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综述:肠道微生物群与蛋白质翻译后修饰相互作用的研究进展
肠道微生物群与蛋白质翻译后修饰的相互作用:机制与展望肠道微生物群作为复杂的生态系统,通过多种机制调控宿主细胞功能,其中蛋白质翻译后修饰(PTMs)是关键环节。PTMs包括磷酸化、乙酰化、糖基化、乳酸化、泛素化等,通过共价修饰调控蛋白质活性、定位和相互作用,广泛参与细胞信号转导、免疫调节和代谢稳态维持。糖基化受肠道微生物群的调控糖基化是高频PTM,主要分为O-糖基化和N-糖基化。肠道微生物如Faecalibacterium prausnitzii通过产生丁酸上调O-糖基化相关蛋白,促进糖链合成。而Akkermansia muciniphila、Bacteroides等菌属富含糖基化酶,可降解黏液
来源:Microbiological Research
时间:2025-09-26
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丁酸梭菌通过肠道菌群-免疫轴调控缓解辐射诱导的小鼠骨丢失
Highlight全腹照射通过肠道菌群与免疫失调诱发骨丢失,而丁酸梭菌干预可显著逆转这一过程。Animal Model所有动物实验均经苏州大学伦理委员会批准(批准号:SUDA20250320A13),遵循机构与国家动物福利伦理准则。12周龄雌性C57BL/6J小鼠(约28克)购自北京维通利华实验动物技术有限公司,在苏州大学实验动物中心SPF(无特定病原体)环境中适应1周后开始实验。Total Abdominal Irradiation Induces Bone Loss in Mice尽管局部骨照射已被报道可导致骨丢失,但全腹照射(TAI)对骨骼的影响尚不明确。我们基于先前研究建立TAI模型,
来源:Microbiological Research
时间:2025-09-26
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日本乳房重建术式比较研究:胸肌前与胸肌下组织扩张器置入术后并发症分析
在植入物乳房重建领域,胸肌前(prepectoral)置入术式因其能减轻术后疼痛并改善美学效果,已成为胸肌下(subpectoral)重建的广泛替代方案。然而在日本,硅胶乳房植入物(SBIs)的prepectoral置入仍未被批准,其临床安全性尚未明确。研究人员回顾性分析了2023年1月至2024年12月期间接受即刻两阶段乳房重建伴组织扩张器(TE)置入的176例患者(187侧乳房)。患者被分为prepectoral组(128例/135侧)和subpectoral组(48例/52侧),比较了两组术后感染、血清肿(seroma)及TE暴露等并发症差异,并通过单因素多因素逻辑回归分析风险因素。研究
来源:Breast Cancer
时间:2025-09-26
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双分子靶向策略增强慢病毒载体对VEGFR2表达细胞的基因递送效率
在癌症基因治疗领域,系统性递送治疗基因至转移病灶仍面临特异性、效率和安全性的三重挑战。肿瘤相关内皮细胞(TAECs)作为肿瘤血管生成的关键介质,因其高表达血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)且直接接触血液循环系统,成为理想的靶向治疗靶点。然而,传统嵌合型慢病毒载体(LVs)虽能实现靶向递送,却因靶向模块与融合糖蛋白的结构冲突导致转导效率受限(仅约30%),严重制约了其临床应用潜力。为突破这一瓶颈,Ahani团队在《Virology Journal》发表的研究中,创新性地采用双分子靶向策略(Two-Molecules Targeting Approach, TMTA),将靶向模块(VEGFR2
来源:Virology Journal
时间:2025-09-26
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基于AlphaFold2生成扩散模型UFConf的迭代结构扩散建模(IMSD)探索变质蛋白折叠转换路径
1 引言蛋白质科学长期遵循"序列-结构-功能"范式,认为蛋白质序列唯一决定其三维结构,进而决定功能。然而,内在无序蛋白(IDPs)和变质蛋白(MPs)的发现突破了这一传统认知。变质蛋白能够采用两种或更多截然不同的空间结构,在功能调控中发挥重要作用。尽管实验研究表明蛋白质数据库中高达4%的蛋白质可能具有折叠转换特性,但由于替代态通常种群稀少,直接实验观测面临巨大挑战。计算工具成为研究变质蛋白的重要手段。分子动力学(MD)模拟虽然能提供原子级分辨率,但折叠转换过程的时间尺度远超常规MD模拟能力。增强采样方法如副本交换等部分解决了这一问题,但仍存在计算成本高的问题。AlphaFold2(AF2)作为
来源:Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics
时间:2025-09-26
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代谢基因DsUGT84A1与靶点突变Pro197His/Ser协同介导播娘蒿对苯磺隆抗性的机制研究
