵塞结构域(plug)的霍乱弧菌(Vibrio harveyi)截短几丁质孔蛋白(VhChiPΔN-plug)识别。通过黑脂膜(BLM)电生理学实验发现,模拟N-plug的合成肽从trans侧(相当于天然胞外取向的周质面)施加时,能选择性地定向结合VhChiPΔN-plug孔道。该结合具有电压依赖性、超长停留时间及亚微摩尔级亲和力,证明其结合强效且特异。N-plug肽与蛋白复合物的共晶结构(PDB: 8ZXI)显示,肽段N端保守的天冬氨酸(Asp

    来源:Biophysical Journal

    时间:2025-10-09

  • 综述:界面与晶界工程助力高性能固体氧化物电池

    Context & scale固体氧化物电池(SOCs)的发展仍受限于宏观领域缺乏具有多元电化学现象的先进催化材料,以及微观领域催化材料较差的电化学反应动力学。SOCs材料的电化学活性高度依赖于不同催化剂组装的界面(interface)和相同化学组分组装的晶界(grain boundary)。深入理解并阐明界面与晶界的工作机制,优化这些关键区域,仍是最具挑战性且极具价值的科学技术问题。近五年来大量研究致力于解决这些挑战,但对界面和晶界的准确系统认知仍显不足,极大限制了SOCs的进一步发展。本综述提供了界面与晶界处传质和能量存储/转换的基础原理,分析了界面与晶界的优化原则,并介绍了SOC

    来源:Joule

    时间:2025-10-09

  • FGF-23通过诱导糖胺聚糖重塑血管细胞外基质促进慢性肾病血管钙化的机制研究

    慢性肾病(CKD)是一种以肾功能进行性丧失为特征的疾病,患者常伴有心血管疾病(CVD)风险显著升高。在CKD进程中,尿毒症毒素(UTs)的积累是导致血管病变的关键因素之一。近年来,骨源性激素——成纤维细胞生长因子23(FGF-23)作为一种新型尿毒症毒素,被证实与动脉硬化、血管钙化和左心室肥厚等心血管并发症密切相关。然而,FGF-23如何直接作用于血管细胞并导致病理改变的机制尚不完全清楚。本研究提出假设:FGF-23可通过调节血管细胞中糖胺聚糖(GAGs)的表达,尤其是硫酸化GAG(sGAG)和透明质酸(HA),从而参与血管细胞外基质(ECM)的重塑和钙化过程。为验证这一假设,研究团队分别以大

    来源:Renal Failure

    时间:2025-10-09


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