播娘蒿(Descurainia sophia)作为中国麦田入侵性杂草,对乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase, ALS)抑制剂类除草剂苯磺隆(tribenuron-methyl)产生了显著抗性。本研究通过整株生物测定发现,抗性种群(R)相比敏感种群(S)的抗性指数(resistance index, RI)高达35.20倍。使用细胞色素P450抑制剂马拉硫磷(malathion)处理可部分逆转抗性,表明存在代谢抗性机制。靶点抗性(target-site resistance, TSR)分析显示,R种群ALS基因第197位脯氨酸(Pro)突变为组氨酸(His)或丝氨酸(Se
来源:The Plant Journal
时间:2025-09-26
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多效应因子协同触发美洲龙葵(Solanum americanum)对丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)的非寄主抗性机制研究
引言植物在自然界中持续面临病原菌侵袭,但病害发生并不常见,这主要归因于其 evolved 的多层免疫机制。植物免疫主要包括两个层面:模式触发免疫(PTI)和效应因子触发免疫(ETI)。PTI通过细胞表面的模式识别受体(PRR)识别病原菌相关分子模式(PAMP),而许多病原菌则通过III型分泌系统(T3SS)递送效应蛋白来抑制PTI。作为反击,植物进化出ETI,通过NLR蛋白识别特定效应因子,并常引发超敏反应(HR),导致侵染部位局部细胞死亡。Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000(Pto DC3000)是研究植物-微生物相互作用的模式细菌病原体,其III型
来源:The Plant Journal
时间:2025-09-26
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中国家族KRT9基因变异致掌跖表皮分化障碍的鉴定与植入前遗传学诊断研究
掌跖表皮分化障碍(KRT9-palmoplantar epidermal differentiation disorder, KRT9-pEDD)是一种罕见的常染色体显性遗传病,患者手掌和脚底皮肤会出现弥漫性增厚、黄变和局部脱屑裂纹。这种疾病通常在出生后数周至数月内发病,伴随终身的热觉和触觉敏感性下降、行走困难以及社交障碍。目前尚无有效治疗方法,遗传阻断成为患者家庭生育健康后代的关键手段。KRT9-pEDD主要由角蛋白9(Keratin 9, KRT9)基因突变引起,该基因编码的角蛋白9是掌跖表皮终末分化角质细胞中特异性表达的类型I中间丝蛋白,其突变会导致细胞骨架结构异常和机械脆性。全球发病率
来源:Hereditas
时间:2025-09-26
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色氨酸代谢酶与犬尿喹啉酸在抗体介导性肾小球肾炎中的免疫调控作用及机制研究
引言色氨酸(TRP)作为必需氨基酸,其95%以上通过犬尿氨酸途径代谢,该途径是体内烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)合成的唯一de novo途径。吲哚胺2,3-双加氧酶(IDO)存在IDO1和IDO2两种亚型,是该途径的限速酶。近年研究发现该途径与免疫功能密切相关,包括IDO在妊娠免疫耐受中的作用、表达IDO的抗原呈递细胞通过色氨酸分解代谢调节T细胞活化、衰老和炎症中细胞固有NAD生成减少改变巨噬细胞免疫功能,以及恶性肿瘤通过IDO1表达实现免疫逃逸。IDO2则在B细胞中发挥关键作用,促进自身免疫发展。在肾脏疾病领域,犬尿氨酸3-单加氧酶(KMO)缺失对缺血再灌注损伤模型的急性肾损伤(AKI)具有
来源:The FASEB Journal
时间:2025-09-26
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m6A修饰的环状RNA circNEK11通过miR-1236-3p/GPX2轴调控肝细胞癌进展的机制研究
3.1 circNEK11的鉴定与特征分析通过高通量环状RNA测序技术对8对HCC组织与癌旁组织、2对非复发与复发HCC组织进行分析,筛选出在HCC组织中异常高表达且与复发密切相关的circNEK11(hsa_circ_0067347)。该环状RNA由NEK11基因的12、13、14和15号外显子反向剪接形成,通过Sanger测序验证其环化位点。分子特性研究表明:circNEK11在cDNA中能被发散引物特异性扩增,而在基因组DNA中无法扩增;其半衰期显著长于线性NEK11 mRNA;对RNase R酶处理具有抗性;通过核质分离实验和RNA荧光原位杂交(FISH)证实其主要定位于细胞质。3.2
来源:Cancer Science
时间:2025-09-26
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基于光声/超声影像的深度学习与影像组学整合模型在乳腺癌分子亚型无创预测中的突破性研究
乳腺癌作为全球女性最常见的恶性肿瘤,其发病率近年来持续上升,已成为癌症相关死亡的主要原因之一。这种疾病具有高度异质性,根据雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人表皮生长因子受体2(HER2)的表达情况,可分为Luminal A、Luminal B、HER2过表达和三阴性四种主要分子亚型。其中Luminal型乳腺癌(包括Luminal A和Luminal B)通常预后较好,尤其Luminal A型对内分泌治疗敏感;而非Luminal型(包括HER2过表达型和三阴性)则更具侵袭性,对内分泌治疗不敏感,但新辅助治疗可能获得较高的病理完全缓解率。目前临床标准的免疫组化(IHC)检测虽然能够进行分子
来源:Breast Cancer Research
时间:2025-09-26
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全球斑秃终生风险性别差异揭示:女性风险更高且社会经济因素加剧不平等
头发是人类外貌特征的重要组成部分,而斑秃(Alopecia Areata, AA)作为一种自身免疫性疾病,会导致患者出现斑片状脱发,严重影响患者的外形美观和心理健康。近年来,自身免疫性疾病的发病率在全球范围内呈现上升趋势,已成为一个重要的公共卫生问题。然而,关于斑秃的性别差异特征一直存在科学争议——有些研究显示女性发病率较高,另一些研究则认为男女发病率相近。这种认识上的不一致,特别是关于区域和时间趋势、年龄特征以及社会经济维度上的性别差异,仍然缺乏系统性的表征,亟待深入研究。为了解决这些知识空白,由孙嘉晨和李宇皓共同领导的研究团队在《Biology of Sex Differences》杂志上
来源:Biology of Sex Differences
时间:2025-09-26
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前列腺癌跨源miRNA生物标志物的系统鉴定:计算与实验整合分析揭示miR-136-3p的诊断潜力
引言前列腺癌(PCa)是全球男性中第二常见的恶性肿瘤,其早期诊断和有效治疗手段仍面临重大挑战。尤其是转移性PCa对现有疗法易产生耐药性,患者预后较差。近年来,microRNA(miRNA)作为内源性非编码RNA,在转录后水平调控基因表达,为癌症发病机制提供了新见解。研究表明,miRNA在PCa中常出现表达失调,可作为肿瘤抑制因子或癌基因发挥作用。然而,关于miRNA–mRNA调控网络在PCa中的作用研究仍较少。本研究旨在通过生物信息学方法结合实验验证,筛选PCa相关的关键miRNA,构建miRNA–mRNA网络,并探索其作为诊断生物标志物的潜力。方法MiRNA微阵列数据研究使用了GEO数据库中
来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology
时间:2025-09-26
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基于机器学习的免疫逃逸特征谱预测胃腺癌预后及免疫治疗获益
背景胃腺癌(STAD)仍是全球癌症相关死亡的主要因素之一。尽管免疫治疗取得进展,但由于肿瘤固有的免疫逃逸机制,仅部分STAD患者能从免疫检查点抑制剂中获益。因此,亟需可靠的预测性生物标志物来指导预后评估和治疗决策。材料与方法研究从TCGA数据库获取325例STAD患者的转录组数据和临床信息,并从GEO数据库获取多个验证队列(GSE84437、GSE62254等)。通过整合10种机器学习算法(包括随机生存森林、LASSO等)构建101种预测模型,依据验证数据集中的一致性指数(C-index)选择最优模型。采用生存分析、免疫浸润反卷积及多种免疫治疗响应指标评估IES的预后和免疫学意义。关键基因通过
来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology
时间:2025-09-26
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丙酸通过上调GPR43介导粪便微生物移植对缺血再灌注损伤的肾脏保护作用
引言急性肾损伤(AKI)是全球医疗卫生系统面临的重大挑战,约20%–25%的住院患者受其影响,不仅导致死亡率显著上升(增加1.7至3.3倍),还常进展为慢性肾脏病(CKD)。肾脏缺血再灌注损伤(IRI)是引起AKI的主要原因之一,其特征为再灌注后加重的炎症反应与肾小管细胞凋亡。目前仍缺乏针对IRI的有效靶向治疗手段。近年来,肠-肾轴在肾脏病理中的作用日益受到关注。肠道菌群失调——表现为微生物多样性降低和有益菌群减少——可加剧全身性炎症和肾功能障碍。尤其AKI相关的肠道菌群紊乱会破坏肠道屏障完整性,促进细菌移位和内毒素血症,从而放大肾损伤。粪便微生物移植(FMT)作为一种已证明能有效对抗艰难梭菌
来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
时间:2025-09-26
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胸膜肺炎放线杆菌铁饥饿应答的转录组与蛋白质组整合分析揭示其铁获取与代谢重编程机制
1 引言胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae, APP)是猪传染性胸膜肺炎(Porcine Contagious Pleuropneumonia, PCP)的主要病原体,对全球养猪业构成严重威胁。该病原体包含2种生物型和19种血清型,且不同血清型间交叉免疫保护较弱,使得现有疫苗防控效果有限。铁是细菌生长和致病性的关键元素,参与呼吸作用、ATP生成及DNA复制修复等核心生理过程。宿主通过铁结合蛋白(如转铁蛋白和乳铁蛋白)实施营养免疫,限制游离铁的可利用性,从而迫使APP进化出高效的铁获取系统以维持生存和致病力。此前研究虽对APP在铁限制条件下的转录响应
来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
时间:2025-09-26
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无色、耐用且自防御的隐形眼镜纳米涂层:按需对抗角膜炎的智能隐形护盾
隐形眼镜(CL)佩戴者面临着感染性角膜炎(IK)的高易感性风险。开发能够预防IK的隐形眼镜颇具挑战,因为很难在不牺牲光学性能和佩戴舒适度的前提下实现抗菌功能。为解决这一难题,研究人员在隐形眼镜表面构建了无色超光滑的聚硅氮烷涂层,该涂层在细菌生长产生的酸性或碱性刺激下可释放抗菌铵离子。释放的铵离子对大肠杆菌(Escherichia coli)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)这两种IK主要病原体具有显著杀菌效果。此外,该抗菌涂层凭借其无色特性和超光滑表面(表面粗糙度低于1纳米),完美保持了原始隐形眼镜的固有可见光透射率(100%)和佩戴舒适性。涂层通过共价键与镜片连接
来源:Journal of Materials Chemistry B
时间:2025-09-26
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可注射羧甲基壳聚糖-聚苯胺/氧化葡聚糖三重网络水凝胶:长效胃肠标记与光热协同肿瘤治疗新策略
本研究展示了一种新型羧甲基壳聚糖-聚苯胺/氧化葡聚糖(carboxymethyl chitosan–polyaniline/oxidized dextran, CMCS–PANI/OD)三重网络水凝胶,专为内镜下胃肠组织标记设计。该水凝胶通过希夫碱(Schiff base)键和酰胺键交联构建多糖-聚合物杂化结构,有效解决了传统标记剂存在的沉降、渗漏和标记周期短等局限,同时显著提升了生物相容性、可注射性及生理环境稳定性。其独特的光热转换特性使水凝胶具备双重功能:既可实现病变部位的精准定位,又能在近红外(NIR)激光照射下高效消融肿瘤。通过全面的体外(in vitro)和体内(in vivo)评估
来源:Journal of Materials Chemistry B
时间:2025-09-26
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肿瘤细胞源DNASE2B通过调控PSA分泌介导M2巨噬细胞浸润促进前列腺癌进展的机制研究
Section snippets (章节摘要)Bioinformatics analysis (生物信息学分析)采用基因表达谱交互分析(GEPIA, http://gepia.cancer-pku.cn)评估DNASE2B在前列腺腺癌(PRAD)与癌旁组织中的表达模式。通过人类蛋白质图谱(HPA, https://www.proteinatlas.org)单细胞转录组模块绘制DNASE2B在前列腺细胞亚型中的空间表达异质性图谱。借助肿瘤免疫单细胞中心2(TISCH2, http://tisch.comp-genomics.org)进行单细胞分辨率分析。DNASE2B overexpressio
来源:Experimental Cell Research
时间:2025-09-26
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小麦miR9668负调控TaRPM1-1A增强耐盐性的分子机制解析
土壤盐渍化已成为制约全球农业生产的最主要非生物胁迫因素之一,严重影响作物生长发育的各个阶段。据统计,全球有超过9亿公顷的土地受到盐渍化影响,其中灌溉农业用地占相当大比例。随着气候变化和人类活动加剧,土壤盐渍化问题日益严重,对作物生产构成重大障碍,特别是对于世界第二大谷物作物——小麦而言。中国作为全球最大的小麦生产国,由于缺乏耐盐小麦品种,盐渍化导致小麦产量和品质受到严重限制。因此,深入解析小麦耐盐性的分子机制,挖掘耐盐基因并用于分子育种,成为保障粮食安全和促进农业可持续发展的重要策略。以往研究表明,NBS-LRR蛋白在植物抗病性中发挥关键作用,这类蛋白包含N端核苷酸结合位点(NBS)和C端富亮
来源:The Crop Journal
时间:2025-09-26